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Vas metablicas
*La mayora de metabolitos que forman parte de estas reacciones son compartidos por ms de
una va metablica.
*Las rutas metablicas que llevan a cabo procesos vitales para el organismo y son
fundamentales para su crecimiento y supervivencia se dice que conforman el metabolismo
primario, mientras que las dems, que cumplen funciones complementarias, dan lugar al
metabolismo secundario.
Las rutas metablicas ms importantes son las que se encargan de la transduccin de energa.
Es decir, aquellas que permiten a los seres vivos degradar los nutrientes de energa potencial
alta ingeridos en la dieta, fundamentalmente carbohidratos, y transformar esa energa en trabajo
celular. Como resultado, se producen adems macromolculas y calor.
De entre todas las rutas transductoras eucariotas, las ms importantes cuantitativamente son las
del metabolismo del carbono, llamadas vas metablicas centrales, que son bsicamente las
mismas en organismos muy distintos.
En el caso de las plantas, los azcares tambin pueden obtenerse por fotosntesis: los
organismos fototrficos son capaces de generar la energa suficiente a partir de la luz solar para
reducir compuestos sencillos (CO2) mediante el ciclo de Calvin y sintetizar carbohidratos.
Metabolitos centrales
Al llegar a una encrucijada metablica, se seguir una u otra va de la bifurcacin segn las
condiciones en las que se encuentre la clula. El diseo metablico de una ruta siempre busca
aprovechar al mximo los metabolitos y optimizar el rendimiento energtico de estos en cada
momento.
Ej.: la ruta de la gluclisis produce poca energa, de manera que el metabolito que produce, el
piruvato, pasa al ciclo de Krebs para ser oxidado. O bien, en las clulas musculares, si estas
estn en condiciones anaerobias (ejercicio intenso), el piruvato puede ser fermentado a
lactato para seguir aprovechndolo.
Reacciones metablicas
Las reacciones qumicas que conforman el metabolismo siempre pertenecen a aquellos tipos que
pueden ser catalizadas por enzimas: transferencia de electrones (oxidasas), formacin de enlaces
covalentes con gasto de ATP (ligasas), isomerizacin (isomerasas), transferencia de grupos
funcionales (transferasas), hidrlisis (hidrolasas) y adicin de grupos a dobles enlaces (liasas).
Tipos de rutas metablicas
Una gran parte de los procesos metablicos tienen como objetivo la obtencin de energa,
siendo agrupados bajo el nombre de catabolismo. Esto engloba aquellas reacciones
degradativas que permiten obtener energa qumica (en forma de ATP, NADH y NADPH) de la
materia orgnica.
Por otro lado, el resto de procesos, que permiten invertir esa energa en funciones especficas,
constituyen el anabolismo. Este comprende aquellas reacciones biosintticas que usan esa
energa para construir componentes celulares (macromolculas).
Ej: en la gluclisis se obtiene el precursor piruvato junto a ATP y NADH. En el ciclo de Krebs
se obtienen varios precursores adems de energa en forma de ATP, NADH y FADH.
Todas las rutas catablicas confluyen a nivel del acetil-CoA, que pasa al ciclo de Krebs y a la
cadena transportadora de electrones para permitir la obtencin de energa.
El movimiento de los metabolitos a travs de una ruta metablica viene dado por simple
equilibrio qumico; sin embargo, ciertas enzimas estn sometidas a diversos mecanismos de
regulacin. El objetivo de estos procesos controlar el flujo metablico para mantener estables
las condiciones metablicas de la clula, es decir: la homeostasis.
*Las enzimas sometidas a regulacin son normalmente aquellas que catalizan reacciones
irreversibles. Sin embargo, es interesante destacar que el paso ms importante de una ruta
metablica no tiene por qu ser el ms regulado.
Los mecanismos de regulacin pueden afectar a una enzima de dos maneras: modificando su
concentracin o modificando su actividad en un compartimento concreto. Asimismo, pueden
llevar a cabo cualquiera de ambos procesos de forma directa o indirecta.
Sntesis de enzimas
La sntesis de cualquier enzima que lleve a cabo una determinada actividad importante para la
clula tiene una regulacin tan compleja que es sensible a casi cualquier cambio en su
ambiente.
Esta regulacin puede darse tanto a nivel transcripcional (mediante factores de transcripcin)
como post-transcripcional.
Degradacin de enzimas
*El proteasoma destruye la enzima marcada, pero la ubiquitina no se degrada y puede ser
reutilizada ms adelante. Los aminocidos producidos tambin se reciclan.
El proceso de ubiquitinizacin est mediado por tres enzimas: E1 (enzima activante de UBQ),
E2 (enzima conjugante de UBQ) y E3 (protena ligasa). La E3 es la ms importante de las tres
en tanto que gobierna el paso limitante de la reaccin (hay ms de mil isoformas de E3, cada
una para un tipo de sustrato).
