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Tarea 2
UNIDAD 2: TAREA 2
Enzimología y Bioenergética
ESTUDIANTES
Jonathan Varela
TUTORA:
BIOQUIMICA
GRUPO: 201103_40
UNAD
OCTUBRE DE 2019
Ejercicio 1. Enzimología
Tipos de
Tipo de Enzima Función 3 ejemplos
inhibición
enzima, que no
puede recuperar
su actividad.
-reversible:
cuando el
complejo
enzima-inhibidor
puede disociarse
y volver a
actuar.
Existen dos tipos
Inhibición
Competitiv
a donde el
inhibidor
compite
con el
sustrato
por el
centro
activo
Inhibición
No
competitiv
a donde el
inhibidor
no compite
con el
sustrato ya
que no
interaccion
a con el
centro
activo.
Factor Explicación
Referencias
Ejercicio 2. Bioenergética
Reacción de óxido-
Explicación Ejemplo
reducción
hidruro al anillo de
nicotinamida.
Clasifique
Reacci
como
ón del
Energía libre endergóni
ciclo Grafique la reacción
de Gibs ca o
de
exergónic
Krebs
a
Piruvat El piruvato es Exergónica
oa oxidado a un
Acetil- grupo acetilo
CoA de dos
carbonos
(acetato) y se
libera CO2,
parte de la
energía de
esta oxidación
es captada
por la
reducción del
NAD+ a
NADH + H+,
algo de la
energía
restante es
almacenada
temporalment
e por la
combinación
del grupo
acetilo con
CoA formando
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acetil CoA. El
destino del
piruvato
depende de la
carga energía
de la célula.
En células o
tejidos con
alta carga de
energía el
piruvato es
dirigido hacia
la
gluconeogéne
sis, pero
cuando la
carga de
energía es
baja, el
piruvato se
oxida a CO2 y
agua en el
ciclo ATC, con
la generación
de 15
equivalentes
de ATP por
cada piruvato.
Las
actividades
enzimáticas
del ciclo ATC
(y la
fosforilación
oxidativa) se
localizan en la
mitocondria.
Cuando el
piruvato es
transportado
a la
mitocondria,
este
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encuentra dos
enzimas
metabólicas
principales: la
piruvato
carboxilasa
(una enzima
de la
gluconeogéne
sis) y la
piruvato
deshidrogena
da (PDH), la
primera
enzima del
completo
PDH. Con una
carga de
energía alta
en la célula la
coenzima A
(CoA) esta
altamente
acilada,
principalment
e como
acetil.CoA, y
capaz de
activar
alostéricamen
te a la
piruvato
carboxilasa
dirigiendo al
piruvato hacia
la
gluconeogéne
sis. Cuando la
carga de
energía es
baja la CoA
no esta
acilada, la
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piruvato
carboxilasa
esta inactiva,
y el piruvato
es
metabolizado
preferenteme
nte por la vía
del PDHc y las
enzimas del
ciclo del ATC
a CO2 y agua.
El NADH y
FADH2
reducidos que
se general
durante las
reacciones
oxidativas
pueden
entonces ser
utilizados
para dirigir la
síntesis de
ATP por la vía
de la
fosforilación
oxidativa.
Referencias
Ejercicio 1. Enzimología
Tipo de
Función 3 ejemplos Tipos de inhibición
Enzima
Hidrolasas Catalizar las 1. Peptidasas Inhibición
roturas de las 2. Esterasas reversible
macromolécula 3. Glucosidasa
s s
Catálasis por
Catálasis Covalente
Proximidad
Atrae a los dos reactivos a
Se crea un enlace
una proximidad adecuada
Característica covalente transitorio
dentro del centro activo,
1 entre la enzima y el
para aumentar la
sustrato.
velocidad.
Forman un reactivo
intermediario, a través
Característica Su atracción se considera
de la unión covalente
2 una Trampa de Entropía.
entre la enzima y el
sustrato.
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Factor Explicación
Efecto de
Concentració
n del
Sustrato
Referencias
https://webs.ucm.es/info/btg/personales/jvsgago/fundaments%20de
%20biocatalis.pdf
Tena Aldave, M., & Jorrín Novo, J. (s.f.). Universidad D Cordoba.
