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Apunte Acidos Nucleicos
Apunte Acidos Nucleicos
Academia pio
NÚCLEO CELULAR
ENVOLTURA NUCLEAR.
CROMATINA Y CROMOSOMAS.
NUCLEOPLASMA Y NUCLEOLO.
El nucleoplasma es el medio interno del núcleo. Es información genética necesaria para que los
una estructura formada por una dispersión coloidal orgánulos celulares puedan realizar la transcripción y
en forma de gel compuesta por proteínas síntesis de proteínas; también conservan y
relacionadas con la síntesis y empaquetamiento de transmiten la información genética contenida en el
los ácidos nucleicos. También posee nucleótidos, ADN, duplicando el ADN en la reproducción celular.
ARN, ADN, agua e iones. Existe en su seno una red
de proteínas fibrilares similar a las del citoplasma. Su
función es ser el seno en el que se produce la síntesis
de ARN diferentes y la síntesis del ADN nuclear.
Además, con su red de proteínas, evita la formación
de nudos en la cromatina.
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EL ADN
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Estructura terciaria
El ADN es una molécula muy larga en algunas
especies y, sin embargo, en las células eucariotas se
encuentra alojado dentro del minúsculo núcleo.
Cuando el ADN se une a proteínas básicas, la
estructura se compacta mucho.
Las proteínas básicas son Histonas o Protaminas. Estructura cuaternaria
La unión con Histonas genera la estructura La cromatina en el núcleo tiene un grosor de 300Å.
denominada nucleosoma. Cada nucleosoma está La fibra de cromatina de 100Å se empaqueta
compuesto por una estructura voluminosa, formando una fibra de cromatina de 300Å.
denominada core, seguida por un eslabón o "Linker". El enrollamiento que sufre el conjunto de
El core está compuesto por un octámero de nucleosomas recibe el nombre de solenoide. Los
proteínas, Histonas, denominadas H2A, H2B, H3 y solenoides se enrollan formando la cromatina del
H4. Cada tipo de histona se presenta en número par. núcleo interfásico de la célula eucariota. Cuando la
Esta estructura está rodeada por un tramo de ADN célula entra en división, el ADN se compacta más,
que da una vuelta y 3/4 en torno al octámero. El formando los cromosomas.
Linker está formado por un tramo de ADN que une un
nucleosoma con otro y una histona H1.
El conjunto de la estructura se denomina fibra de
cromatina de 100Å. Tiene un aspecto repetitivo en
forma de collar de perlas, donde las perlas serían los
nucleosomas, unidos por los linker.
El ADN debe encontrarse más compacto en el núcleo
de losespermatozoides. En este caso, el ADN se une
a proteínas de carácter más básico, denominadas
Protaminas. El ADN se enrolla sobre estas proteínas,
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ARN:
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Estructura primaria
Al igual que el ADN, se refiere a la secuencia de
las bases nitrogenadas que constituyen sus
nucleótidos.
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ARNu
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de ADN molde, y sigue el principio de ADN eliminan los enlaces entre las cadenas
complementariedad de bases fijando el consumiendo en el proceso ATP.
nucleótido que debe incorporarse a la cadena
en formación según tal regla. 2) Topoisomerasas, enzimas que desenrollan el
2) Necesitan un cebador, la polimerización que ADN y lo relajan. Existen cuatro
realizan estas enzimas requiere que exista una topoisomerasas (I a IV) que actúan eliminando
cadena previa inicial (cebador) ya que son superenrollamientos negativos; o bien
incapaces de coger sobre su centro activo dos induciéndolos, dependiendo del grado de
nucleótidos individuales y comenzar la síntesis. plegamiento que tenga el ADN en su estado
Uno de los sustratos necesarios de la reacción natural.
es, por tanto, una cadena preexistente, y
ninguna de estas enzimas es capaz de iniciar la 3) Proteínas fijadoras de ADN, proteínas que
síntesis de una cadena nueva desde su primer estabilizan las cadenas separadas uniéndose a
nucleótido. ellas.
3) Su dirección de síntesis es fija de 5'→ 3', esto 4) Primasas, enzimas que sintetizan el cebador,
significa que adicionan nucleótidos a la cadena éste suele ser un corto fragmento de ARN,
siempre por un extremo fijo, el extremo 3'. O necesario para que pueda comenzar la ADN
bien, que de los dos extremos del nucleótido polimerasa III, y que posteriormente será
libre que se va a incorporar, utilizan su grupo eliminado y sustituido por un fragmento de ADN
fosfato o extremo 5' para añadirlo a la cadena por la ADN polimerasa I.
en crecimiento.
4) La velocidad con que adicionan nucleótidos, o 5) ADN ligasas, enzimas que se encargan de unir
procesividad, se mide como el número de trozos formados de cadenas, realizando un
nucleótidos incorporados en la unidad de enlace fosfodiéster entre los nucleótidos
tiempo y es una característica propia de cada pertenecientes a dos segmentos de una
polimerasa. cadena.
