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Preguntas clave
Esquema
La tecnología del DNA es la responsable de los rápidos avances que se están haciendo
en la genética de todos los organismos modelo. También es un tema con un interés
considerable en el dominio público. Algunos ejemplos son el gran anuncio público de
las secuencias de los genomas completos de humano y chimpancé en los últimos años, y
la popularidad de los análisis forenses a partir de DNA en los shows televisivos y en las
películas (Figura 5-1). Estos resultados espectaculares, ya sea en humanos, peces,
insectos, plantas u hongos, se han obtenido a través del uso de tecnologías que permiten
aislar trozos pequeños de DNA, llevarlos de una célula a otra, y amplificarlos en
grandes muestras. La mayoría de los sistemas sofisticados que permiten estas
manipulaciones del DNA de cualquier organismo provienen de las bacterias y sus virus.
Por lo tanto, el avance de la genética moderna hasta el estado de conocimientos actual
ha dependido completamente del desarrollo de la genética bacteriana, el tema de este
capítulo.
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Las bacterias pertenecen a una clase de organismos conocida como procariotas, que
también incluyen el alga verdeazulada (actualmente clasificada como cianobacteria).
Una característica clave que define los procariotas es que su DNA no está encerrado en
un núcleo rodeado de membrana. Al igual que los organismos superiores, las bacterias
tienen genes compuestos de DNA que se encuentran dispuestos en una larga serie en un
“cromosoma”. Sin embargo, la organización de su material genético es única en varios
aspectos. El genoma de la mayoría de las bacterias es una única molécula de DNA de
doble cadena con la forma de un círculo cerrado. Además, en la naturaleza, las bacterias
tienen a menudo elementos extras de DNA denominados plásmidos. La mayoría de
plásmidos también son círculos de DNA, pero son mucho más pequeños que el genoma
bacteriano principal.
Cuando los científicos empezaron a estudiar las bacterias y los fagos, estaban
especialmente interesados en sus sistemas hereditarios. Claramente, las bacterias y los
fagos deben tener sistemas hereditarios porque muestran una apariencia y una función
constantes de una generación a la siguiente (mantienen una coherencia genealógica).
Pero, ¿cómo funcionan estos sistemas hereditarios? Las bacterias, al igual que los
organismos eucariotas unicelulares, se reproducen asexualmente por crecimiento y
división celular, una célula se convierte en dos. Esta reproducción asexual es bastante
sencilla de demostrar experimentalmente. Sin embargo, ¿se dan a veces uniones de
diferentes tipos con el propósito de la reproducción sexual? Además, ¿cómo se
reproducen los fagos que son mucho más pequeños? ¿Se unen alguna vez para un ciclo
similar al sexual? En este capítulo se pretende contestar estas preguntas.
Vamos a ver que hay una variedad de procesos hereditarios en las bacterias y los fagos.
Estos procesos son interesantes por la biología básica de estas formas, pero también
actúan como modelos –como fuentes de conocimiento de los procesos genéticos que
funcionan en todos los organismos. Para un genetista, el atractivo de estas formas es que
se pueden cultivar en números muy grandes porque son muy pequeñas. Por
consiguiente, es posible detectar y estudiar sucesos genéticos muy raros que son
difíciles o imposibles de estudiar en los eucariotas.
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surgir de diferentes maneras, pero en todos los casos, se reúnen dos moléculas de DNA.
Sin embargo, una diferencia importante respecto a los eucariotas es que, en las
bacterias, raramente se reúnen dos cromosomas completos; normalmente, se une un
cromosoma completo con un fragmento de otro cromosoma. Las posibilidades están
esquematizadas en la Figura 5-2.
Una célula bacteriana también puede absorber un trozo de DNA del ambiente externo e
incorporarlo en su propio cromosoma, un proceso llamado transformación. Además,
algunos fagos pueden coger un trozo de DNA de una célula bacteriana e inyectarlo en
otra, donde puede incorporarse en el cromosoma, en un proceso denominado
transducción.
Antes de analizar estos modos de intercambio genético, vamos a considerar las formas
prácticas de manejar las bacterias, que son muy diferentes de las que se utilizan para
trabajar con organismos multicelulares.
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Es bastante fácil obtener bacterias con mutaciones. Los mutantes nutricionales son un
buen ejemplo. Las bacterias de tipo salvaje son prototróficas, es decir, pueden crecer y
dividirse en un medio mínimo –un substrato que sólo contiene sales inorgánicas, una
fuente de carbono para la energía y agua. Se pueden obtener mutantes auxotróficos a
partir de un cultivo prototrófico. Estos mutantes son células que no crecerán a menos
que el medio contenga uno o más bloques de construcción específicos de la célula como
la adenina, la treonina o la biotina. Otro tipo de mutantes útiles son los que difieren de
las bacterias de tipo salvaje en la capacidad de utilizar una fuente de energía específica.
Por ejemplo, el tipo salvaje (lac+) puede utilizar lactosa y crecer, mientras que el
mutante (lac-) no puede. La Figura 5-4 muestra otra manera de distinguir las colonias
lac+ y lac- mediante el uso de una tinción. En otra categoría de mutantes, mientras el
tipo salvaje es susceptible a un inhibidor, como el antibiótico estreptomicina, los
mutantes resistentes pueden dividirse y formar colonias en presencia del inhibidor.
Todos estos tipos de mutantes permiten a los genetistas diferenciar distintas cepas
individuales y, de ese modo, proporcionan marcadores genéticos (alelos marcadores)
para realizar un seguimiento de los genomas y las células en los experimentos. La Tabla
5-1 resume algunos fenotipos bacterianos mutantes y sus símbolos genéticos.
Las siguientes secciones describen el descubrimiento de varios procesos por los que los
genomas bacterianos recombinan. Los métodos históricos son interesantes por sí
mismos, pero también sirven para presentar los distintos procesos de recombinación, al
igual que las técnicas analíticas que hoy en día todavía son aplicables.
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Descubrimiento de la conjugación
RECUADRO
E. coli tiene un único cromosoma circular de 4.6 Mb de longitud. De sus 4000 genes sin
intrones, un 35% son de función desconocida. El ciclo sexual es posible por la acción de
un plásmido extragenómico llamado F, que confiere un tipo de “masculinidad”. Otros
plásmidos llevan genes cuyas funciones equipan a la célula para vivir en ambientes
específicos, tales como genes de resistencia a fármacos. Estos plásmidos han sido
adaptados como vectores génicos, que son transportadores de genes y constituyen la
base de las transferencias génicas que son esenciales en la ingeniería genética moderna.
E. coli es unicelular y crece por simple división celular. Debido a su tamaño pequeño
(~1 m de longitud), E. coli puede crecer en grandes cantidades y ser sometida a
procedimientos de selección intensiva y de rastreo para sucesos genéticos raros. La
investigación en E. coli representa el inicio del razonamiento de “caja negra” en la
genética: mediante la selección y el análisis de los mutantes, se pudo deducir el
funcionamiento de la maquinaria genética, aunque era demasiada pequeña como para
ser vista. Fenotipos como el tamaño de la colonia, la resistencia a fármacos, el uso de
fuentes de carbono, y la producción de colorantes son el equivalente de los fenotipos
morfológicos de la genética de eucariotas.
