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Evaluación de la entrega mediada por AAV de shRNA para apuntar vulnerabilidades genéticos de cáncer de mama
basal-al igual

Catarina Pinto una , segundo , Gabriela Silva una , Ana S. Ribeiro do , re , Mónica Oliveira do , re , Manuel Garrido una ,
Vanessa S. Bandeira una , André Nascimento una , Ana Sofia Coroadinha una , segundo , Cristina Peixoto una , segundo ,
Ana Barbas una , do , Joana Paredes re , mi , Catarina Brito una , segundo , Paula M. Alves una , segundo , •
una IBET, Instituto de Biología Experimental e Tecnológica, Apartado 12, 2780-901 Oeiras, Portugal
segundo Instituto de Tecnología Química Biológica e António Xavier, la Universidad Nova de Lisboa, Av. da República, 2780-157 Oeiras, Portugal
do Bayer Portugal, Carnaxide, Portugal
re I3S, Instituto de Investigação e Inovação em Saúde, Universidade do Porto, Rua Alfredo Allen, 208, 4200-135 Oporto, Portugal
mi IPATIMUP, Instituto de Patología Molecular e Inmunología de la Universidad de Oporto, Rua Dr. Roberto Frías s / n, Oporto, Portugal

INFORMACIÓN DEL ARTÍCULO RESUMEN

palabras clave: vectores virales adeno-asociados (AAV) para aplicaciones de terapia génica están ganando impulso, con más terapias en movimiento en etapas posteriores
Terapia de genes de desarrollo clínico y hacia la aprobación de mercado, a saber, para la terapia del cáncer. El desarrollo de vectores citotóxicos menudo se ve obstaculizada
vectores virales adenoasociados Basal-como por los efectos secundarios que surgen cuando se infectan las células no diana, y su producción se pueden obstaculizados por los efectos tóxicos del
la producción de AAV cáncer de mama
transgén en las líneas celulares que producen. En este estudio, se evaluó el potencial de suministro mediado por rAAV de los ARN de horquilla corta
(ARNhc) para apuntar vulnerabilidades genéticos de cáncer de mama basales-similares. Nuestros resultados muestran que mediante la optimización de la
estequiometría de los plásmidos después de la transfección y la hora de la cosecha, es posible aumentar los títulos virales y calidad. Todos los vectores
rAAV-shRNA obtenidos transducen eficientemente las líneas celulares BLBC MDA-MB-468 y HCC1954. PSMA2 se asoció con una disminución significativa
en la viabilidad celular y la inducción apop- tosis. Es importante destacar que, rAAV2-PSMA2 también se ralentizó el crecimiento tumoral en un modelo de
xenoinjerto BLBC ratón, así potencialmente representa una estrategia terapéutica contra este tipo de cáncer.

1. Introducción como la única opción de tratamiento ( Caldas Lopes et al., 2009 ; Schneider et al., 2008 ). El tratamiento
estándar para estos pacientes, a saber, la cirugía, la radiación y la quimioterapia, a menudo no
La terapia génica tiene la oportunidad de expandirse más allá de terapias basadas drogas erradicar completamente la enfermedad, es incapaz de mantener una protección sostenida, y se
convencionales y entregar un tratamiento dirigido a través ulación REG de genes endógenos ( Naldini, acompaña de efectos secundarios graves, tales como la citotoxicidad para las células no cancerosas ( Luo
2015 ). A medida que nuestro conocimiento sobre cancer's inicio y la progresión evoluciona, las et al., 2015 ; Santiago-Ortiz y Schaffer, 2016 ). Por lo tanto, existe una fuerte necesidad médica no
características fenotípicas específicas de tumores se descubren que puede ser explorado en este satisfecha de terapias dirigidas para BLBC con im- me demostraron la eficacia clínica, efecto con
contexto, para lograr una mayor especificidad y potencia de las terapias desarrolladas ( Miest y menores efectos secundarios, y los tiempos de supervivencia del paciente más largos dirigidos ( Carey
Cattaneo, 2013 ). cáncer de mama (BLBC) pacientes de tipo basal pueden beneficiarse en gran et al., 2010 ; Santiago-Ortiz y Schaffer, 2016 ). Una gran cantidad de esfuerzo se ha llevado a cabo
medida del desarrollo de este tipo de terapias. A pesar de que este subtipo representa hasta el 20% hacia el descubrimiento de dianas moleculares accionables para esta enfermedad ( Bianchini et al.,
del cáncer de mama en todo el mundo (BC) inci- dencia, es responsable de un número 2016 ). Recientemente, Petrocca et al realizaron un genoma de pantalla ancha pequeños ARN
desproporcionado de muertes, ya que a menudo conduce a la recaída con metástasis a distancia ( Schneiderinterfiriendo (siRNA) para identificar las vulnerabilidades genéticos selectivos causar letalidad en este
et al., 2008 ). La falta de marcadores moleculares y caracterización deficiente, alteradas por una subtipo de cáncer de mama ( Petrocca et al., 2013 ). Aunque prometedores, estos cables todavía se
presentación molecular heterogéneo, conduce a la falta de terapias dirigidas y deja los clínicos con enfrentan a retos considerables que llegan a la clínica debido a la ineficacia de las plataformas de
fármacos quimioterapéuticos citotóxicos entrega ( Kacsinta y

• El primer autor en: IBET, Apartado 12, 2780-901 Oeiras, Portugal.

Correos electrónicos: cpinto@ibet.pt (C. Pinto), gabrielasilva@ibet.pt (G. Silva), aribeiro@ipatimup.pt (AS Ribeiro), monicao@ipatimup.pt (M. Oliveira),
manuel.garrido@ibet.pt (M. Garrido), vbandeira@ibet.pt (VS Bandeira), un ascimento@ibet.pt (A. Nascimento), avalente@ibet.pt (AS Coroadinha),
peixoto@ibet.pt (C. Peixoto), ab@ibet.pt (A. Barbas), jparedes@ipatimup.pt (J. Paredes), anabrito@ibet.pt (C. Brito), marques@ibet.pt (PM Alves).

https://doi.org/10.1016/j.jbiotec.2019.05.016
Recibido el 1 de de agosto de de 2018; Recibido en forma 24 de mayo 2019 revisado; Aceptado el 27 de de mayo de 2019

