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SantanderBio Research Project No. 8864 (Contract No. 00002243). Biodiversity and ecosystem services for integral management of the territory - Discovering strategic
ecosystems for the strengthening of governance in the department of Santander. View project
All content following this page was uploaded by Martha Patricia Ramirez Pinilla on 23 August 2014.
Resumen
Las colecciones biológicas son depositarias del patrimonio biológico del país. Sin embargo, no siempre es fácil
acceder a la información asociada a estas colecciones, por falta de recursos y tiempo para extraer los datos
de las etiquetas de colecta o catálogos de los especímenes. Gracias a la cooperación entre el Instituto de
Ciencias Naturales de la Universidad Nacional de Colombia (ICN), la Escuela de Biología de la Universidad
Industrial de Santander (UIS) y la ONG Idrocolectivo (IDRO), pretendemos divulgar datos biológicos de alta
calidad y permitir su uso a través de redes académicas como RENATA. Este esfuerzo contribuye al
fortalecimiento de procesos de investigación científica, conservación de la biodiversidad, educación superior
y educación ambiental, redundando en beneficios para todos los colombianos.
Abstract
Biological collections are repositories of natural heritage. Nevertheless, it's not always easy to access the
information associated with these collections either because of constraints on time or resources necessary to
extract the information from specimen labels or catalogues. Through a joint effort by the Instituto de
CienciasNaturales of the Universidad Nacional de Colombia (ICN), the Escuela de Biología of the Universidad
Industrial de Santander (UIS) and the NGO Idrocolectivo (IDRO), an environmental education organization,
we are making high quality biological collections data available across academic networks as RENATA. In
conclusion, this effort contributes to strengthen scientific research, conservation, higher education and public
outreach about biodiversity.
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INTRODUCCIÓN
Las colecciones biológicas son bibliotecas de especímenes, es decir, acervos de ejemplares que se
encuentran almacenados en condiciones especiales para garantizar su integridad a través del tiempo. Los
especímenes brindan información biológica a distintos niveles: histórico, geográfico, genético, ecológico,
anatómico y morfológico, entre otros. Las colecciones son, por tanto, depositarias del patrimonio biológico
de la humanidad, almacenando además ejemplares que en muchos casos son testigos únicos de especies ya
extintas.
Siendo Colombia un país megadiverso, estas colecciones adquieren gran importancia en procesos
investigativos, educativos y de conservación de la biodiversidad, que conciernen no solo a nuestro país sino
también al mundo entero. En la actualidad, las colecciones biológicas del Instituto de Ciencias Naturales de
la Universidad Nacional de Colombia (ICN) contienen cerca de un millón de ejemplares que incluyen hongos,
plantas, animales, polen y especímenes arqueológicos. A su vez, las colecciones adscritas a la Escuela de
Biología de la Universidad Industrial de Santander (UIS) contienen más de 20000 ejemplares de plantas,
animales y preparaciones depositadas en la colección limnológica.
No obstante la gran cantidad de datos sobre la biodiversidad nacional que albergan estas dos instituciones
en sus colecciones, no es fácil acceder a ellos para desarrollar investigación y apoyar la toma de decisiones
en el sector ambiental. Además, es aún más difícil para la comunidad no científica apropiarse de estos datos,
limitando la difusión del conocimiento sobre biodiversidad en el país. Esta situación se debe principalmente
a falta de recursos y tiempo para extraer la información directamente de las etiquetas de colecta de los
especímenes o catálogos. Además, la manipulación de los ejemplares de las colecciones biológicas requiere
formación especializada para evitar su deterioro.
Con el desarrollo de este proyecto, financiado por el Ministerio de Educación Nacional (Red RENATA) y
cofinanciado por la Universidad Nacional de Colombia, la Universidad Industrial de Santander y la ONG
Idrocolectivo (IDRO), se entregan 13800 nuevos registros biológicos digitalizados y georreferenciados de alta
calidad provenientes de las colecciones biológicas del ICN y la UIS y que están visibles a través de los
portales de las colecciones virtuales de dichas instituciones. Además, se generó un nuevo portal de
colecciones virtuales para la UIS y una aplicación web de Educación Ambiental, que permitirá tener un
conocimiento general de las características que diferencian los principales grupos de reptiles presentes en
Colombia. Por lo anterior, consideramos que el presente es proyecto pionero, ya que propende por la
divulgación de la información biológica contenida en las colecciones y brinda la posibilidad de incorporarla a
procesos educativos, de investigación y conservación, en un mundo virtual, disponible para cualquier
persona con acceso a internet.
