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CAPITULO I
CONSERVACION DE CULTIVOS MICROBIANOS
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La selección del método tiene que basarse en la naturaleza del cultivo y en las
ventajas e inconvenientes del método escogido. Si el microorganismo aun no se
conoce del todo es aconsejable utilizar varios métodos de conservación (Dhingra
y Sindair, 1995).
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Los principales inconvenientes de este sistema son los costes de los equipos y
mantenimiento, y los daños mecánicos que se pueden provocar en las células
(Dhingra y Sinclair, 1985).
1.2.1.1 Subenfriamiento.
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1.2.1.2 Nucleación.
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Enfriamiento lento: reduce este riesgo porque sale mas agua de las
células y por lo tanto se forman menos cristales, pero tiene efectos
negativos debido a que los cristales formados son mas grandes, al
incremento de concentración intracelular de sales y a cambios en la
membrana celular. El encogimiento del protoplasto y la reducción del area
superficial puede hacer que, después de la descongelación, se rompan
las membranas.
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1.4.1 Liofilización
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Esta etapa se realiza en condiciones por debajo del punto triple del agua
(punto donde coexisten agua, hielo y vapor) para evitar el paso por la fase
liquida, de manera que es un proceso ideal para productos termolábiles
ya que puede deshidratar a bajas temperaturas porque trabaja a presiones
inferiores a 610 Pa (4,58 Torr).
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1.4.2 Atomización
Las partículas de polvo al final del proceso tienen una forma de esferas o
fragmentos de esferas vacías en su interior que permiten una fácil
rehidratación (Toledo, 1991).
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Las ventajas del secado por atomización según Masters (1991), citado por
Barbosa-Canovas y Vega-Mercado (2000), son las siguientes:
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CAPITULO II
NUTRICION MICROBIANA
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La nutrición es el proceso por el cual los seres vivos toman del medio donde
habitan, los compuestos químicos que necesitan para llevar a cabo sus procesos
energéticos y biosintéticos que les permiten crecer y reproducirse.
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NUTRICION AUTÓTROFA
NUTRICION HETERÓTROFA
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NUTRICION LITOTROFA
NUTRICION ORGANOTROFA
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NUTRICION FOTOAUTOTROFA
Organismo que usa la luz como fuente de energía para generar ATP y el CO2
atmosférico como fuente de carbono para producir compuestos orgánicos. Un
ejemplo es la cianobacteria Anabaena.
NUTRICION QUIMIOAUTOTROFA
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Orgánica Fotoorganoheterótrofo
-heterótrofo
Orgánico
-organo- Dióxido de
carbono Fotoorganoautótrofo
-autótrofo
Luz
Foto-
Orgánica Fotolitoheterótrofo
-heterótrofo
Inorgánico
-lito- Dióxido de
carbono Fotolitoautótrofo
-autótrofo
Orgánica Quimioorganoheterótrofo
-heterótrofo
Orgánico
Compuesto -organo- Dióxido de
químico carbono Quimioorganoautótrofo
Quimio- -autótrofo
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Dióxido de
carbono Quimiolitoautótrofo
-autótrofo
Ejemplos
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CAPITULO III
VIAS METABOLICAS
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Todos los seres vivos llevan a cabo el procesamiento de los nutrientes que los
mantienen vivos. A este conjunto de procesos, se le conoce como metabolismo
al conjunto de reacciones bioquímicas y procesos físico-químicos que ocurren
en un organismo.
Los microorganismos son sistemas que necesitan una gran cantidad de energía
para mantenerse ordenados. Esta energía se obtiene de la oxidación de
compuestos orgánicos reducidos. Los nutrientes proporcionan esos compuestos
reducidos y, en el curso de la oxidación, se libera energía (que se acumula en
forma de moléculas almacenadoras de energía, especialmente el ATP) y se
producen elementos estructurales que servirán para la construcción de nuevas
células (crecimiento y diferenciación).
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necesaria para las nuevas síntesis, así como para otros procesos que requieran
energía.
Son cuatro las características de las vías metabólicas, las cuales derivan de su
función, que es la obtención de productos para ser utilizados por las células.
Son muy exergonicas de forma que sus reacciones son completas. Esta
característica confiere dirección a la vía metabólica.
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Rutas catabólicas. Son rutas dativas en las que se libera energía y poder
reductor y a la vez se sintetiza ATP. Por ejemplo, la glucólisis y la beta-
oxidación. En conjunto forman el [cattaridmo]].