Disponible en línea del 28 de mayo de 2019

0168-1656 / © 2019 Publicado por Elsevier


C. Pinto, et al. Journal of Biotechnology 300 (2019) 70-77

Dowdy, 2016 ). y la orientación se confirmaron por análisis de restricción y secuenciación. shRNA secuencias
Recombinante viral adeno-asociado (rAAV) vectores se han in- creasingly éxito como específicas de genes se obtuvieron de la base de datos consorcio con- RNAi ( http://www.broadinstitute.org/rnai/publ
plataformas de entrega de terapia de genes y han demostrado ser un enfoque prometedor para tratar ). Las secuencias de ARNhc control de mezcla aleatoria, no hay una orientación a los genes
una variedad de enfermedades humanas ( Brimble et al., 2016 ; Kaplitt et al., 2007 ; Testa et al., 2013 ). humanos o de ratón conocidas, fueron de Sigma. Los números de catálogo shRNA son:
El número de pliegues in- de los estudios preclínicos y ensayos clínicos humanos ha demostrado su PLK1shRNA: TRCN0000006247; MCL1shRNA: TRCN0000196390; PSMA2shRNA:
perfil favorable de seguridad, administración de genes eficaz, y la expresión transgénica resistente y TRCN0000003879; PSMB4shRNA: TRCN0000003914; Ctrl1shRNA: SHC202; y Ctrl2shRNA:
persistente en vivo, con la respuesta inmune manejable y efectos adversos menores tras la inyección ( Samulski
SHC016.
y Muzyczka, 2014 ; Santiago-Ortiz y Schaffer, 2016 ; Snyder y Moullier de 2011 ). De hecho, un vector
basado en rAAV1 para el tratamiento de una deficiencia de lipoproteína lipasa se convirtió en el
primer producto de terapia génica comercialmente-aprobado para aplicaciones clínicas por la Misión 2.3. Producción, purificación y determinación de títulos de vectores de rAAV-shRNA
de com- ( Bryant et al., 2013 ).

vectores rAAV-shRNA fueron producidos en células HEK293 T mediante sistema de transfección 2- o


3- plásmido utilizando 5 g de ADN / 1 x 10 6 células, con polietilenimina lineal (PEI; Polysciences) o con

potencial de vectores rAAV para aplicaciones de cáncer también se ha de- monstrated en varios CaPO 4 como reactivos de transfección. En las células HEK293 T del sistema 2-plásmido (se sembraron a
4-5 x 10 4 células / cm 2
in vitro estudios de cáncer, i n vivo modelos preclínicos de cáncer, y los ensayos clínicos, con una
amplia variedad de enfoques, tales como la entrega de factores anti-angiogénesis (PEDF, 20-24 h antes) fueron co-transfectadas a 70-80% de confluencia con dividual in- plásmidos
endostatina 34, Kringle pAAV-shRNA, generado arriba, más el plásmido pDG ( Grimm et al., 2003 ), Que codifica la reps y gorra
5, Kallistatin), genes suicidas (sistema HSV-TK y poliomavirus antígeno T medio), genes y los productos de adenovirus que codifica esenciales para la producción del vector AAV,
moléculas inmunoestimuladoras (TRAIL, interferones, utilizando diferentes proporciones de plásmido como se indica a continuación. 3-plásmido transfec-
Las interleuquinas), pequeñas moléculas de ARN de ADN codificada para la regulación cional ción se realizó con plásmidos: pAAV-shRNA, pAAV-Helper - que codifican productos génicos de
post-transcriptasa de oncogenes, moléculas de superficie celular inmunogénicas y antígenos tumorales adenovirus requeridos para la producción de partículas de AAV fective in-, y pAAV-RC - que codifican
( Ledford, 2015 ; Luo et al., 2015 ; Santiago-Ortiz y Schaffer, 2016 ). los genes rep y cap (necesaria trans 1:: elementos para la replicación y empaquetamiento del
genoma viral) (todos de Stratagene / Agilent), a una relación molar plásmido de 1-actuando 1. Todos
Aquí se describe un enfoque terapéutico basado en rAAV para apuntar BLBC. Firma los plásmidos, excepto pAAV-ARNhc, se amplificaron en células E. coli DH5a (Invitrogen). El ADN de
dependencias genéticas identificadas previamente para este subtipo de cáncer de mama (es decir, MCL plásmido se purificó con el kit de plásmido Qiagen EndoFree de, según las instrucciones del
1, PSMA2 y PSMB4) ( Petrocca et al., 2013 ) Fueron objeto usando suministro mediado por rAAV de Proveedor. Las transfecciones con la cejilla 4 método se realizaron usando el fosfato de calcio
shRNA. Con- downregulation Sist de los genes diana condujo a una disminución en la viabilidad Transfección Kit de Sigma (CAPHOS) según las instrucciones kit's. Las transfecciones de células
celular y la apoptosis inducida en líneas celulares de BLBC. Además, las inyecciones tratumoral in- HEK293 T con PEI se realizaron según los protocolos Dard dares utilizando ADN optimizada:
de vectores de rAAV de orientación PSMA2 resultado en el crecimiento del tumor ralentizó en un relación de PEI de 1: 1,8 (g), como pre viamente descrito ( Merten y Al-Rubeai, 2011 ). 48-72 h post
modelo de xenoinjerto BLBC. Además, nuestros resultados indican que la optimización del plásmido trans- fection, las células se lisaron con 0,1% de Triton-X100 (Sigma), la liberación de los vectores
tras la transfección estequiometría y el tiempo de la cosecha debe hacerse de una manera intracelulares en el sobrenadante. Se recogieron los medios con las células lisadas y se incubó con
dependiente de transgén, con el objetivo de eludir los posibles efectos citotóxicos de los transgenes 30 unidades / ml Benzonase ® nucleasa (Merck Millipore) y estéril 2mMMgCl 2 ( Sigma) durante 1 h a
en la línea celular productora y el rendimiento de los lotes de rAAV de mayor calidad . 37ºC, para la eliminación de la célula huésped y ADN desempaquetado. La solución se clarificó por
centrifugación (4000 XG / 30min / 4 0 C) y el sobrenadante que contiene el vector (mary de stock viral
pri-) se filtró a través de filtros de tamaño de poro de 0,45 m (Merck Millipore). La purificación de los
diferentes vectores de rAAV-shRNA se per- formada por cromatografía de afinidad utilizando la
2. Materiales y métodos resina de alto rendimiento AVB Sepharose (GE Healthcare), de acuerdo con ins- trucciones del
fabricante. La pureza se controló por SDS-PAGE seguido de In- stantBlue ™ y contenido de
2.1. Cultivo de células endotoxina evaluó con el kit de prueba de LAL cromogénico (Endosafe-PTS). Todos los vectores
usados ​en este estudio pasaron la prueba dotoxin es-.
HEK293 T (ATCC CRL-3216 ™) y las células HT1080 (ATCC ® células CCL121) se cultivaron
en alta glucosa (4,5 g / L) DMEM suplementado con 10% (v) de suero v / bovino fetal (FBS). Las
líneas celulares de cáncer de mama basales HCC1954 y MDA-MB-468, amablemente
proporcionados por el profesor Judy Lieberman (Medicina de Harvard Scholl, EE.UU.) se cultivaron
en medio RPMI 1640 suplementado con 10% (v / v) de FBS, 6 mM de HEPES y 5? M 2 -
mercaptoetanol. Medios y reactivos de cultivo celular fueron de Gibco Life Technologies. Las células
se incubaron a 37 ° C en una atmósfera humidificada con 5% de CO 2 en aire.
productividades virales fueron evaluados en las poblaciones virales primarios y vectores ficados
PUR. partículas (vp) de titración viral se realizó usando el kit de AAV titulación ELISA (PROGEN
Biotechnik GmbH), según las instrucciones del fabri- cante. Para rAAV-shRNA genoma de vector (vg)
2.2. Construcción de plásmidos pAAV-shRNA cuantificación, se extrajo el ADN viral y se purificó con el kit de alta puro viral de ácido nucleico
(Roche). Vg título se cuantificó por tiempo real cuantificación PCR (qPCR) de fragmento de ADN

