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GUÍA DE ESTUDIO DE
CONTENIDOS TEÓRICOS
TEMAS:
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DEPARTAMENTO DE BIOQUÍMICA HUMANA
MATERIA QUÍMICA BIOLÓGICA - CICLO LECTIVO 2016
Clasificación de aminoácidos ---------------------------------------------------------- 42
Propiedades ácido-base de los aminoácidos ------------------------------------------ 47
Reacciones químicas de los aminoácidos --------------------------------------------- 49
ESTRUCTURA DE NUCLEÓTIDOS ---------------------------------------------- 52
Estructura general de nucleótidos. Bases púricas y pirimidínicas ----------------- 52
Propiedades fisicoquímicas de las bases púricas y pirimidínicas ------------------ 54
Nucleósidos ------------------------------------------------------------------------------- 56
Nucleótidos -------------------------------------------------------------------------------- 56
ADN:Doble hélice ------------------------------------------------------------------------ 59
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MATERIA QUÍMICA BIOLÓGICA - CICLO LECTIVO 2017
UNIONES QUIMICAS. GRUPOS FUNCIONALES
De un centenar de elementos químicos conocidos, sólo aproximadamente 20 de ellos forman parte de
los seres vivos. Más aún, sólo 6 elementos no metálicos (C, O, H, N, P y S) constituyen más del 95
% de la masa total de las células. Los datos de la tabla siguiente indican la composición elemental del
cuerpo humano:
Composición elemental del cuerpo humano (En porcentaje respecto a peso seco):
ELEMENTO PORCENTAJE
Carbono 50
Oxígeno 20
Hidrógeno 10
Nitrógeno 8,5
Fósforo 2,5
Azufre 0,8
Estos pocos elementos forman la mayor parte de los diferentes compuestos químicos presentes en los
organismos vivos, desde los estructuralmente más simples (como agua, dióxido de carbono, glucosa)
hasta los más complejos, como proteínas, glucógeno, celulosa, ácidos nucleicos, entre otros.
La molécula es la mínima porción de sustancia que puede existir conservando las propiedades de ésta.
La fórmula química de una sustancia establece qué elementos la forman y en qué proporción atómica
(átomo: es la mínima porción de materia que puede existir en estado de libertad). Por ejemplo, la
sustancia química agua tiene una fórmula: H2O, esto indica que está formada por oxígeno e hidrógeno.
En este caso se unen dos átomos de H y un átomo de O. Esta sustancia puede dividirse en átomos,
pero los átomos de H y de O en los que se disocia no tienen las mismas propiedades que la sustancia
agua. Incluso dos sustancias diferentes pueden estar formadas por los mismos elementos y unidos en
la misma proporción. Veamos el siguiente ejemplo:
Propanal Propanona
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En ambos casos, la fórmula molecular es C3H6O, sin embargo, estos átomos están unidos de diferente
forma lo cual determina que los dos compuestos señalados tengan propiedades físicas y químicas
diferentes y definan, por lo tanto, compuestos químicos diferentes.
Por lo tanto, sustancias diferentes pueden estar formadas por elementos idénticos unidos en la misma
proporción. La diferencia se debe a la presencia de enlaces atómicos distintos en cada uno de los
compuestos señalados. Esto explica por qué, a partir de unos pocos elementos, se pueden generar la
diversidad de sustancias químicas presentes en los organismos vivos.
Es importante conocer entonces cual es la fuerza que mantiene unidos a los átomos entre sí para
formar los distintos compuestos y como se relacionan las propiedades físicas y químicas de las
sustancias con el tipo de unión química que se establece entre los átomos que la forman.
Para estudiar los distintos tipos de uniones químicas es necesario tener conocimientos básicos acerca
de estructura atómica y por lo tanto es altamente recomendable que leer este tema antes de comenzar
con esta unidad temática.
El siguiente texto en itálica es sólo para recordar algunos conceptos que pueden requerir para una
mejor comprensión de tema Uniones Químicas
Los electrones giran alrededor del núcleo. Sin embargo, existe una zona del espacio alrededor del
núcleo donde es mayor la probabilidad de encontrar a un electrón. A esta zona se la denomina
orbital.
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Las funciones de onda son ecuaciones matemáticas que describen el movimiento y el estado
energético del electrón de un átomo. De la resolución de estas ecuaciones surgen valores numéricos
que se conocen como números cuánticos. Estos son cuatro: principal, azimutal, magnético y de spin.
El número cuántico principal, n, determina el nivel principal de energía del electrón. Esta energía
está vinculada con la distancia del electrón al núcleo, por lo tanto, el número cuántico principal
permite estimar la distancia radial del electrón al núcleo. El número cuántico principal toma valores
desde n=1 hasta n=7. El nivel n=1 es el más cercano al núcleo y tiene la energía más baja. A veces
se usan las letras K, L, M, N, O, P, Q para designar los niveles principales 1,2, 3, etc.,
respectivamente.
El número cuántico azimutal, l, puede asumir todos los valores enteros desde 0 hasta n-1, es decir:
0, 1, 2, (n-1). Este número designa el subnivel o subcapa dentro del nivel principal de energía, e
indica la forma del orbital o nube electrónica en el cual se mueve el electrón alrededor del núcleo.
Los números cuánticos azimutales se designan por las letras s, p, d ó f. Cuando un electrón tiene un
valor de l=0, el orbital se designa s, cuando l=1, el orbital se designa p, cuando l=2, d y cuando l=3,
f. La forma de los orbitales s es una esfera concéntrica con el núcleo, en tanto que los orbitales p,
por ejemplo, tienen forma de pera. Los orbitales s pueden contener como máximo 2 electrones, los
p, 6; los d, 10 y los f, 14 electrones.
Cada nivel energético está formado por uno ó más subniveles. Así por ejemplo el nivel caracterizado
por n=1 tiene un sólo subnivel, caracterizado por l=0 (subnivel s) (Si n=1, l sólo puede tomar el
valor n-1=0). En cambio, el nivel n=2 tiene dos subniveles (l toma valores desde 0 hasta n-1, es decir
0 y 1), los cuales se caracterizan por las letras s y p respectivamente. El nivel 3 tiene tres subniveles,
dado que los valores de l serán (desde 0 hasta n-1): 0, 1 y 2 s, p, d).
Con respecto a número cuántico magnético, m, y al número cuántico de espín, s, diremos que el
primero designa la orientación del orbital en el espacio (toma valores enteros, desde -l hasta +l). En
número de spin describe el sentido de giro del electrón sobre su eje y puede tener dos valores,
designados +1/2 y -1/2 (generalmente se simbolizan con flechas apuntando en sentido contrario; ↑
y ↓).
Aplicamos estos conceptos al átomo más sencillo, es decir el átomo de H (hidrógeno). Este elemento
tiene Z=1, por lo tanto, tiene un solo electrón y el mismo se halla en el nivel energético más bajo, es
decir tiene n=1. El valor de l será 0 (toma el valor n-1=0) de modo que se halla en un orbital s y
ocupa una nube esférica alrededor del núcleo. Dado que l=0, el único valor posible de m será 0 y
por lo tanto el orbital tendrá una única orientación posible en el espacio como corresponde para
una esfera. El único electrón del átomo de hidrógeno gira alrededor de su eje
(puede hacerlo en los dos posibles sentidos diferentes, +1/2 o - 1/2.)