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Se podría argumentar que las células de las dos cepas realmente no intercambian genes,
sino que pierden substancias que las otras células pueden absorber y utilizar para su
crecimiento.
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En 1953, William Hayes descubrió que, en los tipos de “cruces” aquí descritos, los
parentales conjugados se comportaban de manera desigual (más tarde, veremos
maneras de demostrar esta participación desigual). Un parental (y sólo ese parental)
parecía transferir una parte o todo su genoma a otra célula. Por lo tanto, una célula actúa
como donante y la otra, como receptora. Este “cruce” es bastante diferente de los
cruces eucariotas en los que los progenitores contribuyen equitativamente con los
genomas nucleares.
Accidentalmente, Hayes descubrió una variante de esta cepa donante original que no
producía recombinantes al cruzarse con la cepa receptora. Aparentemente, la cepa de
tipo donante había perdido la capacidad de transferir material genético y se había
convertido en una cepa de tipo receptora. Mientras trabajaba con esta variante donante
“estéril”, Hayes encontró que podía recuperar la capacidad de actuar como donante al
asociarse con otras cepas donantes. De hecho, la capacidad donante se transmitía rápida
y efectivamente entre las cepas durante la conjugación. Parecía estar ocurriendo una
especie de “transferencia infecciosa” de algún factor. Sugirió que la capacidad donante
es un estado hereditario, impuesto por un factor de fertilidad (F). Las cepas que
contienen F pueden donar y se designan F+. Las cepas que carecen de F no pueden
donar y son receptoras, designadas F-.
Ahora se sabe mucho más sobre F. Es un ejemplo de una pequeña molécula circular no
esencial de DNA llamada plásmido que puede replicarse en el citoplasma
independientemente del cromosoma hospedador. La Figura 5-8 muestra cómo las
bacterias pueden transferir los plásmidos como el F. El plásmido F dirige la síntesis de
los pili (pilus, en singular), proyecciones que inician el contacto con una receptora
(véase Figuras 5-7 y 5-8) y acercan ambas células. El DNA de F de la célula donante
hace una copia de cadena sencilla de sí mismo mediante un mecanismo peculiar
denominado replicación por círculo rodante. El plásmido circular “rueda”, y a medida
que gira, va liberando la copia de cadena sencilla como un hilo de pescar. Esta copia
pasa a través de un poro a la célula receptora donde se sintetiza la otra copia formando
una doble
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hélice. Así pues, una copia de F permanece en la donante y otra copia aparece en la
receptora, tal y como se muestra en la Figura 5-8. Cabe notar que el genoma de E. coli
está representado como un único cromosoma circular en la Figura 5-8. (Se examinará la
evidencia de este hecho más adelante). La mayoría de los genomas bacterianos son
circulares, una característica bastante diferente de los cromosomas nucleares eucariotas.
Veremos que esta característica conlleva a muchas de las idiosincrasias de la genética
bacteriana.
Cepas Hfr
1. Al cruzarse con cepas F-, esta nueva cepa producía 1000 veces más recombinantes
que una cepa F+ normal. Cavalli-Sforza designó a este derivado como una cepa Hfr para
simbolizar su capacidad de promover una alta frecuencia de recombinación (en inglés,
high frequency of recombination).
Se puso de manifiesto que una cepa Hfr resulta de la integración del factor F en el
cromosoma, como se ilustra en la Figura 5-9. Ahora se puede explicar la primera
propiedad inusual de las cepas Hfr. Durante la conjugación, el factor F insertado en el
cromosoma conduce una parte o todo el cromosoma a la célula F - de manera eficiente.
Entonces, el fragmento cromosómico puede recombinar con el cromosoma receptor.
Los pocos recombinantes observados por Lederberg y Tatum en los cruces F+ × F- eran
debidos a la formación espontánea, pero poco frecuente, de células Hfr en el cultivo F +.
Cavalli-Sforza aisló ejemplos de estas células raras de los cultivos de F + y encontró que,
de hecho, actuaban como verdaderas Hfr.
¿Muere una célula Hfr tras dar su material cromosómico a una célula F-? La respuesta es
no. El cromosoma Hfr se replica y transfiere una cadena sencilla a la célula F - durante la
conjugación, justo como los plásmidos F. El hecho que el DNA transferido sea de
cadena sencilla se puede demostrar visualmente mediante el uso de cepas y anticuerpos
especiales, tal y como se muestra en la Figura 5-10. La replicación del cromosoma
asegura un cromosoma completo para la célula donante tras el apareamiento. En la
célula receptora, la cadena transferida se convierte en una doble hélice y los genes
donados pueden llegar a incorporarse en el cromosoma receptor mediante
entrecruzamientos, creando así, una célula recombinante (Figura 5-11). Si no hay
recombinación, los fragmentos de DNA transferidos simplemente se pierden en el curso
de la división celular.
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Transmisión lineal de los genes HFR desde un punto fijado En 1957, se obtuvo una
visión más clara del comportamiento de las cepas Hfr cuando Elie Wollman y François
Jacob investigaban el patrón de transmisión de los genes Hfr a las células F - durante el
cruce. Ellos cruzaron
Hfr azir tonr lac+ gal+ strs × F- azis tons lac- gal- strr
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la transferencia del DNA de cadena sencilla empieza por un punto fijado del
cromosoma donado, llamado el origen (O), y continúa de manera lineal. Actualmente,
se sabe que el punto O es el sitio por donde se inserta el plásmido F. Cuanto más lejos
está un gen de O, más tarde se transfiere a F -. El proceso de transferencia generalmente
se parará antes de que se transfieran los genes más lejanos y, como resultado, estos
genes se incluirán en un número menor de ex conjugantes.
¿Cómo se puede explicar la segunda propiedad inusual de los cruces Hfr, que los ex
conjugantes F- raramente se convierten en Hfr o F+? Cuando Wollman y Jacob
permitieron que los cruces Hfr × F- continuaran durante 2 horas antes de la interrupción,
encontraron que, de hecho, algunos ex conjugantes se habían convertido en Hfr. En
otras palabras, la parte de F que confiere la capacidad donadora finalmente se había
transmitido, pero a una frecuencia muy baja. La rareza de los ex conjugantes Hfr sugirió
que el F insertado se transmitía como el último elemento del cromosoma lineal. Se
puede resumir el orden de transmisión con el siguiente mapa genérico, donde la flecha
indica la dirección de la transferencia, empezando por O:
O a b c F
Cepa Hfr
H O thr pro lac pur gal his gly thi F
1 O thr thi gly his gal pur lac pro F
2 O pro thr thi gly his gal pur lac F
3 O pur lac pro thr thi gly his gal F
AB 312 O thi thr pro lac pur gal his gly F
Cada línea se puede considerar un mapa que muestra el orden de los alelos en el
cromosoma. A primera vista, parece ser una mezcla aleatoria de los genes. Sin
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embargo, cuando se invierten algunos de los mapas Hfr, la relación de las secuencias se
aclara.