Obtenido de Universidad D Cordoba:
https://www.uco.es/dptos/bioquimica-biol-
mol/pdfs/32%20INVERTASA%20CINETICA.pdf
Ejercicio 2. Bioenergética
Ejercicio 2 .1 Conservación de la energía de las oxidaciones biológicas
Reacción de
óxido- Explicación Ejemplo
reducción
FADH a El FAD es una molécula En la última parte del
FADH2 compuesta por una unidad de ciclo de Krebs, Como
Riboflavina unidad a un ocurre en otras rutas,
pirofosfato, el cual se adhiere a por ejemplo en la
una ribosa unida a una beta oxidación de
adenina. los ácidos grasos, tal
conversión ocurre
Es una coenzima que mediante tres pasos:
interviene como dador o una primera
aceptor de electrones o oxidación, una
protones (reductor) en hidratación y una
reacciones metabólicas redox, segunda oxidación.
su estado oxidado se reduce a Estos tres pasos,
FADH2 al aceptar dos átomos además de regenerar
de hidrógeno; es decir, al el Oxalacetato,
reducirse capta dos protones y permiten la extracción
dos electrones, lo que permite ulterior de energía
que intervenga como dador de mediante la formación
energía y/o poder reductor de de FADH2 y NADH.
metabolismo [ CITATION Aca10 \l
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endergónic
Krebs Gibbs ao
exergónica
Oxaloacetat Es el primer paso para Su La reacción
o a Citrato llevar a cabo el ciclo de ∆ G °=−31,4 kJes
'
/mol
Krebs, el cual consiste: sumamente
exoergónica,
El sitio activo de la enzima, lo que indica
activa el acetil-CoA para que es un
hacerlo afín a un centro proceso
carbonoso del oxalacetato. irreversible.
Como consecuencia de la
unión entre las dos
moléculas, el grupo tioéster
(CoA) se hidroliza,
formando así la molécula
de citrato [ CITATION Gui \l
3082 ].
Referencias
https://www.uco.es/dptos/bioquimica-biol-
mol/pdfs/32%20INVERTASA%20CINETICA.pdf
Ejercicio 1. Enzimología
Tipo de Tipos de
Función 3 ejemplos
Enzima inhibición
Los
inhibidores no
competitivos
se unen a la
enzima en
puntos
distintos al
centro activo,
su unión
incapacita a la
enzima para
desarrollar su
acción
catalítica, y en
este caso, el
aumento en la
concentración
de sustrato no
revierte la
inhibición.
Inhibidor
Acompetitivo
es parecido al
no
competitivo,
se une en un
sitio diferente
del sitio
activo. Sin
embargo, el
inhibidor
acompetitivo
sólo se une
con el
complejo ES:
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E + S ES E +
P + I ESI
Factor Explicación
Referencias
http://www.botanica.cnba.uba.ar/Pakete/6to/Enzimas.htm
Ejercicio 2. Bioenergética
Reacción
de
óxido- Explicación Ejemplo
reducció
n
ADP a La fosforilación oxidativa La glucólisis o glicólisis es la
ATP es un proceso metabólico ruta metabólica encargada de
que utiliza energía oxidar la glucosa con la
liberada por la oxidación finalidad de obtener energía
de nutrientes para para la célula. Consiste en 10
producir adenosina reacciones enzimáticas
trifosfato (ATP). Se le consecutivas que convierten a
llama así para distinguirla la glucosa en dos moléculas
de otras rutas que de piruvato, el cual es capaz
producen ATP con menor de seguir otras vías
rendimiento, llamadas "a metabólicas y así continuar
nivel de sustrato". Se entregando energía al
calcula que hasta el 90 % organismo.
de la energía celular en
forma de ATP es producida
de esta forma.
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Clasifique
Reacció como
Energía
n del endergóni
Grafique la reacción libre de
ciclo de ca o
Gibs
Krebs exergónic
a
C. ∆ Gº=0 kJ /molEndergónic
Succinat a
oa
Fumarat
o
Referencias
Ejercicio 1. Enzimología
que interactúen.
Factor Explicación
D). Efecto de
la temperatura Las enzimas presentan un comportamiento dual
respecto a la temperatura. En el rango 5ºC - 50ºC la
actividad aumenta, ya que la velocidad de reacción se
incrementa. A temperaturas superiores (60ºC a 80ºC)
la gran mayoría de las enzimas se inactivan debido a
la desnaturalización que sufren. Una excepción a este
comportamiento la constituyen las enzimas de las
bacterias termófilas que se encuentran en hábitats
muy cálidos, como son las fuentes termales. Para
cada enzima existe una temperatura óptima en la cual
su actividad es máxima.
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Referencias
Morton, D. R. R. K. (1951, 3 septiembre). Transferasas:
procesos, funciones, nomenclatura y subclases. Recuperado 7
abril, 1953, de https://www.lifeder.com/transferasas/
L, E., Y, R., & RAVELO, S. (2000a, 2 mayo). INHIBIDORES DE
LAS ENZIMAS IFOPOL Y SU IMPACTO EN LA INDUSTRIA.