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El elemento helio (He) tiene número atómico Z=2, por lo tanto, su configuración electrónica será:
2He = 2 electrones
[Estos dos electrones se ubican en el nivel de menor energía, n=1.
Si n=1 ===> l= 0 ===> Los electrones están en un orbital s
ml = 0 ===> una única orientación espacial del orbital
ms = +1/2 y - -1/2 (Los dos electrones tienen distinto sentido de giro)]
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Hibridización de orbitales en el átomo de C:
Concepto de electronegatividad
La electronegatividad de un elemento expresa la tendencia del mismo a atraer electrones. A cada
elemento se le asigna un número positivo que indica la electronegatividad del mismo. Linus Pauling
desarrolló una escala de electronegatividades (relativa) en la cual asignó al fluor (F), que es el
elemento con mayor capacidad para atraer electrones (es decir, es el más electronegativo), el valor de
4. Al cesio (Cs), que junto con el francio (Fr) son los elementos que sostienen más débilmente a los
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electrones, se les asigna un valor más bajo, 0,7. De acuerdo a la ubicación de los elementos en la tabla
periódica, se puede decir que la electronegatividad aumenta al recorrer un período de izquierda a
derecha y en un grupo de abajo hacia arriba.
Sentido de aumento de la electronegatividad en la T.P.
UNIONES QUIMICAS
Cuando se acercan dos átomos se ejercen varias fuerzas electrostáticas entre ellos. Algunas de éstas
tratan de mantener los átomos unidos, otras tienden a separarlos (recordar que cargas eléctricas del
mismo signo se repelen, cargas de signo contrario se atraen: los electrones se repelen entre sí, los
protones atraen a los electrones, entre otros ejemplos). Cuando las fuerzas de atracción superan a las
de repulsión, se forma un enlace químico. La regla del octeto establece que, cuando se forma un
enlace químico, los átomos ceden o comparten electrones, de manera tal que la capa más externa o
de valencia de cada átomo contenga 8 electrones. La inercia química de los gases nobles se atribuye
a esta configuración electrónica. Puede decirse por lo tanto que cuando dos átomos se unen entre sí
lo hacen tratando de adquirir cada uno de ellos la estructura de un gas noble, logrando así una
estructura estable.
El átomo de sodio es un buen ejemplo para ilustrar la regla del octeto:
11Na: 1s2 2s2 2p6 3s1
Cuando este elemento se une a otro elemento, tiende a adquirir configuración de gas noble. Este
elemento tenderá a perder el electrón de su último nivel y adquirir la estructura de un gas noble, en
este caso el 10Ne (neón), más que a ganar 7 electrones y adquirir la estructura del 18Ar (argón). El
sodio tiene una electronegatividad baja (no tiene tendencia a ganar electrones, tiene tendencia a perder
electrones, es un elemento muy electropositivo).
Las uniones químicas son principalmente de dos clases:
a) Uniones iónicas
b) Uniones covalentes
Uniones iónicas
Se forman por transferencia de electrones de un átomo (electropositivo) a otro (electronegativo). El
que pierde los electrones se convierte en un ión positivo (catión) y el que los gana se convierte en un
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ión negativo (anión). Entre ambas especies se genera una atracción electrostática, que constituye la
unión iónica.
Este tipo de unión está presente por ejemplo en el compuesto NaCl:
17Cl: 1s2 2s2 2p6 3s2 3p5 => 7 electrones de valencia
11Na: 1s2 2s2 2p6 3s1 => 1 electrón de valencia
El cloro, al adquirir 1 electrón toma la configuración electrónica de un gas noble, por lo tanto, se
forma la especie Cl-. El sodio tenderá a perder su electrón de valencia para adquirir la estructura de
gas noble (8 electrones en su último nivel) y se convertirá en Na+:
Cl Na Cl Na
Los iones cloruro se rodean de iones sodio y éstos de iones cloruro para formar la red cristalina. Otros
ejemplos son el cloruro de magnesio y el óxido de calcio.
Cl Mg Cl
En este tipo de unión química existe transferencia de electrones desde un átomo a otro, por lo tanto.
se da entre elementos de muy diferente electronegatividad, frecuentemente entre elementos del Grupo
I o II con los elementos del grupo VI u VII.
Los compuestos con este tipo de unión se caracterizan por: poseer elevado punto de fusión y de
ebullición, presentar estructura cristalina iónica, ser solubles en agua y poco solubles en solventes
orgánicos y por ser buenos conductores de la corriente eléctrica en solución acuosa o en estado
fundido. Este tipo de unión se presenta en sales y bases.
Uniones covalentes
Enlace covalente es aquel que se verifica cuando los átomos, para adquirir estructura electrónica de
gas noble, comparten pares de electrones. Ambos elementos unidos por este tipo de unión tienen
electronegatividades similares.
En el compuesto metano, CH4, las uniones son covalentes. El carbono (C), que tiene un valor de
electronegatividad de 2,5, se une con el H (hidrógeno) cuyo valor de electronegatividad es 2,5:
1H: 1s1
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6C: 1s2 2s2 2p2
C H H C H
H
Compartiendo pares de electrones, ambos elementos adquieren estructura electrónica de gas noble:
8 electrones el C y 2 electrones el H (éste adquiere la configuración del He, el gas noble más
cercano en la T.P).
En la molécula de nitrógeno (N2), se comparten entre ambos átomos 3 pares de electrones.
15N: 1s2 2s2 2p6 3s2 3p3
H O H
Sólo necesita 2 electrones para adquirir la configuración de gas noble (ocho electrones en el último
nivel). En el compuesto SO3 cada átomo de S se une a tres átomos de O, de manera que los electrones
se distribuyen como se ilustra:
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Uniones covalentes dativas
Esta molécula presenta una unión covalente doble y dos uniones covalentes dativa. En la unión
covalente dativa el par electrónico que establece la unión entre los dos átomos pertenece a uno solo
de ellos, en este caso el átomo de S. Se simboliza con una flecha →, dirigida hacia el átomo que
acepta el par electrónico.
Los compuestos con uniones covalentes se caracterizan por: poseer bajo punto de fusión y ebullición,
ser solubles en solventes orgánicos (los que poseen uniones covalentes), ser insolubles en agua, no
conducir la corriente eléctrica. La unión covalente es la más generalizada entre los compuestos de la
llamada química orgánica.
Es importante destacar que el par electrónico que se comparte por dos átomos no se halla equidistante
de ambos núcleos, sino que la mayor parte del tiempo se halla desplazado hacia el elemento más
electronegativo. Evidentemente esto no ocurre en las moléculas diatómicas homonucleares:
Como se ve en los ejemplos anteriores, en la molécula de H2O los electrones de unión se hallan más
desplazados hacia el O, elemento más electronegativo que el H. Si bien la diferencia de
electronegatividades entre ambos no es suficiente para generar iones, se genera sobre los núcleos de
ambos átomos una densidad de carga positiva (+) sobre el H y negativa (-) sobre el O.