1. Un extremo del factor F integrado sería el origen, donde empieza la transferencia del
cromosoma Hfr. El término estaría en el otro extremo de F.
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regiones podría actuar como una región de apareamiento donde el apareamiento podría
estar seguido de un entrecruzamiento. Se sabe que estas regiones de homología
principalmente son segmentos de elementos transponibles denominadas secuencias de
inserción. Para una explicación completa de las secuencias de inserción, véase el
Capítulo 14.
Así, el factor de fertilidad existe en dos estados:
2. El estado integrado: como una parte contigua del cromosoma circular, F se transmite
tan sólo al final de la conjugación.
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genomas completos, como pasa en eucariotas; sino que ocurre entre un genoma
completo, el de F-, llamado endogenote, y uno incompleto, proveniente de la Hfr
donante y denominado exogenote. En ese momento, la célula tiene dos copias de un
segmento de DNA: una copia es parte del endogenote y la otra, del exogenote. Así, en
ese momento, la célula es un diploide parcial, llamado merocigoto. La genética
bacteriana es genética de merocigotos. Un simple entrecruzamiento en un merocigoto
rompería el anillo y no produciría recombinantes viables, tal y como se muestra en la
Figura 5-16. Para mantener el círculo intacto, debe haber un número par de
entrecruzamientos. Un número par de entrecruzamientos produce un cromosoma
circular intacto y un fragmento. Aunque tales sucesos de recombinación se representan
por sencillez como entrecruzamientos dobles, el mecanismo molecular real es algo
diferente, es más como una invasión del endogenote por una sección interna del
exogenote. El otro producto del “doble entrecruzamiento”, el fragmento, generalmente
se pierde en el crecimiento posterior de la célula. Además, sólo sobrevive uno de los
productos recíprocos de la recombinación. Por eso, otra característica distintiva de la
recombinación bacteriana es que hay que olvidarse de los productos de intercambio
recíprocos en la mayoría de casos.
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Para obtener este merocigoto, antes se deben seleccionar ex conjugantes estables que
lleven el último alelo donado, que, en este caso, es leu+. ¿Por qué? Porque si se
selecciona el último
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marcador, se sabe que esas células en algún momento también deben haber albergado
los marcadores anteriores –en concreto, arg+ y met+.
se muestra en la Figura 5-18. Cabe notar que la escisión defectuosa ocurre porque hay
otra región homóloga cercana que se aparea con la original. El F’ de nuestro ejemplo se
denomina F’ lac porque el trozo que se cogió del cromosoma del hospedador tiene el
gen lac. Se han encontrado factores F’ con muchos genes cromosómicos diferentes y se
han llamado de acuerdo con esos genes. Por ejemplo, los factores F’ que llevan gal o
trp se denominan F’ gal o F’ trp, respectivamente. Como las células F lac+/F- lac- tienen
el fenotipo Lac+, se sabe que lac+ es dominante sobre lac-.
Los diploides parciales hechos con cepas F’ son útiles para varios aspectos de la
genética bacteriana rutinaria, como el estudio de la dominancia o de la interacción
alélica. Algunas cepas F’ pueden llevar partes muy grandes (hasta un cuarto) de un
cromosoma bacteriano.
Plásmidos R
En la década de los 40, se descubrió una propiedad alarmante de las bacterias patógenas
mediante estudios realizados en hospitales japoneses. La disentería bacteriana está
causada por bacterias
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del género Shigella. Inicialmente, esta bacteria era sensible a un amplio conjunto de
antibióticos que se utilizaban para controlar la enfermedad. Sin embargo, en los
hospitales japoneses, se demostró que la Shigella aislada de pacientes con disentería era
resistente a muchos de estos fármacos simultáneamente, incluyendo la penicilina, la
tetraciclina, la sulfanilamida, la estreptomicina y el cloranfenicol. Esta resistencia a
múltiples fármacos se heredaba como un único paquete genético, y se podía transmitir
de manera infecciosa –no sólo a otras cepas sensibles de Shigella, sino a otras especies
bacterianas relacionadas. Este talento, que se parece a la movilidad del plásmido F de E.
coli, es extraordinariamente útil para las bacterias patógenas porque la resistencia se
puede extender rápidamente a través de una población. Sin embargo, sus implicaciones
para la ciencia médica son extremas ya que las enfermedades bacterianas se vuelven,
repentinamente, resistentes a los tratamientos de una amplia gama de fármacos.
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Algunos plásmidos diseñados derivados de los plásmidos R, como el pBR 322 y el pUC
(véase Capítulo 20), han llegado a ser los vectores preferidos para la clonación
molecular del DNA de todos los organismos. Los genes de un plásmido R que confieren
resistencia se pueden utilizar como marcadores para realizar el seguimiento del
movimiento de los vectores entre las células.
Algunas bacterias pueden absorber fragmentos de DNA del medio externo, y tal
absorción constituye otra manera por la que las bacterias pueden intercambiar sus genes.
El origen del DNA puede ser otras células de la misma especie o células de otras
especies. En algunos casos, el DNA se ha liberado de células muertas; en otros casos,
células bacterianas vivas han secretado el DNA. El DNA absorbido se integra en el
cromosoma receptor. Si este DNA es de un genotipo distinto del genotipo del receptor,
el del receptor puede verse cambiado permanentemente, un proceso acertadamente
denominado transformación.
La transformación se puede utilizar para medir cuán estrechamente están ligados dos
genes en un cromosoma bacteriano. Cuando el DNA (el cromosoma bacteriano) se
extrae para los experimentos de transformación, es inevitable que se rompa en trozos
más pequeños. Si dos genes donados se encuentran muy cercanos en el cromosoma, hay
muchas posibilidades de que a veces estén en el mismo trozo de DNA transformante.
Por lo tanto, ambos serán absorbidos, causando una transformación doble. De manera
inversa, si los genes están ampliamente separados en el cromosoma, será más probable
que se transporten en segmentos transformantes separados. Posiblemente, un genoma
podría absorber ambos segmentos de manera independiente, creando un transformante
doble, pero este resultado no es probable. Por lo tanto, en los genes ampliamente
separados, la frecuencia de los transformantes dobles será igual al producto de las
frecuencias de los transformantes sencillos. Por eso, debería ser posible probar el
ligamiento estrecho a partir de la desviación de la regla del producto. En otras palabras,
si los genes están ligados, entonces la proporción de transformantes dobles será mayor
que el producto de las frecuencias de los transformantes sencillos.
Mensaje. Las bacterias pueden absorber fragmentos de DNA del medio que les rodea.
Dentro de la célula, estos fragmentos se pueden incorporar en el cromosoma.
5.4 Genética de los bacteriófagos
La palabra bacteriófago, que es un nombre para los virus bacterianos, significa “que
come bacterias”. Estos virus parasitan y matan las bacterias. Trabajos pioneros en la
genética de los bacteriófagos a mediados del siglo veinte constituyeron los fundamentos
de investigaciones más recientes en virus causantes de tumores y otros tipos de virus de
animales y plantas. De esta manera, los virus bacterianos han proporcionado un
importante sistema modelo.