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Cuando hay ausencia de oxígeno, la glucólisis es la única vía que produce ATP
en los animales. Los organismos primitivos se originaron en un mundo cuya
atmósfera carecía de O2 y, por esto, la glucólisis se considera como la vía
metabólica más primitiva. Está presente en todas las formas de vida actuales.
Es la primera parte del metabolismo energético y en las células eucariotas ocurre
en el citoplasma. En esta fase, por cada molécula de glucosa se forman 2 ATP
y 2 NADH.
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Rompimiento de la molécula.
Por otra parte, hay que considerar tres tipos de reacciones fundamentales:
2. Transferencias de H+ .
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Que aparentemente es idéntica a la glucosa oxidasa que trabaja con DPI (2,6-
dinitrofenol indofenol) como aceptor de hidrógeno en lugar de O2, y:
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Sistema de la Fosfocetolasa
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El ciclo de Krebs (de los ácidos tricarboxílicos o del ácido cítrico) es una vía
metabólica presente en todas las células aerobias, es decir, las que utilizan
oxígeno como aceptor final de electrones en la respiración celular. En los
organismos aerobios las rutas metabólicas responsables de la degradación de
los glúcidos, ácidos grasos y aminoácidos convergen en el ciclo de Krebs, que a
su vez aporta poder reductor a la cadena respiratoria y libera CO2.
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Los siguientes dos pasos del ciclo implican reestructurar el citrato a un isómero
que se oxide con mayor facilidad. La aconitasa convierte el alcohol terciario en
uno secundario (oxidable), para ello, primero se deshidrata generando un doble
enlace cis y luego de hidrata con un grupo alcohol en el carbono 2.
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En esta etapa la energía del enlace tioester del Succinil-CoA se aprovecha para
llevar a cabo la fosforilación a nivel de sustrato de GDP y generar GTP, Succinato
y regenerar la Coenzima A. La enzima que actúa en esta etapa es la Succinil-
CoA Sintetasa. De aquí en mas no se producirán mas descarboxilación, solo
resta oxidar el succinato hasta oxalacetato y reiniciar el ciclo.
La Fumarasa cataliza la hidratación del doble enlace del fumarato para obtener
malato. La Fumarasa, igual que la succinato deshidrogenasa también
estereoespecífica, solo cataliza la hidrólisis del fumarato (no maleato) para
formar el isómero L-Malato.
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Es la última reacción del ciclo de Krebs e implica la última oxidación para obtener
el oxalacetato a partir de Malato con la reducción de una molécula más de NAD+
por acción de la enzima Malato deshidrogenasa. Aunque la reacción es poco
favorable, solo exergonica a muy bajas concentraciones de Oxalacetato,
recordar que la siguiente reacción (reacción 1 del ciclo) es una reacción
irreversible, y muy exergonica, por lo que el poco oxalacetato que se produce es
inmediatamente captado por la citrato sintasa para producir la condensación con
el Acetil-CoA. De esta forma se mantiene bajas las concentraciones de
oxalacetato (alrededor de 10-6M), la reacción de deshidrogenacion del malato
se hace termodinámicamente posible y el ciclo avanza.
A lo largo de una vuelta del ciclo de Krebs vemos como el grupo acetilo de dos
carbonos ingresa el ciclo, combinándose con oxalacetato, y como resultado se
liberan a lo largo del ciclo 2 carbonos en forma de CO2. Si embargo, tener en
cuenta que estos 2 carbonos que se liberan no corresponden al acetilo, si no que
son los pertenecientes al oxalacetato. Así los dos carbonos del acetilo formaran
parte de la nueva molécula del oxalacetato generada, que serán oxidados y
liberados en las subsiguientes vueltas del ciclo.
Como balance general del ciclo, tenemos que por cada molécula de Acetil-CoA
que ingresa al ciclo se generan una molécula de GTP, y tres de NADH y una
FADH2 que luego en la cadena respiratoria cederán sus electrones para la
formación de mas moléculas de ATP.
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Hay cuatro reacciones clasificadas como anapleróticas, aunque la producción de oxalacetato a partir de piruvato es probablemente
la más importante fisiológicamente.