Un plásmido de AAV2 vector que lleva un CMV-promotor del gen de GFP impulsado flanqueado promotor de CMV encapsidado que dirige la expresión del transgén GFP, en al menos 3 diluciones

por ITRs, y un gen de resistencia a puromicina bajo el control de un promotor HEF1 fuera de la en serie diferentes de las existencias de ADN viral extraído, en contra de un plásmido de ADN pAAV-

casete de expresión de AAV2 sin shRNA (pAAV-Puro) se generó basándose en el AAV2 Ctrl1shRNA curva estándar linealizado . Ocho diluciones en serie del estándar plásmido (que
contiene 10 8, 10 7, 10 6, 10 5, 10 4, 10 3, 10 2, y 10 1
construcción de vector pAAV - MSC-CMV-eGFP-CytbAS (especie de regalo del profesor U. Michel,
Universidad de Medicina de Göttingen, Alemania), después de la eliminación de la moter pro
adicional CMV. Para construir los vectores pAAV2-shRNA, fragmentos de ADN que con- tienen el
promotor H1, gen específico o control de mezcla aleatoria shRNA conse- Se-, y los sitios de copias de ADN de plásmido) se utilizaron para generar una curva estándar para la cuantificación
restricción BstBI y HindIII, en los 3'extremities 5 'y, respectivamente, se sintetizaron químicamente ( absoluta de las muestras de vectores. Todas las reacciones se realizaron por triplicado utilizando
GenScript) y se clonó en el sitio BstBI / HindIII de pAAV-Puro dentro de la caja de expresión de cebadores específicos de CMV (adelante: 5'-GCGCCTCTTAT ACCCACGTAG-3 'e inverso:
AAV2. Los plásmidos generados pAAV-shRNA fueron am- plified en células de E. coli Stbl3 5'-TAACACCGCCCCGGTTT-3') y la mezcla I Master SYBR Green (Roche). Análisis de los resultados
(Invitrogen), qPCR se llevó a cabo con el software LC480. partícula infecciosa (ip) de titración se per- formado en
las células de fibrosarcoma HT1080 como se ha descrito previamente ( Merten

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y Al-Rubeai, 2011 ). Brevemente, las células se transdujeron a 50% de confluencia con diluciones instrucciones.
seriadas de los stocks virales para 2 h. Después de 48 h de incubación en las células de los medios
completos se recogieron y el porcentaje de GFP + / células fected in- se cuantificó por citometría de 2.8. entrega xenoinjertos y de ratón del vector
flujo (Cyflow Espacio, Partec).
Todos los experimentos con animales se llevaron a cabo de acuerdo con las Directrices para el
2.4. pAAV-shRNA plásmido transfección Cuidado y Uso de Animales de Laboratorio, la Directiva 86/609 / CEE. modelo BLBC humano fue
establecida en N: NIH (s) II: nu / nu ratones desnudos con células MDA-MB-468. Brevemente, 2 × 10 6 células
células HEK293 T en 60-70% de confluencia fueron transfectadas transitoriamente con individuo MDA-MB-468 se inyectaron en la almohadilla de grasa mamaria de Mujer N: NIH (s) II: nu / nu ratones
pAAV-shRNA construye en 5 g de ADN por 1 × 10 6 células utilizando PEI como reactivo de transfección, en desnudos. De tres a cuatro ratones se mantuvieron por jaula, con alimento y agua
una relación ADN: PEI de 1: 2 (g). Después de 8 h de incubación, el medio se reemplazó, y las células se
cultivaron adicionalmente. Después de 24-48 h, las células fueron imágenes por microscopía de ad libitum, y se examinan diariamente. peso ratones y el volumen del tumor se midieron dos veces a
fluorescencia para la expresión de transgén de GFP y se cosechan para la extracción de ARN para la semana hasta que los tumores alcanzaron un volumen promedio de 100- 150 mm 3. Los ratones se
estudios de expresión génica y GFP + la cuantificación de células por citometría de flujo (Cyflow Espacio, distribuyen a continuación en diferentes grupos experimentales, con el volumen tumoral promedio
Partec). igual, para la iniciación del tratamiento. rAAV2-shRNA inyecciones intratumorales se realizaron dos
veces por semana, durante 3-4 semanas. Los tumores se midieron en dos dimensiones
perpendiculares y el volumen se calculó por la fórmula [volumen = (longitud) x (anchura) 2 / 2] para
2.5. rAAV-shRNA vector de transducción y activadas por fluorescencia clasificación de células aproximar el volumen de un elipsoide.