Estos virus se pueden utilizar en dos tipos distintos de análisis genéticos. Por un lado, se
pueden cruzar dos genotipos de fago distintos para medir la recombinación y, por lo
tanto, cartografiar el genoma vírico. El cartografiado del genoma vírico por este método
es el tema de esta sección. Por otro lado, los bacteriófagos se pueden utilizar como una
forma de reunir conjuntamente los genes bacterianos para los estudios de ligamiento u
otros estudios genéticos. Estudiaremos el uso de los fagos en
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los estudios bacterianos en la Sección 5.5. Además, como veremos en el Capítulo 20,
los fagos se utilizan en la tecnología del DNA como transportadores, o vectores, de
DNA foráneo. Antes de poder comprender la genética de los fagos, se debe examinar su
ciclo de infección.
La mayoría de las bacterias son susceptibles al ataque por los bacteriófagos. Un fago
está compuesto por un “cromosoma” de ácido nucleico (DNA o RNA) rodeado por una
cubierta de moléculas proteicas. Los tipos de fagos no se identifican por nombres de
especies, sino por símbolos –por ejemplo, el fago T4, el fago , y así sucesivamente.
Las Figuras 5-22 y 5-23 muestran la estructura del fago T4. Durante la infección, un
fago se une a una bacteria e inyecta su material genético en el citoplasma de la bacteria,
tal y como se esquematiza en la Figura 5-22. La Figura 5-24 muestra una micrografía
electrónica del proceso. Entonces, la información genética del fago controla la
maquinaria de la célula bacteriana parando la síntesis de los componentes bacterianos y
redireccionando la maquinaria sintética bacteriana para hacer componentes del fago.
Las cabezas del fago recién hechas se rellenan individualmente con las réplicas del
cromosoma del fago. Finalmente, se crean muchos descendientes de fagos y éstos se
liberan cuando la pared celular bacteriana se rompe. Este proceso de rotura se denomina
lisis. La población progenie del fago se denomina lisado fágico.
¿Cómo se puede estudiar la herencia de los fagos cuando son tan pequeños que sólo son
visibles bajo el microscopio electrónico? En este caso, no se puede producir una colonia
visible mediante la siembra, pero se puede producir una manifestación visible de un
fago aprovechando varios caracteres del fago.
Vamos a ver las consecuencias de un fago que infecta una única célula bacteriana. La
Figura 5-25 muestra la secuencia de sucesos en el ciclo infeccioso que lleva a la
liberación de la progenie de fagos de la célula lisada. Tras la lisis, la progenie de fagos
infecta las bacterias vecinas. Este ciclo se repite a través de rondas de replicación
progresivas, y, a medida que los ciclos se repiten, el número de células lisadas aumenta
exponencialmente. Al cabo de 15 horas después de que una única partícula fágica haya
infectado una única célula bacteriana, los
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efectos son visibles a simple vista como una zona clara, o calva, en el cultivo confluente
opaco de bacterias que cubre la superficie de la placa de medio sólido (Figura 5-26).
Estas calvas pueden ser grandes o pequeñas, difusas o definidas, y así sucesivamente,
según el genotipo del fago. Así, la morfología de la calva es un carácter del fago que se
puede analizar en el nivel genético. Otro fenotipo del fago que se puede analizar
genéticamente es la dispersión de hospedador, ya que los fagos difieren en el espectro
de cepas bacterianas que pueden
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infectar y lisar. Por ejemplo, una cepa específica de bacterias puede ser inmune al fago
1 pero susceptible al fago 2.
Dos genotipos de fagos se pueden cruzar de la misma manera que se cruzan dos
organismos. El cruce entre fagos se puede ilustrar por un cruce de dos fagos T2 que
originalmente fue estudiado por Alfred Hershey. Los genotipos de las dos cepas
parentales en el cruce de Hershey eran h-r+ × h+r-. Los alelos corresponden a los
siguientes genotipos:
h- : puede infectar dos cepas distintas de E. coli (que podemos llamar cepas 1 y
2)
h+ : sólo puede infectar la cepa 1
r- : lisa las células rápidamente, produciendo, de ese modo, grandes calvas
r+ : lisa las células lentamente, produciendo calvas pequeñas
Para realizar el cruce, se infecta la cepa 1 de E. coli con los dos genotipos parentales del
fago T2. Este tipo de infección se denomina infección mixta o infección doble (Figura
5-27). Tras un periodo de incubación apropiado, el lisado fágico (la progenie de fagos)
se analiza extendiéndolo en un cultivo bacteriano confluente formado por una mezcla de
las cepas 1 y 2 de E. coli. Hay cuatro tipos de calvas distinguibles (Figura 5-28). Las
calvas grandes indican lisis rápida (r-), y las calvas pequeñas indican lisis lenta (r+). Las
calvas fágicas con el alelo h- infectarán los dos hospedadores, formando una calva clara;
mientras que las calvas fágicas con el alelo h+ solo infectarán un hospedador, formando
una calva turbia. Así, los cuatro genotipos se pueden clasificar fácilmente como parental
(h-r+ y h+r-) y recombinante (h+r+ y h-r-), y la frecuencia de recombinación se puede
calcular de la siguiente manera:
FR = (h+r+) + (h-r-)
número de calvas
(pág. 202)
(pág. 203)
se cruzan dos mutantes rII diferentes, pueden ocurrir unos pocos entrecruzamientos
raros entre los sitios mutados, produciendo recombinantes de tipo salvaje, tal y como se
muestra aquí:
gen rII
parental 1
parental 2
tipo salvaje
doble mutante
A medida que aumenta la distancia entre dos sitios mutados, tales sucesos de
entrecruzamiento son más probables. Así, la frecuencia de los recombinantes rII+ es una
medida de la distancia dentro del gen. (El producto recíproco es un doble mutante e
indistinguible de los parentales).
Benzer utilizó una aproximación ingeniosa para detectar los recombinantes rII+ muy
raros. Utilizó el hecho de que los mutantes rII no infecten una cepa de E. coli llamada
K. Por eso, hizo el cruce rII × rII en otra cepa y entonces sembró el lisado fágico en un
cultivo confluente de la cepa K. Sólo los recombinantes rII+ formarán calvas en este
cultivo. Esta manera de encontrar sucesos genéticos infrecuentes (en este caso, un
recombinante) es un sistema selectivo: sólo los sucesos raros deseados pueden producir
un cierto resultado visible. En contraste, un rastreo es un sistema en el que se escanean
visualmente grandes números de individuos para buscar la poco frecuente “aguja en el
pajar”.
Esta misma aproximación se puede utilizar para cartografiar sitios mutados dentro de
los genes de cualquier organismo del que se puedan obtener grandes números de células
y para los que se puedan distinguir los fenotipos salvaje y mutante. Sin embargo, este
tipo de
(pág. 203)
(pág. 204)
5.5 Transducción
Algunos fagos son capaces de tomar genes bacterianos y llevarlos de una célula
bacteriana a otra: un proceso conocido como transducción. Así, la transducción se
suma a la batería de modos de transferencia de material genómico entre las bacterias –
junto a la transferencia del cromosoma Hfr, la transferencia del plásmido F’, y la
transformación.