Recuperado 7 abril, 2002, de
http://www.actaf.co.cu/revistas/ATAC/ATAC1-2006/9.pdf
https://www.academia.edu/13335632/Harper._Bioquimca_Ilustr
ada
T, M., V, J., & N, J. (2002, 2 enero). Estudio cinético de la
actividad invertasa de levadura de panadería..
Recuperado 2 marzo, 2004, de
https://www.uco.es/dptos/bioquimica-biol-
mol/pdfs/32%20INVERTASA%20CINETICA.pdf
Torres, G. (2011). Capítulo 3. Módulo de bioquímica. Universidad
Nacional Abierta y a distancia UNAD (pp. 57- 75). Recuperado
de http://repository.unad.edu.co/bitstream/10596/9281/1/201103_M
odulo_bioquimica_1_2013%20_final_45_leccione_WORD.pdf
Ejercicio 2. Bioenergética
- cómo se da la
reacción química de
GDP a GTP
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- conversión
de Succinil CoA a
succinato que es
donde participa la
coenzima
Clasifique
Reacción
Grafique la Energía libre como
del ciclo de
reacción de Gibs endergónica o
Krebs
exergónica
D). alfa- Después de la Es una
cetoglutarat conversión del EXERGÓNICA
o a Succinil isocitrato en α- ya que actúa
COA cetoglutarato un sistema
se produce una multienzimático
segunda , llamado
reacción de complejo alfa-
descarboxilació cetoglutarato
n oxidativa, deshidrogenasa
que lleva a la (reguladora,
formación de inhibida por
succinil CoA. La NADH+H+) que
descarboxilació posee 3
n oxidativa del enzimas y 5
α- coenzimas.
chetoglutarato
es muy
parecida a la
del piruvato,
otro α-
cetoácido.
Referencias
Letra seleccionada: D
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Ejercicio 1. Enzimología
Tipo Funció
3 ejemplos Tipos de inhibición
de n
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Enzim
a
Las LIASAS DE
liasas CARBONO INHIBIDOR COMPETITIVO
son OXÍGENO: Específicamente al sitio activo,
enzima Enzimas que en donde compite con el
s que rompen enlaces sustrato en un proceso dinámico
elimina carbono-oxígeno de equilibrio. La inhibición es
LIASA n como las hidro- reversible por el sustrato
S. molécul liasas con la Vmax no cambia; el Km esta
as de eliminación de incrementado, definido por la
agua, agua , las que [S] que se requiere para llegar a
dióxido actúan sobre la ½ de la actividad máxima de
de polisacáridos con a reacción
carbono la eliminación de
y alcohol ,las que
amonía actúan sobre
co sustratos
mediant fosfatados con la
e eliminación de
ruptura fosfato y
de algunas
enlaces
. Los LIASAS DE
proceso CARBONO-
s de NITRÓGENO INHIBIDOR NO
este Eenzimas que COMPETITIVO
tipo liberan amoniaco Se une a la E o al complejo ES
están o uno de sus en un sitio diferente al sitio
vincula derivados, con la activo. La unión al sustrato no se
dos a la formación de un altera, pero el complejo ESI no
aparició doble enlace o un puede producir producto. La
n de la anillo. Algunas inhibición no puede revertirse
diabete catalizan la por el sustrato
s y la eliminación real La Km no está alterada. la
ansieda del amoniaco, Vmax disminuye
d. amina o amida, proporcionalmente a la
por ejemplo: concentración del inhibido
LIASAS DE
CARBONO-
HALÓGENO
Se estableció
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originalmente
sobre la base de
la enzima de
eliminación de
ácido clorhídrico
(HCl) a partir de
1,1,1-tricloro-
2,2-bis-etano
(DDT).