HCC1954 y las células MDA-MB-468 a 60-70% de confluencia fueron transducidas con vectores 3. resultados

individuales rAAV2-shRNA a una multiplicidad de infección (MOI) de 4 × 10 4 vg / célula en 2% de suero


de medios que contienen. Después de 8 h de incubación, el medio se sustituye por medio completo y 3.1. Desarrollo de vectores de VAAr que expresan eGFP y un shRNA orientación vulnerabilidades
trans células zamiento fueron seleccionadas mediante FACS para la expresión GFP 24 h y 48 h después genéticas BLBC
de allí-. Después del aislamiento FACS, las células se utilizaron inmediatamente para la extracción de
ARN para estudios de expresión génica o se cultivaron adicionalmente para los ensayos de viabilidad y la 3.1.1. Diseño y validación de plásmidos rAAV-shRNA
apoptosis. Ordenando se llevó a cabo en las instalaciones del Instituto Gulbenkian de Ciencia citometría Sobre la base de la representación excesiva de la maquinaria del proteasoma conduce identificado como

de flujo en MoFlo (Beckman Coulter) y FACSAria (Becton Dickinson) citómetros. BLBC vulnerabilidades intrínsecas en un estudio previo ( Petrocca et al., 2013 ), Dos subunidades del

proteasoma fueron elegidos como objetivos potenciales

- proteasoma subunidad alfa 2 (PSMA2) y la subunidad del proteasoma beta 4 (PSMB4). Otra
susceptibilidad persistente identificado fue MCL1, BCL2 regulador de la apoptosis de la familia
2.6. La expresión de genes (MCL1), una proteína anti-apoptótica que fue el tercer objetivo elegido para el presente estudio.
secuencias de ARNhc Tar geting estos genes (MCL1sh, PSMA2sh y PSMB4sh) se obtuvieron de una
El ARN total de las células se extrajo con Qiagen RNeasy Mini Kit según instrucciones del base de datos a disposición del público ( https://www.broadinstitute.org/ ARNi / TRC ). Una orientación
fabricante con la digestión con ADNasa. cDNA fue sintetizado, a partir de cantidades iguales de ARN, polo shRNA como quinasa 1 (Plk1), una proteína quinasa Ser / Thr altamente expresado durante la
por transcripción inversa usando el Advantage RT-para-PCR kit (Clontech Laboratories, Mountain mitosis ( Zitouni et al., 2014 ), También se obtuvo. La inhibición de esta proteína se ha demostrado
View, CA), o la alta fidelidad Kit de Síntesis de ADNc (Roche), según la fabri- Instrucciones de Türer. previamente para reducir la proliferación e inducir la apoptosis en células de cáncer ( Bhola et al.,
La expresión génica se cuantificó en Roche LightCycler 480 (LC480) utilizando cebadores 2015 ; Liu et al., 2017 ), Así PLK1sh se utilizó como control positivo. Además, dos scramble shRNA
específicos de genes y la mezcla I Master SYBR Green (Roche). Todos los experimentos se (Ctrl1sh y Ctrl2sh), sin objetivos conocidos en las células humanas o de ratón, sirvieron como
realizaron en plicate tri- y se recogieron los datos de curva de fusión para comprobar la especificidad controles negativos. Todas las secuencias de ARNhc fueron clonados en un vector de expresión
del producto. transcritos de ARNm se normalizaron a ambos hipoxantina fosforribosiltransferasa 1 ( HPRT1) pAAV, co-ex presionando un gen reportero eGFP para facilitar el seguimiento de la transducción de
y los niveles de proteína ribosomal L22 (rpl22) de ARNm en la misma muestra, y los resultados se células diana. Validación de shRNA eficiencia desmontables de los dife- rentes construcciones de
calcularon como el cambio veces en relación con células de control utilizando el método de plásmidos se evaluó mediante transfección transitoria de células HEK293 T. Se obtuvieron
cuantificación relativa avanzado desde el software LC480. Los cebadores usados ​fueron (directo e eficiencias desmontables gen diana que van desde 40 a 90%, dependiendo del shRNA ( Figura 1 ),
inverso, respectivamente): HPRT1: 5'-CCTGGCGTCGTGATT AGTGAT-3 'y Mostrando que las secuencias diseñadas causados ​potente y específico de silenciamiento del gen
5'-AGACGTTCAGTCCTGTCCATAA-3'; MCL1: 5'-TGC TTCGGAAACTGGACATCA-3 'y 5'-3' diana.
TAGCCACAAAGGCACCAAAAG-; Plk1: 5'-AAAGAGATCCCGGAGGTCCTA-3 'y 5'-GGCTGCGGTG
AATGGATATTTC-3'; PSMA2: 5'-GAGCGCGGGTACAGCTTTT-3 'y
5'-ACCACACCATTTGCAGCTTTA-3; PSMB4: 5'-CGC GAAGCGTTTTTGGGGT-3 'y
5'-GAGTGGACGGAATGCGGTA-3; Rpl22: 5'-CACGAAGG AGGAGTGACTGG-3 'y
5'-TGTGGCACACCACTGACATT-3'. 3.1.2. implementación de la plataforma para la producción de vectores rAAV-shRNA libre de endotoxina

Los procesos de producción basados ​en la transfección transitoria de células T HEK293


constituyen una plataforma versátil, que permite una pantalla de actuación rápida de múltiples
vectores de rAAV para el plomo (más prometedor Snyder, 2016 ; Snyder y Moullier de 2011 ; van der
Loo y Wright, 2016 ). Por lo tanto, para la producción de vectores de rAAV-shRNA, 2 y 3-transfección
2.7. La viabilidad celular y la apoptosis del plásmido utilizando CaPO _ 4 o PEI como agente de transfección, se pusieron a prueba.

