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Biomoleculas PDF
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LIPIDOS
Denominamos lípidos a un conjunto muy heterogéneo de biomoléculas cuya
característica distintiva aunque no exclusiva ni general es la insolubilidad en agua,
siendo por el contrario, solubles en disolventes orgánicos (benceno, cloroformo, éter,
hexano, etc.). Están constituidas básicamente por tres elementos: carbono (C),
hidrógeno (H) y oxígeno (O); en menor grado aparecen también en ellos nitrógeno (N),
fósforo (P) y azufre (S).
Una característica básica de los lípidos, y de la que derivan sus principales propiedades
biológicas es la hidrofobicidad. La baja solubilidad de los lípidos se debe a que su
estructura química es fundamentalmente hidrocarbonada (alifática, alicíclica o
aromática), con gran cantidad de enlaces C-H y C-C (Figura de la izquierda). La
naturaleza de estos enlaces es 100% covalente y su momento dipolar es mínimo. El
agua, al ser una molécula muy polar, con gran facilidad para formar puentes de
hidrógeno, no es capaz de interaccionar con estas moléculas. En presencia de
moléculas lipídicas, el agua adopta en torno a ellas una estructura muy ordenada que
maximiza las interacciones entre las propias moléculas de agua, forzando a la molécula
hidrofóbica al interior de una estructura en forma de jaula, que también reduce la
movilidad del lípido. Todo ello supone una configuración de baja entropía, que resulta
energéticamente desfavorable. Esta disminución de entropía es mínima si las
moléculas lipídicas se agregan entre sí, e interaccionan mediante fuerzas de corto
alcance, como las fuerzas de Van der Waals. Este fenómeno recibe el nombre de
efecto hidrofóbico
Triglicéridos
El glicerol es un alcohol de tres carbonos, en cada uno de ellos posee un grupo oxidrilo
(OH). Cada OH se combina con el hidrógeno del grupo carboxilo de un ácido graso, de
esta manera el ácido graso se "ensambla" con el glicerol desprendiéndose agua (OH
(del alcohol) + H (del carboxilo) H 2O) . De la unión del glicerol con un ácido graso se
forma un monoglicérido, con dos ácidos grasos tenemos un diglicérido, y con tres
ácidos grasos tenemos un triglicérido. Los triglicéridos más importantes son:
Grasas y aceites
Se diferencian uno del otro por que a temperatura ambiente los aceites son líquidos
oleosos, esta característica está dada por que son triglicéridos no saturados, mientras
que las grasas presentan ácidos grasos saturados. Ambos sirven de depósito de
reserva de energía para células animales (grasas) y en vegetales (aceites). Estos
compuestos son altamente energéticos, aproximadamente 9,3 kilocalorías por gramo.
Cuando un organismo recibe energía asimilable en exceso, este puede almacenarla en
forma de grasa, que podrá ser reutilizada posteriormente en la producción de energía,
cuando el organismo lo necesite. En general, la grasa es almacenada en los adipositos
(células que forman el tejido adiposo) donde puede movilizarse para obtener energía
cuando el ingreso calórico es menor que el gasto de calorías. Esta capa es utilizada en
determinados animales como aislante térmico, como por ejemplo en mamíferos
marino.
Fosfolípidos
Comportamiento en solución
En medios acuosos, los lípidos sin incapaces de formar soluciones verdaderas. Algunos
tienen un grupo polar en algún extremo de la molécula, por lo que en medio acuosos
pueden formar: micelas, monocapas y bicapas que son grupos macromoleculares con
gran cantidad de lípidos.
Micelas
Bicapas lipídicas planas
Esteroides
POLIMEROS
Los copolímeros son polímeros que se obtienen polimerizando juntos dos o más
monómeros distintos. Son los más importantes y comunes y los de mayor aplicación
industrial.
Ejemplos
BIOPOLÍMEROS
Muchas de las grandes moléculas que se encuentran en los seres vivos son polímeros
de moléculas mucho más pequeñas y sencillas, son biopolímeros. Sus estructuras son
mucho más complejas que las de los polímeros sintéticos pues suelen incluir muchos
monómeros distintos.
Los más importantes son los polisacáridos, las proteínas y los ácidos nucleicos.
Estas macromoléculas cumplen las funciones más importantes de la célula: intervienen
en el almacenamiento de energía, regulan la velocidad de las reacciones químicas en
el organismo, tienen un papel preponderante en la transmisión de caracteres
genéticos, etc. Sus complejas estructuras están perfectamente definidas y contienen
información en sí mismas.
HIDRATOS DE CARBONO
Los glúcidos son compuestos formados en su mayor parte por átomos de carbono,
hidrógeno y oxígeno, su función es producir energía.