LIASAS DE
CARBONO-
AZUFRE
Las enzimas INHIBIDOR QUE NO
eliminan COMPITE
ácido Se une solamente al complejo
ES en sitios distintos al
Liasas de catalítico. La unión del sustrato
carbono-fósforo modifica la estructura de la
enzima, haciendo posible la
LIASAS DE unión del inhibidor. La inhibición
CARBONOCARB no puede revertirse por el
ONO Esta sustrato
subclase incluye
enzimas que Aparentemente la Vmax esta
rompen enlaces disminuida; la Km esta
carbono-carbono disminuida, definida por la [S]
como las que se requiere para llegar a la
descarboxilasas , ½ de la actividad máxima de a
los aldehído- reacción
liasas catalizan la
reversión de una
condensación
aldólica y los
oxo-ácido-liasas,
que catalizan la
ruptura de un
ácido 3-hidroxi ,
o las reacciones
inversas:
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CATÁLISIS
ÁCIDO- CATÁLISIS COVALENTE
BÁSICA
La enzima Recibe el nombre de catálisis
favorece la covalente aquella en donde el
reacción catalizador no sólo estabiliza
actuando energéticamente el Complejo
como ácido o Activado, ya sea esta por formación
como base. de enlaces de hidrógeno,
Se trata de un neutralización del campo eléctrico,
tipo de etc., sino que además el sustrato
catálisis se ve modificado transitoriamente
bastante por formación de enlace covalente
frecuente en con el catalizador (realmente se
CARACTERÍSTI las enzimas. cambia el camino de la reacción)
CA 1 Los residuos para dar lugar a un intermedio de
de las reacción muy reactivo.
enzimas
favorecen la Dependiendo del tipo de reacción
reacción implicada en la formación del
actuando enlace covalente sustrato-
como ácido o catalizador, la catálisis covalente
como base (o puede ser nucleófila y electrófila.
ambos)
mediante la
transferencia
de protones al
activar la
molécula de
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agua
haciéndolo
más reactivo.
La base
desprotonada
puede captar
un protón del
agua, dando
lugar a un
radical
hidroxilo que
puede formar
un enlace con
otro átomo.
neutro
carbonilo a sí
mismo.
La catálisis Fundamentalmente proteasas,
CARACTERÍSTI por el ácido o rompen los enlaces peptídicos. Para
CA 3 por la base un mismo tipo de reacción, las
puede ocurrir estrategias son distintas.
de dos modos
diferentes:
catálisis
específica y
catálisis
general.
La catálisis Serín-proteasas (catálisis
ácida covalente): en su centro activo
principalment tendrán una serina. Son enzimas
CARACTERÍSTI e es usada que se encuentran en el tracto
CA 4 para gastrointestinal como la tripsina y
reacciones la quimotripsina. La tripsina rompe
orgánicas los enlaces peptídicos cuando hay
químicas; lisina o arginina, la quimotripsina
mientras que tiene aminoácidos aromáticos
en la catálisis (fenilalanina, tirosina y triptófano)
básica, que aportan una oquedad amplia y
preferenteme apolar en el sitio ligante. Las
nte las elastasas tienen aminoácidos poco
reacciones voluminosos como la glicina y
biológicas son alanina que aportan una oquedad
las que poco profunda y pequeña.
surgen, o bien
se sintetizan
para formar
otras. Hay
muchos
compuestos
químicos
posibles que
pueden actuar
como fuentes
para los
protones para
ser
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transferidos
en un sistema
de catálisis
ácida. Un
compuesto
como el ácido
sulfúrico
H2SO4 puede
ser usado. Por
lo general
esto se hace
para crear un
grupo de
salida más
probable,
como la
conversión de
un grupo AH a
un grupo
H2O.
FACTOR EXPLICACION
IMPORTANTE RECORDAR
Ejercicio 2. Bioenergética
Reacción de
óxido- Explicación Ejemplo
reducción
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Las reacciones
redox
catalizadas por
oxido
rreductasas son
vitales en todo
el metabolismo,
pero dentro del
proceso de
NADP+ a estas reacciones
NADPH + H+ es de particular
importancia la
liberación de
energía a partir
de los
nutrientes,
donde los
compuestos
reducidos, como
la glucosa, se
oxidan,
liberando de
este modo
energía, que es
transferida al
NAD+mediante
la reducción
hacia el NADH,
como parte de
la glucolisis y el
ciclo de Krebs.
En células
eucariotas, los
electrones
transportados
por el NADH
que se produce
en el citoplasma
por glucolisis,
son transferidos
al interior de la
mitocondria
(para reducir el
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NAD+
mitocondrial)
por lanzaderas
mitocondriales,
como la
lanzadera
malato-
aspartato. El
NADH
mitocondrial es
entonces
oxidado a su
vez por la
cadena de
transporte de
electrones, que
bombea
protones a lo
largo de la
membrana y
genera ATP a
través de
fosforilación
oxidativa. Estos
sistemas de
lanzadera
también tienen
la misma
función de
transporte en
los cloroplastos.