Para investigar los efectos de los vectores de rAAV-shRNA sobre la viabilidad celular, las células La evaluación inicial de la productividad vector se realizó utilizando rAAV- Ctrl1sh para eludir
transducidas con ordenados se sembraron en placas de 96 pocillos a diferentes densidades de células efectos derivados de knockdown gen diana en la línea celular de producción (HEK293 T), lo que
y se incubaron durante 48-120 h. Después de cada período de incubación de 24 h, la viabilidad celular podría enmascarar los resultados. Como se observa en Figura 2 - A, no hubo diferencias significativas
se evaluó utilizando el reactivo de la viabilidad celular PrestoBlue ™ (Life Technologies), de acuerdo en la productividad (vg / célula) obtenida con los dos reactivos de transfección ensayadas. Mientras
con ins- trucciones del fabricante. Para los ensayos de apoptosis Se sembraron células transducidas que las altas tasas de transfección bajo costo y pueden hacer con CaPO 4 la opción obvia para
en placas de 24 pocillos, a diferentes densidades de células, y el número de células apoptóticas se producciones a pequeña escala, los rendimientos similares obtenidos en estas preparaciones nos
determinó por citometría de flujo usando el kit de apoptosis FLICA (inmunoquímicos Technologies) llevó a seguir con PEI transfección, para facilitar la escalabilidad y resultados más consistentes ( van
según der Loo y Wright, 2016 ).
del fabricante

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tabla 1
Optimización de la relación de plásmido y el tiempo de cosecha de vectores rAAV-shRNA.

tiempo de cosecha pDG: pAAVshRNA vg / célula ip / célula vp / vg

48 h post TF 1: 1 1.3E + 04 7.3E + 01 94


1: 3 2.9E + 04 9.9E + 01 29
1: 9 2.1E + 04 6.0E + 01 26
72 h post TF 1: 1 1.2E + 04 5.2E + 01 130
1: 3 1.4E + 04 8.3e + 01 105
1: 9 9.1e + 03 6.0E + 01 87

Figura 1. Validación de AAV-shRNA plásmidos para la regulación a la baja de las vulnerabilidades genéticas
BLBC. QRT-PCR análisis de la PLK1, MCL1, PSMA2, gen PSMB4 ex pression 24 h post-transfección de
células HEK293 T con las diferentes construcciones de plásmido. los niveles de mRNA se normalizaron contra
los niveles de limpieza rpl22 de ARNm dentro de la misma muestra y se muestran como el cambio veces en Fig. 3. caracterización purificada vector rAAV-shRNA. Purificación de diferentes vectores de
relación con los respectivos niveles en células de control transfectadas con control negativo scramble Ctrl1sh rAAV-shRNA se realizó por cromatografía de afinidad utilizando la resina de alto rendimiento AVB
plásmido. El gráfico representa los valores + desviación media estándar (SD) de dos experimentos Sepharose. Seis vectores rAAV-shRNA (dos controles revueltos negativos, un control positivo, y tres
independientes, con tres repeticiones técnica cada uno. vectores de rAAV-shRNA Tar geting tres genes de dependencia BLBC diferentes) se obtuvieron. La
pureza de vectores rAAV- shRNA se controló por SDS-PAGE seguido de tinción con azul de
instantánea. M: patrón de proteína; VP1, VP2, VP3: AAV proteínas estructurales.

En cuanto a los sistemas de transfección, como se observa en Figura 2 - B, sistema de transfección

2-plásmido entregado rendimientos de producción significativamente más elevados. En promedio, el título de

vector viral, como por vg / célula, fue hasta 5 veces superior con el sistema de 2-plásmido en relación con el consistentemente disminución del cociente vp / vg. Además, aumentar la proporción de pAAV en la

3-plásmido. mezcla de transfección disminuido aún más cápside vacía produc- ción. El protocolo optimizado final

El control de calidad de cada preparación de vector AAV en términos de partículas virales totales, se fijó en pDG: pAAV = 1: 3 y toh = 48 hpt para el rendimiento ip superior.

genomas virales envasados ​y partículas infecciosas es tical cri- antes se llevan a cabo ensayos de
potencia, ya que diferentes rAAV variantes producidas potencialmente tener diferentes relaciones de los Seis vectores rAAV-shRNA, dos de control de codificación scramble shRNA (rAAV-Ctrl1sh,

parámetros mencionados. métodos aguas arriba estándar para rAAV producción de vectores combinan rAAV-Ctrl2sh) y cuatro gen diana shRNA (rAAV- PK1sh, rAAV-MCL1sh, rAAV-PSMA2sh,

el plásmido que lleva el transgén (pAAV) y el plásmido helper / embalaje (PDG) en una relación 1: rAAV-PSMB4sh) se produjeron y se purificaron por cromatografía de afinidad. SDS-PAGE seguido

equimolar 1, y el tiempo de conjunto de la cosecha (TOH) a las 72 h después de la transfección (hpt). de tinción InstantBlue ™ reveló altos niveles de pureza para todos los lotes ( Fig. 3 ). Los títulos

Como se observa en tabla 1 , Esta combinación dio lugar a una alta relación / vg vp. obtenidos después de la purificación (10 13 VP / ml; 0.4-1 × 10 12 vg / ml; 10 10 ip / ml - Tabla 2 ) Están
dentro de rangos reportados ( Kotin de 2011 ; Samulski y Muzyczka, 2014 ). la calidad del lote, en
términos de vp / vg / IP, se man- contenido dentro de un pequeño rango, lo que sugiere que el

Con el fin de disminuir esta proporción y, en consecuencia, disminuir cápsidas vacías producidas, protocolo optimizado superar los posibles efectos secundarios que surgen de la activación de la

se ensayaron diferentes combinaciones de los parámetros mencionados. tabla 1 muestra que la maquinaria de RNAi

disminución de tiempo de la cosecha a 48 hpt

Figura 2. implementación de la plataforma para la pro- ducción de rAAV-shRNA vector.


Evaluación de rAAV productividad vector después de la transfección de células HEK293 T
utilizando UNA) diferentes agentes de transfección (CaPO4 vs. PEI) y SEGUNDO) diferentes
condiciones de transfección (2- vs. sistema 3-plásmido). Los gráficos muestran datos (media ±
SD) de al menos dos experimentos independientes. *, P <0,05, se determinó la significación
estadística utilizando la prueba t de Student de dos colas.