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CONCEPTOS TEÓRICOS
Las colecciones biológicas y su digitalización
Los adelantos de internet y las Tecnologías de la Información y las Comunicaciones (TIC) de las últimas
décadas han facilitado el acceso a información difícil de obtener, al menos en tiempo real. Por esto, muchas
colecciones biológicas del mundo ya han adelantado importantes esfuerzos para mostrar y compartir datos
e imágenes de sus ejemplares a través de sus portales web y se han originado iniciativas que pretenden
concentrar y patrocinar estos esfuerzos con el fin de garantizar que la información sobre la biodiversidad
mundial circule libremente y sea de fácil acceso para todos. En este contexto, las iniciativas más importantes
a nivel local, regional y mundial son: el Sistema de Información sobre Biodiversidad de Colombia (SIB
Colombia); The Inter American Biodiversity Information Network (IABIN); The Global Biodiversity Information
Facility (GBIF) y The Global Plant Initiative (GPI).
En concordancia con varios acuerdos e iniciativas internacionales como el Convenio Sobre la Diversidad
Biológica firmado por los países miembros de la Organización de Naciones Unidas [6] y la Iniciativa Global
Sobre Taxonomía (GTI), que propenden por el conocimiento y conservación de la biodiversidad mundial así
como del libre intercambio de información sobre ella, el ICN incluye como una de sus principales metas el
“divulgar los resultados de las actividades de investigación del Instituto, para difundir el conocimiento sobre
los recursos naturales en Colombia” [11]. En consecuencia, el personal del ICN viene trabajando arduamente
desde el año 2004 para facilitar acceso a la información almacenada en sus colecciones, a través de la
sistematización y liberación de datos en su portal web (www.biovirtual.unal.edu.co), lo que garantiza el libre
acceso a este recurso. Durante este proceso, el ICN ha sistematizado y liberado datos de cerca del 50% de
sus colecciones biológicas (casi 550000 registros), gracias a esfuerzos cooperativos con diferentes redes y
sistemas de información nacionales e internacionales como GBIF, IABIN, GPI, el SIB Colombia y la Red
RENATA. Además, gracias a la experiencia adquirida, viene desarrollando proyectos conjuntos con
entidades nacionales para la transmisión de experiencias en lo referente a sistematización y liberación de
datos de colecciones biológicas, dentro de los que se encuentran la UIS e IDRO.
Para Okada et al. [5], existen dos tipos de Educación Ambiental (EA): la EA directa y la EA indirecta. La
primera se refiere a aquella desarrollada en espacios naturales en la cual los educandos pueden aprender
debido al contacto directo con los ecosistemas. La segunda corresponde a material generado por
educadores ambientales, como libros, videos, grabaciones, juegos y herramientas digitales, que promueven
el aprendizaje en entornos virtuales y a su vez permiten el acceso a información a la que no podría
accederse normalmente, principalmente por la dificultad de visitar algunos entornos naturales, como la
selva húmeda tropical o, en este caso, las colecciones científicas. Según Cabero et al. [4], la ventaja principal
del uso de los multimedia en la Educación Ambiental es que permite ofrecer al usuario la posibilidad de
aprender a su propio ritmo, lo que motiva al estudiante y lo estimula a retener mayor información. En este
orden ideas, se considera que el multimedia reduce el tiempo de aprendizaje y cuenta con consistencia
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Teniendo en cuenta este marco conceptual, se hace evidente la necesidad para que desde la academia se
libere el conocimiento sobre el inmenso acervo biológico que custodian instituciones de educación superior
como la UIS y el ICN, de manera que este permee procesos educativos a todo nivel.
