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Metabolismo de Bases

Dra. SUSANA GONZALEZ


2019
Nucleótidos
• Constituyentes de los ácidos nucleicos: ácido
desoxirribonucleico (ADN) y ácido ribonucleico (ARN),
depositarios moleculares de la información genética
• Señales químicas en las células, en respuesta a
hormonas y otros estímulos extracelulares (AMPc,
GMPc)
• Componentes estructurales de cofactores enzimáticos
(NAD, FAD, Coenzima A)
• Intermediarios metabólicos de alta energía (UDP-
glucosa), reguladores alostéricos y en metabolismo
energético (ATP, GTP)
Estructura General de un
Nucleótido
(Base nitrogenada)

(1 a 3 grupos fosfatos)

(Monosacárido de 5 C)

Se muestra un ribonucleótido; en un desoxirribonucleótido el H


reemplaza al OH del C 2’
Estructura de las Bases

6-aminopurina 2-amino-6-oxopurina

4-amino-2-oxopirimidina
2,4-dioxopirimidina
5-metil-2,4-dioxopirimidina
Algunas estructuras importantes…
ATP AMPc: 3’, 5’-monofosfato
cíclico de adenosina

Coenzima A

Deriva de
adenosina
difosfato
Rutas Metabólicas que conducen a
la formación de nucleótidos

• De Novo: a partir de precursores metabólicos


(aminoácidos como fuente de C y N, formiato y
CO2 como fuente de C)

• De Recuperación: reciclan las bases libres y los


nucleósidos liberados durante la degradación de
ácidos nucleicos
Síntesis de Novo: Origen de los
átomos del anillo de las Purinas
C6
C4, C5 y N7

N1

C8

C2
N3 y N9
La forma activada de la ribosa es necesaria
para la biosíntesis de los nucleótidos de
purina, pirimidina y las vías de recuperación

PRPP sintetasa
Actividad regulada por:
• Mg2+ como activador
Ribosa-5-fosfato
Ribosa-fosfato
• AMP, GMP y sus
PRPP correspondientes
pirofosfoquinasa o sintetasa
dinucleótidos, ADP y
GDP, como inhibidores.

5-fosforribosil 1-pirofosfato
(PRPP)
Vista General de la
Producción de Nucleótidos
de Purinas

Buchanan y Greenberg
describieron la ruta biosintética
de Purinas (1950)
La glutamina aporta el N9 del anillo, que se
une al C1 de la ribosa

PRPP
amidotransferasa

• AMP, GMP la inhiben


(actúan como reguladores
alostéricos que regulan su
propia síntesis por
retroinhibición) y también los
di y trinucleótidos
Vida media muy corta
• PRPP la activa
Adición de glicina (C4, C5 y N7 del anillo púrico): se
forma una unión amida entre el carboxilo de la glicina
y el amino de la fosforibosilamina

Fosforribosil-
glicinamido-sintetasa
Introducción del grupo formilo (C8 del anillo) vía THF:

Formil
transferasa
…el anillo ya posee sus 5 miembros
(imidazol), pero antes de cerrarse…

Fosforribosil-formil-
glicinamido-sintetasa

N3
El cierre del anillo requiere ATP

Fosforribosil
aminoimidazol
sintetasa
carboxilasa

C6

Se forma unión
amida:
Amino del aspartato
y el carboxilo del C5
del anillo

Se rompe N-C
Adenilo-succinato liasa
IMP
del aspartato
Biosíntesis de AMP y GMP a partir de IMP Conversión del
carbonilo en
C6 en amino

Requiere 7 enlaces alta E

IMP
Requiere 6 ATP

Introducción de
amino en C2
Xantosina-5´-monofosfato
Requiere 8 enlaces alta E
Mecanismos de Regulación
de la Biosíntesis de los
- GDP/ADP
Nucleótidos de Adenina y
Guanina
PRPP amidotransferasa
- AMP/GMP y los di
y tri nucleótidos

4 enzimas son
reguladas

GMP, AMP se convierten en


GDP, GTP y ADP por quinasas
específicas (usando ATP)
+ +
Degradación de los Nucleótidos de Purinas

• Los nucleótidos se degradan y producen


bases libres
• Las bases libres pueden ser recuperadas
• Si no son reutilizadas y recicladas, se
degradan y sus productos finales son
excretados
Las bases Púricas se reciclan a
través de vías de recuperación
Las bases se transforman en sus nucleósidos monofosfato en un solo paso,
usando la ribosa-5-P del PRPP
APRTasa
Adenina + PRPP AMP + PPi

HGPRTasa
Guanina + PRPP GMP + PPi

HGPRTasa
Hipoxantina + PRPP IMP + PPi

APRTasa: adenina-fosforribosil-transferasa
HGPRTasa: hipoxantina-guanina-fosforribosil-transferasa