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Tabla 2 impacto en BLBC potencial tumorigénico, se evaluaron los efectos de su caída en términos de
rendimientos purificadas vector rAAV-shRNA. impacto sobre la viabilidad celular y la apoptosis in- ducción en HCC1954 y líneas de células
MDA-MB-468. En MDA-MB-468, una disminución generalizada en la viabilidad de alrededor del 30%
rAAV-shRNA vp / mL vg / ml ip / mL
se observó después de la entrega mediada por rAAV de PLK1sh, MCL1sh, PSMA2sh y PSMB4sh,
control de mezcla aleatoria Ctrl1sh 1.3E + 13 1.1E + 12 2.1E + 10 en comparación con células transducidas con el control scramble ( Fig. 6 - UNA). Estos resultados
Ctrl2sh 4.0E + 13 9.3E + 11 3.4E + 10
indican que incluso un nivel moderado de knockdown gen puede ofrecer el efecto deseado. Por lo
control positivo PLK1sh 2.7E + 13 3.6E + 11 2.0E + 10
tanto, una mayor optimización de las secuencias de ARNhc para las vulnerabilidades genéticas aquí
vulnerabilidades genéticas BLBC MCL1sh 3.3E + 13 4.3E + 11 1.7E + 10
PSMA2sh 4.3E + 13 1.8E + 12 4.3E + 10 explotados podría estar justificada, en un intento de aumentar gen desmontables para potenciar el
PSMB4sh 3.6E + 13 4.7E + 11 1.6E + 10 efecto funcional. En términos de la inducción de apoptosis en estas células, un aumento significativo
tistically esta- se logró con rAAV-PSMA2sh, con hasta un aumento de 2 veces en el porcentaje de
células apoptóticas en comparación con el control de mezcla aleatoria ( Fig. 6 - B). Esto está en
en células HEK293 T. Sin embargo, rAAV-shRNA orientación nerabilities vul- genéticos mostró una consonancia con la eficiencia mostrada caída del vector referido. En HCC1954 células, se observó
tendencia a tener relaciones vp / VG superiores. una disminución significativa de la viabilidad celular sólo para vector viral rAAV-PLK1sh, y no hubo
ningún efecto significativo sobre la inducción de apoptosis por cualquiera de los vectores virales
3.2. downregulation PSMA2 disminuye la viabilidad celular e induce la apoptosis en líneas celulares de BLBC probados en estas células (datos no presentados). Las diferentes actividades biológicas de los
vectores virales entre MDA-MB-468 y HCC1954 podrían ser debido a sus diferentes firmas
moleculares y el estado oncogénico ( Grigoriadis et al., 2012 ).
3.2.1. eficiencia gen diana rAAV-shRNA desmontables
rAAV-shRNA eficiencia vector de transducción se evaluó en dos líneas celulares BLBC
-HCC1954, una línea celular epitelial pobremente diferenciado derivado de un carcinoma ductal sin
invasión de los ganglios linfáticos; y MDA-MB-468, una línea celular con morfología epitelial derivado
de un sitio metastásico. Todos los vectores desarrollados tenían niveles comparables de eficiencia
ducción trans- para cada una de las líneas de células - alrededor de 60% para MDA-MB- 468 y 3.3. Efecto de rAAV-PSMA2sh inyecciones intratumorales en BLBC xenoinjertos de ratón
aproximadamente el 80% para HCC1954 ( Fig. 4 ).

También se evaluó Target knockdown de genes después de la entrega mediada por rAAV de Para evaluar si las vulnerabilidades genéticas pronosticadas pueden ser aprovechadas para la
shRNA a HCC1954 y líneas de células MDA-MB-468. rAAV- PSMA2sh mostró una regulación a la terapia del cáncer de mama utilizando la tecnología desarrollada, se evaluó si PSMA2 knockdown
baja constante del gen diana en ambas líneas celulares, de la eficiencia knockdown alrededor de podría suprimir el crecimiento tumoral en vivo usando BLBC xenoinjertos de ratón. Cuando los tumores
80% ( Fig. 5 ). Sin embargo, los otros vectores rAAV-shRNA evaluados mostraron o bien no eran alrededor de 100 mm 3,
desmontables detectable gen (rAAV-MCL1sh), o niveles que no sobrepasan 50% de eficiencia ratones fueron tratados con rAAV-PSMA2sh, rAAV-PLK1sh, rAAV-Ctrl1sh o PBS, utilizando dos
desmontables (rAAV-PLK1sh, rAAV-PSMB4sh). Estos resultados difieren significativamente de los dosis de vector, por inyecciones intratumorales. progresión tumoral pro- se monitorizó cada 3 días
niveles obtenidos después de HEK293 T transfección transitoria, probablemente refleja las midiendo el volumen del tumor en cada condición.
diferencias en el sistema de suministro de shRNA y célula diana. Sin embargo, dado que el nivel del
gen desmontables que se traduce en un fenotipo observable es probable que dependa de la gen de Como un modelo de tumor agresivo, el crecimiento de la masa tumoral fue rápida, especialmente
interés y sobre el resultado esperado, es difícil predecir si la eficiencia de la precipitación observada para los grupos de control tratados con PBS o con los controles revueltos, en ambas dosis de vectores
tendrá un efecto funcional. probados ( Fig. 7 ). Sin embargo, los ratones tratados con rAAV-PSMA2 mostraron una reducción en el
crecimiento del tumor con el tiempo, evidentes después de día 13 del tratamiento ( Fig. 7 ). Curiosamente,
para rAAV- PLK1sh, una reducción en el crecimiento del tumor sólo es aparente para la dosis más alta,
posiblemente reflejando la baja regulación a la baja de genes conseguido con este constructo y la
3.2.2. En la actividad biológica in vitro consiguiente menor impacto sobre la viabilidad celular.
Para evaluar si la regulación a la baja de los genes diana tiene una

Fig. 4. La eficacia de transducción de vectores virales de rAAV-shRNA en líneas celulares BLBC. Crecimiento exponencial MDA-MB-468 y no fueron transducidas HCC1954 células (NT) o transducidas con los vectores virales indicados
(4.6E + 4 vg / células cada uno). rAAV eficiencia vector de transducción se controló 48 h después de transducción por citometría de flujo de detección de eGFP. Gráficos muestran datos representativos obtenidos para cada línea celular.
Gráficos representan porcentaje de células transducidas (media ± DE) de tres experimentos independientes.

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Fig. 5. eficiencia desmontables del gen diana de los vectores de


rAAV-shRNA en la celda BLBC líneas.

crecimiento exponencial UNA) MDA-MB-468 y SEGUNDO)

HCC1954 células se transdujeron con los vectores virales in-


dicated (4.6E + 4 vg / células cada uno). Veinticuatro o
cuarenta y ocho horas después fueron ordenados y se
procesan células ducción trans. El ARN total se extrajo y los
niveles de ARNm de la PLK1, MCL1, PSMA2 y PSMB4 se
DE- termined mediante qRT-PCR. niveles de mRNA se
malized nor- contra HPRT1 limpieza y genes rpl22 dentro de
la misma muestra y se muestran como el cambio veces en
relación con los respectivos niveles en las células
transducidas con rAAV-Ctrl1sh vector (media + SD) de tres
periments ex independientes.