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lesiones sobre el genoma celular; se estima que cada eucariotas: La estructura de los genes en eucariotas
veinticuatro horas se pierden alrededor de 5000 es compleja. La secuencia de nucleótidos que
bases púricas por destrucción de sus enlaces constituye un gen, y los propios genes entre sí, no se
glicosídicos con la desoxirribosa. Sin embargo, disponen linealmente en los cromosomas sino
gracias a los mecanismos de reparación, estas espaciados por fragmentos de ADN que no poseen
lesiones son eliminadas prácticamente en su información que pueda ser transcrita. En todo gen,
totalidad, las que no lo son se convierten en además, distinguiremos las siguientes regiones:
mutaciones. Existen varios tipos de mutaciones,
clasificadas según el tipo de cambio que se produce La región promotora o promotor (P)
sobre la molécula de ADN: La región codificadora (C)
1) Sustitución de una base por otra: La región terminadora o terminador (T)
a) Transición si el cambio es de una base por a) La región promotora es una porción del ADN
otra del mismo grupo, base púrica por situada al principio del gen y que, sin codificar
base púrica o pirimidínica por pirimidínica. ningún aminoácido, sirve para que las enzimas que
b) Transversión, si el cambio es de base realizan la transcripción reconozcan el principio del
púrica a pirimidínica, o a la inversa. gen.
b) La región codificadora es la parte del gen que
2) Inserción de un par de bases, o adición de contiene la información para la síntesis de la
nucleótidos. proteína. En la región codificadora van a existir
fragmentos de ADN que no contienen información:
3) Delección de un par de bases o eliminación de
los intrones, y fragmentos que sí que contienen
nucleótidos.
información: los exones. Considerando la hebra 5'-
>3', el principio de esta región viene marcado por
la secuencia de bases nitrogenadas ATG y el final
por una de estas tres tripletas: TAA, TAG, TGA;
tripletas que se denominan de paro, sin sentido o
secuencias stop.
c) La región terminadora. Marca el final del gen.
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modificado de guanina (G) que protege al transcrito forma, parece un sistema derrochador. Sin
de la degradación. También ayuda al ribosoma a embargo, el empalme posibilita un proceso
unirse al ARNm y a comenzar a leerlo para hacer una llamado empalme alternativo, en que puede
proteína. hacerse más de un ARNm del mismo gen.
Mediante el empalme alternativo, los humanos (y
otros eucariontes) podemos codificar
secretamente un número mayor de proteínas que
los genes que tenemos en nuestro ADN.
En el empalme alternativo, un pre-ARNm se puede
empalmar en cualquiera de dos (¡a veces muchas
Imagen de un pre-ARNm con un cap 5' y una cola de
más que dos!) maneras diferentes. Por ejemplo, en
poli-A. El cap 5' se encuentra en el extremo 5' del pre-
el siguiente diagrama, el mismo pre-ARNm puede
ARNm y es un nucleótido de G modificado.
empalmarse de tres maneras diferentes, según los
La cola de poli-A se encuenra en el extremo 3' del
exones que se conservan. Esto resulta en tres
pre-mRNA y se compone de una larga cadena de
ARNm maduros diferentes que se traducen en
nucleótidos de A (de los cuales solo se muestran
proteínas con estructuras diferentes.
unos cuantos).
¿Cómo se añade la cola poly-A? El extremo 3' del
ARN se forma de una manera un poco extraña.
Diagrama de empalme alternativo.
Cuando durante la transcripción aparece una
secuencia llamada señal de poliadenilación en la
molécula del ARN , una enzima corta el ARN en dos Una secuencia de ADN codifica un transcrito de
en ese sitio. Otra enzima añade de 100 100 pre-ARNm que contiene cinco regiones y
100 – 200 200 200 nucleótidos de adenina (A) en el potencialmente todas pueden utilizarse como
extremo cortado para formar una cola de poli-A. La exones: exón 1, exón 2, exón 3, exón 4 y exón 5.
cola le brinda al transcrito mayor estabilidad y lo Los exones se disponen en orden lineal a lo largo
ayuda a ser exportado del núcleo hacia el citosol. del pre-ARNm y tienen intrones entre ellos.
