UNIVERSIDAD NACIONAL AUTÓNOMA DE MÉXICO

FACULTAD DE ESTUDIOS SUPERIORES CUAUTITLÀN

DEPARTAMENTO DE CIENCIAS BIOLÓGICAS
SECCIÓN BIOQUÍMICA Y FARMACOLOGÍA HUMANA

FES LABORATORIO DE GENÉTICA

CUAUTITLAN PREVIO PRÁCTICA NO. 4 Bioinformática
Elaborado por: Grupo: 1001 Equipo
Galván Valle Fabiola Semestre: 2016-I 2

Fecha: Profesor de Teoría: Profesores de Laboratorio: Evaluación:

27/10/2015 M. en C. Maritere M. en C. Maritere Domínguez
Domínguez Rojas Rojas
pBQD Larisa González Salcedo

1. Define qué es bioinformática.

Campo de la ciencia que se ocupa del manejo computacional de todas las clases de información biológica,
bien sea de genes o sus productos, de organismos o aun de ecosistemas1.

2. ¿Qué es una base de datos y cómo se clasifican?

Se le llama base de datos a los bancos de información que contienen datos relativos a diversas temáticas y
categorizados de distinta manera, pero que comparten entre sí algún tipo de vínculo o relación que busca
ordenarlos y clasificarlos en conjunto2.

-Según la variabilidad de los datos almacenados

 Bases de datos estáticas

Éstas son bases de datos de sólo lectura, utilizadas primordialmente para almacenar datos históricos que
posteriormente se pueden utilizar para estudiar el comportamiento de un conjunto de datos a través del
tiempo, realizar proyecciones y tomar decisiones.

 Bases de datos dinámicas

Éstas son bases de datos donde la información almacenada se modifica con el tiempo, permitiendo
operaciones como actualización, borrado y adición de datos, además de las operaciones fundamentales de
consulta. Un ejemplo de esto puede ser la base de datos utilizada en un sistema de información de una
tienda de abarrotes, una farmacia, un videoclub.

-Según el contenido

 Bases de datos bibliográficas

Solo contienen un representante de la fuente primaria, que permite localizarla. Un registro típico de una
base de datos bibliográfica contiene información sobre el autor, fecha de publicación, editorial, título,
edición, de una determinada publicación, etc. Puede contener un resumen o extracto de la publicación
original, pero nunca el texto completo, porque si no, estaríamos en presencia de una base de datos a texto
completo (o de fuentes primarias —ver más abajo). Como su nombre lo indica, el contenido son cifras o
números. Por ejemplo, una colección de resultados de análisis de laboratorio, entre otras.

 Bases de datos de texto completo

Almacenan las fuentes primarias, como por ejemplo, todo el contenido de todas las ediciones de una
colección de revistas científicas.

 Bases de datos o "bibliotecas" de información química o biológica

Son bases de datos que almacenan diferentes tipos de información proveniente de la química, las ciencias de
la vida o médicas. Se pueden considerar en varios subtipos:

-Las que almacenan secuencias de nucleótidos o proteínas.

-Las bases de datos de rutas metabólicas.

-Bases de datos de estructura, comprende los registros de datos experimentales sobre estructuras 3D de
biomoléculas

-Bases de datos clínicas.

 Bases de datos bibliográficas (biológicas, químicas, médicas y de otros campos)3.

En Bioinformática existen:

 Bases de datos bibliográficas  Bases de datos genómicas

 Bases de datos taxonómicas  Bases de datos de proteínas
 Bases de datos de nucleótidos  Bases de datos de microarrays
 3. ¿Cuáles son los principales proveedores de recursos bioinformáticos?
 El National Center for Biotechnology Information (NCBI) centraliza los bancos de datos y
aplicaciones de EEUU
 El European Bioinformatics Institute (EBI) realiza una función similar en Europa
 GenomeNet reúne bases de datos diversas en Japón

Existen varias BD que intercambian diariamente su contenido

Genbank (NCBI)

EMBL (EBI)

KEGG (Genome net)4

REFERENCIAS

1. Bioinformatics & Biological Computing. (Fecha de acceso octubre 23 de 2015). Disponible en:
http://bip.weizmann.ac.il/

2. Date C. J. (2001) Introducción a los Sistemas de Bases de Datos. México: Pearson Prentice Hall.

3. Netronycs “Bases de Datos”. (Fecha de acceso octubre 23 de 2015). Disponible en:

http://www.netronycs.com/clasificacion_de_base_datos.html

4. Introducción a la Bioinformática. Bases de Datos. (Fecha de acceso octubre 23 de 2015). Disponible en:
www.ub.edu/stat/docencia/.../introbioinformatica/.../Bases_de_datos.ppt