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GLOBAL DIVERSITY OF

MICROBIAL COMMUNITIES IN
MARINE SEDIMENT
Viviana Aragón
Yorledis Ortiz
Pamela Berrio
Laura Vélez
INTRODUCCIÓN
Sedimentos marinos

Sin embargo. la
diversidad
taxonómica del
bioma microbiano
sedimentario
marino y la
Constituyen el 70% distribución espacial
Incluyen de la diversidad se
de la superficie de han limitado poco a
la tierra. nivel mundial.

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Ubicación de los sitios de muestreo

Pregunta de investigación: ¿cuál es la


distribución de la diversidad global en el
microbiana sedimentario marino?

Para intentar resolver esta pregunta: se


realizó un muestreo en 40 sitios durante 14
expediciones científicas principales

Resultados: se encontraron muestras en


distintos sitios como en áreas de mar abierto,
áreas máximas y mínimas donde el oxígeno
disuelto y la actividad aeróbica ocurren en
todo el sedimento, área de la capa superficial
del suelo y áreas de agua de mar

Teniendo en cuenta este gráfico se genera


la siguiente pregunta: ¿cuál es la
composición taxonómica en la parte óxica y
anóxica de las comunidades microbianas que
se encontraron en los sitios de muestreo?

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Composición taxonómica de comunidades
microbianas sedimentarias marinas Pregunta de investigación: ¿cuál
es la composición taxonómica en
la parte óxica y anóxica de las
comunidades microbianas que se
encontraron en los sitios de
muestreo?
Para intentar responder a esta
pregunta se amplificaron las
secuencias del gen ARNr 16S,
mediante cebadores específicos de
bacterias y arqueas
Principales resultados: la
composición taxonómica de la
comunidad de arqueas y bacterias
en el sedimento anóxico difieren
marcadamente de las del
sedimento óxico
Teniendo en cuenta este gráfico
se genera la siguiente
pregunta: ¿cuáles son las
diferencias de la composición
microbiana en el
bioma sedimentario marino, en el
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agua de mar y en el suelo?
Comparación de la composición de las comunidades
microbianas en distintos biomas

Pregunta de Para intentar responder a Principales resultados: Teniendo en cuenta este gráfico
investigación:¿cuáles esta pregunta se emplearon las composiciones de las se genera la siguiente pregunta:
son las diferencias de la cebadores universales de ¿cuáles son los factores ambientales
comunidades de bacterias
composición microbiana RNAr 16S. Y para el gráfico
y arqueas de los tres que limitan la beta diversidad de
en el bioma sedimentario de ordenación NMDS se
marino, en el agua de utilizó los valores de índice biomas son notoriamente comunidades microbianas en
sedimentos marinos? 5
mar y en el suelo? de similitud de Jaccard diferentes
Diversidad beta de comunidades microbianas
en sedimentos marinos

Pregunta de Para intentar responder a Principales Teniendo en cuenta este


investigación: ¿cuáles esta pregunta se empleó resultados: factores gráfico se genera la
son los factores gráficos de ordenación NMDS ambientales como; la siguiente pregunta:
ambientales que limitan utilizando el índice de Jaccard, ausencia o presencia de ¿la distancia geográfica y
la beta diversidad de cuyos valores a emplear se oxígeno disuelto, contribuyen la litología son factores que
comunidades derivaron de las poblaciones significativamente a la limitan la composición
microbianas en ASV(Amplicon Sequence composición taxonómica de microbiana?
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sedimentos marinos? Variant) enrarecidas estas especies marinas
Pregunta de Para intentar Principales resultados: hay Teniendo en cuenta esta
investigación: ¿la responder a esta una correlación relativamente gráfica se genera la siguiente
distancia geográfica y la pregunta se utilizó el débil entre la distancia pregunta: ¿Cómo afecta la
litología son factores que método de grupos de geográfica y la composición de presencia o ausencia de
limitan la composición pares no ponderados la comunidad. Mientras que oxígeno la riqueza de las
microbiana? con dendrogramas de para la litología se obtuvo una comunidades microbianas?
media aritmética fuerte correlación con la
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composición de la comunidad
Perfiles de profundidad de la riqueza microbiana
en sedimentos marinos
Para intentar responder esta Principales resultados: en Teniendo en cuenta esta
Pregunta de
pregunta Se seleccionó al sedimentos óxicos y gráfica se genera la siguiente
investigación:¿Cómo afecta
azar 1000 secuencias de los anóxicos la riqueza pregunta:¿cuáles son las
la presencia o ausencia de
datos y se usaron para bacteriana es diez veces ASV(Amplicon Sequence
oxígeno la riqueza de las
calcular la riqueza de ASV( mayor que la riqueza de las Variant) de las comunidades
comunidades microbianas?
Amplicon Sequence Variant) arqueas marinas que presentan una
para la muestra mayor co-ocurrencia?

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Análisis de red de ASV coexistentes
Pregunta de investigación: ¿cuáles son las ASV
(Amplicon Sequence Variant) de las comunidades
marinas que presentan una mayor co-ocurrencia?

Para intentar responder esta pregunta Se


realizó un análisis de red basado en la correlación
de rango de spearman de los ASV obtenidos
utilizando los cebadores universales

Principales resultados: los patrones de co-


ocurrencia están determinados por el estado
redox, los donantes de electrones disponibles en
el sedimento y las interacciones entre microbios
sedimentarios que permiten el uso eficaz de los
limitados sustratos disponibles

Teniendo en cuenta este gráfico se genera la


siguiente pregunta: ¿cuál es la composición de
los diez clúster (comunidades) que están
altamente conectadas en la red?

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Pregunta de investigación: ¿cuál es
la composición de los diez clúster
(comunidades) que están altamente
conectadas en la red?

Para intentar responder esta


pregunta se realizó un análisis de
red basado en la correlación de rango
de spearman de los ASV obtenidos
utilizando los cebadores universales

Principales resultados: los


patrones de co-ocurrencia están
determinados por el estado redox, los
donantes de electrones disponibles
en el sedimento y las interacciones
entre microbios sedimentarios que
permiten el uso eficaz de los limitados
sustratos disponibles

Teniendo en cuenta este gráfico se


genera la siguiente pregunta: ¿cuál
es la riqueza global de los taxones
microbianos?
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Número global de taxones microbianos

Pregunta de investigación:
¿cuál es la riqueza global de los
taxones microbianos?

Para intentar responder a esta


pregunta se utilizaron 5 modelos
de SAR, los datos de ASV se
enrarecieron utilizando un
método basado en cobertura en
el paquete de R.

Media= 7,85X103 Media= 3,28X104


con un modelo asintótico con un modelo asintótico y
y un valor de AIC= 2,988 un valor de AIC= 4,366
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CONCLUSIÓN
● La diversidad de los sedimentos marinos disminuye al aumentar la profundidad del sedimento y la tasa
de disminución es generalmente menor para arqueas que para bacterias

● De cinco modelos de relación ASV-área, el modelo asintótico es el mejor

● Para la comparación de biomas sedimentarios marinos se mostró que cada uno contiene una
comunidad claramente diferente

● Las bacterias son más diversas que las arqueas en la biosfera global de la tierra

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¡GRACIAS!

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