Transcripción y Traducción en Procariontes vs.

Eucariontes
Etapas de la traducción

Iniciación
Elongación
Terminación
Primer Paso requerido para la Traducción: Tener
tRNAs aminoacilados correctamente

1. Formación de
aminoacil-adenilato

2. Síntesis de aminoacil-tRNA

1 ATP!

Activación del aminoácido antes de su unión al tRNA. Esta activación se realiza

por la aminoacil tRNA sintetasa y ATP para dar lugar a un Aminoacil
Adenilato (aminoacil AMP)
Especificidad de las aminoacil-tRNA
sintetasas

Fidelidad del código genético!

Visualización del tRNA unido a una
aminoacil tRNA sintetasa
Existe un mecanismo de corrección tanto para el
tRNA como para el aminoácido
Aminoácidos similares pasan por un doble filtro en las aa-tRNA sintetasas

Isoleucil – tRNA sintetasa

Leu es demasiado grande para

el sitio activo de síntesis

Ile cabe en el sitio de síntesis

pero no en el de edición

Val cabe en el sitio de síntesis y

en el de edición por lo que es
eliminado
 Hay dos clases de aa-tRNA sintetasas dependiendo del grupo que
inicialmente se aminoacila

Se considera que ancestralmente las

aa-tRNA sintetasas funcionaban en
forma de dímero, de ahí la orientación
I de sus sitios activos hacia 2’OH y
3’OH de la ribosa
II
Existen dos tRNAs para Metionina, uno iniciador y
otro elongador

El fMet-tRNA iniciador tiene

características especiales

En la mitad de los casos, la

metionina es removida de
Reconoce los codones AUG ó GUG
la proteína
Algunas características del código
genético

-61 codones para aminoácidos, 3 codones de paro

-Hay aproximadamente 40 tRNAs diferentes para los 61
codones (hipótesis del bamboleo)
-Hay 20 aminoácidos y 20 aminoacil-tRNA sintetasas
-El código genético es degenerado
-Enlace tangible entre biosíntesis de aminoácidos y
metabolismo primario
Si la secuencia del mRNA se lee por tripletes existen tres posibles marcos de
lectura. ¿Cómo saber cuál de los tres es el correcto?

¡ Se define por el codón de inicio AUG !

 Estructura del RNA mensajero: Procariontes vs. Eucariontes

Alberts et al., 3rd ed., p.237

En bacterias la selección del codón de inicio AUG se realiza por
interacción entre el mRNA y rRNA 16S (subunidad 30S del
ribosoma)

Shine-Dalgarno
5´AGGAGGU3´
Interacción de Shine-Dalgarno con el rRNA 16S
En eucariontes el mRNA para traducirse es reconocido por
el CAP (7mGpppG)

Funciones:
Protección (5’exo)
Procesamiento
Exportación
Traducción
 Entorno del codón de inicio AUG

En eucariontes: el primer AUG que permita pausar

el ribosoma debe tener un entorno adecuado

A
5’CAP .....C C C C A U G G
G
40S consenso
 El ribosoma: máquina molecular
Ribosoma: 2 subunidades desiguales unidas débilmente,
formadas por polímeros de alto peso molecular, de estructura
compacta

Traducción: lectura consecutiva de tripletes en el mRNA que

permiten síntesis concomitante de una cadena polipeptídica

El ribosoma realiza 3 funciones:

a) Función genética (decodificar la secuencia de nucleótidos en
aminoácidos
b) Función enzimática (catalizar la formación del enlace peptídico)
c) Función de translocación (maquina que se mueve a lo largo del
mRNA, por la que van pasando los tRNAs y se elonga la cadena
peptídica)

Función genética --------------- subunidad pequeña

Función enzimática ------------ subunidad grande
Función de translocación --- ambas subunidades
 Para el inicio de la traducción:

 Las subunidades ribosomales deben estar separadas

 La subunidad pequeña debe reconocer al mRNA
 El tRNA aminoacilado (fmet-tRNAmet o met-tRNA) debe colocarse en
la posición P de la subunidad ribosomal pequeña
 Debe ocurrir el reconocimiento codón-anticodón de inicio
 Ocurre hidrólisis de al menos una molécula de GTP

