El método de clasificación de las bacterias es un método sencillo; se basa en la

diferencia de color, y básicamente la clasificación que se hace es en función del

espesor que tiene la pared celular en las bacterias. Hay unas bacterias que tienen
la pared celular más gruesas que otras. Debido a esa diferencia de espesor
celular, el pigmento que se añade en las bacterias va a quedar retenido en
algunas y en otras no. Gracias a ese contraste se pueden distinguir las formas de
clasificar a las bacterias. Los microrganismos también tienen otras capas, por
ejemplo, la cápsula bacteriana que recubre toda la bacteria y se encarga de dar
una especie de protección para evitar la despigmentación, la pérdida de agua
hacia los exteriores o la resequedad. La pared celular se encarga de contener o
mantener dentro del microorganismo todo lo que tiene que ver con el ADN
bacteriano, y los organelos involucrados en la duplicación del ADN y la
elaboración de proteínas y enzimas para el procesamiento de sustratos y el
mantenimiento del microorganismo para que este se conserve.
Dentro del material genético se encuentra el ADN bacteriano y, unos fragmentos
de ADN conocidos como plásmidos, que dan información genética que las
bacterias pueden compartir entre sus vecinos. Si la bacteria muere, la pared
celular se rompe. Al romperse la pared celular sus vectores o plásmidos quedan
libres y pueden ser adquiridos por otra bacteria que esté cerca. La información
genética que adquiere el otro microorganismo puede ser favorable o no, en el caso
que sea favorable, el microorganismo se va a duplicar y al duplicarse va a ir
duplicando el material genético o el plásmido que ha adquirido.
La pared celular es la que rodea toda la célula y la que permite contener todo lo
que se conoce como protoplasto. Lo que tienen en común las dos bacterias, Gram
positivas y negativas, es que tienen pared celular y membrana plasmática. La
diferencia es que la pared celular en las Gram positiva es mucho más gruesa y
estas carecen de membrana externa, la cual si está presente en las Gram
negativas.
La estructura encargada de controlar la presión osmótica en la célula es la
membrana citoplasmática, debido a los poros que presenta. Esto hace que se
mantenga la forma y la estructura de la célula correctamente.
El protocolo para hacer la diferenciación de Gram positivas y Gram negativas es
con la coloración de Gram. La diferencia fundamental es el espesor del
peptidoglucano, el espesor de la pared celular. Las Gram positivas tienen una gran
cantidad de peptidoglucano y la Gram negativas tienen una capa muy fina de este
componente. El peptidoglucano es el componente principal de las células
procariotas. También se pueden encontrar bacterias que carecen de pared celular.
Por ejemplo, los Mycoplasma qué sólo tiene la pared citoplasmática y no tienen
nada de peptidoglucano.
Lo que va a diferenciar una pared de otra, dentro de dos diferentes procariotas,
son los aminoácidos que se puedan enlazar (enlace peptídico). Los aminoácidos
van a ir variando dependiendo de la naturaleza propia de cada microorganismo. La
membrana plasmática es la encargada de la transferencia o el intercambio de
materia de la célula con los alrededores.
Cambiando de tema, con respecto al diseño de bio-reactores. Vamos a encontrar
a los bio-reactores por lotes (Batch), que son los más conocidos; y los de
fermentación continua. Los costos de producción es un factor importante. En el
caso del continuo, este tiene una ventaja, ya que continuamente se está
obteniendo el producto de interés, es decir, no hay intervalos de tiempo donde se
pare la producción. En comparación con el Batch, en donde se requieren una serie
de etapas de producción para generar el producto de interés.