Tipos de carbohidratos:
Monosacáridos: son los que están formados por una molécula de azúcar.
Los monosacáridos son los carbohidratos más simples, pues no pueden ser hidrolizados
a carbohidratos más pequeños. La fórmula química general de un monosacárido no
modificado es (C•H2O)n, donde n cualquier número igual o mayor a tres.
Los monosacáridos son clasificados de acuerdo a tres características diferentes: la
posición del grupo carbonilo, el número de átomos de carbono que contiene y su
quiralidad. Si el grupo carbonilo es un aldehído, el monosacárido es una aldosa; si el
grupo carbonilo es una acetona, el monosacárido es una cetosa. El monosacárido más
pequeño posible, aquellos que poseen tres átomos de carbono, son llamados y triosas.
Aquellos con cuatro son llamados tetrosas, lo que poseen cinco son llamados pentosas,
seis son llamados hexosas y así sucesivamente. Entre los sistemas de clasificación son
frecuentemente combinados. Por ejemplo, la glucosa es una aldohexosa (un aldehído
de seis átomos de carbono), la ribosa es una aldopentosa (un aldehído de cinco átomos
de carbono) y la fructosa es una cetohexosa (una cetona de seis átomos de carbono).
Cada átomo de carbono posee un grupo de hidroxilo (-OH), con la excepción del
primero y el último carbono, todos son asimétricos, haciéndolos centros estéricos con
dos posibles configuraciones cada uno (el -H y -OH pueden estar a cualquier lado del
átomo de carbono). Debido a esta asimetría un número de isómeros puede existir para
cada monosacárido dado. Por ejemplo la aldohexosa D-glucosa, tienen la fórmula
(C·H2O)6, de la cual exceptuando dos de sus seis átomos de carbono, todos son centros
quirales, haciendo que la D-glucosa sea uno de los esteroisómeros posibles. En el caso
del gliceraldehido, una aldotriosa, existe un par de posibles esteroisómeros, los cuales
son enantiómeros y epímeros (1,3-dihidroxiacetona, la cetosa correspondiente es una
molécula simétrica que no posee centros quirales). La designación D o L es realizada
de acuerdo a la orientación del carbono asimétrico más alejados del grupo carbonilo: si
el grupo hidroxilo está a la derecha de la molécula es un azúcar D, si está a la izquierda
es un azúcar L. Como los D azúcares son los más comunes, usualmente la letra D es
omitida
La definición de cuan largo debe ser un carbohidrato para caer en cualquiera de estas
dos categorías varía de acuerdo a la opinión personal. Ejemplos de oligosacáridos
incluyen los disacáridos mencionados antes, el trisacárido rafinosa y el tetrasacárido
estaquiosa.
Los carbohidratos en una persona ocupan de 8,3 y 14,5 g/kg de su peso corporal y el
55% de la energía diaria que necesita el organismo humano debe provenir de
carbohidratos ya sea obtenidos de alimentos ricos en almidón como las pastas, se
desaconseja en cambio el consumo de glúcidos tipo azúcar por su actividad altamente
oxidante (las dietas con muchas calorías o con mucha glucosa aceleran el
envejecimiento celular; se sobreentiende que sí pueden ser necesarias dietas
hipercalóricas en climas gélidos o en momentos de gran desgaste energético
muscular). Nótese que el sedentarismo o la falta de los suficientes movimientos
cotidianos del cuerpo humano provocan una mala metabolización de las grasas y de los
hidratos de carbono, aparejada esta mala metabolización con enfermedades
degenerativas.
Nutrición
Los carbohidratos requieren menos agua para digerirse que las proteínas o grasas y
son la fuente más común de energía. Las proteínas y grasas son componentes vitales
para la construcción de tejido corporal y células, y por lo tanto debería ser
recomendado no explotar tales recursos usándolos para la producción de energía.
Los carbohidratos no son nutrientes esenciales: el cuerpo puede teñir toda su energía a
partir de las proteínas y grasas[3] [4]. El cerebro no puede quemar grasas y necesita
glucosa para energía, del organismo puede sintetizar esta glucosa a partir de
proteínas. Los carbohidratos las proteínas contienen 4 kcal por gramo mientras que las
grasas contienen 9 kilocalorías y el alcohol contiene 7 kcal gramo.
Los alimentos que son altos en carbohidratos incluyen dañes, pastas, granos, papas,
fibra, arroz y cereales.