En el caso de la molécula de hidrógeno (H2) (molécula homonuclear), el par electrónico está
igualmente compartido por ambos átomos. Cuando se genera cierta carga sobre los átomos que se
unen mediante uniones covalentes, se dice que el enlace covalente es polar, para diferenciarlo de los
enlaces H-H, Cl-Cl, O=O, etc., que son covalentes no polares.
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polaridad (ejemplo C=O) y la polaridad de las mismas será mayor cuanto mayor sea la diferencia de
electronegatividad entre los dos átomos que se unen. En las moléculas poliatómicas, la presencia de
enlaces polares no es suficiente para que la misma resulte polar. Los ejemplos siguientes ilustran
el concepto: H2O y Cl4C.
Ambos dipolos O-H presentes en la molécula de agua no se anulan, ambos contribuyen a la polaridad
de la molécula. En cambio, los cuatro dipolos C-Cl se anulan mutuamente (En este sistema formado
por distintos dipolos se crean fuerzas que se anulan mutuamente). La molécula, si bien tiene enlaces
polares, como un todo, resulta no polar. Por lo tanto, además de la presencia de enlaces polares, es
necesario tener presente la geometría de la molécula para determinar si la misma es o no polar: la
presencia de grupos polares en una molécula es condición necesaria pero no suficiente para que
la misma resulte polar.
A: CH4 B: CH3 OH
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Considerando las moléculas A y B, esta última será más soluble en agua dado que B es una molécula
polar en tanto A, no lo es.
UNIONES INTERMOLECULARES
Enlace electrostático: Un grupo cargado en una molécula puede atraer un grupo con carga opuesta
presente en otra molécula y consecuentemente se crea entre ambas moléculas una fuerza de atracción.
Esta fuerza es directamente proporcional a la carga de los grupos involucrados e inversamente
proporcional a la distancia que las separa.
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Fuerzas de Van Der Waals: También son fuerzas de atracción molecular. Dado que la distribución
de la carga electrónica alrededor de un átomo cambia con el tiempo, se establece en determinado
tiempo una distribución asimétrica de cargas la cual induce una similar asimetría en la distribución
de cargas en los átomos vecinos, lo cual lleva a la formación de dipolos que se atraen mutuamente.
Puede darse por la atracción entre una molécula polar y otra molécula que aislada no es polar. Al
aproximarse el dipolo a la molécula no polar, su carga parcial atrae o repele los electrones de la otra
molécula induciendo en ésta un dipolo (dipolo inducido).
También es posible la atracción entre dos moléculas no polares, por ejemplo, la molécula de H2. Si
los electrones de ambos H se encuentran en un determinado momento en uno de los extremos de su
orbital molecular puede quedar el núcleo expuesto por corto tiempo y adquirir una carga parcial
positiva. Esta carga positiva en un átomo atraerá los electrones de otra molécula de H2 y determinará
la atracción transitoria entre ambas moléculas. La magnitud de las fuerzas de Van der Waals varía
con la distancia entre dipolos: Sólo son efectivas a distancias muy cortas. La energía de una unión de
este tipo es de alrededor de 1 kcal/mol, considerablemente más débil que las uniones electrostáticas
y las uniones puente de hidrógeno.
Cuando dos moléculas tienen superficies complementarias, como por ejemplo una enzima y su
sustrato o un antígeno y su anticuerpo, ser posible que ambas estructuras se acerquen lo suficiente
como para que se establezcan múltiples uniones de Van der Waals, que a cortas distancias serán
efectivas y de este modo se producirá una unión estable entre ambas estructuras. Por ejemplo:
GRUPOS FUNCIONALES
Las propiedades químicas de los compuestos dependen de la estructura de los mismos. Sin embargo,
ciertas propiedades son atribuibles fundamentalmente a un grupo atómico ordenado de manera
particular, más que al conjunto de la molécula. Así por ejemplo las propiedades químicas de los ácidos
orgánicos se atribuyen al grupo COOH, llamado grupo carboxilo, el cual caracteriza a los mismos.
Tales grupos de átomos que determinan las propiedades químicas de los distintos compuestos se
denominan grupos funcionales.
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Un determinado grupo funcional, por ejemplo, el grupo –OH puede estar en un carbono primario,
secundario o terciario. Es conveniente entonces recordar que un carbono primario es aquel que tiene
sólo una de sus valencias implicadas en una unión con otro átomo de C. Un carbono secundario tiene
dos de sus valencias involucradas en uniones con átomos de carbono. Un carbono terciario tiene tres
uniones C-C.
A continuación, están indicados los grupos funcionales que frecuentemente se encuentran en las
moléculas de importancia biológica. Las valencias libres en cada grupo funcional (indicada por una
línea, --) en las diferentes moléculas representan una unión a una cadena hidrocarbonada.
GRUPOS FUNCIONALES
Grupo Funcional Fórmula Sufijo Ejemplo
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Los ésteres se consideran como el producto de reacción entre un ácido carboxílico y un alcohol. En
tanto que los anhídridos son el producto de reacción entre dos ácidos. Ambos compuestos se
hidrolizan (reaccionan en medio acuosos) y generan los compuestos que los constituyen:
éster + agua <========> ácido + alcohol
anhídrido + agua < ========> ácido + ácido
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Las amidas son el producto de deshidratación entre un ácido carboxílico y el amoníaco. De este modo
la reacción de hidrólisis de las amidas rinde un ácido carboxílico y amoníaco:
amida + agua < ======= > ácido carboxílico + amoníaco
Las amidas N sustituidas son aquellas en los que los átomos de H unidos al N de las amidas son
reemplazados por cadenas hidrocarbonadas: uno o los dos H (amidas monosustituidas o
disustituidas). Por ejemplo:
Un grupo con S es el grupo tiol, -SH, similar al grupo hidroxilo. Por ejemplo, el etanotiol tiene la
siguiente estructura:
CH3 --- CH2 ---SH
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ESTRUCTURA DE LOS PRINCIPALES COMPUESTOS DEL ORGANISMO
Nuestro organismo está formado por compuestos de estructuras muy diversas, desde moléculas
relativamente simples como los azúcares y aminoácidos hasta polímeros enormemente complejos
como las proteínas y los ácidos nucleicos. Las estructuras de estos compuestos se relacionan
íntimamente con sus funciones fisiológicas.
A continuación, analizaremos brevemente las estructuras de glúcidos, lípidos, aminoácidos y
nucleótidos.
ESTRUCTURA DE GLÚCIDOS
Los glúcidos previamente denominados hidratos de carbono o carbohidratos o azúcares pueden
clasificarse según el número de subunidades en MONOSACÁRIDOS, DISACÁRIDOS,
OLIGOSACÁRIDOS Y POLISACÁRIDOS. Los monosacáridos, como glucosa, fructosa y
galactosa, son los más sencillos. Son nutrientes esenciales para el organismo y a partir de ellos se
sintetizan otros compuestos. Se unen por enlaces glicosídicos para formar los otros tipos de
carbohidratos. Los disacáridos, maltosa, sacarosa, lactosa, contienen 2 unidades de monosacáridos
unidos por un enlace glicosídico. Los oligosacáridos, como por ejemplo la porción de carbohidratos
de las glicoproteínas y los glicolípidos, contienen de 3 a 10 unidades de monosacáridos. Los
polisacáridos, como el almidón y el glucógeno contienen hasta miles de unidades de monosacárido
y además de constituir la reserva de monosacáridos celulares, junto con los oligosacáridos están
involucrados en procesos de reconocimiento entre células y en el transporte de proteínas entre
distintos compartimientos subcelulares.