Descubrimiento de la transducción
Sin embargo, en este caso, los investigadores también recuperaron recombinantes del
experimento del tubo con forma de U, en el que se impedía la conjugación con un filtro
que separaba los dos brazos. Supusieron que algún agente estaba llevando los genes de
una bacteria a otra. Variando el tamaño de los poros del filtro encontraron que el agente
responsable de la transferencia de genes era del mismo tamaño que un fago conocido de
Salmonella, llamado fago P22. Además, el agente filtrable y P22 eran idénticos en
cuanto a la sensibilidad al antisuero y a la inmunidad a las enzimas hidrolíticas. De este
modo, Lederber y Zinder habían descubierto un nuevo tipo de transferencia génica,
mediado por un virus. Fueron los primeros que llamaron transducción a este proceso.
Como una rareza en el ciclo lítico, a veces las partículas víricas toman genes bacterianos
y los transfieren cuando infectan otros hospedadores. La transducción se ha demostrado
posteriormente en muchas bacterias.
Hay dos tipos de transducción: generalizada o especializada. Los fagos con transducción
generalizada pueden llevar consigo cualquier parte del cromosoma bacteriano, mientras
que los fagos con transducción especializada sólo pueden llevar ciertas partes
específicas.
Mensaje. Los fagos virulentos no pueden llegar a ser profagos, pues siempre lisan una
célula inmediatamente después de entrar. Los fagos atemperados pueden existir dentro
de la célula bacteriana como profagos, permitiendo que sus hospedadores sobrevivan
como bacterias lisogénicas; también pueden producir la lisis bacteriana ocasional.
(pág. 204)
(pág. 205)
Transducción generalizada
Un fago que lleva DNA bacteriano puede infectar otra célula. Entonces, este DNA
bacteriano puede incorporarse en el cromosoma de la célula receptora mediante
recombinación (Figura 5-29). Este tipo de transducción es necesariamente la de tipo
generalizado, ya que se pueden transducir los genes de cualquiera de las partes
fragmentadas del genoma hospedador.
Tanto el fago P1 como el P22 pertenecen a un grupo de fagos que presenta transducción
generalizada. El DNA de P22 se inserta en el cromosoma hospedador, mientras que el
DNA de P1 permanece libre, como un plásmido. Sin embargo, ambos transducen a
través del rellenado defectuoso de la cabeza.
La transducción generalizada se puede utilizar para obtener información del ligamiento
en bacterias cuando los genes están suficientemente juntos como para que un fago
pueda cogerlos y transducirlos en un único trozo de DNA. Por ejemplo, supongamos
que se quiere encontrar la distancia de ligamiento entre met y arg en E. coli. Se puede
hacer crecer el fago P1 en una cepa donante met+ arg+ y posteriormente permitir que los
fagos P1 provenientes del lisado de esta cepa infecten una cepa met- arg-. Primero, se
selecciona un alelo donado, por ejemplo, met+. Entonces, se mide el porcentaje de
colonias met+ que también son arg+. Las cepas que han transducido
(pág. 205)
(pág. 206)
En este experimento, el fago P1 que ha crecido en la cepa donante leu+ thr+ azir infecta
la cepa receptora leu- thr- azis. La estrategia consiste en seleccionar uno o más alelos
donados en el cromosoma receptor y entonces examinar estos transductantes en busca
de la presencia de los alelos no seleccionados. Los resultados se esquematizan en la
Tabla 5-3. El experimento 1 en la Tabla 5-3 nos dice que leu está relativamente cerca de
azi y distante de thr, dejando dos posibilidades:
El experimento 2 nos dice que leu está más cerca de thr que de azi, así que el mapa debe
ser
thr leu azi
(pág. 206)
(pág. 207)
el locus azi porque la cabeza del fago no puede llevar un fragmento de DNA tan grande.
P1 sólo puede cotransducir genes que estén separados menos de 1.5 minutos
aproximadamente, en el mapa cromosómico de E. coli.
Transducción especializada
Un transductor generalizado, como el fago P22, coge al azar fragmentos del DNA
hospedador roto. ¿Cómo son capaces otros fagos, que actúan como transductores
especializados, de llevar sólo ciertos genes hospedadores a las células receptoras? La
respuesta breve es que un transductor especializado se inserta en el cromosoma
bacteriano en una única posición. Cuando sale, se produce un bucle defectuoso (similar
al tipo que producen los plásmidos F’). Por lo tanto, sólo puede tomar y transducir los
genes que están cerca.
Comportamiento del profago El fago tiene efectos inusuales cuando se utilizan las
células lisogénicas con en los cruces. En el cruce de una Hfr no infectada con una
receptora F- lisogénica (Hfr × F- ()), se recuperan fácilmente ex conjugantes F-
lisogénicos con genes Hfr. Sin embargo, en el cruce recíproco Hfr () × F-, los genes
tempranos del cromosoma Hfr se recuperan entre los ex conjugantes, pero los
recombinantes para los genes tardíos no se recuperan. Además, los ex conjugantes
lisogénicos casi nunca se recuperan de este cruce recíproco. ¿Cuál es la explicación?
Las observaciones tienen sentido si el profago se está comportando como lo hace un
locus de un gen bacteriano (es decir, como parte del cromosoma bacteriano). Así, el
profago entraría en la célula F- según el tiempo específico que corresponde con su
posición en el cromosoma. Los genes tempranos se recuperan porque entran antes que el
profago. Los genes tardíos no se recuperan porque la lisis destruye la célula receptora.
De hecho, en los experimentos de apareamiento interrumpido, el profago siempre
entra en la célula F- en un tiempo específico, íntimamente ligado al locus gal.
(pág. 207)
(pág. 208)
explica muy bien la inmunidad de las bacterias lisogénicas, ya que un fago encontraría
inmediatamente un represor y sería inactivado).
Como un profago, siempre se inserta entra la región gal y la región bio del
cromosoma hospedador (Figura 5-33) y, como es de esperar, en los experimentos de
transducción, sólo puede transducir los genes gal y bio.
¿Cómo se lleva los genes vecinos? La explicación radica, de nuevo, en una inversión
imperfecta del mecanismo de inserción de Campbell, como el de la formación de F’. Un
sistema especializado de enzimas codificadas por el fago codifica el suceso de
recombinación entre las regiones específicas de y del cromosoma bacteriano y utiliza
el sitio de fijación de como sustrato. El sistema enzimático sólo permite que se
integre en un punto específico entre gal y bio en el cromosoma (véase Figura 5-33a).
Además, durante la lisis, normalmente el profago se escinde precisamente por el
punto correcto para producir un cromosoma circular de normal, como se ve en la
Figura 5-33b(i). Muy raramente, la escisión puede ser anormal debido a la creación de
un bucle defectuoso. En este caso, el DNA del fago que forma el bucle puede coger un
gen cercano y dejar atrás algunos genes del fago, como se ve en la Figura 5-33(ii). El
genoma del fago resultante es defectivo a causa de los genes que ha dejado, pero
también ha ganado algún gen bacteriano, gal o bio. El DNA anormal que lleva genes
consigo se puede empaquetar en las cabezas de los fagos para producir partículas
fágicas que pueden infectar otras bacterias. Estos fagos se conocen como dgal (-
defectuoso gal) o dbio. En presencia de una segunda partícula fágica normal durante
una infección doble, el dgal se puede integrar en el cromosoma en el sito de fijación de
(Figura 5-33c). De este modo, los genes gal se transducen en este caso al segundo
hospedador.
