Facultad de Ciencias Básicas Sociales y TALLER 3

Humanas AMINOÁCIDOS
BIOQUÍMICA Abril de 2020

TALLER AMINOÁCIDOS Y PROTEÍNAS

1. Hallar el punto isoeléctrico de los siguientes aminoácidos mostrando las cargas en la estructura y las cargas
netas de la especie zwitterion. Compare los resultados con las tablas propuestas en los videos.

a) Valina

2,32+ 9,62
pl= =5,97
2
b) Lisina

8,95+10,53
pl= =9,74
2
c) histidina
 6,00+9,17
pl= =7,58
2
d) aspártico

2,09+3,86
pl= =2,97
2
e) tirosina

2,20+9,11
pl= =5,65
2

2. Hallar el punto isoeléctrico de los siguientes péptidos mostrando las cargas en la estructura y las cargas netas
de la especie zwitterion. Compare los resultados con las tablas propuestas en los videos.

a) Asp–Phe–Arg–Lys–Thr–Gly–His

N- Asp–Phe–Arg–Lys–Thr–Gly–His-C
 pH Carga Carga Carga Carga Carga Carga Carga Carga Carga Carga
N Asp Phe Arg Lys Thr Gly His C neta
+1 0 0 +1 +1 0 0 +1 0 +4
COOH 1,82 +1 0 0 +1 +1 0 0 +1 -1 +3
Asp 3,86 +1 -1 0 +1 +1 0 0 +1 -1 +2
His 6,00 +1 -1 0 +1 +1 0 0 0 -1 +1
Asp 9,82 0 -1 0 +1 +1 0 0 0 -1 0
Lys 10,53 0 -1 0 +1 0 0 0 0 -1 -1
Arg 12,48 0 -1 0 0 0 0 0 0 -1 -2

10,53+ 9,82
pl= =10,175
2
b) Thr–Pro–Asp–Glu–Met–Trp–Arg

N-Thr–Pro–Asp–Glu–Met–Trp–Arg-C

pH Carga Carga Carga Carga Carga Carga Carga Carga Carga Carga
N Thr Pro Asp Glu Met Trp Arg C neta
+1 0 0 0 0 0 0 +1 0 +2
COOH 2,17 +1 0 0 0 0 0 0 +1 -1 +1
Asp 3,86 +1 0 0 -1 0 0 0 +1 -1 0
Glu 4,25 +1 0 0 -1 -1 0 0 +1 -1 -1
N 9,62 0 0 0 -1 -1 0 0 +1 -1 -2
Arg 12,48 0 0 0 -1 -1 0 0 0 -1 -3

3,86+4,25
pl= =4.055
2
c) Leu–Glu–Gln–His–Val–Phe–Glu
 N-Leu–Glu–Gln–His–Val–Phe–Glu-C

pH Carga Carga Carga Carga Carga Carga Carga Carga Carga Carga
N Leu Glu Gln His Val Phe Glu C neta
+1 0 0 0 +1 0 0 0 0 +2
COOH 2,19 +1 0 0 0 +1 0 0 0 -1 +1
Glu 4,25 +1 0 -1 0 +1 0 0 -1 -1 -1
His 6,00 +1 0 -1 0 0 0 0 -1 -1 -2
N 9,64 0 0 -1 0 0 0 0 -1 -1 -3

3. Hallar el punto isoeléctrico de los siguientes péptidos mostrando las cargas en la estructura y las cargas netas de
la especie zwitterion. Compare los resultados con las tablas propuestas en los videos.

4. ¿Cómo se clasifican los péptidos y las proteínas (Diferencie cada clasificación)?

Clasificación de los péptidos

 Oligopeptididos: Menos de 10 AA
 Polipéptidos: Entre 10 – 100 AA
 Proteínas: Mas de 100 AA

Clasificación de las Proteínas

 Forma:
- Fibrosas: Forma largos filamentos de proteína, de forma cilíndricas. Tienen funciones estructurales o de
almacenaje. Son resistentes e insolubles al agua.
- Globulares: Se pliegan en forma esférica y forman una estructura más compleja. Se diferencian de las
fibrosas por ser más o menos solubles en disoluciones acuosas (donde forman suspensiones coloidales).
 Solubilidad:
- Albuminas
- Globulinas
- Prolaminas
- Gluteinas
 Composición:
- Simples (Holoproteinas): Al ser hidrolizadas producen solamente aminoácidos simples
- Complejas (Heteroproteinas): Al ser hidrolizadas producen aminoácidos y aparte otras sustancias que no
son proteínas
  Estructura:
- Primaria: Secuencia de AA
- Secundarias: Formación de Hélices α y Laminas β
- Terciaria: Se van a formar muchas más interacciones, involucradas las cadenas R de cada aminoácido.
- Cuaternaria: Formada por dos o más polipéptidos

5. ¿Por qué es importante conocer la clasificación de las proteínas en cuanto a su estructura?

Porque en cuanto a su estructura las proteínas se diferencian en gran manera, además dependiendo de su estructura
están van a cumplir diferentes funciones.

6. Describa algunas funciones de las proteínas.

Funciones de las proteínas

 Energéticas
 Contráctil
 Hormonal
 Biocatalizadoras

7. ¿Qué es la serotonina?

La serotonina es una sustancia química que tiene una amplia variedad de funciones en el cuerpo humano. A veces se le
llama el químico feliz, porque contribuye al bienestar y la felicidad. El nombre científico de la serotonina es 5-
hidroxitriptamina o 5-HT. Se encuentra principalmente en el cerebro, los intestinos y las plaquetas de la sangre.

