Tarea No.

1 al 3er parcial

Predicción de pases transmembranles

Usted ya cuenta con un modelo preliminar de estructura secundaria de su proteína

• a) Ahora haga el análisis de hidrofobicidad con los programas de Expasy y

establezca por consenso los cruces transmembranales.
• HMMTOP- Prediction of transmembrane hélices (Hungarian Academy of Sciences)
http://www.enzim.hu/hmmtop/html/adv_submit.html
• TMHMM-Prediction of transmembrane hélices in proteins (CBS; Denmark)
http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM-2.0/
• Tmpred- Prediction of transmembrane regions and proteins orientation (EMBnet-
CH) https://embnet.vital-it.ch/software/TMPRED_form.html

Hacer lo mismo con los programa:

• Quick2D https://toolkit.tuebingen.mpg.de/tools/quick2d
• BCL::JuFo9D Server http://www.meilerlab.org/index.php/servers/show?s_id=5

Programa con plantillas para realizar el modelo: Biorender https://biorender.com/

Realice un modelo o dibulo de su estructura proteica de acuerdo a los resultados que le de

cada una de las bases de datos.

Antes de enviar su tarea al siguiente correo preguntese lo siguiente:

1.- ¿Mi trabajo tiene estructura y orden?
2.- ¿Realice el estudio en cada uno de las 5 bases de datos y coloque evidencia en mi
trabajo?
3. ¿Hay una explicación de cada grafico y el resultado que obtuve?
4.- ¿Realice un gráfico al final de mi trabajo con la estructura trasnmembranal de mi
proteina?

Si cumples con los 4 puntos y estas seguro de tu trabajo, envialo al correo:

hectorhugo_vargas@my.uvm.edu.mx

Tienes hasta el sábado 2 de mayo, hasta las 23:59h para enviarlo. Si tienes dudas puedes
preguntar.

Regla: “CRUCE TRANSMEMBRANAL MATA ESTRUCTURA SECUNDARIA” y se considera alfa-

hélice trasnmembranal (OBVIAMENTE ESTO NO APLICA PARA BARRILES BETA).