MONOSACÁRIDOS
Los glúcidos más sencillos son los monosacáridos y pueden definirse como polihidroxialdehídos o
polihidroxicetonas. Su fórmula molecular es (C-H2O)n con n ≥3 y es por eso que se denominaron
hidratos de carbono. Son cadenas carbonadas donde un carbono es un grupo carbonilo y los otros
generalmente presentan grupos hidroxilo. Si el grupo carbonilo es un aldehído, el monoscárido es
una aldosa (glucosa, etc.) y si es una cetona es una cetosa (fructosa, etc.). En la mayoría de los
monosacáridos la cadena de carbonos presenta de 3 (triosa) a 7 (heptosa) carbonos. Los
monosacáridos más simples son de 3 carbonos: GLICERALDEHÍDO (aldotriosa) y
DIHIDROXIACETONA (cetotriosa). Es decir, dependiendo del número de carbonos del
monosacárido es:
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MONO- Nº DE
ALDEHIDO CETONA EJEMPLO
SACARIDO CARBONOS
ALDO- CETO-
TRIOSA 3 GLICERALDEHIDO
TRIOSA TRIOSA
ALDO- CETO-
TETROSA 4 ERITRULOSA
TETROSA TETROSA
ALDO- CETO
PENTOSA 5 RIBOSA
PENTOSA PENTOSA
ALDO- CETO
HEXOSA 6 GALACTOSA
HEXOSA HEXOSA
ALDO- CETO
HEPTOSA 7 SEDOHEPTULOSA
HEPTOSA HEPTOSA
En la siguiente figura se muestran las estructuras de dos hexosas muy comunes: la glucosa, que es
una ALDOSA por tener una función aldehído, y la fructosa, que es una CETOSA por poseer una
función cetona.
Glucosa Fructosa
Otro azúcar importante, no ya desde el punto de vista energético es la ribosa. Esta pentosa forma
parte de los ácidos nucleicos (del ARN como ribosa y del ADN como desoxirribosa). La ribosa es
una aldosa, por poseer la función aldehído.
Asimetría
La mayoría de los monosacáridos presenta una estructura asimétrica. Es importante tener esto en
cuenta porque las enzimas generalmente reconocen una sola de las formas isoméricas.
Un átomo de carbono al cual se unen cuatro grupos químicos diferentes constituye un centro
asimétrico (o quiral). La triosa gliceraldehído tiene 1 (UN) carbono asimétrico y por lo tanto tiene
2 (DOS) isómeros ópticos activos (ENANTIÓMEROS): el D-gliceraldehído y el L-gliceraldehído.
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Los monosacáridos de más carbonos se asignan como D o L según la configuración del carbono
asimétrico más alejado del grupo carbonilo (el aldehído o la cetona).
Aquellos que tienen la misma configuración que el D-gliceraldehído (el OH hacia la derecha)
pertenecen a la serie D y los que tienen la configuración del L-gliceraldehído (el OH hacia la
izquierda) pertenecen a la serie L. Dado que la mayor parte de los azúcares de los organismos vivos
pertenecen a la serie D, se asume que los azúcares son D a menos que se indique específicamente.
Cuando decimos glucosa, entonces, nos referimos a la Dglucosa.
D-gliceraldehído L-gliceraldehido
Imagen
especular
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D-Gliceraldehído D-Glucosa
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Epímeros son diastereoisómeros que contienen más de un C asimétrico y que difieren en la
posición del grupo hidroxilo de sólo uno de los carbonos asimétricos. La D-glucosa y la D-
galactosa son epímeros, que difieren solo en la posición 4.
EPIMEROS
D-glucosa D-galactosa
En resumen:
ESTEREOISOMEROS
ENANTIOMEROS DIASTERÓMEROS
EPIMEROS
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Proyección de Fischer
D-glucosa D-fructosa
Fórmula de Haworth
α-D-glucopiranosa α-D-fructofuranosa
El carbono carbonílico forma un hemiacetal (si es aldehído) o hemicetal (si es una cetona),
generando un nuevo centro asimétrico. El carbono del aldehído o cetona originales que ahora se une
a un oxígeno en el anillo se denomina carbono anomérico, y entonces se los llama anómeros a los
isómeros que se generan: ALFA y BETA.
α - D-glucosa
β -D-glucosa
Se designa α (alfa), al anómero que presenta los grupos -OH y -CH2OH (que sustituyen a los carbonos
unidos por el oxígeno) en trans (apuntan en sentidos opuestos), y se designa β (beta) si los grupos
son cis (apuntan hacia el mismo sentido). También se pueden escribir ésas estructuras como las
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proyecciones de Fischer: α (alfa), si el OH del carbono anomérico está del mismo lado que el anillo
y β (beta) si está del lado opuesto.
α-D-Glucosa β-D-Glucosa
El azúcar se dibuja con el anillo perpendicular al plano del papel, el oxígeno se escribe atrás a la
derecha, el C-1 a la derecha y los sustituyentes por encima o debajo del plano del papel. El grupo
hidroxilo unido al carbono anomérico es α si está por debajo del plano del anillo o si el -OH y el -
CH2OH que se encuentran en los dos carbonos que están unidos por el oxígeno son trans, y en cambio
es β si está por encima o si el -OH y el CH2OH son cis. Lo que se escribe a la derecha en la
proyección de Fischer se escribe hacia abajo en la fórmula de Haworth. Las formas alfa y beta del
mismo monosacárido son formas especiales de epímeros denominadas anómeros que difieren sólo en
la configuración del carbono acetálico (o cetálico).
Los azúcares pueden dibujarse más exactamente con las formas silla o bote predominando en solución
la forma silla.
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Forma silla
Forma bote
En solución acuosa, el anillo puede abrirse y cerrarse. Cuando se abre, se forma la cadena lineal, y
cuando se cierra, el hidroxilo puede adoptar ambas configuraciones alfa o beta. El proceso mediante
el cual se equilibran las formas α y β en solución se denomina mutarrotación. Dentro de las células
la mutarrotación es catalizada enzimáticamente, por lo que ocurre muy rápido. Sin embargo, cuando
el carbono anomérico une el azúcar a otro compuesto, el enlace se fija en una configuración. Las
enzimas pueden diferenciar esas configuraciones y son específicas para solamente una de ellas.
DERIVADOS DE AZÚCARES
Aminoazúcares
Son aquellos que contienen grupos amino, como la glucosamina y la galactosamina. El grupo amino
en general está acetilado.
Azúcares sulfatados
Algunos azúcares contienen grupos sulfato, en particular los componentes de los
glicosaminoglicanos como el condroitín sulfato y la heparina, componentes principales del tejido
conectivo.
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Azúcares fosforilados
Dentro de las células los azúcares a menudo incorporan grupos fosfato, lo que evita que atraviesen
las membranas debido a sus cargas negativas. Cuando la glucosa entra a las células se fosforila en la
posición 6. Los grupos fosfato también pueden unir azúcares a nucleósidos. Por ejemplo, la glucosa
1-fosfato puede reaccionar con UTP para formar UDP-glucosa.
