Variación de la forma del tubérculo y la

profundidad del ojo en una familia diploide de

papas andinas

Oscar Loya 1, Erik Mantilla 1

Estudiante de Genotecnia Vegetal. Ingeniería Agronómica. Facultad de Ciencias
Agrícolas. Universidad Central del Ecuador. 17243 Av. Universitaria, Ecuador. 

Resumen:

Antecedentes: La apariencia de los tubérculos es muy variable en el

germoplasma de papa cultivada en los Andes. La población de mapeo
de retrocruzamiento diploide ' DMDD ' derivado del genoma
secuenciado recientemente ' DM 'evaluamos la utilidad de los
descriptores morfológicos de la forma del tubérculo para la
identificación de los loci genéticos responsables de la variación de la
forma y profundidad del ojo.

Resultados: Se utilizaron descriptores morfológicos subjetivos y

medidas objetivas de la longitud y el ancho del tubérculo para evaluar
la variación en la forma del tubérculo y la profundidad del ojo. Se
utilizaron mapas genéticos basados en hembras para la identificación
del locus de rasgos cuantitativos (QTL). Se identificaron siete formas
morfológicas de tubérculos dentro de la población, se clasificaron en
dos grupos: cilíndrico y no cilíndrico. Los cilíndricos clasificados como '
comprimido ',' redondo ',' oblongo ', y ' alargado ' principalmente
portaba un alelo marcador que se originaba en el progenitor
masculino. Los tubérculos no cilíndricos clasificados como ' obovoide ','
elíptico ', y ' alargado ' estaban en el segundo grupo, en su mayoría
carecían del alelo marcador que se originaba en el progenitor
masculino.

Conclusiones: La utilización de un marcador molecular en la forma y

profundidad del ojo QTL permitió la reclasificación de la variación en la
forma general del tubérculo en dos grupos principales. Se recomienda
la medición cuantitativa de la longitud y el ancho en diferentes partes
del tubérculo para acompañar la clasificación del descriptor
morfológico para capturar correctamente la variación de forma.
Palabras clave: Forma del tubérculo, profundidad del ojo, descriptores
morfológicos, loci de rasgos cuantitativos (QTL)
1. Antecedentes

Los ritos culturales, la nomenclatura popular y la asociación de determinadas formas

con distintas preferencias y usos culinarios se han transmitido de generación en
generación.
La manipulación y el procesamiento de las variedades actuales constan de el color
uniforme y la forma redonda u oblonga. En consecuencia, una gran selección ha
llevado a una baja diversidad de estos rasgos en los cultivares modernos. Existe una
gran variabilidad en la apariencia de los tubérculos en el germoplasma de papa
cultivada en los Andes. Mientras que las papas silvestres son generalmente pequeñas y
redondas con ojos bastante superficiales , los tubérculos de las variedades autóctonas
de domesticación temprana son más grandes y tienen una gran variabilidad en la forma
y la profundidad del ojo. Los agricultores andinos buscan mantener esta rica diversidad
cultivando mezclas de razas locales en sus campos.
Algunos estudios con Solanum tuberosum ( ya sea a nivel tetraploide o diploide), han
utilizado dos categorías de forma (redonda, larga), tres (redonda, ovalada y larga) o
cuatro (redonda, ovalada, ovalada larga, ovalada muy larga, Se registraron seis tipos de
formas (larga, ovalada larga, ovalada, ovalada redonda, redonda, comprimida) ,el
mapeo genético se agruparon en tres clases principales (redonda, ovalada, larga)

El Centro Internacional de la Papa (CIP) posee actualmente la mayor biodiversidad de