AMINOÁCIDOS
R-C- COOH
NH2
Se han propuesto varios métodos para clasificar los aminoácidos sobre la base de sus
grupos R. El más significativo se funda en la polaridad de los grupos R. Existen cuatro
clases principales:
PROTEÍNAS
- Péptidos y Enlace peptídico.
Los péptidos son cadenas lineales de aminoácidos enlazados por enlaces químicos de
tipo amídico a los que se denomina Enlace Peptídico. Así pues, para formar péptidos los
aminoácidos se van enlazando entre sí formando cadenas de longitud y secuencia
variable. Para denominar a estas cadenas se utilizan prefijos convencionales como:
Dipéptidos.- si el nº de aminoácidos es 2.
Tripéptidos.- si el nº de aminoácidos es 3.
Tetrapéptidos.- si el nº de aminoácidos es 4.
1. la a(alfa)-hélice
2. la conformación beta
- Desnaturalización.
Muchas moléculas proteicas sólo retienen su actividad biológica dentro de una
fluctuación muy limitada de temperatura y de pH. La exposición de proteínas solubles o
globulares a pH extremos o a temperaturas elevadas, les hace experimentar un cambio
conocido como desnaturalización, el efecto más visible del cual, consiste en un
descenso de su solubilidad. Puesto que los enlaces químicos covalentes del esqueleto
peptídico de las proteínas no se rompen durante este tratamiento relativamente suave,
se ha llegado a la conclusión de que la estructura primaria permanece intacta. La
mayoría de las proteínas globulares experimentan el proceso de desnaturalización
cuando se calientan por encima de 60°-70° C. La formación de un coágulo insoluble
blanco cuando se hierve la clara de huevo es un ejemplo común de desnaturalización
térmica. La consecuencia más significativa de la desnaturalización es que las proteínas
pierden su actividad biológica característica, por ejemplo, al calentar las enzimas se
suele perder su capacidad catalítica.
La desnaturalización consiste en el desplegamiento de la estructura nativa plegada
característica de la cadena polipeptídica de las moléculas de las proteínas globulares.
Cuando la agitación térmica provoca que la estructura nativa plegada se desarrolle o
se distienda, originando una cadena libremente ondulada, la proteína pierde su
actividad biológica.
Especificidad.
La especificidad se refiere a su función; cada una lleva a cabo una determinada función
y lo realiza porque posee una determinada estructura primaria y una conformación
espacial propia; por lo que un cambio en la estructura de la proteína puede significar
una pérdida de la función.
Estructura Primaria
Estructuras Secundarias
Estructura Terciaria
Estructura cuaternaria.
ACIDOS NUCLEICOS
A las unidades químicas que se unen para formar los ácidos nucleicos se les denomina
nucleótidos y al polímero se le denomina polinucleótido o ácido nucleico.
Los nucleótidos están formados por una base nitrogenada, un grupo fosfato y
un azúcar; ribosa en caso de ARN y desoxiribosa en el caso de ADN.
Las bases nitrogenadas son las que contienen la información genética y los
azúcares y los fosfatos tienen una función estructural formando el esqueleto del
polinucleótido.
En el caso del ADN las bases son dos purinas y dos pirimidinas. Las purinas son A
(Adenina) y G (Guanina). Las pirimidinas son T (Timina) y C (Citosina) . En el caso
del ARN también son cuatro bases, dos purinas y dos pirimidinas. Las purinas son A y G
y las pirimidinas son C y U (Uracilo).
Las bases se unen al carbono 1' del azúcar y el fosfato en el carbón 5' para formar el
nucleótido.
Estructura de un Nucleótido
Los nucleótidos se unen para formar el polinucleótido por uniones fosfodiester entre el
carbono 5' de un nucleótido y el carbono 3' del siguiente.
Unión Fosfodiester en los Ácidos Nucleicos
El ADN está formado por dos cadenas muy largas de polinucleótidos unidas entre sí por
puentes de hidrógeno específicos entre las bases de las dos cadenas. La base de una
cadena que se une por los puentes de hidrógeno con la base de la otra cadena se dice
que forman un par de bases. A se parea con T y G con C.
Existen varios tipos de ARN cada uno con función distinta. Los que forman parte de las
subunidades de los ribosomas se les denomina ARN ribosomal (rARN), los ARN que
tienen la función de transportar los aminoácidos activados, desde el citosol hasta el
lugar de síntesis de proteínas en los ribosomas; se les conoce por ARN de
transferencia (tARN) y los ARN que son portadores de la información genética y la
transportan del genoma (molécula de ADN en el cromosoma) a los ribosomas son
llamados ARN mensajero (mARN). El tamaño de las moléculas de ARN es mucho
menor que las del ADN. En el caso de E. coli va de menos de 100 nucleótidos en los
tARN hasta casi 4000 (4kb) en rARN.