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Lactosa
(Galactosa-b(1-4)-glucosa
Maltosa Sacarosa
(Glucosa-(1-4)-glucosa) (Glucosa-(1-2)-fructosa)
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GLUCOGENO
enlace α1 → 4
enlace α 1 → 6
La celulosa, por otra parte, tiene una función bien diferente como el principal componente estructural
de la pared de las células vegetales. Se compone enteramente de moléculas de glucosa unidas por
enlaces de tipo β y es un polisacárido no ramificado. Este tipo de uniones hace que forme cadenas
muy extendidas que constituyen fibras de gran resistencia mecánica.
Adenina
Enlace N-glicosídico
Ribosa
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ESTRUCTURA DE LÍPIDOS
Clasificación y estructura
Se incluye dentro de este grupo a compuestos químicos de naturaleza diversa que tienen una
característica común: su insolubilidad en agua y solventes polares y su solubilidad en solventes no
polares como cloroformo, benceno, etc. Están formados por carbono e hidrógeno y en menor medida
por oxígeno. También pueden contener fósforo, nitrógeno y azufre. Los lípidos son mayormente una
forma de almacenamiento de combustible metabólico, también forman parte de la estructura de las
membranas, otros lípidos particulares son hormonas, vitaminas, etc.
Por tratarse de un grupo de compuestos muy heterogéneo es difícil su clasificación. Un criterio
posible considera a los lípidos según contengan ácidos grasos en su estructura y que mediante una
reacción química (saponificación) pueden liberarlos. Según este criterio se clasifica a los lípidos en
saponificables y no saponificables.
Dentro del grupo de los lípidos saponificables se encuentran:
• Lípidos simples: Son aquellos lípidos que sólo contienen carbono, hidrógeno y oxígeno. Estos
lípidos simples se subdividen a su vez en:
1. Acilglicéridos o grasas: Cuando los acilglicéridos son sólidos se les llama grasas y cuando
son líquidos a temperatura ambiente se llaman aceites.
2. Céridos o ceras.
• Lípidos complejos: Son los lípidos que además de contener en su molécula carbono, hidrógeno y
oxígeno, también contienen otros elementos como nitrógeno, fósforo, azufre u otra biomolécula como
un glúcido. Los lípidos que forman parte de las biomembranas son los lípidos complejos, razón por
la cual también se les llama lípidos de membrana. Los lípidos complejos comprenden diferentes
subgrupos de compuestos
Los lípidos insaponificables son aquellos que NO poseen ácidos grasos en su estructura y no producen
reacciones de saponificación. Entre los lípidos insaponificables encontramos a:
Terpenos
Esteroides
Prostaglandinas
ACIDOS GRASOS
Los ácidos grasos son ácidos monocarboxílicos que, aunque pueden encontrarse libres, normalmente
forman parte de otros lípidos. Los ácidos grasos presentan la fórmula general R–COOH, donde R es
una cadena carbonada generalmente con número par de carbonos y que puede presentar dobles
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enlaces. Según el número de dobles enlaces se clasifican en ácidos grasos (AG) saturados, AG
monoinsaturados y AG poliinsaturados
En las siguientes tablas se muestran ejemplos de cada uno de ellos. La nomenclatura C10:0 indica un
AG de 10 C con 0 insaturaciones.
Nombre común Fórmula Nombre sistemático
Fórmico C1:0 Metanoico
Acético C2:0 Etanoico
Propiónico C3:0 Propanoico
Butírico C4:0 Butanoico
Valérico C5:0 Pentanoico
Caproico C6:0 Hexanoico
Caprílico C8:0 Octanoico
Capricho C10:0 Decanoico
Láurico C12:0 Dodecanoico
Mirístico C14:0 Tetradecanoico
Palmítico C16:0 Hexadecanoico
Esteárico C18:0 Octadecanoico
Araquídico C20:0 Eicosanoico
Behénico C22:0 Docosanoico
Lignocérico C24:0 Tetracosanoico
En las siguientes tablas se muestran ejemplos de ácidos grasos mono y poliinsaturados. C18:19 indica
un AG de 18C con 1 insaturación entre el C9 y C10. Se denomina C1 al carbono carboxílico. Otra
nomenclatura asigna letras griegas a los C, comenzando por el Cα que es el C2. Los AG insaturados
también pueden nombrarse considerando la posición de la doble ligadura con respecto al metilo
terminal, en ese caso ω9, por ejemplo, significa que el doble enlace se encuentra a 9 C del metilo.
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CERAS
Las ceras son ésteres de los ácidos grasos con alcoholes primarios de cadena larga y responden a la
fórmula general:
O
||
R-O-C-R’
En general son sólidas y totalmente insolubles en agua. Su función está relacionada con su
impermeabilidad al agua y con su firme consistencia. Así las plumas, el pelo, la piel, las hojas, frutos,
están cubiertas de una capa cérea protectora. Una de las ceras más conocidas es la que segregan las
abejas para confeccionar su panal.
LÍPIDOS COMPLEJOS
Los lípidos compuestos son aquellos cuya molécula presenta dos o más componentes claramente
diferenciados de los cuales uno de ellos una vez separado presenta propiedades de lípido. Dentro de
este grupo están los fosfolípidos y los glucolípidos.
Fosfolípidos
Este grupo de lípidos se caracteriza por presentar en su estructura un grupo fosfato esterificado con
un alcohol. El alcohol puede ser glicerol, que es precursor de los fosfoglicéridos o esfingol
(esfingomielinas). Los fosfolípidos de glicerol o fosfoacilgliceroles son lípidos de membrana que
presentan en su estructura glicerol que se encuentra esterificado con ácido fosfórico y ácidos grasos.
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sn-glicerol-3-fosfato Ácido fosfatídico (1,2-diacil-sn-glicerol-3-fosfato).
El grupo fosfato a su vez puede estar esterificado con un alcohol sencillo, de manera que el grupo
fosfato forma un puente con dos uniones éster entre dos alcoholes: puente fosfodiéster. Dependiendo
de la naturaleza del alcohol sencillo que aporta el residuo A que se une al grupo fosfato (ver esquema
siguiente) tenemos diferentes familias de fosfolípidos.
FAMILIA GRUPO A
FOSFATIDILCOLINAS
(LECITINAS)
COLINA
FOSFATIDILETANOLAMINAS
(CEFALINAS) ETANOLAMINA
FOSFATIDILSERINAS
SERINA
FOPSFATIDILINOSITOL
MIOINOSITOL
FOSFATIDILGLICEROLES
GLICEROL
CARDIOLIPINAS FOSFATIDILGLICEROL
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Los esfingolípidos derivan del esfingol. El esfingol es un alcohol de 18 C con un grupo -OH en el
C1, una doble ligadura entre C4 y C5 y un grupo amino en el C2 (adenás tiene otro OH- en el C3).
Los ácidos grasos se unen al esfingol y forman las ceramidas. En las ceramidas el ácido graso se une
al grupo amino del esfingol mediane una unión AMIDA.
En las ceramidas, el grupo hidroxilo del C1 proveniente del esfingol se puede unir a otros compuestos.