METODOLOGÍA DE DESARROLLO
Sistematización, georreferenciación y difusión de los datos biológicos de las colecciones biológicas del ICN
y la UIS
El proceso de digitalización de una colección comprende distintas etapas, como son: digitalización de los
datos, georreferenciación y puesta a disposición del conjunto de datos a la comunidad en general a través
de canales de comunicación, como la web. Estos procesos son además acompañados por protocolos de
control de calidad, para asegurar la integridad de los datos.
Digitalización de datos. Los datos a digitalizar se extrajeron de los catálogos de las colecciones en papel y
etiquetas de los ejemplares y se cargaron en la aplicación Specify® 6, que es una aplicación para la gestión y
administración de bases de datos de colecciones biológicas que cuentan con los recursos y personal
necesarios para su administración. Esta aplicación cuenta con una interfaz simplificada que permite realizar
diferentes gestiones sobre la base de datos y valida la consistencia de la información. Cabe mencionar que
el proceso de sistematización desarrollado en el ICN e implementado en este proyecto [8], cumple con
normas internacionales, lo que hace posible que los datos sean convertidos fácilmente a estándares
mundiales para el intercambio de información biológica como el Darwin Core versión 1.4 [10].
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Disponibilidad de la información en línea. Una vez la información fue digitalizada y georreferenciada, se hizo
disponible para el público en general. Para esto, la página web de cada una de las instituciones cuenta con
un buscador que permite realizar búsquedas tomando como criterios los campos significativos de la base de
datos. La consulta es realizada sobre un copia de la base de datos que maneja Specify®6 y es mostrada a
través del navegador con toda la información correspondiente al ejemplar consultado (información
taxonómica, geográfica, determinación y colección), y en caso de que existan, se incluyen imágenes, mapas
y sonidos.
La página web de las colecciones biológicas de la UIS fue desarrollada con software open source, cuya
implementación se basó en el modelo de la página web de las colecciones biológicas del ICN. Fue creada en
lenguaje PHP, lo cual permite realizar consultas a una base de datos en MySQL. Esta base de datos es una
copia realizada a una base de datos de producción, gestionada con el software Specify 6®. La copia de la
base de datos es generada periódicamente dependiendo del índice de cambio que tenga la base de datos de
producción. Esto se realiza con el fin de tener más control sobre la información que se vaya a publicar a
través del portal de internet; además, no es recomendado tener esta información en tiempo real ya que se
pueden presentar inconsistencias. A este recurso se incorporaron herramientas de libre acceso, como un
visor de imágenes, Zoomify, un visor de mapas usando la aplicación Google Maps y reproductor de audio
MP3 Player, que permiten mostrar la información de cada ejemplar con mayor detalle.
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RESULTADOS
Sistematización de colecciones y aplicación web
Gracias a este esfuerzo cooperativo se entrega un nuevo portal de colecciones biológicas para la UIS, 13800
nuevos registros biológicos digitalizados y georreferenciados de alta calidad de las colecciones biológicas del
ICN y la UIS y una aplicación web de educación ambiental que permite tener un conocimiento general de las
características que diferencian los principales grupos de reptiles presentes en Colombia e información muy
importante de esta biota. El aplicativo puede ser consultado en los portales del ICN, UIS e IDRO (tabla 1).
CONCLUSIONES
Los beneficios de la puesta a disposición de datos biológicos en la web para que puedan ser consultados
libremente son enormes y como plantea Chapman[1], luego de una amplia revisión, los usos que se le
pueden dar a los datos sobre registros de especies biológicas se enmarcan en casi todos los aspectos de la
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vida humana en cualquier parte del mundo. Es por esto que la liberación de la información primaria de las
especies de plantas y animales que el ICN y la UIS guardan en sus colecciones, brindará varios beneficios
para la sociedad en general, entre los cuales están:
Las autoridades ambientales contarán con datos primarios de fauna y flora con los cuales apoyar sus
estudios y dictámenes ambientales de manera objetiva y oportuna.
En consecuencia con las políticas nacionales sobre el uso de las TIC y la educación en ambientes virtuales, la
liberación de información biológica primaria permitirá apoyar procesos educativos en ambientes web a todo
nivel, desde la básica primaria hasta el nivel de posgrado, en cualquier parte del mundo. Esta acción
brindará la oportunidad de verificar, profundizar y ampliar el conocimiento sobre la biodiversidad regional y
del país. Por otra parte, la vinculación al proyecto de un componente de educación ambiental permitirá
llevar a la comunidad (por ejemplo, estudiantes de primaria y bachillerato, docentes de ciencias naturales y
educadores ambientales), el conocimiento científico que poseemos en la academia sobre el grupo de los
reptiles.
