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Las principales pirimidinas que hay en los nucleótidos son uracilo (2,4-
dioxopirimidina, U), timina (2,4-dioxo-5-metilpirimidina, T) y citosina (2-oxo-4-
aminopirimidina, C). Las principales purinas son adenina (6-aminopurina, A) y
guanina (2-amino-6-oxopurina, G).
QFB. Andrea Guadalupe Flores Valdes
M. en C. de los Alimentos y Biotecnología
Tanto el DNA como el RNA contienen dos bases purínicas principales, adenina y
guanina y dos pirimidinas principales. Tanto en el DNA como en el RNA una de las
primidinas es la citosina pero la segunda no es la misma en los dos, en el DNA es
timina y en el RNA uracilo. Aunque raramente se encuentra timina en el RNA o uracilo
en el DNA.
Nucleósido
Los nucleósidos están formados por ribosa y desoxirribosa y una base heterocíclica.
En cada nucleósido, un enlace b-N-glicosídico conecta el C-1 del azúcar al N-1 de la
pirimidina o al N-9 de la purina.
Los nombres de los nucleósidos se derivan de los de sus bases. El ribonucleósido
que contiene adenina se llama adenosina; su contraparte desoxi se llama
desoxiadenosina. De igual modo, los ribonucleósidos de guanina, citosina y uracilo
son guanosina, citidina y uridina, respectivamente. Los desoxirribonucleósidos de
guanina, citosina y timina son desoxiguanosina, desoxicitidina y desoxitimidina,
respectivamente.
Nucleótidos
Los ribonucleósidos contienen tres grupos hidroxilo que se pueden fosforilar (2’, 3’
y 5’), y los desoxirribonucleósidos contienen dos de esos grupos hidroxilo (3’ y 5’).
En los nucleótidos naturales, los grupos fosforilo suelen estar unidos al átomo de
oxígeno del grupo 5’-hidroxilo.
Cuando contiene otras bases secundarias: En el DNA, las formas metiladas de las
bases principales, donde solo se indica la posición en el anillo donde se ha producido
la sustituación (*5-metilcitosina); en DNA víricos, ciertas bases pueden estar
hidroximetiladas o glucosiladas. Estas alteraciones sirven como señales específicas
para la regulación o protección de la información genética.
Los secuencia lineal de nucleótidos de los ácidos nucleicos están unidos por
enlaces fosfodiéster.
Unidos covalentemente mediante “puentes” de grupos fosfato, en los cuales el
grupo hidroxilo en 5’ de un nucleótido está unido al grupo hidroxilo en 3’ del
nucleótido siguiente mediante un enlace fosfodiéster. Este enlace se crea por la
polaridad de ambos grupos haciendo que la molécula del DNA y RNA sea hidrofílicos
ESTRUCTURA
Las hebras son complementarias, y una puede servir como plantilla para la otra.
La mayor parte de las moléculas de ADN consisten de dos hebras, de polinucleótidos.
Cada una de las bases en una hebra forma puentes de hidrógeno con una base de
la hebra opuesta. La guanina se aparea con citosina y la adenina con timina,
maximizando los puentes de hidrógeno entre sitios potenciales. Entonces, los pares
de bases G/C tienen tres puentes de hidrógeno, y los pares de bases A/T tienen dos.
Antiparalelas
Los esqueletos de azúcar-fosfato en las hebras complementarias de ADN de doble
hebra tienen orientaciones opuestas. En otras palabras, son antiparalelas. Cada
extremo del ADN de doble hebra está formado por el extremo 5’ de una hebra y el
extremo 3’ de la otra.
Las dos cadenas se enrollan entre sí para formar una estructura helicoidal de doble
hebra, o doble hélice.
Las interacciones no covalentes cooperativas entre las superficies superior e inferior
de cada par de base acercan entre sí a esos pares y crean un interior hidrofóbico que
hace que se tuerza el esqueleto de azúcar-fosfato. Son esas interacciones de
apilamiento las que crean la conocida hélice.
Estabilidad
La estructura del ADN es estable gracias a:
- Enlaces de hidrógeno que se forman en los pares de bases
- El apilamiento de las bases nitrogenadas: éstas exhiben la tendencia a apilarse unas
sobre otras con una orientación más o menos perpendicular al eje de la hélice, de
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forma que las interacciones de nubes electrónicas de los orbitales entre las bases
apiladas contribuye a la estabilidad de la doble hélice (fuerzas de van der Waals).
- Interior hidrofóbico
- La hidratación de los grupos polares del esqueleto azúcar-fosfato con el entorno
acuoso.
Desnaturalización
Desenrollamiento y la separación de las hebras individuales complementarias.
Durante la replicación, reparación, recombinación y transcripción del ADN, se da
lugar a alteraciones en distintas regiones localizadas de la doble hélice.
Calor o agente caotrópico (urea o cloruro de guanidinio). Al elevar la T° (85°C), se
dispersan las bases y se rompen puentes de hidrógeno entre éstas.
La temperatura a la que la mitad del ADN se ha convertido en una sola cadena se le
llama punto de fusión, Tm.
El desensamble comienza con el desenrollamiento de un tramo interno corto de
ADN, formando una “burbuja” de una hebra. Esta burbuja de una hebra desestabiliza
rápidamente los pares apilados de bases, y esta desestabilización se propaga en
ambas direcciones a medida que se expande la burbuja.
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M. en C. de los Alimentos y Biotecnología
Es más fácil fundir ADN rico en A/T que ADN rico en G/C, por las interacciones de
apilamiento más débiles y un puente de hidrógeno menos.
Absorbancia
Los dobles enlaces conjugados de derivados de purina y pirimidina (bases
aromáticas nitrogenadas) de las cadenas de DNA absorben luz ultravioleta. Si bien
los espectros son dependientes del pH, a pH de 7.0 todos los nucleótidos comunes
absorben luz a una longitud de onda cercana a 260 nm.
Esta característica es usada para determinar su concentración.
- A-ADN: está enrollado más apretadamente que el B-ADN, y los surcos mayor y
menor tienen ancho similar. Hay unos 11 pb por vuelta y los pares de bases están
desplazados unos 20° en relación al eje mayor de la hélice.
- Z-ADN: no hay surcos y la hélice es izquierda, no derecha. Regiones ricas en G/C.
Se dice que está relajada si tal molécula puede reposar plana sobre una superficie.
*Cromatina
*Nucleosomas
*Hidrólisis de ac. nucleicos