El análisis de red filogenético ofrece foto del `' de los orígenes COVID-19

El análisis de red filogenético ofrece foto del `'
de los orígenes COVID­19
Reviewed by James Ives, M.Psych. (Editor) Apr 9 2020

Los investigadores de Cambridge, de Reino Unido, y de Alemania han
reconstruido los “caminos evolutivos tempranos” de COVID­19 en seres
humanos ­ como la infección se extendió de Wuhan fuera a Europa y a
Norteamérica ­ usando técnicas genéticas de la red.

Analizando los primeros 160 genomas completos del virus que se ordenarán
de pacientes humanos, los científicos han correlacionado algo de la extensión
original del nuevo coronavirus con sus mutaciones, que crea diversos linajes
virales.

Hay demasiadas mutaciones rápidas para trazar cuidadosamente
un árbol de familia COVID­19. Utilizamos un algoritmo
matemático de la red para visualizar todos los árboles plausibles
simultáneamente. Estas técnicas se saben sobre todo para
correlacionar los movimientos de poblaciones humanas
prehistóricas a través de la DNA. Pensamos que es esto la
primera vez que se han utilizado para trazar las rutas de la
infección de un coronavirus como COVID­19.”

El Dr. Peter Forster, genetista, autor importante, universidad de
Cambridge

Las personas utilizaron datos de los genomas del virus muestreados de
enfrente del mundo entre el 24 de diciembre de 2019 y el 4 de marzo de
2020. La investigación reveló tres “variantes distintas” de COVID­19,
consistiendo en los atados de los linajes estrechamente vinculados, que
etiqueta “A”, “B” y “C”.

Forster y los colegas encontraron que el tipo más cercano de COVID­19 al que
está descubierto en palos ­ pulse “A”, el “genoma humano original del virus” ­
estaba presente en Wuhan, pero no eran asombrosamente el tipo
predominante del virus de la ciudad.

P
Saved from URL: https://www.news-medical.net/news/20200409/372/Spanish.aspx
1
/4
El análisis de red filogenético ofrece foto del `' de los orígenes COVID-19

Las versiones transformadas de “A” fueron consideradas en americanos
denunciados para haber vivido en Wuhan, y un gran número de virus el A
fueron encontrados en pacientes de los E.E.U.U. y de la Australia.

El tipo importante del virus de Wuhan, “B”, era frecuente en pacientes de
enfrente del Este de Asia. Sin embargo, la variante no viajó mucho más allá
de la región sin otras mutaciones ­ implicando una “acción del fundador” en
Wuhan, o “resistencia” contra este tipo de COVID­19 fuera del Este de Asia,
diga a los investigadores.

La variante de “C” es la de tipo europeo mayor, encontró en pacientes
tempranos de Francia, de Italia, de Suecia y de Inglaterra. Está ausente de la
muestra china del continente del estudio, pero visto en Singapur, Hong Kong
y Corea del Sur.

El nuevo análisis también sugiere que una de las introducciones más
tempranas del virus en Italia viniera vía la infección alemana primero
documentada el 27 de enero, y que otra ruta italiana temprana de la infección
fue relacionada con un “atado de Singapur”.

Importantemente, los investigadores dicen que su infección establecida
exacto trazada genética de las técnicas del establecimiento de una red
encamina: las mutaciones y los linajes virales ensamblaron los puntos entre
los casos sabidos.

Como tal, los científicos sostienen que estos métodos “filogenéticos” se
podrían aplicar al genoma muy último del coronavirus que ordenaba para
ayudar a predecir los sitios calientes globales futuros de la transmisión y de la
onda irruptiva de la enfermedad.

El análisis de red filogenético tiene el potencial de ayudar a
determinar las fuentes indocumentadas de la infección COVID­
19, que se pueden entonces quarantined para contener la
extensión adicional de la enfermedad por todo el mundo.”

El Dr. Peter Forster, persona del instituto de McDonald de la
investigación arqueológica en Cambridge, así como del instituto
de universidad de la formación permanente

P
Saved from URL: https://www.news-medical.net/news/20200409/372/Spanish.aspx
2
/4
El análisis de red filogenético ofrece foto del `' de los orígenes COVID-19

Las conclusión se publican hoy en los procedimientos del gorrón de la
National Academy of Sciences (PNAS). El software usado en el estudio, así
como las clasificaciones para más de 1.000 genomas y contar del coronavirus,
está disponibles libremente en http://www.fluxus­technology.com.

La variante “A”, más estrechamente vinculada al virus encontrado en ambos
palos y pangolins, es descrita como “la raíz del brote” por los investigadores.
El tipo “B” se deriva de “A”, separada por dos mutaciones, después “C” es a su
vez una “hija” de “B”.

Los investigadores dicen que la localización de la variante de “B” al Este de
Asia podría resultar de un “efecto del fundador”: un atascamiento genético
que ocurre cuando, en el caso de un virus, un nuevo tipo se establece de un
grupo pequeño, aislado de infecciones.

Forster sostiene que hay otra explicación digno de la consideración.

El virus el A de Wuhan podía inmunológico o ambientalmente
adaptarse a un gran parte de la población asiática del este.
Puede necesitar transformarse para vencer resistencia fuera del
Este de Asia. Parecemos ver un régimen más lento de la
mutación en el Este de Asia que a otra parte, en esta fase inicial.

La red viral que hemos detallado es una foto de los primeros
tiempos de una epidemia, antes de que los caminos evolutivos
de COVID­19 se obscurezcan por los granes números de
mutaciones. Es como la cogida de una supernova incipiente en el
acto.”

El Dr. Peter Forster, genetista, autor importante, universidad de
Cambridge

Desde que el estudio de hoy de PNAS conducto, el equipo de investigación ha
ampliado su análisis a 1.001 genomas virales. Mientras que con todo par­ser
revisado, Forster dice el último trabajo sugiere que la primera infección y
extensión entre seres humanos de COVID­19 ocurrieran entre mediados de

P
Saved from URL: https://www.news-medical.net/news/20200409/372/Spanish.aspx
3
/4
El análisis de red filogenético ofrece foto del `' de los orígenes COVID-19

septiembre y principios de diciembre.

Los métodos filogenéticos de la red usados por los investigadores ­
permitiendo la visualización de centenares de árboles evolutivos
simultáneamente en un gráfico simple ­ fueron promovidos en Nueva Zelanda
en 1979, después desarrollados por los matemáticos alemanes en los años
90.

Estas técnicas vinieron a la atención de profesor Colin Renfrew, co­autor del
arqueólogo del nuevo estudio de PNAS, en 1998. Renfrew continuó establecer
a uno de los primeros grupos de investigación del archaeogenetics en el
mundo en la universidad de Cambridge.

Source:
University of Cambridge
Journal reference:
Forster, P., et al. (2020) Phylogenetic network analysis of SARS­CoV­2
genomes. PNAS. doi.org/10.1073/pnas.2004999117.

Advertencia: Esta página es una traducción de esta página originalmente en
inglés. Tenga en cuenta ya que las traducciones son generadas por máquinas,
no que todos traducción será perfecto. Este sitio Web y sus páginas están
destinadas a leerse en inglés. Cualquier traducción de este sitio Web y su
páginas Web puede ser imprecisa e inexacta en su totalidad o en parte. Esta
traducción se proporciona como una conveniencia.

P
Saved from URL: https://www.news-medical.net/news/20200409/372/Spanish.aspx
4
/4