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Glu deshidrogenasa
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Gln Sintetasa
Glutamato sintasa
Con respecto a la vía ligada de asimilación de sulfato, se sabe que las siguientes
enzimas se encuentran en los cloroplastos: ATP sulfurilasa, APS
sulfotransferasa, tiosulfonato reductasa y cisteína sintasa aunque el uso del
sulfuro ligado (acarreador –S-S-),como sustrato para la última enzima no ha sido
estudiado. Los trabajos realizados acerca de la tiosulfonato reductasa sugieren
que esta enzima se encuentra asociada a membranas.
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Los lípidos como clase son realmente moléculas mucho menores que los
polisacáridos; sus pesos moleculares raramente son superiores a 1000. Sin
embargo, su biosíntesis es más compleja que la del glucógeno porque la mayor
parte de sus moléculas contienen más de un tipo de enlace químico, mientras
que en el glucógeno las unidades de glucosa están ensambladas por un solo tipo
básico de enlace.
Los lípidos más simples son los lípidos neutros o triacil gliceroles (también
llamados triglicéridos); son las grasas de reserva encontradas en el tejido
adiposo o graso. Sus unidades estructurales son el glicerol y tres moléculas de
ácidos grasos de cadena larga. Algo más complejos y funcionalmente más
importantes son los fosfolípidos, que son elementos estructurales importantes de
las membras celulares. Se muestra también la estructura de una molécula típica
de fosfólipido está constituida por dos moléculas de ácidos grasos (ácido
palmítico y ácido oleico), una molécula de fosfato y los dos alcoholes glicerol y
etano lumina Este lípido es la fosfátidil etanotamina, uno de los fosfolipidos más
abundantes de los tejidos animales. Observamos que la fosfatidiletanolamina
contiene los enlaces éster entre los ácidos grasos y el glicerol, y un «puente»
fosfodiéster entre los dos acholes diferentes, cada uno de los cuales requiere
un modelo específico de reacción enzimático en su biosíntesis.
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AMP+ATP ® ADP+ADP
El ADP así formado puede ser fosforilado entonces a ATP directamente durante
la glucólisis o la fosforilación oxidativa. El CMP formado a partir de CTP debe
también ser refosiorilado a CTP; este proceso tiene lugar en dos pasos,
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La oxidación de los hidrocarburos alifáticos parece ser otra ruta adicional para la
síntesis de los ácidos grasos en algunos microorganismos, principalmente en las
bacterias del suelo. Otra ruta implica la oxidación de un metilo terminal a alcohol
primario, que se oxida posteriormente a aldehído y después a ácido (oxidación
terminal):
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(vii) Una vez en la pared celular, esta unidad completa activada se une
a una cadena de peptidoglucano alargándose esta cadena en una
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unidad.
Los aminoácidos son utilizados también por las células para sintetizar
nucleótidos (bloques constituyentes de los ácidos nucleicos). Existen dos tipos
de nucleótidos según el azúcar que contengan:
Ribonucleótidos: ribosa; síntesis de RNA Deoxiribonucleótidos: deoxiribosa;
síntesis de DNA
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Una vez que se han sintetizado los nucleótidos, éstos se activan por ATP. En
este proceso el nucleótido, que ya contiene un grupo fosfato, adquiere otros dos
grupos fosfato. Por ejemplo, la guanosina monofosfato se activa a guanosina
trifosfato:
El ATP, además de ser una molécula que intercambia energía, es la forma activa
de un nucleótido, la adenosina monofosfato (AMP), que se utiliza para sintetizar
ácidos nucleicos.
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CAPITULO IV
REGULACION Y CONTROL METABOLICO
4.1. INTRODUCCION
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Anteriormente se vio que la vía enzimática tiene que ver con la descomposición
de sustratos llevada a cabo por los microorganismos y como estas vías están
unidas a rutas biosintéticas, ya sea mediante intermediarios de alta energía o de
bajo peso molecular. Esta actividad metabólica global de la célula en crecimiento
representa el funcionamiento de un gran número de rutas enzimáticas
interconectadas que necesitan de un balance muy bueno para funcionar
apropiadamente. El control de estas enzimas puede tomar dos formas básicas:
la alteración del número de moléculas de la enzima. Dentro de esta clasificación
se puede reconocer muchas formas.
Las enzimas que catalizan una reacción reversible y dependen de una cierta
concentración de sustrato para operar, a menudo no parecen traer sustrato
suficiente cuando este se calcula por célula. Sin embargo, particularmente en las
células eucarióticas la compartimentación permite a las enzimas asociarse
espacialmente en las estructuras membranosas, que pueden dar
concentraciones locales de sustrato muy altas. Lo mismo puede ser enzimática
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cierto para otros factores necesarios para la actividad como los iones metálicos,
co enzimas y pH.