Puede unirse a un grupo fosfato y a través de este se puede unir a la colina, formando la
esfingomielina. Este compuesto es un importante componente de las membranas celulares.
En la estructura de los esfingolípidos se distinguen dos colas hidrofóbicas: una la aporta el esfingol
(desde C3 a C18) y la otra cola la aporta el ácido graso (el ácido graso y el esfingol se unen para
formar la ceramida mediante una union amida). En las esfingomielinas el grupo fosfato y la colina
forman la cabeza polar de la molécula. Por lo tanto, la esfingomielina es una molécula anfipática con
2 colas hidrofóbicas. Cuando la molécula anfipática tiene dos colas hidrofóbicas, esa molécula en un
medio acuoso se ordena formando bicapas. Es por eso que los esfingolípidos son constituyentes
mayoritarios de las membranas, por ejemplo, de las membranas de neuronas.
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Glucolípidos
Son lípidos complejos que contienen monosacáridos o sus derivados (glucosa, galactosa,
Nacetilglucosamina, etc). El monosacárido se une al C1 de la ceramida. Por lo tanto, son moléculas
anfipáticas, con un cabeza polar que la aporta el o los glúcidos que se unen al C1 de la ceramida, y 2
colas hidrofóbicas. Esto explica por qué son parte de las bicapas lipídicas de las membranas de todas
las células.
En los glucolípidos, un glúcido se une al C1 de la ceramida. Los más sencillos contienen una única
molécula de azúcar, aunque también pueden presentar cadenas de 2 a 10 residuos de azúcares.
Cuando los glucolípidos contienen en su estructura azúcares neutros como glucosa o galactosa (sólo
una molécula), se los denomina CEREBRÓSIDOS (glucocerebrósido o galactocerebrósido). Los
sulfátidos son los ésteres sulfúricos de los cerebrósidos (el sulfato esterifica el C3 de la hexosa).
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N-Acetil Galactosamina
Galactosa
Glucosa
Ceramida
Ácido siálico
Estructura de un gangliósido
LÍPIDOS ISOPRENOIDES
Este grupo de lípidos se caracteriza por ser derivados del isopreno.
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El retinol o vitamina A1 y el deshidro-3-retinol o vitamina A2 son diterpenos parcialmente ciclados,
mientras el fitol es un diterpeno lineal. La vitamina A tiene un grupo –OH en el extremo de la cadena
hidrocarbonada. Ese hidroxilo se puede esterificar con un ácido graso.
Son también terpenoides la vitamina E o α-tocoferol y los derivados quinónicos, como las
ubiquinonas, la plastoquinona y las vitaminas K.
Vitamina E o α-tocoferol
Los carotenoides son derivados poliisoprénicos de 40 átomos de carbono (tetraterpenos). Por ejemplo,
el β-caroteno:
El β-caroteno es un pigmento presente en las frutas y hortalizas como las zanahorias y el tomate.
Cuando el β-caroteno se cliva genera la Vitamina A. (compare las estructuras de la vitamina A y del
β-caroteno
ESTEROIDES
Los esteroides pueden considerarse también lípidos isoprenoides, puesto que en último término
provienen del isopentenilpirofosfato. Su estructura se relaciona con la del anillo esterano o
ciclopentano-perhidrofenantreno.
Los esteroles presentan un grupo hidroxilo en el C-3 y diferentes sustituyentes en el C-17. En la figura
pueden verse diversos esteroles.
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Vitamina D3 o colecalciferol
PROSTAGLANDINAS
Las prostaglandinas son lípidos cuya molécula básica está constituida por 20 átomos de carbono que
forman un anillo ciclopentano y dos cadenas alifáticas.
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La figura muestra la estructura de la prostaglandina A1 y A2. El número 1 indica que en las cadenas
laterales hay sólo 1 doble ligadura. En la PGA2, hay 2 dobles ligaduras en las cadenas laterales.
Al igual que los leucotrienos, las prostaglandinas derivan del ácido araquidónico.
Ambos tipos de compuestos tienen diversas funciones.
(Este tema será desarrollado con más detalle en clases próximas.)
micela
bicapa
Las micelas y las bicapas se separan del ambiente polar mediante un proceso conocido como “efecto
hidrofóbico”. Cuando se disuelve una sustancia no polar en un entorno polar, las moléculas polares
(i.e. agua en una solución acuosa) se acomodan de manera más ordenada alrededor de la sustancia no
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polar disuelta debido a que las moléculas polares no pueden formar puentes de hidrógeno con las
moléculas no polares. Es por esto que, en un entorno acuoso, las moléculas polares del agua forman
una caja ordenada de “clatrato” alrededor de la molécula no polar disuelta. De cualquier manera,
cuando la molécula no polar se separa del líquido polar, la entropía (el estado de desorden) de la
molécula polar en el líquido se incrementa. Esto es esencialmente una forma de fase de separación,
similar a la separación espontánea que ocurre cuando se ponen juntos agua y aceite.
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ESTRUCTURA DE AMINOÁCIDOS
Introducción
Las proteínas son las macromoléculas más abundantes en las células y constituyen alrededor del 50%
de su peso seco. Dentro de las células exhiben una enorme diversidad de funciones biológicas: como
constituyentes de las membranas biológicas (glicoproteínas de identificación, transportadores,
canales, etc.), como catalizadores de reacciones químicas (enzimas), interactuando con los ácidos
nucleicos (histonas, ribosomas), interactuando con hormonas y neurotransmisores (receptores), etc.
Para entender los aspectos estructurales y las características químicas de las proteínas, es fundamental
primero analizar los componentes bioquímicos que las constituyen, los aminoácidos.
Los aminoácidos son moléculas relativamente pequeñas compuestas por carbono, oxígeno, hidrógeno
y nitrógeno. La hidrólisis ácida o básica (es decir la ruptura en unidades constitutivas por acción de
un ácido o una base) de las proteínas y/o péptidos más comunes origina unos veinte aminoácidos que
presentan una característica común dada por la presencia de un grupo carboxilo (-COOH) y un
grupo amino (-NH2) ligados a un mismo carbono, que es llamado carbono alfa (Cα). Este carbono
presenta generalmente sus otros dos enlaces compartidos con un hidrógeno y un grupo (serie de
átomos unidos) denominado grupo radical (-R). La diferencia entre aminoácidos, está dada entonces
por las características del grupo radical unido a dicho Cα. Esto a su vez provoca que, de acuerdo a las
características del grupo radical, varíe la estructura general, el tamaño, la carga eléctrica y su
solubilidad. Todos los aminoácidos pueden ser cristalizados y su estructura estudiada mediante la
difracción de rayos X.
Carbono alfa
Grupo radical
Los aminoácidos que constituyen normalmente las proteínas comunes son denominados
aminoácidos primarios o comunes. Estos se diferencian de todos los otros aminoácidos que están
en los organismos vivos y que forman parte de proteínas especiales, como componentes de éstas, o
bien se encuentran en forma libre participando de vías metabólicas particulares. De entre los veinte
aminoácidos comunes existe uno, la prolina en el que el carbono alfa y el nitrógeno forman parte de
un anillo del grupo radical, es decir no se observa un grupo amino sino que en este caso en particular
se habla de un grupo imino, por lo que se suele denominar a la prolina un iminoácido.