Mensaje. La transducción ocurre cuando los fagos recién formados adquieren genes del
hospedador y los transfieren a otras células bacterianas. La transducción generalizada
puede transferir cualquier gen hospedador. Ocurre cuando durante el empaquetamiento
del fago se incorpora accidentalmente DNA bacteriano en lugar de DNA del fago. La
transducción especializada es debida a la formación de un bucle defectuoso del profago
en el cromosoma bacteriano, así que el nuevo fago incluye tanto genes fágicos como
bacterianos. El fago transductor sólo puede transferir genes específicos del hospedador.
(pág. 208)
(pág. 209)
(pág. 209)
(pág. 211)
(pág. 211)
(pág. 212)
Resumen
Se pueden encontrar otros tipos de plásmidos además del F. Los plásmidos R llevan
alelos de resistencia a antibióticos, a menudo dentro de un elemento móvil llamado
transposón. La extensión rápida del plásmido causa una resistencia amplia en la
población a fármacos importantes médicamente. Derivados de estos plásmidos naturales
han llegado a ser importantes vectores de clonación, útiles para el aislamiento de genes
y el estudio de todo tipo de organismos.
Los rasgos genéticos también se pueden transferir de una célula bacteriana a otra en
forma de fragmentos de DNA tomados por la célula del ambiente extracelular. Este
proceso de transformación en las células bacterianas fue la primera demostración de que
el DNA es el material genético. Para que ocurra la transformación, el DNA debe ser
incorporado por una célula receptora y entonces debe ocurrir la recombinación entre el
cromosoma receptor y el DNA incorporado.
(pág. 212)
(pág. 213)
Términos clave
Problemas resueltos
Problema resuelto 1. Suponga que una célula fuera incapaz de llevar a cabo la
recombinación generalizada (rec-). ¿Cómo se comportaría esta célula como receptora en
la transducción generalizada y en la especializada? Primero, compare cada tipo de
transducción y, entonces, determine el efecto de la mutación rec- en la herencia de los
genes para cada proceso.
SOLUCIÓN
(pág. 213)
(pág. 241)
Problema resuelto 2. En E. coli cuatro cepas Hfr dan los siguientes marcadores
genéticos, mostrados en el orden que se donan:
Cepa 1: Q W D M T
Cepa 2: A X P T M
Cepa 3 : B N C A X
Cepa 4 : B Q W D M
Todas estas cepas provienen de la misma cepa F+. ¿Cuál es el orden de estos marcadores
en el cromosoma circular de la F+ original?
SOLUCIÓN
Una aproximación de dos pasos funciona bien: (1) se determina el principio subyacente
y (2) se dibuja un diagrama. Aquí, el principio es claramente que cada cepa Hfr dona
marcadores genéticos desde un punto fijado en el cromosoma circular y que los
primeros marcadores son los que se donan con la frecuencia más alta. Como no se
donan todos los marcadores con cada Hfr, sólo los primero marcadores son donados por
cada Hfr. Cada cepa nos permite dibujar los siguientes círculos:
Problema resuelto 3. En un cruce Hfr × F-, leu+ entra como el primer marcador, pero se
desconoce el orden de los otros marcadores. Si Hfr es de tipo salvaje y F - es auxótrofa
para cada marcador en cuestión, ¿cuál es el orden de los marcadores en un cruce donde
se seleccionan los recombinantes leu+ si el 27% son ile+, el 13% son mal+, el 82% son
thr+ y el 1% son trp+?
SOLUCIÓN
Problema resuelto 4. Se realiza un cruce entre una Hfr que es met+ thi+ pur+ y una F-
que es met- thi- pur-. Los estudios de apareamiento interrumpido muestran que met+
entra en el receptor el último, así que se seleccionan los recombinantes met+ en un
medio que contiene suplementos que sólo satisfacen las necesidades para pur y thi.
Estos recombinantes se examinan para la presencia de los alelos thi+ y pur+. Se
encuentran los siguientes números de individuos para cada genotipo:
SOLUCIÓN
(pág. 214)
(pág. 215)
Para calcular la distancia entre met y pur, calculamos el porcentaje de met+ pur- thi-, que
es 52/388 = 15.4 u.m. De forma similar, la distancia entre pur y thi es 6/338 = 1.8 u.m.
SOLUCIÓN
Cada una de estas tres cepas dona los genes por conjugación. En las cepas Hfr y F +, se
donan los genes lac+ del cromosoma hospedador. En la cepa Hfr, el factor F se integra
en el cromosoma de cada célula, así que los marcadores cromosómicos se pueden donar
de manera eficiente, particularmente si un marcador está cerca del sitio de integración
de F y se dona tempranamente. La población de células F + contiene un pequeño
porcentaje de células Hfr, donde F se integra en el cromosoma. Estas células son las
responsables de la transferencia génica mostrada por los cultivos de células F+. En la
transferencia génica mediada por Hfr y F+, la herencia requiere la incorporación de los
fragmentos transferidos por recombinación (recuerde que se necesitan dos
entrecruzamientos) en el cromosoma F-. Por lo tanto, una cepa F- que no puede llevar a
cabo la recombinación no puede heredar los marcadores cromosómicos donados, aún
cuando se transfieran de cepas Hfr o de células Hfr en cepas F +. El fragmento no se
puede incorporar en el cromosoma por recombinación. Como estos fragmentos no
poseen la capacidad de replicarse en la célula F -, se diluyen rápidamente durante la
división celular.
A diferencia de las células Hfr, las células F’ transfieren los genes que van en el factor
F’, un proceso que no requiere la transferencia cromosómica. En este caso, los genes
lac+ están ligados al factor F’ y se transfieren con él a una frecuencia elevada. En la
célula F-, no se necesita la recombinación porque la cepa F’ lac+ puede replicarse y
mantenerse en la población de células F- en división. Por lo tanto, los genes lac+ se
heredan incluso en una cepa rec-.
Problemas
PROBLEMAS BÁSICOS
5. Una genetista microbióloga aísla una nueva mutación en E. coli y desea cartografiar
su posición cromosómica. Utiliza los experimentos de apareamiento interrumpido
con cepas Hfr y los experimentos de transducción generalizada con el fago P1.
Explique por qué cada técnica, por si misma, es insuficiente para una cartografía
precisa.
6. En E. coli, cuatro cepas Hfr donan los siguientes marcadores mostrados en el orden
en que se donan:
Cepa 1: M Z X W C
Cepa 2: L A N C W
Cepa 3: A L B R U
Cepa 4: Z M U R B
7. Se le dan dos cepas de E. coli. La cepa Hfr es arg+ ala+ glu+ pro+ leu+ Ts; la cepa F-
es arg- ala- glu- pro- leu- Tr. Todos los marcadores son nutricionales excepto T, que
determina la sensibilidad o la resistencia al fago T1. El orden de entrada es el que se
da, siendo arg+ el primero que entra en el receptor, y Ts, el último. Encuentra que la
cepa F- muere cuando se expone a penicilina (pens), pero la cepa Hfr no muere
(penr). ¿Cómo localizaría el locus para pen en el cromosoma bacteriano con respecto
a arg, ala, glu, pro y leu? Formule su respuesta en pasos lógicos, bien explicados y
dibuje diagramas específicos cuando sea posible.
