Acidos nucleicos

- macromoleculas de la transferencia de informacion genetica (DNA, RNA)

- DNA: acido desoxirribonucleico (nucleo, mitocondria y cloroplastos)
- cadena lineal (eucariotas) o circular (procariotas)

componentes:
- nucleosidos= base (nitrogenada) +azucar
- Nucleotidos = Base (nitrogenada) + Azucar +
Fosfato

Bases (nitrogenadas):
- purinas: anillo hexano + anillo pentano, 9C
-Adenina
-Guanina
- Pirimidinas: anillo hexano, 6C
- Citosina
- Timina
- se nombran por numeración normal (Ej: 3C)

azucar:
- ribosa: ( en el ADN esta molecula no cuenta
con el oxigeno en la posicion 2) ( de ahi
viene el prefijo DESOXI) ( el RNA cuenta
con ribosa normal)
- se distingue por numeración prima (Ej: 3`C
o 3`)

Enlace:
- se da un enlace N-glicosidico entre el azucar
y la base

Tautomerismo:
- puede estar en su forma amino o imino
- puede estar en su forma Keto o enol

complementriedad entre bases:

- se da por puentes de hidrogeno entre bases
- ambas bases deben ser electronegativas para formar
el enlace.
- Guanina y citosina (3 puentes de hidrogeno)
- Adenina y tinia (2 puentes de hidrogeno)

ADN
- doble hélice dextrogira (gira a la derecha)
- cada hélice es una cadena polinucleo antiparalelas
- se juntan entre cadenas por puentes de hidrogeno.
- las cadenas son antiparalelas (van en dirección opuesta)
- Surco mayor: es rico en información química (importancia
asociada a la union de proteínas con importancia de expresión
genica).
- la complementareidad de las bases genera que las hélices sean
antiparalelas (Ej: una comienza con 5`-3`y termina con 3`-5`).
- tienen enlaces fosfodiester: 1 enlaces fosfoester con 2 desoxiribosas
diferentes
Configuración nucleosidos:
Sin: azúcar a la derecha (mas compacta, giros de helice)
Anti: Azucar a la izquierda (mas relajada)

RNA
- timina se cambia por uracilo
- azúcar ribosa en vez de desoxiribosa
- tambien tiene enlace fosfodiester pero con ribosas.
- material genetico de algunos virus
- estructura lineal no helicoideal

estructuras de regulación genica:

- estructuras secundarias (cuando se pierden
puentes de hidrogeno en algunas partes)
- Hairpin
- Bulge
- Loop
- single stand
- Guanina tambien puede formar puentes de hidrogeno con el
Uracilo (el uracilo tiene enlaces comúnmente con la adenina)
- estas estructuras se da debido que el ARN es lineal.

Enlace fosfodiester:
- se forma entre el carbono 3` el O del fosfato y el carbono
5`del otro O del fosfato. para formarse este enlace el
carbono 3`de la primera ribosa (o desoxiribosa) pierde un OH
(CH2OH-CH2) y el carbono 5`pierde un H (OH-H) esto genera el enlace fosfodiester y una
molécula de agua.

Funciones bioquimicas:
- hacen parte de moléculas apostantes de energía (ATP, ADP, AMP) (en la vía energética el
apronte de energía es el fósforo)
- biosíntesis de CHO: transforman glucosa en glucógeno.
- Biosíntesis de lípidos: CDP-acilglicerol.
- En las coenzimas: FAD, NAD
- segundos mensajeros químicos: GMPc, AMPc.

propiedades químicas:
- DNA contiene muy pocos grupos reactivos a PH fisiológico: 2 por molecula = 2 extremos 3`OH
- muy estable debido a su doble helice.
- RNA: mas inestable que el ADN por su estructura lineal.
- reactivada química ADN:
- sensibilidad a PH menores de 4 (depurinacion y
ruptura del enlace fosfodiester)
- sensibilidad a PH basico, se va a desnaturalizar
(se separan las bases nitrogenadas esto debido
a que son enlaces no covalentes)
- Reactivada química del ARN:
- PH básico mayor a 10 rompen el enlace
fosfodiester
- PH acido depurinacion rompiendo el enlace
glicosidico.
- Hidrolicis enzimatica:
- exonucleasa: corta 5`o 3`
- endonucleasa: corta cualquier parte de la cadena
- RNA: ribonucleasas
- DNA: desoxiribonucleasas.
- las moléculas son muy hidrofilicas y polares debido a la excesiva presencia de grupos fosfato y
grupos hidróxilo, esto lo hace insoluble en solventes orgánicos.

Propiedades fisicas:
- Densidad: relación entre el contenido de Guainas y Citocinas
para determinar la densidad del ADN
- pureza: se determina sabiendo que los componentes del ADN
absorben a 260 (longitudes de onda) y las proteínas absorbe a
280 (longitud de onda): para hacer esto se mide la absorvancia
a ambas longitudes de onda, se dividen los resultados
(R260/R280) y si este resultado esta entre 1.8 y 2.6 es pura y
tiene una cantidad baja de proteínas asociadas (contaminantes).
- desnaturalización: cuando se aumenta la temperatura el ADN se
encuentra en doble helice, aproximadamente después de los 70
grados se empieza a desnaturalizar (se separan las 2 hebras). se
hace una curva de desnaturalización y el valor de la mitad (Tm)
se utiliza para determinar microorganismos viendo la cantidad de
guaninas y citosinas debido que cadenas con estos se
 desnaturalizan a temperaturas mas altas debido a los triples enlaces que forman estos.
- renaturalizacion:
- rapida: secuencias altamente repetidas
- Media: secuencias medianamente repetidas
- Baja: baja cantidad de secuencias repetidas
- Conformaciones:
- B: 10 bp/giro (ADN fisiologico)
- A: 11 bp/giro
- z: + 11 bp/giro

Transformación de purinas en acido urico.

- los nucleotidos de purinas (AMP, GMP, ADP, GDP, etc) se
degradan para producir como resultado ultimo acido urico.
- la via para haier esto es que a traves de diferentes enzimas
llegan a ser xantina he hipoxantina a travez de la xantina-
oxidada que las transforma en acido urico.
- un medicamento que inhibe esto es el alopurinol el cual
inhibe dicha transformacion, esto es benefico ya que la
xantina he hipoxantina carecen del doble enlace que tiene
el acido urico por lo que su degradacion es mas sencilla.