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2018
La Biofísica es una Ciencia que
aplica las leyes de la física para
describir los sistemas biológicos,
con el objetivo final de
comprender como la estructura
y dinámica de las moléculas, sus
interacciones en el contexto
celular dan origen a una
característica observable del
sistema biológico (fenotipo).
@BIOFISICAUNR
La biofísica es el arte de ponerle números a la
biología
La BIOFISICA NO ES “Física para Biólogos” o “Métodos
Físicos aplicados a la Biología”.
Es una ciencia moderna, interdisciplinaria, con nuevos
enfoques para comprender la complejidad en Biología que
requiere SU PROPIO IDIOMA, o traducir entre
distintos IDIOMAS.
PARADIGMA: Un sistema biológico no es la mera
suma de sus componentes moleculares, sino su
integración funcional. Este concepto implica varias
escalas, estructura, dinámica, interacciones y
diversas escalas de tiempo (de años a
femtosegundos).
Los primeros Biofísicos
Heraclito, 500 A.C., uno de los
primeros filosofos fisicos.
Teorias mecanisticas de los procesos
vitales
Alessandro Volta
Creo la pila
reemplazando
el musculo por un
electrolito
El paradigma molecular:
Watson y Crick
1953 1990
• Qué preguntas intenta
responder la Biofísica
moderna?
• Qué problemas puede
resolver la Biofísica
moderna?
¿De que modo un polímero lineal de sólo
20 aminoácidos diferentes se pliega en
proteínas con estructuras 3D y funciones
biológicas específicas?
Información
????
Cinética Termodinámica
Solvente
¿Cómo hace la membrana (una barrera
impermeable al agua) para transportar
moleculas polares?
¿Cómo encuentra un factor de transcripción
la secuencia de ADN correcta?
¿Cómo hace una célula muscular para
convertir la energía química del ATP en
fuerza mecánica y movimiento?
¿Por que los lípidos se distribuyen con
patrones simétricos?
¿Podemos “ver” las moléculas?
Microscopio electrónico de
transmisión
Microscopio electrónico
de barrido
Planeta tierra
Longitud DNA en
genoma humano
Nematodo
Para ver un objeto, la
l no debe ser superior
Celula eucariota
al tamaño del objeto
que quiero ver Celula bacteriana
Ribosoma
Proteina
Atomo
Para ver un objeto, la l no debe ser superior
al tamaño del objeto que quiero ver
El método biofísico ideal debería ser capaz de medir
las posiciones de los átomos en las moléculas in
vivo.
También debería permitir visualizar las estructuras que se
forman durante los cambios conformacionales, las
reacciones, las interacciones y las translocaciones de una a
otra estructura celular, independientemente de la escala de
tiempo del proceso.
Hoy no existe ninguna técnica experimental que pueda
brindar TODA ESTA INFORMACION a la vez.
• Predicción de Estructuras 3D
Single
Molec
g N
PDB Content Growth
28/03/2017:
128.330 estructuras
Public Database content
No experimental
structure for most
protein sequences
• Vale la pena determinar TODAS las
estructuras de proteinas?
• Cómo interaccionan?
Estructura 3D:
prediccion, simulacion, refinamiento
http://predictioncenter.org/
Ab initio prediction
http://boinc.bakerlab.org/rosetta/
http://robetta.bakerlab.org/
Evolucion molecular
“The picture of a horse does
not tell you how the horse runs”
(Jeremy Knowles)
Sintesis de proteinas
Catalisis enzimatica
Union de ligandos
Unfolding DNA
Fluctuaciones termicas
Vibraciones
TEORICAS
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Jueves 15:00 – 16:30
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