Fig. 6. efectos funcionales de rAAV-shRNA tores por vectores en las


líneas celulares BLBC. Crecimiento exponencial células
MDA-MB-468 se transdujeron con los vectores virales indicados
(4.6E + 4 vg / células cada uno). Veinticuatro y cuarenta y ocho
horas después, se clasificaron las células transducidas y más rado
cul-. UNA) La viabilidad celular se midió utilizando el ensayo
fluorométrico Presto azul en diferentes puntos de tiempo de cultivo.
La viabilidad celular fue calcu- lada como un porcentaje respecto a
las células trans- ducidas con rAAV-Ctrl1sh vector. Que se muestra
es porcentaje de viabilidad de las células transducidas significa a las
72 h después de la transducción + SD de 3 experimentos in-
dependientes. SEGUNDO) Las células clasificadas se sembraron, y
la apoptosis determinados por kit apoptosis FLICA por citometría de
flujo. Los gráficos muestran apoptosis promedio de células (+ SD) de
tres experimentos independientes, en el día 5 post-ducción trans-. *,
P <0,05 frente a los valores en las células trans- ducidas con control
de mezcla aleatoria

(Ctrl1sh).
La significación estadística se determinó usando el Student de
dos colas t- prueba.

No se observaron diferencias significativas en la ganancia o pérdida de peso ratones. Por otra entrega para la regulación a la baja de los genes necesarios para la supervivencia de las células BLBC.
parte, no se observaron alteraciones importantes macroscópicos en el hígado de ratones tratados Nuestros resultados indican que los métodos de aguas arriba estándar para la producción de rAAV, a
con vector, lo que sugiere que las inyecciones virales rAAV2- ARNhc no incitaron a efectos partir de la transfección transitoria de células HEK293 T, conducen a alto título de la cápside vacía en la
secundarios significativos ni patotoxicity él-. formulación final de los vectores de rAAV que codifican constructos shRNA. Hemos demostrado que
aumentando la relación de plásmido de gen / embalaje trans- en la mezcla de transfección, que duces
probable re- la probabilidad de formación de la cápsida vacía, la relación / vg vp se mejoró y los títulos
de IP se incrementaron ligeramente. Además, la combinación de la relación óptima con una disminución
4. Discusión en el tiempo de la cosecha a

Este estudio evalúa el potencial de shRNA rAAV mediada

Fig. 7. Efecto de vectores rAAV-shRNA en la tasa de crecimiento


tumoral de xenoinjertos de BLBC. UNA) y SEGUNDO) Doblar el
cambio en la progresión del volumen del tumor en ratones
inyectados con los vectores virales que se indican a 2 × 10 9 y 2 ×
10 8 vg / tumor / inyección, respectiva- mente. Los datos son la
media ± error estándar de la media de 10 animales inyectados
con PBS, de 5 animales inyectados con 2 x 10 8 virus / tumor, y de
7 animales inyectados con 2 x 10 9 virus / tumor. La diferencia
estadística entre los grupos se determinó por ANOVA de dos vías
usando el Graphpad 6 (Prism ®) software (** p <0,01, * p <0,05 en
comparación con los ratones de control inyectados con el control
de mezcla aleatoria RAA-Ctrl1sh, para cada dosis vector
probado).