Transmisión.- Con estas bases, WyC propusieron el mecanismo de duplicación del ADN
por medio del cual, las dos células hijas provenientes de una división celular contienen
copias idénticas del ADN presente en la célula que se dividió. A la duplicación del
ADN se le conoce con el nombre de replicación.
Durante la replicación, las dos cadenas se van separando y cada una de ellas sirve de
patrón para la síntesis de su cadena complementaria. Las bases se van agregando una
a una y la selección de cuál base entra en un sitio específico de la cadena en
formación, queda determinada por la base en la cadena patrón con la que se va a
aparear.
El Código Genético
U C A G
U Phe Ser Tyr Cys U
Phe Ser Tyr Cys C
Leu Ser Alto Alto A
Leu Ser Alto Trp G
C Leu Pro His Arg U
Leu Pro His Arg C
Leu Pro Gln Arg A
Leu Pro Gln Arg G
A Ile Thr Asn Ser U
Ile Thr Asn Ser C
Ile Thr Lys Arg A
Met Thr Lys Arg G
(Inicio)
G Val Ala Asp Gly U
Val Ala Asp Gly C
Val Ala Glu Gly A
Val Ala Glu Gly G
Primera Tercera
Posición Segunda Posición Posición
(5'-) (3'-)
El mensaje que está contenido en el genoma se encuentra escrito en un lenguaje de 4
letras (las cuatro bases), el cual se transcribe usando el mismo lenguaje, al sintetizar el
mARN. La síntesis de proteínas se le denomina traducción porque ahora se pasa del
lenguaje de 4 letras a otro con 20 letras (los 20 aminoácidos). Para pasar de un
lenguaje a otro se necesita un código para hacer la traducción y se le denomina código
genético.
Las equivalencias entre los dos lenguajes se presentaron en la tabla anterior. Tres
bases contiguas (un triplete) codifican un aminoácido, así como también para la
puntuación del mensaje. Se determinó qué tripletes codifican cada aminoácido y
qué tripletes indican el inicio y la terminación del mensaje. Al triplete se le dio el
nombre de codón. Se encontró que algunos aminoácidos podían ser codificados por
más de un codón, o sea hay codones que son sinónimos. Por esta razón se dijo que el
código genético es degenerado.
Se pueden agregar porciones de ADN que contienen genes que no están presentes en
el cromosoma incrementando el número de genes de la célula, o bien se pueden
inducir cambios que eliminen genes activos presentes en la célula haciendo en este
caso que la célula pierda cierta capacidad genética.
superior
Ninguna AAT CGG GAG Asn Arg Val
TTA GCC CTC
Transversión AAT CCG TAG Asn Arg (fin)
(GC:TA) TTA GCC ATC
Transición GC:AT AAT ACC AAG Asn Arg Lis
TTA GCC TTC
Incerción, cambio de marco AXA TCG GGA
T T AGC CCT
En párrafos anteriores se mencionó que la replicación del ADN se hace con gran
fidelidad, con una frecuencia de errores del orden de 10 -8, sin embargo, sí ocurren
errores.
Si se substituye una purina por otra, o una pirimidina por otra, al cambio se le llama
transición; si se substituye una purina por una pirimidina al cambio se le llama
transversión; si se agrega o elimina una base entonces se produce lo que se llama un
cambio de marco. En este último caso, se lee en forma errónea todo el mensaje que
sigue al punto de cambio. En algunas ocasiones, cuando se modifica una de las bases y
la ADN polimerasa no la identifica, entonces introduce una A y el cambio final será la
introducción de una T en la cadena patrón. La célula tiene mecanismos para eliminar
los errores o cambios que ocurren en el ADN, bien sea durante la síntesis o cuando ya
está formado. Si la célula no repara los cambios y entra en el proceso de duplicación
con el ADN modificado, el cambio se fija y se vuelve permanente. El gene modificado
puede ahora codificar una proteína diferente, y si este es el caso, se dice que tuvo
lugar una mutación.
Si la substitución, inserción o eliminación de una base tuvo lugar en alguna parte del
ADN que codifica una proteína, entonces puede cambiar un codón y dar lugar a una
modificación que produzca la introducción de un aminoácido diferente o se codifique
por terminación de la cadena peptídica.
Las mutaciones se clasifican de acuerdo al efecto que tienen sobre el producto del
gene modificado. Se dice que la mutación es: 1) sin sentido, si el producto es inactivo
o incompleto, 2) de pérdida del sentido, si el producto es defectuoso y 3)
silenciosa, si no se altera ni la función ni la cantidad del producto activo.