Dado que las
formas oxidada
como reducida
de la
nicotinamida
adenina
dinucleótido son
usadas en estos
conjuntos
enlazados de
reacciones, la
célula mantiene
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concentraciones
significativas
tanto de NAD+
como de NADH,
con una alta
proporción de
NAD+/NADH
que permite a
esta coenzima
actuar como
agente oxidante
y agente
reductor. En
contraste, la
función principal
del NADH es la
de agente
reductor en el
anabolismo,
estando la
coenzima
implicada en
rutas como la
biosíntesis de
ácidos grasos y
la fotosíntesis.
Puesto que el
NADPH es
necesario para
conducir las
reacciones
redox como un
fuerte agente
reductor, la
proporción
NADP+
/NADPH se
mantiene muy
baja.
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CLASIF
IQUE
COMO
REACCIÓN ENERGÍA
ENDER
DEL CICLO GRAFIQUE LA REACCIÓN LIBRE DE
GÓNIC
DE KREBS GIBS
AO
EXERG
ÓNICA
La reacción Es una
tiene una reacción
energía endergó
CIS- libre de nica
ACONITAT Gibbs (tambié
O A estándar n
ISOCITRA positiva llamada
TO (6,3kJ/mol) reacción
, aunque el desfavo
consumo rable o
acelerado no
de espontá
isocitrato, nea) es
mantiene la una
energía reacción
libre casi en química
cero en en
condiciones donde
intracelular el
es. La increme
aconitasa nto de
produce energía
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Íte
Pregunta Solución
m
A ¿Qué tipos de La hidrolisis enzimática de la lactosa ha pasado
enzimas se a ser una operación industrial cuya importancia
activan va en aumento, en el momento actual se
participan en utilizan dos tipos de enzimas:
la hidrolisis Lactasas de levaduras; Kluyveromyces fragilis o
del azúcar de saccharomyces lactis.
la leche, Lactasas fúngicas; aspergillus niger, Rhyzopus
cuáles son oryzae, etc. Estas enzimas catalizan la misma
sus reacción, sin embargo son muy diferentes en
característica algunas de sus propiedades. Las lactasas de
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Tarea 2
C De acuerdo [S] Vo
con la (mM) (mM/min) 1/Vo 1/[S]
cinética 75 8 0,125 0,0133
enzimática de 100 17 0,059 0,0100
Michaelis- 224 33 0,030 0,0045
Menten, 475 45 0,022 0,0021
Determine la 950 54 0,019 0,0011
velocidad 1250 66 0,015 0,0008
máxima y el 1750 79 0,013 0,0006
km, para los 2000 82 0,012 0,0005
siguientes
datos a
través del
método de
Método de
Lineweaver –
Burk. Para
esta actividad
realice el
cálculo de los
valores que
se presenta,
por el método
de
Lineweaver –
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Tarea 2
Burk -
Calcule los
recíprocos de
la actividad
enzimática y
concentración
de sustrato y
grafique 1/v
como función
de 1/ [S].
El análisis de
Lineweaver-
Burk plantea
la necesidad
de trabajar
con los
valores
inversos, es
decir (1/Vo y
1/[S]).
Esto significa
que el
análisis de
estimación
lineal arroja
una ecuación
de la
siguiente
forma: y =
mx + b
(Línea recta).
las variables
del caso son:
1/Vo = m y
1/[S] = b
Donde: m: Es
la pendiente
de la recta b:
Es el
intercepto
con el eje y.
Conociendo que la mayoría de las enzimas
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Esta enzima
tiene un pH
óptimo de
6.5. ¿Qué es tienen un rango de pH optimo entre 6 y 8.
lo más Pero sabiendo que esta enzima tiene un pH
probable que óptimo de 6,5, se podría afirmar que un pH de
suceda con la 5,9 o 8,0 sufrirían proceso de
actividad de desnaturalización de las enzima, es decir que
D
la enzima si pierden su estructura nativa, su óptimo
el pH cae a funcionamiento y consiguiente cambiarían sus
5,9 o propiedades físico-químicas-estructurales.
aumenta a 8?
Explique su
respuesta.
Que sucede si
por BIORREACTOR
contaminació Es un recipiente o sistema que mantiene un
n cruzada ambiente H biológicamente activo, En algunos
dentro de los casos, un biorreactor es un recipiente en el que
procesos de se lleva a cabo un proceso químico que
E la industria, involucra organismos o sustancias
se contamina bioquímicamente activas derivadas de dichos
el biorreactor organismos. Estos equipos poseen varias
con sales de características.
Calcio y de
sodio. ¿Cómo
se afecta la
actividad
enzimática?
¿cómo se
llama este
proceso y
como se
clasifica?
Referencias