La serotonina se usa para transmitir mensajes entre las células nerviosas, se piensa que se activa para contraer músculos
lisos y contribuye al bienestar y la felicidad, entre otras cosas. Como precursor de la melatonina, ayuda a regular los
ciclos de sueño-vigilia del cuerpo y el reloj interno.

8. ¿Por qué las estructuras antiparalelas son más estables que las estructuras paralelas en las estructuras
láminas Beta?

Son más estable las antiparalelas porque son más compactas y los puentes de Hidrogeno estarán más juntos. Mientras
que las paralelas los puentes de Hidrogeno están más muy alejados por lo cual es fácil de destruir.

9. ¿Qué otras fuerzas a parte de los puentes de hidrógeno, intervienen en la estructura terciaria?

Las interacciones pueden ser: Van der Waals, Interacciones salinas, puentes de hidrogeno, puentes disulfuro, grupos
polares (hidrofilicas) o interacciones no polares (hidrofóbicas).

10. ¿Por qué los aminoácidos apolares se sitúan hacia el interior de la estructura terciaria en un medio acuoso
(AGUA)?

las cadenas laterales con carácter apolar se orientan hacia el interior de la molécula evitando las interacciones con el
disolvente, y forman un núcleo compacto con carácter hidrofóbico. las cadenas laterales de los aminoácidos polares se
localizan en la superficie de la molécula, interaccionando con el agua y permitiendo que la proteína permanezca en
disolución

11. ¿Mencione 2 formas de desnaturalizar una proteína?

Si agregamos a una proteína en un pH acido va a ser que todas esas conformaciones se rompan. Esto va relacionado a lo
que es el pKa de cada aminoácido.
Polaridad de los disolventes, si se agrega un solvente apolar los grupos apolares que se encontraban dentro de la
estructura van a comenzar a salir de adentro hacia afuera.

12. ¿En qué consiste el método Kjeldahl?

El procedimiento es directo, el material necesario es muy simple (aparato de destilación Kjeldahl), y es fácilmente
adaptable al análisis rutinario de un gran número de muestras. Es el método estándar para la determinación del
contenido proteico en grano, harinas, carnes, y en general, en materiales biológicos.

En el método Kjeldahl, la muestra se descompone en caliente medio sulfúrico, en presencia de un agente reductor
catalizador (mercurio, cobre o selenio). También suele adicionarse una sal neutra para aumentar el punto de ebullición
de la disolución de ácido sulfúrico. De esta forma que aumenta temperatura de trabajo, con lo cual se favorece la
descomposición. El tratamiento transforma el nitrógeno de la muestra en NH4+. La posterior adición de una base fuerte
libera el NH3, que es arrastrado hasta un frasco colector por destilación en corriente de vapor.

13. Qué tipos de reacciones colorimétricas existen para la identificación de aminoácidos y proteínas. Consulte las
reacciones y los reactivos utilizados en cada uno de ellos.

Pruebas colorimétricas para aminoácidos y proteínas

 Prueba de Ninhidrina:

Es un poderoso agente reactivo común para visualizar las bandas de separación de aminoácidos por cromatografía o
electroforesis. Reacciona con todos los aminoácidos alfa cuyo pH se encuentra entre 4 y 8, dando una coloración que
varía de azul a violeta intenso. Esta prueba es positiva tanto para proteínas como para aminoácidos. En aquellos casos
donde no da positiva la prueba de Biuret, da positiva la de ninhidrina, e indica que no hay proteínas, pero sí hay
aminoácidos libres. De un pH 4 y 8.

Tipo de reacción: De sustitución, ya que como se ve en la imagen la amina pierde sus hidrógenos y el reactivo de
Ninhidrina pierde sus dos moléculas de OH, así el aminoácido se une a la molécula de ninhidrina.

 Prueba de Biuret

Indica la presencia de proteínas, péptidos cortos y otros compuestos con dos o más enlaces peptídicos en sustancias de
composición desconocida. Está hecho de hidróxido potásico (KOH) y sulfato cúprico (CuSO4), junto con tartrato de sodio
y potasio (KNaC4O6·4H2O). El reactivo cambia a violeta en presencia de proteínas, y vira a rosa cuando se combina con
polipéptidos de cadena corta. El hidróxido de potasio no participa en la reacción, pero proporciona el medio alcalino
necesario para que tenga lugar.
Tipo de reacción: La reacción debe su nombre al Biuret, una molécula formada a partir de dos de urea (H 2N-CO-NH-CO-
NH2), que es la más sencilla que da positiva esta reacción. La presencia de proteínas en una mezcla se puede determinar
mediante la reacción del Biuret. El reactivo de Biuret contiene CuSO 4 en solución acuosa alcalina (de NaOH o KOH). La
reacción se basa en la formación de un compuesto de color violeta, debido a la formación de un complejo de
coordinación entre los iones Cu 2+ y los pares de electrones no compartidos del nitrógeno que forma parte de los enlaces
peptídicos presentando un máximo de absorción a 540 nm.

14. Suponga que usted quiere saber cualitativamente y cuantitativamente la cantidad de proteína y aminoácidos
que tiene un huevo, ¿Qué procedimiento emplearía y explique cada uno de los pasos?

Cualitativamente utilizaría la prueba de Biuret para detectar las proteínas