papas cultivadas. Los descriptores morfológicos para la forma del tubérculo utilizados
por el banco de germoplasma del CIP incluyen ocho categorías básicas: comprimida,
redonda, ovoide, obovoide, elíptica, oblonga, alargada y alargada La población de
mapeo de retrocruzamiento diploide ' DMDD ' se desarrolló en el CIP se utilizó para
anclar la primera secuencia publicada del genoma de la papa (DM) y para desarrollar
un mapa genético denso. La abuela de la población, DM, pertenece a la S. tuberosum
Grupo Phureja [ y el padre masculino recurrente, DI, a S. tuberosum diploide
Andigenum Group Goniocalyx, proporcionando así algunas de las variaciones alélicas
presentes en las razas locales andinas.
DMDD segrega numerosos rasgos morfológicos, reproductivos, fisiológicos,
bioquímicos y abióticos relacionados con el estrés, que, combinados con el mapa
genético de alta densidad y la secuencia del genoma de referencia de alta calidad, abren
grandes oportunidades para el rasgo-QTL y estudios de descubrimiento de genes.
El presente trabajo se realizó para evaluar la utilidad de los descriptores morfológicos
para la forma del tubérculo para la identificación de los loci genéticos responsables de
la variación de la forma y profundidad del ojo. Además, la secuencia del genoma de
referencia de la patata se utilizó para buscar genes candidatos potenciales responsables
del efecto QTL encontrado

2. Resultados.

Datos fenotípicos
Entre los genotipos parentales de DMDD, DM (CIP 801092) tenían tubérculos
alargados con ojos superficiales, DI (CIP 703825) tenía tubérculos redondos y ojos
profundos, y DMDI (CIP 305156.17) tenía tubérculos elípticos y ojos ligeramente
profundos.

Los valores medios en todos los experimentos fueron bastante similares para la
relación entre la longitud del tubérculo y el ancho, pero la distribución se inclinó hacia
los valores más pequeños en los ensayos de campo 1 y campo 2. La mayoría de los
individuos de la progenie tenían ojos ligeramente profundos o profundos, pero también
había algunos individuos con ojos muy profundos o superficiales.

Características de los mapas genéticos parentales de DMDD

Los mapas parentales tenían 12 cromosomas correspondientes a los cromosomas de la

papa,Para el mapa paterno, la longitud media de los cromosomas fue de 58,7 cm, el
intervalo de marcador medio fue de 1,9 cm y contenía un promedio de 29 marcadores,
lo que da un total de 339 marcadores. Un total de 423 marcadores mapeados en el
mapa materno con una longitud de cromosoma promedio de 65,4 cm, un intervalo de
marcador promedio de 2,1 cm y un promedio de 35 marcadores por cromosoma. Khan
et al. Han descrito más detalles sobre el mapa genético.

Forma del tubérculo y profundidad del ojo QTL

El QTL de mayor efecto se encontró para la relación de base y / o ápice marcadamente

más estrechos en comparación con el ancho medio

La agrupación de individuos es bastante obvia en todas las clases excepto en el ensayo

de campo 3, donde inesperadamente se puntuaron muchos individuos en la clase
alargada. Los tubérculos cilíndricos tienen ojos muy profundos con mayor frecuencia
en comparación con los tubérculos no cilíndricos, pero ambos tipos de formas tienen
ojos profundos.

En el mapa materno, se encontró un QTL de pequeño efecto para la relación entre la

longitud del tubérculo y el ancho y la forma general en la misma región del cromosoma
5, pero se detectó solo en el campo de prueba 2.

Genes candidatos

Las secuencias de pseudomoléculas correspondientes a aproximadamente 2 cM en los

picos de QTL por mapeo de intervalo en los cromosomas 5, 10 y 12 se escanearon en
busca de genes candidatos. Había un total de 607, 375 y 133 genes dentro de las
regiones que rodean el QTL en los cromosomas 5, 10 y 12 respectivamente. los genes
que se encuentran en las regiones QTL están anotados como proteínas hipotéticas y,
por ejemplo, genes de resistencia a enfermedades.También se encontraron tres
miembros de la familia de genes de expansina en la región de QTL significativo en los
cromosomas 5 y 10; β- expansin y expansin se ubicaron a una distancia de 1.03 Mb y
1.12 Mb respectivamente del marcador QTL PM0333_219 en el cromosoma 5, y α-
 expansin se encontraba a una distancia de 1,78 Mb del marcador QTL - toPt-437059 en
el cromosoma 10. se identificaron tres genes de extensión dentro de 1,11 Mb del
marcador QTL PM0333_219 en cromosoma 5.

3. Discusión.
4. Conclusión

5. Referencias