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Carbono alfa
Prolina
Cada organismo vivo sintetiza sus propias proteínas a partir de los aminoácidos. Las plantas
superiores sintetizan a su vez todos los aminoácidos necesarios. Hay que destacar que los animales
carecemos de esa capacidad. Cada especie animal puede sintetizar sólo algunos aminoácidos que
necesita y, por lo tanto, depende de la dieta para incorporar aquellos aminoácidos que debe sintetizar
para formar proteínas. Esos aminoácidos se los considera esenciales y no porque sean los únicos
necesarios para la vida de la especie, sino porque deben estar incluidos en la dieta. Cada especie,
tiene su grupo de aminoácidos esenciales propios.
La mayoría de los aminoácidos que ingerimos se encuentran en forma de proteínas, sin embargo, sólo
los aminoácidos pueden incorporarse a las diferentes rutas metabólicas. Para ello, las proteínas y
péptidos ingeridos sufren un proceso de hidrólisis por medio de enzimas proteolíticas (secretadas por
el estómago, páncreas e intestino delgado) en el tracto gastrointestinal. Después de la acción de las
enzimas los aminoácidos quedan libres, son absorbidos por el intestino y transportados a la corriente
sanguínea, por medio de la cual llegan al hígado donde ocurre su metabolismo y distribución. Las
proteínas endógenas también se degradan después de un tiempo, adquieren señales que indican a las
enzimas de degradación cuando deben comenzar su proceso.
Como se mencionó anteriormente, a los aminoácidos comunes se los suele clasificar en una primera
aproximación en aminoácidos esenciales y no esenciales, de acuerdo a la capacidad de ser o no
sintetizados, por la célula, tejido u organismo en consideración. En general se le asigna una
abreviatura de tres letras a cada aminoácido primario o bien una sola letra (en mayúscula), la cual se
emplea cuando se desean expresar a los aminoácidos constituyentes en una cadena peptídica o
proteica.
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Los aminoácidos comunes se pueden clasificar en:
Esenciales (deben ser suministrados por la dieta)
Arginina Arg R
Histidina His H
Leucina Leu L
Isoleucina Ile I
Lisina Lys K
Metionina Met M
Fenilalanina Phe F
Treonina Thr T
Triptofano Trp W
Valina Val V
Dentro de esta clasificación de aminoácidos esenciales, cabe destacar que en el caso de la arginina y
la histidina son esenciales durante el crecimiento en el niño, pero no para el adulto.
En los períodos en que el organismo atraviesa crisis funcionales (desnutrición aguda o crónica,
traumatismos o trastornos articulares y/o musculares, alteraciones en el tracto gastrointestinal,
hepatitis, afecciones renales, deficiencias cerebrales o nerviosas, etc.) o demandas extra por razones
mecánicas (atletas, etc.) o cerebrales (estrés, exámenes, etc.) se produce aumento en el consumo de
aminoácidos, por lo que muchas veces conviene completar la dieta habitual por medio de la
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administración exógena de aminoácidos. Por las mismas razones, la ingesta de alimentos que
contienen aminoácidos significa además un extraordinario recurso preventivo, por cuanto incorpora
al organismo mecanismos de fortalecimiento ante previsibles compromisos extra, sean éstos
derivados de circunstancias especiales o de inevitables decadencias de las funciones orgánicas
derivadas de la edad.
Como ya hemos comentado de los veinte aminoácidos proteicos conocidos, ocho son esenciales para
la vida humana y dos semiesenciales. Estos diez aminoácidos son los que requieren ser incorporados
al organismo con la alimentación, especialmente, cuando se da una situación de disfunción o
enfermedad.
El organismo no almacena el exceso de aminoácidos que provienen de la dieta, los transforma en
intermediarios metabólicos comunes como el piruvato, oxalacetato y αcetoglutarato, es decir, que los
aminoácidos van a ser precursores de la glucosa, ácidos grasos y cuerpos cetónicos, por lo tanto,
actúan como combustible y precursores metabólicos.
Asimismo, al igual que en los azúcares, cuando un aminoácido posea más de un átomo de carbono
asimétrico habrá 2n posibles estereoisómeros. La mayoría de los aminoácidos comunes, posee un
solo carbono asimétrico, las excepciones son treonina e isoleucina que poseen 2 átomos de carbono
asimétricos; esto origina 4 posibles estereoisómeros los cuales son llamados diasteroisómeros; sin
embargo, solo uno de cada uno de ellos se encuentra formando parte de las proteínas.
Una forma de realizar la clasificación es la de agrupar a los aminoácidos según las características
físico-químicas que les confieren los grupos radicales (R) que se encuentran ligados al Cα. De
acuerdo a las propiedades de éstos grupos R y en particular de la polaridad que éstos presentan a un
pH fisiológico, los aminoácidos se pueden clasificar en:
1.- Aminoácidos no polares o hidrofóbicos
2.- Aminoácidos polares pero sin carga neta efectiva
3.- Aminoácidos negativamente cargados, o aminoácidos ácidos, y
4.- Aminoácidos positivamente cargados o aminoácidos básicos
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Aminoácidos no polares
Dentro de los ocho aminoácidos con grupos no polares y con características hidrofóbicas, se
incluyen
- cinco aminoácidos cuyos grupos radicales son cadenas alifáticas hidrocarbonadas: L-alanina
(Ala); L-valina (Val); L-leucina (Leu); L-isoleucina (Ile); Lprolina (Pro);
- dos aminoácidos cuyos grupos radicales poseen anillos aromáticos: L-fenilalanina (Phe) y
L-triptofano (Trp)
L-Fenilalanina L-Triptofano
- y uno el cual contiene azufre en su grupo radical en forma de éter de azufre: L-metionina
(Met)
L-Metionina
Aminoácidos polares
Los aminoácidos polares pero sin carga neta efectiva, son aminoácidos más hidrofílicos que los
anteriores y poseen grupos funcionales capaces de formar uniones puente de hidrógeno con el agua
(por lo tanto más solubles). Esta categoría incluye siete aminoácidos: L-serina (Ser); L-treonina (Thr);
L-tirosina (Tyr); L-asparagina (Asn); Lglutamina (Gln); L-cisteína (Cys) y glicina (Gly).
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En el caso de la cisteína en particular es importante mencionar que este aminoácido puede presentarse
en las proteínas en forma dimérica unido covalentemente a través de un puente disulfuro. Al
aminoácido formado se lo suele denominar cistina, y se conoce que es importante para las
características estructurales de ciertas proteínas como la insulina y anticuerpos. En éstas proteínas la
cistina sirve de nexo entre dos cadenas polipeptídicas formando lo que se denomina un enlace cruzado
(cross-linking) a través de la unión disulfuro.
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protrombina y de otras proteínas con capacidad de unir el ión calcio, y la desmosina un derivado de
lisina que se encuentra en la elastina, otra proteína de característica fibrosa.
