ACTIVIDAD COMPLEMENTARIA SOBRE EVOLUCIÓN

SIMULANDO LA EVOLUCIÓN DE UN GEN EN UNA POBLACIÓN

Esta actividad integra conceptos de informática y evolución para simular la forma en que podría
darse la evolución de un gen en una población determinada. Para esto utilizaremos AlleleA1, un
programa amigable que permite simular la evolución de una población incorporando las diferentes
fuerzas evolutivas: deriva genética (population size), dirección e intensidad de la selección natural
(fitness), migración y mutación. Específicamente, este programa permite simular el cambio en las
frecuencias de dos alelos (A1 y A2) de un gen en una población hipotética, dependiendo del efecto
de distintas fuerzas evolutivas.

Para realizar la actividad debe ir al sitio web AlleleA1: Programa para simular la evolución de un gen
en una población (http://faculty.washington.edu/herronjc/SoftwareFolder/AlleleA1.html), bajar el
programa (Windows o Mac) y descomprimirlo en la carpeta que desee en su computador. No tiene
que realizar ninguna instalación.

Abra el archivo tipo aplicación y verá un diagrama donde se presenta la frecuencia del alelo A1 en
la ordenada (eje Y) con respecto al número de generaciones transcurridas en la abscisa (eje X), como
se ve en la figura 1. En la parte inferior aparecen los espacios para cambiar los parámetros de cada
simulación. Allí se puede cambiar el tamaño de la población (population size), el éxito reproductivo
o fitness de cada uno de los tres genotipos posibles para un locus con dos alelos (A1 y A2), la
proporción de migrantes en cada generación (fraction migrants each generation), la frecuencia de
A1 en la población fuente (frequency of A1 in source pop’n), la tasa de mutación del alelo A1 al A2
y del alelo A2 al A1 (mutation rate) y el coeficiente de endogamia (inbreeding coefficient [F]).

Figura 1. Interfaz del programa AlleleA1

donde se cambian los parámetros para
hacer la simulación. Tomada de
AlleleA1: Programa para simular la
evolución de un gen en una población.
Con los parámetros que el programa trae por defecto pulse el ícono de “Run”, y verá el resultado
de la simulación. Si vuelve a hacerlo repetidas veces podrá observar que el estado no cambiará en
el tiempo ya que no se incluye el efecto de ninguna fuerza evolutiva. En la sección de “Graph lines”,
escoja la opción “Auto” para que pueda comparar el efecto de cada simulación (podrá ver varias
líneas o simulaciones al mismo tiempo).

Ahora puede iniciar los ejercicios. Debe escribir sus respuestas en un documento, guardarlo en
formato pdf, nombrarlo así: Simulación_Daniela-Pamela-Carolina-Paola.pdf (modifique los nombres
según corresponda) y subirlo a la carpeta del drive llamada Simulaciones.

a. Simule el efecto de la deriva genética:

En la pestaña localizada al extremo derecho de la abscisa, cambie el número de generaciones a ser

simuladas a un total de 100.

Cambie el tamaño de la población modificando infinite por 10000 y corra la simulación unas 3 veces.
Luego comience a disminuir gradualmente el tamaño hasta llegar a 10 individuos, observando lo
que ocurre. Para determinar el efecto de dicho cambio es importante que cada vez que modifique
algún parámetro corra la simulación al menos 3 veces.

Preguntas:

1. ¿Qué diferencias observa en el rumbo de la población generación tras generación al hacer

múltiples corridos con 10.000 y luego con tamaños poblacionales menores?
2. ¿Qué cree que explique dichos cambios?
3. Si ocurre pérdida de alguno de los alelos al transcurrir el tiempo, ¿es más probable que esto
ocurra con tamaños poblacionales grandes o con tamaños pequeños?
4. ¿Qué fuerza evolutiva podría explicar los cambios ocurridos?

b. Simule el efecto de la mutación:

Luego de resetear los parámetros del programa (pulsando el ícono de “Reset”), simule el efecto
individual de la mutación de un alelo a otro asignando una tasa de mutación de A1 a A2 igual a 0.001
en un total de 100 generaciones (recuerde hacer siempre al menos 3 repeticiones).

Ahora, modifique el tamaño poblacional a 10 individuos y simule el efecto de la mutación con una
tasa de mutación de A1 a A2 de 0 a 0.001 y luego cámbiela a 0.01. Compare los resultados teniendo
en cuenta el cambio en la tasa de mutación y en el número poblacional.

Preguntas:

1. ¿Cómo cambian los resultados con respecto a la simulación de la sección anterior?

2. ¿Qué pasa con el alelo A1 en la población con un tamaño poblacional infinito y cómo cambia
cuando tiene una población de 10?
c. Simule el efecto de la migración:

Para simular el efecto de la migración sobre una población debe definir las frecuencias alélicas en la
población fuente y la fracción de la población receptora que corresponde a individuos migrantes.

En un total de 500 generaciones, asigne una fracción de migrantes de 0.01 (1%) y una frecuencia de
A1 en la población fuente igual a 0.7. Luego aumente la fracción de migrantes a 0.1 (10%).

Preguntas:

1. ¿En qué sentido cambia la frecuencia de A1 en la población?

2. ¿Cómo explica que la frecuencia se estabilice en cierto valor? ¿Qué valor es este?

d. Simule el efecto de la selección natural:

Por defecto, los tres genotipos presentados tienen un fitness igual a 1.0. Asumiendo que el alelo A1
es dominante sobre A2 y que este último en condición homocigótica acarrea una desventaja
adaptativa (A2 es deletéreo), asigne un fitness de 0.98 al genotipo A2A2 dejando los demás valores
iguales.

Ahora asuma que cada uno de los genotipos A1A1, A1A2 y A2A2 tienen fitness de 1.0, 0.97 y 0.95,
respectivamente, es decir, que son afectados diferencialmente por la selección natural.

Simule los dos casos anteriores pero disminuyendo el tamaño poblacional a 20.

Preguntas:

1. En el primer caso, ¿qué pasa con la frecuencia del alelo A2 al cabo de 500 generaciones?
¿Por qué cree que nunca se elimina de la población?
2. En el segundo caso, ¿qué pasa con la frecuencia del alelo A2? ¿En qué difiere con respecto
a la simulación anterior?
3. En una población con tan solo 20 individuos, ¿qué pasa con las frecuencias de los alelos?
¿Existe alguna posibilidad de que llegue a perderse el alelo ventajoso (A1) y a fijarse el
desventajoso (A2)?
4. En este caso están compitiendo varias fuerzas evolutivas como la selección natural y la
deriva genética. Puesto que la selección natural tiende a favorecer cierto alelo, el A1 en este
caso, ¿podría la deriva genética evitar dicho efecto? Si esto ocurriera, ¿cuál sería el riesgo
para la adaptación de las poblaciones a su entorno?