a) Influencia del contenido de GC.

Diseñar tres oligonucleótidos de 40 residuos con

diferentes relaciones de GC/AT.

Oligo: 5'-CCTTGTTATGAACTACTAGCCCTTAGGTAGAACTCACATT-3'
Primer1: 40 bases
Composition 11 A; 10 C; 6 G; 13 T; 0 OTHER
Percentage: 27% A; 25% C; 15% G; 32% T; 0%OTHER
MW=12.26 kDa
Hybridization: D:D
Salt: 50 mM
Formamide: 0%
Mismatch: 0 bp
Thermo Tm = 69.6 °C %GC Tm = 63.8 °C GC+AT Tm = 112.0°C

Oligo: 5'-CTCCGAAGTCCAGATAAGATATGACCGGGAAGTATCATGG-3'
Primer1: 40 bases
Composition 13 A; 8 C; 11 G; 8 T; 0 OTHER
Percentage: 32% A; 20% C; 27% G; 20% T; 0%OTHER
MW=12.43 kDa
Hybridization: D:D
Salt: 50 mM
Formamide: 0%
Mismatch: 0 bp
Thermo Tm = 76.8 °C %GC Tm = 66.9 °C GC+AT Tm = 118.0°C

Oligo: 5'-GCAAGTTGCCGTGTACCGTGCGATTCTCGGTAACGGCCCT-3'
Primer1: 40 bases
Composition 6 A; 12 C; 12 G; 10 T; 0 OTHER
Percentage: 15% A; 30% C; 30% G; 25% T; 0%OTHER
MW=12.33 kDa
Hybridization: D:D
Salt: 50 mM
Formamide: 0%
Mismatch: 0 bp
Thermo Tm = 86.1 °C %GC Tm = 72.0 °C GC+AT Tm = 128.0°C
 b) Influencia de la variación en la secuencia de nucleótidos. Diseñar tres oligonucleótidos
de 40 residuo con la misma relación GC/AT pero con diferentes secuencias de
nucleótidos.

Oligo: 5'-CAATGATCCGATGTGCACGAATGGTCATACCTATGCGCGT-3'
Primer1: 40 bases
Composition 10 A; 10 C; 10 G; 10 T; 0 OTHER
Percentage: 25% A; 25% C; 25% G; 25% T; 0%OTHER
MW=12.35 kDa
Hybridization: D:D
Salt: 50 mM
Formamide: 0%
Mismatch: 0 bp
Thermo Tm = 83.2 °C %GC Tm = 67.9 °C GC+AT Tm = 120.0°C

Oligo: 5'-CCCTTTCACAGGAATTCCGTGTCGAGTCTAGAAACTGAGG-3'
Primer1: 40 bases
Composition 10 A; 10 C; 10 G; 10 T; 0 OTHER
Percentage: 25% A; 25% C; 25% G; 25% T; 0%OTHER
MW=12.35 kDa
Hybridization: D:D
Salt: 50 mM
Formamide: 0%
Mismatch: 0 bp
Thermo Tm = 78.5 °C %GC Tm = 67.9 °C GC+AT Tm = 120.0°C

Oligo: 5'-GAAAGCGTTGGTCAGCTCTATCGACTGATACCTCAGTGCA-3'
Primer1: 40 bases
Composition 10 A; 10 C; 10 G; 10 T; 0 OTHER
Percentage: 25% A; 25% C; 25% G; 25% T; 0%OTHER
MW=12.35 kDa
Hybridization: D:D
Salt: 50 mM
Formamide: 0%
Mismatch: 0 bp
Thermo Tm = 79.2 °C %GC Tm = 67.9 °C GC+AT Tm = 120.0°C
 c) Influencia de la longitud de la longitud de secuencia de nucleótidos. Diseñar tres
oligonucleótidos con la misma relación GC/AT pero con diferente tamaño

Oligo: 5'-GAATGTCCAGTCTCGACATG-3'
Primer1: 20 bases
Composition 5 A; 5 C; 5 G; 5 T; 0 OTHER
Percentage: 25% A; 25% C; 25% G; 25% T; 0%OTHER
MW=6.17 kDa
Hybridization: D:D
Salt: 50 mM
Formamide: 0%
Mismatch: 0 bp
Thermo Tm = 56.5 °C %GC Tm = 55.4 °C GC+AT Tm = 60.0 °C

Oligo: 5'-GATAGCTCCTTCTGATGCGGTGACGTCAAACA-3'
Primer1: 32 bases
Composition 8 A; 8 C; 8 G; 8 T; 0 OTHER
Percentage: 25% A; 25% C; 25% G; 25% T; 0%OTHER
MW=9.88 kDa
Hybridization: D:D
Salt: 50 mM
Formamide: 0%
Mismatch: 0 bp
Thermo Tm = 75.4 °C %GC Tm = 64.8 °C GC+AT Tm = 96.0 °C

Oligo: 5'-GAGGGAGGATTGACGCCAGTCTGATTCCATGTCGACCTGCCTTCTGATACACAAGTCAAT-3'
Primer1: 60 bases
Composition 15 A; 15 C; 15 G; 15 T; 0 OTHER
Percentage: 25% A; 25% C; 25% G; 25% T; 0%OTHER
MW=18.52 kDa
Hybridization: D:D
Salt: 50 mM
Formamide: 0%
Mismatch: 0 bp
Thermo Tm = 88.1 °C %GC Tm = 72.1 °C GC+AT Tm = 180.0°C