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La homocisteína, es un aminoácido precursor de la cisteína Cys; y la taurina es un caso particular de
aminoácido no carboxílico el cual se combina con los ácidos y sales biliares;
Existe otra serie de aminoácidos que intervienen en la síntesis de agentes químicos para la transmisión
de impulsos nerviosos. Este es el caso de la L-dopa y el 5-hidroxi-triptofano conocido con el nombre
de serotonina. Otros aminoácidos que actúan como neurotransmisores son el ácido γ amino butírico
o GABA, la glicina, el ácido glutámico y el ácido aspártico.
Finalmente, debemos también considerar aquellos aminoácidos relacionados con una acción
hormonal como es el caso de los aminoácidos asociados a la glándula tiroides:
Valoración de la Glicina.
Ión dipolar
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De todos los aminoácidos comunes solamente la histidina presenta una capacidad amortiguadora
significativa entre pH 6-8 (La hemoglobina, proteína transportadora de O2 y CO2 es rica en este
aminoácido).
El grupo γ-carboxilo del ácido glutámico y δ-carboxilo del ácido aspártico poseen valores de
constantes de disociación más cercanos a los ácidos carboxílicos sencillos como el ácido acético. El
grupo sulfhidrilo de la cisteína y el grupo hidroxilo de la tirosina son ácidos muy débiles. Los grupos
ε-amino de la lisina y el grupo guanidino de la arginina, son fuertemente básicos y pierden sus
protones a valores de pH muy elevados.
En general todos los aminoácidos cuyos grupos radicales son de característica aromática como Trp,
Tyr, His y Phe absorben luz ultravioleta (UV). Dada la incidencia de estos grupos aromáticos, la
absorbancia de una solución de proteína está dentro del espectro ultravioleta (289 nm). Todos los
aminoácidos absorben luz en el UV lejano, lo que se emplea como un método de determinación
simple (<220 nm).
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ESTRUCTURA DE NUCLEÓTIDO
Una característica esencial de los seres vivos es su capacidad para reproducirse. Para ello cada
individuo debe contener una descripción completa de sí mismo, que además ha de ser capaz de
transmitir a sus descendientes para que ellos puedan construir otro individuo con esas características.
A nivel celular, una célula ha de disponer de esas instrucciones para construir una réplica idéntica de
sí misma. En una célula, esa información se encuentra en el ácido desoxirribonucleico (ADN). El
ADN tiene la particularidad de que posee información también para hacer copias de sí mismo. Para
que la información contenida en el ADN se pueda expresar hace falta otra sustancia que es el ácido
ribonucleico (ARN).
Los ácidos nucleicos son polímeros de nucleótidos (polinucleótidos) y a su vez los nucleótidos son
moléculas constituidas por una base nitrogenada, un monosacárido de cinco carbonos (pentosa) y de
uno a tres fosfatos. Este tipo de estructuras participa en una amplia variedad de procesos biológicos:
1. Constituyen las unidades estructurales de los ácidos nucleicos (ADN y ARN)
2. Forman parte de coenzimas de óxido reducción (FAD, NAD+, NADP+)
3. Forman parte de compuestos que actúan como segundos mensajeros en el mecanismo de
acción de determinadas hormonas y neurotransmisores (AMP cíclico, GMP cíclico).
4. Los nucleótidos de purina actúan en general como compuestos reservorios de energía (ATP,
GTP).
5. Los nucleótidos de pirimidina también son utilizados como intermediarios de alta energía en
procesos biosintéticos (UDP, CDP que forman UDP-glucosa y CDP-acilglicerol intermediarios en la
síntesis de glucógeno y lípidos respectivamente).
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Las bases nitrogenadas se asemejan estructuralmente a sustancias cíclicas de seis átomos (dos de
éstos átomos son nitrógeno) como en las pirimidinas o bien a un anillo de pirimidina fusionado con
un imidazol (estructura cíclica con dos anillos y cuatro átomos de nitrógeno). Dentro del grupo de las
bases púricas se encuentran la Adenina (A), y la Guanina (G) mientras que Timina (T), Citosina (C),
Uracilo (U) son bases pirimidínicas. Estos derivados de la purina y la pirimidina son las bases que se
encuentran con mayor frecuencia en los ácidos nucleicos.
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La hipoxantina y la xantina también son bases púricas e intermediarias en el catabolismo de la adenina
y la guanina. El producto final del catabolismo de las purinas en los humanos es el ácido úrico, una
base púrica completamente oxidada.
Las bases nombradas son las que se encuentran mayoritariamente en los ácidos nucleicos. Sin
embargo, también hay otras bases menos frecuentes, llamadas bases raras o menores como la 5-metil-
citosina, 5-hidroxi-metil-citosina, 2-metil-guanina y 6-metiladenina.
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Los compuestos que presentan una estructura HN-C=O, es decir la presencia de un hidrógeno en el
átomo de nitrógeno adyacente al grupo funcional cetona, también son capaces de presentar este tipo
de isomería. Las bases pirimidínicas que hemos nombrado, presentan este tipo de estructura y por lo
tanto dos tautómeros posibles. Para el caso de las purinas, sólo la guanina presenta un grupo ceto (C6)
en condiciones similares. La importancia del predominio de una u otra forma en condiciones
fisiológicas radica en el apareamiento de las bases por uniones puente de hidrógeno entre las
diferentes bases, como en el ADN.
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NUCLEÓSIDOS
Un nucleósido está formado por una base púrica o pirimidínica unida a través del N9 o el N1 a un
azúcar, generalmente ribosa o 2-deoxirribosa por una unión betaglucosídica. La numeración de los
carbonos de los azúcares es la habitual, pero colocando una tilde sobre el número, para distinguirlo
del número correspondiente a la base. Los nucleósidos que contienen ribosa se denominan
ribonucleósidos y los que contienen 2deoxirribosa, desoxirribonucleósidos.
Uracilo Uridina
Timina Desoxitimidina
NUCLEÓTIDOS
Los nucleótidos, ribonucleótidos y/o desoxirribonucleótidos, son esteres fosfofóricos de los
nucleósidos. Cualquiera de los grupos hidroxilo del azúcar del nucleósido puede ser fosforilado, pero
en general se fosforila el hidroxilo del C 5´. El ácido fosfórico se una a un grupo hidroxilo del azúcar
formando un éster fosfórico (en general, el grupo hidroxilo implicado en la unión es generalmente el
de la posición 5’ sin embargo también existen nucleótidos con grupos fosfatos unidos a los hidroxilos
en 2’ o 3’).
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A su vez, un segundo y tercer grupo fosfato se pueden unir al primero de ellos por uniones anhídrido
fosfórico. Los nucleótidos con un solo grupo fosfato se denominan nucleósido monofosfato, con
leósido. Se muestra a continuación la estructura del nucleótido ATP (ó adenosín trifosfato):
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Nucleótidos
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UDP-Glucosa
Polinucleótidos
Existen dos clases de nucleótidos, los ribonucleótidos en cuya composición
encontramos la pentosa ribosa y que forman parte del ARN y los desoxirribonucleótidos, en donde
participa la desoxirribosa y que constituyen el ADN.
Las uniones entre nucleótidos son uniones fosfodiéster. El grupo fosfato de un nucleótido se une con
el hidroxilo del carbono 5’ de otro nucleótido, de este modo en la cadena quedan dos extremos libres,
de un lado el carbono 5’ de la pentosa unido al fosfato y del otro el carbono 3’ de la pentosa.
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