Durante los estudios iniciales sobre enzimas, se aclaró que la actividad de estas
y por tanto el control metabólico, puede ser afectado por ciertos metabolitos
reguladores (efectores, modificadores o moduladores). Estos metabolitos
pueden inhibir o activar la actividad enzimática; sus mecanismos y cinética.
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La naturaleza sigmoidal de la curva que depende del sustrato indica que la unión
de las primera moléculas de sustrato mejora la unión de las primeras moléculas
posteriores. En las enzimas heterotropicas la inhibición o estimulación daría
como resultado cambios en la Km o en la Vmax de la enzima. Se han propuesto
de modelos para explicar la reacción alostéricas: las interacciones concertadas
y las secuenciales, las cuales se ajustan a las observaciones experimentales.
Interacciones concertadas
El modelo concertado predice que la unión de una molécula de sustrato
convierte a la enzima (toda la subunidad) a una forma de alta afinidad, la
cual puede unir más rápidamente al sustrato. El efecto de los inhibidores
o de los activadores en una enzima heterotropica también se puede
explicar con este modelo.
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Interacciones secuenciales
El modelo secuencial sugiere que hay dos estados conformacionales para
las subunidades de la enzima. La unión del sustrato provoca un cambio
en la conformación de la subunidad en cuestión. Este cambio no altera
significativamente la otra subunidad, pero aumenta o disminuye la
afinidad de las subunidades por el sustrato nuevamente, un inhibidor o un
activador puede encajar en el modelo.
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MODIFICACION IRREVERSIBLE
Algunas enzimas, en particular las enzimas digestivas, se sintetizan en
una forma inactiva conocida como zimógeno. Esta forma se activa por la
acción de una segunda enzima que rompe la molécula en un punto
específico. Un ejemplo de esta forma de control es el quimiotripsinogeno,
la forma inactiva de la quimiotripsina, el quimiotripsinogeno se sintetiza en
el páncreas y consiste en una sola cadena polipeptídica, reticulada por
cinco enlaces disulfuro. Cuando el enlace peptídico que une a la arginina
15 y la isoleucina 16 se rompe por la acción de la tripsina, el
quimiotripsinogeno se convierte en la quimiotripsina totalmente activa.
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MODIFICACION REVERSIBLE
La modificación de las enzimas de formas inactivas a formas activas
puede ser reversible por ejemplo una fosforilasa que se encuentra en el
musculo existe dos formas: una activa y otra inactiva. La forma inactiva
pasa a la forma activa por la fosforilación de un residuo especifico de
serina mediante una enzima fosforilasa cinasa especifica. Bajo diferentes
condiciones, el grupo fosfato es removido de la enzima activa por una
segunda enzima específica, fosforilasa fosfatasa, para producir la enzima
inactiva.
A menudo esta forma de fosforilación reversible está bajo un segundo
sistema de control puesto que la fosforilación y defosforilacion continua
serian un desperdicio de energía. Se puede ver un buen ejemplo en el
metabolismo del glucógeno, una forma de almacenamiento de glucosa
donde la síntesis y el rompimiento deben ser controlados y coordinados.
En los animales el metabolismo del glucógeno está bajo el control de
hormonas en una serie compleja de reacciones que incluyen la
modificación reversible de las enzimas.
La hormona epinefrina se une a la membrana celular estimulando una
enzima adenil ciclasa. La adenil ciclasa unida a la membrana produce
AMPc a partir de ATP. Las mayores concentraciones celulares de AMPc
activan al enzima glucógeno sintetasa con lo que se obtiene su forma
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OPERONES
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OPERON LAC
El primer operon descubierto fue el operon lac, el cual se compone de tres
genes estructurales que intervienen en la captación y metabolismo de la
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Las células eucarióticas contienen un núcleo separado del resto de la célula por
una membrana, el cual contiene cromosomas lineales múltiples. Cada
cromosoma tiene un DNA individual de doble hélice, aunque generalmente los
cromosomas se encuentran en pares y por lo tanto contienen información
homologa. En los mamíferos un par de cromosomas determina el sexo con dos
cromosomas tipo X que determinan las características femeninas y un
cromosoma X y uno Y que determina las características masculinas.
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Organismos eucariotas.
INTRONES
REFERENCIAS BIBLIOGRAFICAS
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II. Anonimo
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