Adenosina quinasa
Adenosina + ATP AMP + ADP
5´-nucleotidasa
Degradación
de los 5´-nucleotidasa
Adenosina
deaminasa
Nucleótidos Nucleósido

de Purina nucleosidasa nucleosidasa

Xantina
oxidasa

Guanina
deaminasa

FAD, Molibdeno y centros Fe-S Xantina


oxidasa

Producto final del


metabolismo de
purinas
Biosíntesis de Ribonucleótidos de Pirimidinas

Síntesis de Novo: Origen de los


átomos del anillo de pirimidinas

Glutamina Aspartato
Síntesis de UMP
• Formación de carbamil-fosfato (C2 y N3 del
anillo de pirimidinas)

CPS II
CO2 + glutamina + 2 ATP carbamil-fosfato + glutamato +2 ADP +Pi

CPS II: carbamil fosfato sintetasa II, enzima citosólica que usa glutamina. Es
diferente de la CPS I, que es mitocondrial, y utiliza NH3 como sustrato e
interviene en el ciclo de la urea.
Síntesis de novo de los Ya formado el
nucleótidos de pirimidinas anillo pirimidínico,
se agrega PRPP
N1, C4,
C5 y C6 C2 y N3

OMP
Orotidina monofosfato

UMP

Uridina
monofosfato
(ácido orótico)
La síntesis de UMP requiere 6 actividades
enzimáticas que se encuentran en 3 péptidos

• Carbamil fosfato sintetasa II, la aspartato


transcarbamilasa y la dihidroorotasa
• Dihidroorotato deshidrogenasa
• Orotato fosforribosiltransferasa y OMP
descarboxilasa (al inhibir la OMP descarboxilasa
se acumulará ácido orótico)
UMP es el
precursor de los
nucleótidos
citidínicos

UMP

UTP da CTP por


aminación: la
glutamina actúa
como dadora de
grupo amino

CTP
Regulación de la síntesis de novo
de nucleótidos de pirimidina

• La CPS II (carbamil fosfato sintetasa II) se inhibe por UTP,


y es activada por PRPP.

• La Citidilato sintasa (CTP sintasa) se inhibe por CTP


Recuperación de las Bases Pirimidínicas
Pirimidina fosforribosil
Pirimidina (Py) + PRPP transferasa PyMP +PPi

Bases libres Nucleósido

Uracilo o Ribosa-1-fosfato Uridina o


Citosina Citidina

Pirimidina nucleósido fosforilasa

Deoxiribosa-1-fosfato
Timina Timidina

Timina fosforilasa

Quinasas más específicas transforman los nucleósidos en nucleótidos


Degradación de
una Pirimidina: un
ejemplo

Nucleótidos
nucleotidasa
Nucleósidos
nucleosidasa
Bases

Nucleótidos de Citidina y Uridina dan:


Uracilo (finalmente da -alanina,
amonio y Co2)
Nucleótidos de Timidina: dan Timina
Biosíntesis de
Desoxirribonucleótidos
• Se forman por reducción directa de la
posición 2’ de los correspondientes
ribonucleótidos
• Los sustratos son ribonucleósidos difosfato:
ADP, GDP, CDP y UDP
• La reducción tiene lugar a través de una
serie de reacciones de óxido-reducción
catalizadas por la tiorredoxina reductasa y
la ribonucleótido reductasa.
Biosíntesis de Desoxirribonucleótidos

• La regulación de
la enzima es
compleja y asegura
una reserva
Ribonucleótido
equilibrada de
reductasa: utiliza
Tioredoxina precursores para la
la tioredoxina para
reductasa síntesis de ADN.
reducir los
nucleótidos

ADP: dADP
GDP: dGDP
CDP: dCDP
UDP: dUDP…..dUTP…….dUMP----dTTP)
(quinasa) (UTPasa)
dUDP
Conversión de
dUMP
dUMP en dTMP por
la timidilato sintasa y
El ADN contiene
timina en lugar de la dihidrofolato
uracilo. El
precursor
Timidilato
reductasa
inmediato de
dTMP es dUMP sintasa
La formación de dTMP, es blanco
de drogas para el tratamiento de
cáncer, ya que en esos casos las
células se dividen aceleradamente
y requieren activa síntesis de ADN

( Metotrexato, aminopterina
Serina = antifolatos: estructura
hidroximetil similar al DHF, son
transferasa inhibidores de la DHF
Dihidrofolato reductasa, no se regenera
reductasa N5,N10-metilén-THF:
necesario para síntesis de
dTMP)
Muchos agentes quimioterapéuticos
actúan sobre la biósíntesis de
nucleótidos
Un antifolato:

( Metotrexato y aminopterina = son


antifolatos: estructura similar al DHF,
son inhibidores de la DHF reductasa,
por ello no se regenera N5,N10-
metilén-THF: necesario para síntesis
de dTMP)
El 5-Fluorouracilo (un análogo
de pirimidinas) se activa a FdUMP

FdUMP, un inhibidor de la
timidilato sintasa.

enzima

No se produce el
desplazamiento del H

enzima
Las sulfonamidas, análogos del ácido para-
amino benzoico (PABA), inhiben la síntesis
de folato en bacterias

Las sulfanilamidas se usan para tratar ciertas


infecciones bacterianas, y son análogos del
PABA.
El PABA es necesario para la síntesis de folato
en bacterias. Las sulfamidas interfieren con la
síntesis de folato en las bacterias (lo usan en
vez de PABA).
Las sulfamidas no afectan a las células
humanas porque no sintetizan folato, usan
fólico preformado (de la dieta).
Las bacteria no pueden usar preformado
Implicancias clínicas de alteraciones en
el metabolismo de Bases

• Síndrome de Lesch-Nyhan

• Gota

• Aciduria Orótica
Síndrome de Lesch-Nyhan
• Enfermedad Neurológica infantil hereditaria (se
manifiesta a los 2 años, varones)
• Severa o completa deficiencia de la actividad de la
HGPRTasa: las purinas guanina e hipoxantina que se
forman continuamente por degradación de ácidos
nucleicos no pueden recuperarse
• Se caracteriza por la excesiva producción de ácido úrico
porque aumenta síntesis de bases púricas y su
catabolismo
• Retraso mental, mala coordinación, conductas agresivas
y de automultilación (labios y dedos)-el cerebro depende
de vías de recuperación-
GOTA: alteración del metabolismo de las purinas.

• Se caracteriza por: elevados niveles de ácido úrico en sangre


(hiperuricemia) y se manifiesta por depósitos de cristales de la sal
sódica de ácido úrico en los tejidos. Las articulaciones se inflaman y
duelen, a causa de depósitos anormales de urato de sodio (se
visualizan cristales de urato de sodio en leucocitos PMN y macrófagos
en el líquido articular).

Valores normales: Hombre: 3.5-6.5 mg%, Mujer: 2.5-5.5 mg%


Una hiperuricemia aislada no es el único determinante de gota.

Los riñones pueden verse afectados por depósitos de cristales en los


túbulos renales

Múltiples causas debidas a defectos en la síntesis de purinas (1. PRPP


sintetasa no se regula, y aumenta PRPP; 2. déficit parcial de
HGPRtransferasa: aumenta producción de purinas que no se recuperan.
3. secundaria y asociada a otros defectos metabólicos (déficit de
glucosa-6-fosfatasa: la Glu-6-P va a via pentosas y aumenta PRPP)
Tratamiento de la gota:
• Nutricional (evitar
alimentos ricos en
purinas: hígado, riñón,
sesos; evitar el alcohol)
• Farmacológico
(alopurinol)
El alopurinol, un inhibidor de la xantina oxidasa
• Enfermedad hereditaria, baja
Aciduria Orótica incidencia
• Defecto en la enzima que convierte
ácido orótico en uridina monofosfato
(orotatofosforribosiltransferasa-OMP
descarboxilasa)
• Anemia severa, retardo en
crecimiento (no sintetiza pirimidinas)
• Excreción de grandes cantidades
de ácido orótico
•Administrar uridina (nucleósido) por
vía oral para tratar esta condición (se
transforma en nucleótidos)

Enzima bloqueada
en la aciduria
orótica hereditaria
Repasando….
• ¿Qué aminoácidos participan en la
síntesis de bases?
Purinas:…………………..
Pirimidinas:………………….

• ¿Cómo se forma el PRPP?


• ¿Cómo se regula la síntesis de nucleótidos
de purina?
• ¿Cuáles son las reacciones de recuperación
de bases púricas preformadas?

• ¿Qué consecuencias presentaría la inhibición de la


OMP decarboxilasa?
El Metotrexato posee una estructura parecida al …….., inhibe
a la ……………………………e impide que se regenere
el………………………………….., necesario para la
conversión de dUMP a dTMP, esencial para la biosíntesis de
ADN. Consecuencia: las células de crecimiento rápido, como
las células tumorales, perecen.

• ¿Por qué se utiliza el alopurinol en el tratamiento


de la gota?
El alopurinol es un análogo de la………………. El alopurinol
es sustrato de la…………………….., se transforma
en………………, producto que se une a la enzima e inhibe
su acción. Disminuye la producción de…………………. y
aumentan los niveles de hipoxantina y xantina, que se
excretan y alivian los síntomas
El desarrollo de fármacos no
hubiera sido posible sin
comprender en detalle las bases
bioquímicas de la síntesis de
purinas y pirimidinas y sus vías de
recuperación

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