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48 hpt, baja más títulos de vector virales vacías. Una relación / vg vp inferior es instrumental para el silenciamiento génico post-transcripcional vía shRNA pueden dirigirse a ARNm de cada gen, así
empleo con éxito de la terapia génica se acerca como cápsidas vacías disminuirán potencia terapia y como el genoma undruggable considerado ( Kacsinta y Dowdy, 2016 ). En contraste con inhibidores
aumentar las respuestas inmunes a la cápside proteínas. del proteasoma, este enfoque de- fers la posibilidad de evolucionar de una manera específica de la
secuencia, lo que podría superar los mecanismos de resistencia derivados de mutaciones genéticas.
El éxito de la terapéutica contra el cáncer utilizando el enfoque que se refiere, o incluso la Además, posee ventajas superiores sobre otras estrategias con eficacia clínica probada, incluyendo
interrogación correcta como a la posible utilidad clínica, es de- pendiente en el desarrollo de sistemas inhibidores de molécula pequeña, tales como imatinib para el tratamiento de la leucemia mieloide
de administración adecuados para la introducción segura y eficiente de las moléculas de ARNhc en crónica ( Druker et al., 2006 ), y anticuerpos monoclonales, tales como trastuzumab para el cáncer de
células tumorales. AAV ha demostrado ser una opción viable, como vectores de rAAV están entre los mama precoz HER2 positivo ( Smith et al., 2007 ). inhibidores de molécula pequeña tienen un bajo
productos de terapia génica más prometedores desarrollados hasta la fecha. Después de numerosas grado de especificidad cuando se trata de destino de modulación, que puede conducir a efectos
secundarios adversos, y con frecuencia no restringen toda la función de una proteína, resultando en
aplicaciones exitosas en el tratamiento de enfermedades monogénicas por la sustitución de genes ( Cideciyan
et al., 2009 ; Nathwani et al., 2014 ; Valori et al., 2010 ), Arsenal AAV se ha ampliado para comprender efectos anti-oncogénicos ineficientes ( Kikani et al., 2005 ; Lim et al., 2008 ; Pecot et al., 2011 ; Weihua
varias terapias contra el cáncer ( Luo et al., 2015 ) Y diferentes modalidades clínicas que incluyen et al., 2008 ). Por otro lado, los anticuerpos monoclonales se restringen a membrana o proteínas
estrategias de ingeniería del genoma, tales como CRISPR RNAi y / Cas9 ( Valdmanis y Kay, 2017 ). culating cunstancias ( Pecot et al., 2011 ).
La baja capacidad de transgén de carga, a menudo deteriorando la terapia génica mediada por VAAr,
no es un problema con estos enfoques, y hace que tales pequeñas moléculas de ARN a ADN
codificado transgenes ideales para estos vectores.
Tomados en conjunto, este estudio mostró evidencia de que además ción optimización de
plataformas de producción rAAV aguas arriba estándar, basado en tran- transfección sient de células
HEK293 T, tiene el potencial de superar citotoxicidad transgén en las células productoras de
También crucial para una terapia exitosa es maximizar la producción de vector mientras se vectores. Por otra parte, nuestros resultados proporcionan una prueba de concepto de que el
mantiene la consistencia lote. Sin embargo, llegar a títulos elevados durante el procesamiento aguas transporte mediado por shRNA rAAV de Tar Consiguiendo genes de dependencia BLBC puede ser
arriba implica una alta expresión del transgén en células productoras. Mientras surgen algunas un enfoque prometedor para el tratamiento de esta enfermedad. La estrategia aquí desarrollado
preocupaciones cuando se trata de productos génicos inertes, que generalmente establece el estándar representa una mejora en el empleo tradicional de la terapia génica suicida para el cáncer. enfoques
de oro para el título de vector produc- ción, la actividad biológica de transgenes citotóxicos para la de genes suicidas clásicos matarán las células de forma indiscriminada y confiar únicamente en la
terapia del cáncer en las líneas celulares productoras pueden afectar su capacidad de síntesis de ejecución selectiva de especificidad. terapia con genes de dependencia específicos del cáncer
proteínas, tabolism me- y viabilidad, o montaje vector impacto en sí ( Maunder et al., 2017 ). En cuanto a Directivo conferirá un mayor grado de especificidad y seguridad para el tratamiento. Sin embargo, Chen
aplicaciones de ARNhc, la activación de la maquinaria de RNAi en células HEK293 T durante la et al., 2017 ; Sayroo et al., 2016 ). Esta estrategia también podría ser adecuado para el tratamiento de
producción de rAAV, combinado con la carga adicional de la producción de proteínas heterólogas, otros tumores malignos. El shRNA se puede personalizar para cualquier dependencia tumor y
disminución de la viabilidad celular en el tiempo (que era inferior a 72 hpt - datos no mostrados), y adaptar a diferentes subtipos o diferentes tumores. También, una combinación de lotes de rAAV que
deteriora la calidad de preparaciones de vector. Nuestros resultados se suman a un creciente cuerpo de codifican diferentes transgenes se puede utilizar para disminuir la aparición de resistencia tumor.
literatura sobre las estrategias para eludir esos efectos secundarios. Estos incluyen la adición de
proteínas adicionales y extensa manipulación genética del transgén ( Maunder et al., 2017 ), La adición
de AP- domadores ( Strobel et al., 2015 ), La inhibición de la expresión del transgen en células
productoras a través de siRNA o por activación de genes tóxicos sólo a través de la escisión de ADN
espaciador por Cre-recombinasa entregado a través de un segundo vector ( Lee y Jameson, 2002 ). La
estrategia más simple aplicado aquí es lo suficientemente flexible como para permitir la optimización del Finalmente, dada la indicación para el potencial terapéutico de estos Tar consigue, la evaluación
transgén dependiente si es necesario, mientras que llegar a rendimientos comparables a las plataformas de la eficacia clínica en los modelos más relevantes de igenesis de tumor debe estar justificada.
de producción de rAAV (actual Kotin de 2011 ; Snyder, 2016 ). Aunque una disminución en el crecimiento del tumor con el tiempo se observó en modelos de
xenoinjerto de ratón BLBC, estos ratones son inmunodeficientes y, por tanto, no retratan la
inmunogenicidad de la terapia desarrollada. Ahora se ha establecido que varios agentes terapéuticos
anticancerígenos que inducen apoptosis en las células tumorales pueden desencadenar una
respuesta inmune específica de antígeno ( Galluzzi et al., 2016 ). Esto, a su vez, re- activa el sistema
Para evaluar el potencial de esta estrategia para ser utilizado como enfoque apeutic un BLBC inmune contra las células tumorales, la mejora de la respuesta terapéutica. En consecuencia, la
ter-, transduced líneas celulares BLBC con vectores de VAAr que expresan shRNA contra evaluación de medicamentos contra el cáncer está desplazando hacia el uso de ratones
vulnerabilidades genéticas previamente identificados de este subtipo de cáncer de mama. inmunocompetentes para evalua- ción adecuada del resultado terapéutico ( Galluzzi et al., 2016 ). Por
transducción de rAAV-PSMA2 causó una disminución específico y potente en PSMA2 expresión en otra parte, con el desarrollo de in vitro modelos humanos que incorporan células MUNE im-, pruebas
ambas líneas celulares sometidas a prueba, en comparación con células transducidas con rAAV que de pistas prometedoras en un entorno humano también pueden ser posibles ( Nyga et al., 2016 ; Rebelo
lleva un scramble shRNA. La expresión reducida de PSMA2 resultado en una disminución de la et al., 2018 ).
viabilidad y el aumento de la apoptosis en células MDA-MB-468. Además, rAAV2-PSMA2
inyecciones intratumorales en BLBC xenoinjertos de ratón condujo a una disminución en el
crecimiento tumoral con el tiempo, en comparación con PBS o controles revueltos. Estos resultados
son consistentes con Petrocca et al, que indican que las proteínas de la maquinaria del proteasoma
son fundamentales para la viabilidad celular BLBC ( Petrocca et al., 2013 ), Y sugieren que esto podría Declaraciones de interés
ser un vector terapéutico potencial contra este tipo de cáncer, en estudios adicionales.
Ninguna.

Aunque los ensayos clínicos llevados a cabo anteriormente han conducido a la aprobación Expresiones de gratitud

reglamentaria de los inhibidores del proteasoma para el tratamiento de diversas enfermedades,


incluyendo el mieloma múltiple y linfoma de células del manto, adquirido mecanismos re- sistencia Los autores reconocen el Dr. Judy Lieberman para el apoyo científico. El trabajo fue apoyado
comúnmente surgen y socavan eficacia de la terapia ( Manasanch y Orlowski, 2017 ). También, la por el subsidio FCT PTDC / BBB-BIO / beca 1240/2012 y Doctor PD / BD / 52202/2013 a C. Pinto.
eficacia preclínica de estos inhibidores para tumores sólidos no podía ser traducida a la clínica, lo iNOVA4Health - UID / Multi / 04462/2019, un programa financiado por la Fundación para a Ciência e
que indica la importancia para el desarrollo de plataformas de administración adecuados, ya que Tecnologia / Ministério da Educação e Ciência, a través de fondos nacionales y co-financiado por el
incluso el más potente terapéutico puede fallar en la clínica debido a la entrega ineficiente ( Manasanch FEDER en el marco del Acuerdo de Asociación PT2020 es reconocido.
y Orlowski, 2017 ). Terapéutico

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