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Grayscale - 5.clase Transp y SI Pre2014-II
Grayscale - 5.clase Transp y SI Pre2014-II
Clase:Transposones y Secuencias
de Inserción
– TnA Tn1
– TnK Tn5
– TnC Tn9
Autor: Prof. MSc. Débora Alvarado Iparraguirre
Lab. Microbiología Molecular y Biotecnología
A nivel molecular los transposones son secuencias
genicas que causan mutaciones por inserción.
2. Transposición es el
movimiento del transposón.
4. NO se requiere homología
entre el transposon y la
secuencia blanco.
Los transposones bacterianos contienen repeticiones
invertidas terminales (ITRs) en cada extremo.
Las transposasas son codificadas por secuencias dentro
del transposón.
ITRs-closely
related rather
than identical
ITRs-define
the ends of
transposon
Recognition of
the ends-
critical in
transposition;
point mutations
Autonomous abort it
unit-sponsors
its own
transposition
1. Los transposones
más pequeños se
llaman-secuencias IS3
de inserción o
elementos IS.) El
número identifica All ISs contain one
el tipo. 750-2000 ORF=TNP; IS1 is an
bp. exception- frameshift
reads both frames
2. La mayoría de
bacterias
contienen varios
elementos IS y
frecuentemente
más de una copia
en el cromosoma.
3. Durante la
inserción, se
duplica una
pequeña porción
de la secuencia Direct
blanco.. repeat Direct
repeat
La longitud más común para las repeticiones
directas es 9 pb
Los transposones
tienen repeticiones
invertidas terminales
y crean repeticiones
directas de DNA
flanqueante en el
sitio blanco.
Nota:
1- Los sitios blanco
tienen sólo 4-13 pb.
2- Los blancos pueden
ser al azar, “hotspots” o
preferidos (doblez de
Fig.
DNA; secuencias 16.2,
consenso; región Genes
inactiva). VIII
1. Tasa de transposición:
~10-3-10-4 por generación
Resultado 1
Transposón se transposa
nuevamente
Transposón se
integra en el
DNA circular
Reciprocal recombination
2. Las repeticiones between two copies of the
invertidas dan como transposon
resultado la (2)
inversión del
transposón. (1)
(2) (1)
Mecanismo Molecular de la transposición
Transposición 3’-OH ends
generated
No replicativa:
Modelo “Cut &
Paste”
Transestrification in
Acción de la which the 3’-OH end
transposasa directly attacks the
target DNA (within
nucleoprotein complex)
Ambas bandas
transposan
Transposon deja
al DNA donador
sólo una copia
del transposón
sale.
Transposición 1. Acción de la
Replicativa transposasa
Resolution
requires
resolvase
original
duplicated
Intermediarios comunes para L3 R3
22 bp
Considerar factores del consensus MuA also
binds to
huesped en el proceso de internal
site-
transposición needed for
complex
L2 R2
formation
but not
L1 R1 strand
cleavage
El complejo de transferencia
de cadena puede ser blanco
cuts in transfers
para replicación (transposición trans in trans
replicativa) o para reparación
(transposición no replicativa)
additional nicking
common structure
Non-replicative
Breakage & reunion
Replicative
Integrones
Integron de clase I:
5-CS: secuencia conservada 5
3-CS: secuencia conservada 3
Integración de un gen de resistencia
Integron Compuesto
Transposición en la Naturaleza
• Transposones pueden modular la expresión
genética
• Contribuyen a la plasticidad génica
– Tienen una clara influencia sobre la estructura de los
genomas durante la evolución.
• Juegan un rol principal en la adaptación
bacteriana
– Contienen con frecuencia genes de resistencia a
antibióticos.
– La Transposición junto con la conjugación lideran la
transferencia de la resistencia a antibióticos de una
bacteria tipo a otra.
Utilización de los
transposones IS
Secuencia de inserción
IS6110 del complejo
Micobacterium tuberculosis
tiene 1361 pb.
Marcadores moleculares
mediante el método
IS6110-RFLP de IS6110
de Mtb para diferenciar
cepas.
IS6110-RFLP (restriction
fragment length
polymorphism) del gen
IS6110 contribuyo en
estudios epidemiológicos.