Factores de iniciación de la traducción IFs (bacteria)

o eIFs (eucariontes)
 INICIO DE LA TRADUCCIÓN PROCARIONTE

IF1
50S IF2
IF3
30S
[Mg2+]
+ 3
3

fMet GTP
1 + 2
GDP
2
Shine-Dalgarno
3 fMet GTP
fMet fMet GTP
1 2
2
3 1 3 1
AUG AUG

complejo de
inicio de la
traducción
FACTORES DE INICIO DE LA TRADUCCIÓN (PROCARIONTES)

Factor Función
IF1 Previene la unión de tRNAs en el
sitio A de la subunidad 30S
IF2 GTPasa que interacciona con 3
componentes claves durante
iniciación: la subunidad 30S, IF1,
y fMet-tRNAif-Met)
IF3 Se une a 30S y evita re-asociación
con 50S. Participa en el
reconocimiento codon-anticodon

f-met

aa-tRNA
IF3 IF1

5’ 3’
E P A
 INICIO DE LA TRADUCCIÓN EUCARIONTE

60S eIF1A
eIF2
40S
eIF3
eIF4
[Mg2+]
+ eIF5
3
Met 3
4
Met GTP
AUG 1A + 2

4
5 Met GTP
1A 2
GDP
Escaneo para
3 1A
2 buscar el AUG Met GTP
5 2
3 4 3 1A
Met GTP
5 2 AUG
4 3 1A
AUG complejo de
inicio de la
traducción
Se forma un complejo circularizado con los extremos 5’ y 3’
del mRNA

Los factores eIF4 NO existen en bacteria

Ocurre un escaneo de la región 5’ no traducible hasta
encontrar el primer AUG en contexto apropiado

eIF4A: helicasa; utiliza

ATP para deshacer
estructura secundaria en
el mRNA y permitir paso
de 40S
Para regenerar eIF2•GTP que se une a tRNA-met para
iniciar traducción, se requiere el factor eIF2B

eIF2B
intercambia
GDP x GTP
en eIF2

eIF2•GDP
Resumen inicio de la traducción en eucariontes

Complejo 43S

eIF3-eIF4G
Complejo 48S
 Elongación
ribosoma
mRNA
tRNAs-aa
factores de elongación

GTP

GTP
x aa
Factores de
elongación
Bacteria Eucariontes
EF-Tu eEF-1
EF-Ts eEF-1
EF-G eEF-2

1. Posicionamiento del aa-tRNAaa

elongador correcto (EF-Tu/eEF-1 )
2. Hidrólisis de GTP y cambio
conformacional.
Para regenerar EF-Tu•GTP se
requiere EF-Ts
 Formación del enlace
peptídico
Bacteria Eucariontes

Actividad peptidil transferasa del

RNAr 23S (Bases conservadas en
todos los organismos)

3. Ataque nucleofílico amino del aa2 al

carboxilo del aa1
4. Posicionamiento del péptido sobre
el tRNA del sitio A
1. El N3 del anillo de la adenina (2486,
bacteria) sustrae un protón del
grupo amino del aa entrante
proporcionando el ataque
nucleofílico al carbonilo del aa unido
al tRNA en el sito P.
2. El N3 protonado estabiliza el
intermediario del carbono
tetrahédrico formado en el sitio P/A
por puente de H con el oxianión
3. El protón es transferido del N3 al
3’OH del tRNA en el sitio P para
transferir el polipéptido al sitio A
Translocación

Bacteria Eucariontes
EF-Tu eEF-1
EF-Ts eEF-1
EF-G eEF-2

5. Entrada de EF-G/eEF-2
6. Hidrólisis de GTP
7. Cambio conformacional y
desplazamiento
ciclos de elongación
 Terminación
ribosoma
mRNA
factores de terminación

GTP proteína

subunidades ribosoma
mRNA
tRNA libre
Factores de
terminación

Bacteria Eucariontes
RF1 eRF1
RF2
RF3 eRF3

RRF
IF3
EF-G
eRF1 utiliza agua para hidrolizar el péptido
Modelo de terminación propuesto para
bacteria
Moleculas que unen el mismo
sitio en el ribosoma
El gasto energético del proceso de traducción

Se hidrolizan 2 GTP´s por cada aminoácido incorporado

La hidrólisis promueve cambios conformacionales

Cargado de tRNA con su aminoácido

1 ATP /aa

TRADUCCION
Iniciación 1 GTP (1er aminoácido)
Elongación 2 GTPs /aa
Terminación 1 GTP
Resumen RIBOSOMA

Centro peptidil transferasa (PTC)

A: aceptor
P: peptidil
E: salida (exit)

Centro activador
de GTPasa

Centro decodificador