8. Se realiza un cruce entre dos cepas de E. coli: Hfr arg+ bio+ leu+ × F- arg- bio- leu-.
Los estudios de apareamiento interrumpido muestran que arg+ entra el último en el
receptor, así que se seleccionan los recombinantes arg+ en un medio que solo
contiene bio y leu. Estos recombinantes se examinan para la presencia de bio+ y
leu+. Se han obtenido los siguientes números de individuos para cada genotipo:
(pág. 215)
(pág.216)
tasa constante. Así, se asume que dos genes separados por 10 minutos cerca del
extremo de origen están separados por la misma distancia física que dos genes
separados por 10 minutos cerca del extremo de fijación de F -. Sugiera un
experimento crítico para comprobar la validez de este supuesto.
10. Una cepa Hfr particular normalmente transmite el marcador pro+ como el último en
la conjugación. En un cruce de esta cepa con una cepa F -, se recuperan algunos
recombinantes pro+ al principio del proceso de apareamiento. Cuando se mezclan
estas células pro+ con células F-, la mayoría de las células F- se convierten en células
pro+ que también llevan el factor F. Explique estos resultados.
11. Las cepas F’ en E. coli provienen de las cepas Hfr. En algunos casos, estas cepas F’
muestran una elevada tasa de reintegración en el cromosoma bacteriano de la
segunda cepa. Además, el sitio de integración a menudo es el sitio ocupado por el
factor sexual en la cepa Hfr original (antes de la producción de las cepas F’).
Explique estos resultados.
12. Usted tiene dos cepas de E. coli, F- strr ala- y Hfr strs ala+, donde el factor F se
inserta cerca de ala+. Idee un procedimiento de rastreo para detectar las cepas que
lleven F’ ala+.
13. Cinco cepas Hfr de A a E provienen de una única cepa F + en E. coli. El siguiente
cuadro muestra los tiempos de entrada de los cinco primeros marcadores en una
cepa F- cuando se utiliza cada cepa en un experimento de conjugación interrumpida:
A B C D E
+ + + + +
mal (1) ade (13) pro (3) pro (10) his (7)
strs (11) his+ (28) met+ (29) gal+ (16) gal+ (17)
ser+ (16) gal+ (38) xyl+ (32) his+ (26) pro+ (23)
ade+ (36) pro+ (44) mal+ (37) ade+ (41) met+ (49)
his+ (51) met+ (70) strs (47) ser+ (61) xyl+ (52)
a. Dibuje un mapa de la cepa F+, indicando las posiciones de todos los genes y sus
distancias de separación en minutos.
b. Muestre el punto de inserción y la orientación del plásmido F en cada cepa Hfr.
c. Al utilizar cada una de estas cepas Hfr, diga qué alelo seleccionaría para obtener
la mayor proporción de ex conjugantes Hfr.
14. Las células de Streptococcus pneumoniae con genotipo strs mtl- se transforman con
DNA donado de genotipo strr mtl+ y (en un experimento separado) con una mezcla
de dos DNAs con genotipo strr mtl- y strs mtl+. La siguiente tabla muestra los
resultados.
16. Usted ha infectado células de E. coli con dos cepas de virus T4. Una cepa es minute
(m), lisis rápida (r) y turbid (tu); la otra es de tipo salvaje para los tres marcadores.
Los productos de la lisis de esta infección se siembran y se clasifican. Las 10 342
calvas resultantes se distribuyen entre ocho genotipos, como sigue:
17. Mediante el uso de P22 como un fago de transducción generalizada crecido en una
bacteria donante pur+ pro+ his+, se infecta e incuba una cepa receptora con genotipo
pur- pro- his-. Después, los transductantes para pur+, pro+ e his+ se seleccionan
individualmente en los experimentos I, II y III, respectivamente.
I II III
- -
pro his 87% pur his-
-
43% pur pro-
-
21%
pro+ his- 0% pur+ his- 0% pur+ pro- 15%
- + - +
pro his 10% pur his 55% pur- pro+ 60%
pro+ his+ 3% pur+ his+ 2% pur+ pro+ 4%
¿Cuál es el orden de los genes bacterianos?
(pág. 216)
(pág. 217)
19. Se sabe que una cepa bacteriana ade+ arg+ cys+ his+ leu+ pro+ es lisogénica para un
fago descubierto recientemente, pero el sitio del profago no se conoce. El mapa
bacteriano es
La cepa lisogénica se utiliza como fuente del fago, y los fagos se añaden a una cepa
bacteriana con el genotipo ade- arg- cys- his- leu- pro-. Tras una corta incubación, se
siembran muestras de estas bacterias en seis medios distintos, con los suplementos
indicados en la siguiente tabla. La tabla también muestra si las colonias se
observaron en varios medios.
(pág. 217)
(pág. 218)
24. Un experimento de transducción generalizada utiliza una cepa metE+ pyrD+ como
donante y metE- pyrD- como receptora. Se seleccionan los transductantes metE+ y se
examinan para el alelo pyrD+. Se obtienen los siguientes números:
metE+ pyrD- 857
metE+ pyrD+ 1
¿Estos resultados sugieren que estos loci están íntimamente ligados? ¿Qué otras
explicaciones hay para el único “doble”?
25. Se infectó una cepa argC- con un fago transductante y se utilizó el lisado para
transducir receptores metF- en un medio que contenía arginina pero no metionina.
Los transductantes metF+ se examinaron para la necesidad de arginina: la mayoría
era argC+ pero se encontró que un pequeño porcentaje era argC-. Dibuje diagramas
para mostrar el posible origen de las cepas argC+ y argC-.
26. Cuatro cepas de E. coli con genotipo a+ b- se numeran 1, 2, 3 y 4. Cuatro cepas con
genotipo a- b+ se numeran 5, 6, 7 y 8. Se mezclan los dos genotipos en todas las
posibles combinaciones y (tras la incubación) se siembran para determinar la
frecuencia de los recombinantes a+ b+. Se obtienen los siguientes resultados, donde
M = muchos recombinantes, B = Bajo número de recombinantes, y 0 = no
recombinantes:
1 2 3 4
5 0 M M 0
6 0 M M 0
7 B 0 0 M
8 0 B B 0
De acuerdo con estos resultados, asigne un tipo sexual (ya sea Hfr, F + o F-) a cada
cepa.
27. Una cepa Hfr con genotipo a+ b+ c+ d- strs se aparea con una cepa hembra con
genotipo a- b- c- d+ strr. El cultivo se agita vigorosamente en distintos tiempos para
separar las parejas que se aparean. Posteriormente se siembran las células en agar de
los siguientes tres tipos, donde el nutriente A permite el crecimiento de las células
a-; el nutriente B, de las células b-; el nutriente C, de las células c-, y el nutriente D,
de las células d- (un signo más indica la presencia de estreptomicina o de un
nutriente, y un signo menos indica su ausencia).