Empalme de ARN En el primer caso de empalme se conservan los
El tercer evento más importante en el procesamiento cinco exones en el ARNm maduro. Este se
del ARN que sucede en tus células se conoce compone de: exón 1 - exón 2 - exón 3 - exón 4 -
exón 5. Cuando se traduce el transcrito, se
como empalme de ARN. En el empalme de ARN,
especifica la proteína A, una proteína con cinco
ciertas regiones del transcrito del pre-ARNm,
dominios: hélice 1 (codificada por el exón 1), hélice
conocidas como intrones, son reconocidas y
2 (codificada por el exón 2), listón 3 (codificado por
eliminandas por un complejo enzimático
especializado llamado espliceosoma. Los intrones el exón 3), listón 4 (codificado por el exón 4) y
pueden considerarse secuencias "basura" que se hélice 5 (codificada por el exón 5).
deben cortar para que se pueda conformar la "versión En el segundo caso de empalme no se incluye el
con las partes buenas" de la molécula de ARN. exón 3 en el ARNm maduro. Este se compone de:
¿Cuáles son las "partes buenas"? Los fragmentos de exón 1 - exón 2 - exón 4 - exón 5. Cuando se
ARN que no se eliminan se llaman exones. El traduce el transcrito, se especifica la proteína B,
una proteína con cuatro dominios: hélice 1
espliceosoma pega los exones para generar el
(codificada por el exón 1), hélice 2 (codificada por
ARNm final y maduro, el cual se envía fuera del
el exón 2), listón 4 (codificado por el exón 4) y
núcleo.
hélice 5 (codificada por el exón 5). No contiene el
listón 3 porque el exón 3 no se encuentra en el
ARNm.
En el tercer caso de empalme no se incluye el exón
4 en el ARNm maduro. Este se compone de: exón
1 - exón 2 - exón 3 - exón 5. Cuando es traducido,
se especifica la proteína C, una proteína con cuatro
dominios: hélice 1 (codificada por el exón 1), hélice
2 (codificada por el exón 2), listón 3 (codificado por
el exón 3) y hélice 5 (codificada por el exón 5). No
Diagrama de un pre-ARNm en el que se indican contiene el listón 4 porque el exón 4 no se
exones e intrones. A lo largo de la cadena del encuentra en el ARNm.
ARNm, hay un patrón alternante de exones e
intrones: exón 1 - intrón 1 - exón 2 - intrón 2 - exón
3. Cada uno consta de un segmento de nucleótidos
de ARN. Durante el empalme, los intrones se
retiran del pre-ARNm y los exones se vuelven a
pegar para formar un ARNm maduro que no
contiene las secuencias de intrones.
Un punto clave aquí es que es solo los exones de
un gen codifican proteína. Los intrones no solo
carecen de información para construir una
proteína, en realidad tienen que ser eliminados
para el ARNm codifique una proteína con la
secuencia correcta. Si el espliceosoma no quita un
intrón, se obtendrá un ARNm con "basura" extra y
se producirá una proteína errónea durante la
traducción.
Empalme alternativo
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LA TRANSCRIPCIÓN EN PROCARIOTAS:
EL CÓDIGO GENÉTICO
INICIACIÓN
4. La secuencia AUG codifica el principio de la
región que se va a traducir y al mismo tiempo Para que pueda comenzar la traducción,
sirve para codificar al aminoácido metionina. necesitamos unos cuantos ingredientes clave; estos
Por lo tanto, todas las proteínas comienzan son:
por la metionina. Ahora bien, posteriormente, Un ribosoma (que viene en dos
esta metionina que ocupa la posición inicial subunidades, grande y pequeña)
puede ser eliminada. Un ARNm con las instrucciones para la
proteína que vamos a construir
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Un ARNt "de inicio" que lleva el primer medida que los ARNt entran a los espacios en el
aminoácido de la proteína, que casi ribosoma y se unen a los codones, sus aminoácidos
siempre es metionina (Met) se unen a la cadena de polipéptidos creciente en una
Durante la iniciación, estas piezas deben reacción química. El resultado final es un polipéptido
reunirse justo de la forma correcta. Juntas, cuya secuencia de aminoácidos refleja la secuencia
forman el complejo de iniciación, el de codones en el ARNm.
ensamblaje molecular para comenzar a
fabricar una nueva proteína. En bacterias, la situación es un poco distinta. Aquí, la
subunidad ribosomal pequeña no comienza en el
extremo 5' del ARNm y viaja hacia el extremo 3'. En
La iniciación de la traducción sucede así: primero,
lugar de ello, se une directamente a ciertas
el ARNt que lleva metioina se une a la subunidad
secuencias en el ARNm. Estas secuencias de Shine-
ribosomal pequeña. Juntos, se unen al extremo 5' Delgarno se encuentran justo antes de los codones
del ARNm al reconocer el casquete de GTP 5' (que de iniciación y "se los señalan" al ribosoma.
se agregó durante el procesamiento en el núcleo).
Luego, "caminan" sobre el ARNm en la dirección
3', y se detienen cuando llegan al codon de inicio
(a menudo, pero no siempre, el primer AUG).^66
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metionina del primer ARNt al aminoácido en el pequeña una de la otra y del ARNm, cada elemento
segundo ARNt en el sitio A. puede participar (y generalmente lo hace
No está mal. Ahora tenemos dos aminoácidos, ¡un rápidamente) en otra ronda de traducción.
polipéptido (muy pequeño)! La metionina forma
el extremo-N del polipéptido, y el otro aminoácido
es el extremo-C.
TERMINACIÓN
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Epílogo: el procesamiento
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