Por último, con la formación de talento humano se beneficia no solo a las instituciones aquí involucradas,
sino también a otras instituciones del sector público o privado, fortaleciendo tanto la educación, como el
contacto con la investigación en niveles tempranos de la formación de nuestros estudiantes y profesionales.
Estudiantes e investigadores de otras regiones no tendrán que viajar hasta Bogotá y Bucaramanga para ver y
obtener la información de los grupos biológicos de su interés. Gracias a la implementación de los productos
ya existentes en materia de liberación de información de las colecciones del ICN y los nuevos productos
derivados de este esfuerzo, ahora con tan solo entrar en los portales web del ICN, la UIS e IDRO se puede
obtener la información requerida y en muchos casos fotografías de los especímenes, haciendo más ágiles los
procesos de investigación sobre la flora y fauna colombiana.
Sin duda, los aspectos mencionados anteriormente fortalecerán la función social de las colecciones
científicas, generarán afectos, emociones, y por tanto, un tipo de conocimiento que permitirá aportar a la
protección y conservación de la biodiversidad colombiana. Además, se estrecharán los lazos
interinstitucionales y de intercambio académico, tan importantes para enriquecer la investigación y el
desarrollo científico en el país.
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AGRADECIMIENTOS
A las personas que laboraron en la realización de este proyecto en la Universidad Nacional de Colombia, la
Universidad Industrial de Santander y en la ONG Idrocolectivo. Al profesor Jaime Aguirre por su apoyo, a
Juliana Cepeda por la lectura crítica del manuscrito y aportes, y a los evaluadores anónimos del manuscrito.
A la UN, la UIS e IDRO por la infraestructura, al Ministerio de Educación Nacional (Red RENATA) por la
financiación y a Gladys Cárdenas por su aporte en la redacción del texto científico del aplicativo en línea
sobre Reptiles de Colombia.
REFERENCIAS
[1] A.D. Chapman, Uses of Primary Species-Occurrence Data: report for the Global Biodiversity Information
Facility. Copenhagen: Global biodiversity Information Facility, pp. 106, 2005.
[2] A.D. Chapman and J. Wieczorek (eds.), Guide to best Practices for Georeferencing,Copenhaguen: Global
biodiversity Information Facility, pp. 80, 2006.
[3] F. Ojeda y F. Perales, “Ecourban: nuevos caminos para nuevas ideas en Educación ambiental,” Revista
Eureka Enseñanza y Divulgación Científica, vol. 5, no. 1, pp. 75-93, 2008.
[4] J. Cabero y M. Llorente, “Las TICs y la Educación Ambiental,” Revista Latinoamericana de Tecnología
Educativa, vol. 4, no. 2, pp. 9-26, 2005.
[5] M. Okada, H. Tarumi, T. Yoshimura and K. Moriya, “Collaborative Environmental Education Using
Distributed Virtual Environment Accessible from Real and Virtual Worlds,” ACM SIGAPP Applied Computing
Review, vol. 9, no. 1, pp. 15-21, 2002.
[6] Naciones Unidas, “Convenio Sobre la Diversidad Biológica”, 2009. [Online]. Available:
http://www.cbd.int/doc/legal/cbd-es.pdf
[8] R. Bernal, M. Celis and B. Gómez, Manual of best practice for the computerization of the National
Colombian Herbarium: Final report for Global biodiversity Information Facility. Bogotá: Universidad Nacional
de Colombia, pp. 43, 2006.
[10] Taxonomic Databases Working Group, “Darwin Core” Biodiversity Information Standards, 2009.
[Online]. Available: http://rs.tdwg.org/dwc/index.htm
[11] Universidad Nacional de Colombia, “Instituto de Ciencias Naturales” Instituto de Ciencias Naturales,
2011 [Online]. Available: http://www.ciencias.unal.edu.co/unciencias/web/dependencia/?dep=6
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