(pág. 218)
(pág. 219)
Tiempo de muestra Número de colonias en agar del tipo
(minutos) 1 2 3
0 0 0 0
5 0 0 0
7,5 100 0 0
10 200 0 0
12,5 300 0 75
15 400 0 150
17,5 400 50 225
20 400 100 250
25 400 100 250
28. En el cruce
29. Se realiza un experimento de transformación con una cepa donante que es resistente
a cuatro fármacos: A, B, C y D. La receptora es sensible a los cuatro fármacos. La
población celular receptora considerada se divide y se siembra en medios que
contienen varias combinaciones de los fármacos. La siguiente tabla muestra los
resultados.
a. Uno de los genes está obviamente bastante lejos de los otros tres, que parecen
estar estrechamente ligados. ¿Cuál es el gen distante?
b. ¿Cuál es el orden probable para los tres genes que están estrechamente ligados?
30. Usted tiene dos cepas de que pueden lisogenizar E. coli; sus mapas de ligamiento
son los siguientes:
Cepa X Cepa Y
31. Usted tiene tres cepas de E. coli. La cepa A es F’ cys+ trp1/cys+ trp1 (es decir, tanto
F’ como el cromosoma llevan cys+ y trp1, un alelo que hace que se requiera
triptófano). La cepa B es F- cys- trp2 Z (esta cepa necesita cisteína para crecer y
lleva trp2, otro alelo que causa una necesidad de triptófano; la cepa B es lisogénica
para
(pág. 219)
(pág. 220)
32. Se utiliza un fago con transducción generalizada para transducir una cepa receptora
a- b- c- d- e- de E. coli con una donante a+ b+ c+ d+ e+. El cultivo receptor se siembra
en varios medios con los resultados que se muestran en la siguiente tabla. (Note que
a+ indica una necesidad del nutriente A, y así sucesivamente). ¿Qué puede concluir
sobre el ligamiento y el orden de los genes?
33. En 1965, Jon Beckwith y Ethan Signer concibieron un método para obtener fagos
con transducción especializada que llevaran la región lac. Sabían que el sitio de
integración, llamado att80, para el fago atemperado Ф80 (un pariente del fago )
estaba cerca de tonB, un gen que confiere resistencia al fago virulento T1:
tonB att80
Este resultado situó la región lac cerca del sitio de integración del fago Ф80.
Describa los pasos siguientes que los investigadores debieron seguir para aislar las
partículas con transducción especializada del fago Ф80 que llevaban la región lac.
34. E. coli de tipo salvaje ingiere y acumula un determinado colorante alimentario rojo,
que hace que las colonias sean de color rojo sangre. Se utilizó mutagénesis mediante
transposón y se sembraron las células en colorante alimentario. La mayoría de
colonias eran rojas, pero algunas colonias ingieren el colorante y eran blancas. En
una colonia blanca, se secuenció el DNA de alrededor del transposón insertado
mediante el uso de un cebador de la replicación del DNA idéntico a una parte del
extremo de la secuencia del transposón, y se encontró que la secuencia adyacente al
transposón correspondía a un gen de función desconocida llamado atoE, que iba
desde la posición 2.322 hasta la 2.324 Mb del mapa (numerado desde una posición
cero arbitraria). Proponga una función para atoE. ¿Qué proceso biológico se podría
investigar de esta forma y qué otros tipos de colonias blancas se esperarían?
PIES DE FIGURA
Figura inicial
Células bacterianas en división. (Dennis Kunkel Microscopy, Inc.).
Figura 5-1 Los frutos de la tecnología del DNA recombinante son una realidad por
la genética bacteriana
Los resultados espectaculares de la moderna tecnología del DNA, como la
secuenciación del genoma humano, fueron posibles debido a que la genética bacteriana
condujo a la invención de vectores de manipulación de DNA eficientes. (Science, vol.
291, nº 5507 (16 Febrero 2001), págs. 1145-1434. Imagen de Ann E. Cutting).
Figura 5-3 Colonias bacterianas, cada una deriva de una única célula
Los fenotipos bacterianos se pueden determinar en sus colonias. Un stock de células
bacterianas puede crecer en medio líquido que contenga nutrientes, y posteriormente se
puede extender un pequeño número de células de la suspensión líquida en medio sólido
con agar. Cada célula formará una colonia. Todas las células de una colonia tienen el
mismo genotipo y fenotipo.
Figura 5-26 Una calva es un área clara donde todas las bacterias se han lisado por
fagos
Mediante la repetición de infección y producción de progenie de fagos, un único fago
produce un área clara, o calva, en el cultivo confluente opaco de células bacterianas.
(Barbara Morris, Novagen).
Figura 5-27 Cruce de fagos realizado por infección doble de la célula hospedadora
con fagos parentales
Figura 5-37 Las proporciones de los mapas genéticos y físicos son similares pero no
idénticas
Un alineamiento de los mapas genéticos y físicos. (a) Marcadores en el mapa genético
de 1990 en la región cerca de 60 y 61 minutos. (b) La posición exacta de cada gen,
basada en la secuencia completa del genoma de E. coli. (No se ha nombrado cada gen
en este mapa, por simplicidad). Las cajas alargadas son genes y genes putativos. Cada
color representa un tipo distinto de función. Por ejemplo, el rojo indica funciones
regulatorias, y el azul oscuro indica funciones de replicación, recombinación y
reparación del DNA. Las líneas entre los mapas en las partes a y b conectan el mismo
gen en cada mapa. (F. R. Blattner et al., “The Complete Genome Sequence of
Escherichia coli K-12”, Science, vol. 277 September 5, 1997, pp. 1453-1462. Imagen
cortesía de Dr. Guy Plunkett III).
Figura 5-38 La mutagénesis por transposón se puede utilizar para cartografiar una
mutación en la secuencia genómica
La inserción de un transposón inserta una mutación en un gen de posición y función
desconocida. El segmento que sigue al transposón se replica, se secuencia y se se le
busca su concordancia con un segmento de la secuencia completa del genoma.
Parcheados de las figuras
Figura 5-3 Colonias bacterianas, cada una deriva de una única célula
1. Suspensión de células bacterianas
2. Extensión de la suspensión en una placa de Petri con gel de agar
3. Incubación de 1 a 3 días
4. Placa de Petri con gel de agarosa
5. Células individuales (no visibles a simple vista)
6. Colonias visibles (cada una un clon de la célula individual correspondiente)
Figura 5-26 Una calva es un área clara donde todas las bacterias se han lisado por
fagos
1. Áreas claras, o calvas
Figura 5-27 Cruce de fagos realizado por infección doble de la célula hospedadora
con fagos parentales
1. E. coli cepa 1
Figura 5-38 La mutagénesis por transposón se puede utilizar para cartografiar una
mutación en la secuencia genómica
1. Célula de tipo salvaje
2. Transposón
3. Fenotipo mutante inducido por la inserción del transposón
4. Síntesis cebador
5. Identificación del gen completo a partir de la secuencia genómica
TABLAS