*En esta relacin es de gran importancia la afinidad entre ambos elementos, que viene dada
por la constante de disociacin KD.
Control alostrico
Se llama alostera al modo de regulacin enzimtica por el cual la unin de una molcula en
una ubicacin (sitio alostrico) modifica las condiciones de unin de otra molcula en otra
ubicacin distinta (sitio cataltico) de la enzima. Es el modo de regulacin de actividad que
ms comnmente se da en una clula en tanto que evita los cambios bruscos en la
concentracin de ciertos metabolitos.
Gran cantidad de enzimas estn compuestas por muchas subunidades que pueden activarse y
desactivarse alostricamente por separado. En el caso de que todas las subunidades acten
acompasadamente (cooperatividad), pueden definirse dos estados: uno tenso (T) de baja
actividad y otro relajado (R) mucho ms activo.
*Ambas molculas compiten por el mismo sitio alostrico en cada subunidad reguladora.
Modificacin covalente
En cuanto a las modificaciones covalentes reversibles, hay muchos tipos: fosforilacin (ms
frecuente), acetilacin (importante en histonas), miristoilacin, ADP-ribosilacin, etc.
*Las modificaciones covalentes reversibles se llevan a cabo sobre residuos especficos. Ahora
bien, no tienen por qu tener lugar en los mismos residuos en todos los organismos. Ej.:
fosforilacin puede llevarse a cabo sobre Tyr, Ser, Thr e His, pero las tirosn-quinasas son
casi exclusivos de eucariotas mientras que la histidn-quinasas no se encuentran en humanos.
*En general, aunque todas las quinasas hacen lo mismo, cada una acta sobre un residuo
distinto, normalmente perteneciente a una secuencia consenso caracterstica de suya.
Un aspecto que cada vez se considera ms importante es la interaccin entre protenas. As,
recientemente se est observando que existen zonas en el citoplasma donde las protenas se
asocian para llevar a cabo un cierto proceso con mayor eficiencia que si estuvieran aisladas.
Compartimentacin
Dentro de una misma clula, las endomembranas permiten que cada ruta metablica pueda tener
lugar en un compartimento diferente y con sus propias concentraciones de enzimas y sustratos,
lo que facilita la regulacin de stas.
Regulacin hormonal
As, por ejemplo, la insulina, producida por el pncreas, acta sobre varios tejidos activando la
ruta glucoltica mediante el aumento de expresin de varios de los enzimas que participan en
ella. Sin embargo, tambin aumentan la sntesis de cidos grasos, triacilgliceroles y glucgeno.
Como se ve, su funcin es reducir la cantidad de glucosa en el organismo, pero la lleva a cabo
de muy distintas formas a la vez.
Ej.: la transportada GLUT4 desplaza glucosa disuelta en sangre hasta la clula como respuesta
a la insulina. El receptor de insulina, adems, incrementa la actividad de la hexoquinasa, que
convierte glucosa en glucosa-6-fosfato para evitar su salida, y de la glucgeno-sintasa, para
favorecer el almacenamiento de esa glucosa como glucgeno.
Procesos de sealizacin
La sealizacin es un elemento clave en los procesos de control metablico celular en tanto que
muchas rutas metablicas se llevan a cabo exclusivamente como respuesta a una cierta seal,
normalmente una hormona, cuya concentracin debe ser baja (nm-M) para permitir una
regulacin fina de dichas rutas.
Para que una seal tenga xito, debe pasar previamente un proceso de transduccin. Esto es:
ser captada por un receptor que a su vez active un segundo mensajero. En general, existen seis
tipos de receptores que transducen seales:
- Receptores acoplado a protena G: la unin del receptor activa una protena G (con dominio
de unin a GTP) que a su vez activa una enzima que genera un segundo mensajero.
- Receptores con actividad tirosina quinasa: se autofosforilan al captar la seal y activan una
cascada de activacin de quinasas.
- Receptores con actividad guanilil ciclasa: se activan al unirse su ligando, sintetizando el
segundo mensajero cGMP.
- Canales inicos: se abren al detectar la seal, afectando al potencial de membrana.
- Receptores de adhesin (integrinas): cambian de conformacin cuando se unen al ligando,
alterando su interaccin con el citoesqueleto.
- Receptores nucleares: ciertas seales afectan directamente a la expresin de genes
especficos.
Los sistemas transductores de seales son especficos en tanto que los receptores con los que
cuentan slo se unen molculas concretas. Estos receptores tambin amplifican la seal
geomtricamente, ya que suelen provocar una cascada de activacin enzimtica que da lugar a
muchas respuestas diferentes. Para que la respuesta no sea descontrolada, en la mayora de los
casos existe un mecanismo de desensibilizacin o adaptacin del receptor, de tal manera que la
estructura de ste se vea alterada y ya no sea capaz de reconocer la seal o de producir
respuesta. Finalmente, debe sealarse que cuando varios receptores provocan efectos opuestos a
causa de una misma seal, sus respuestas se integran.
Ej.2: las mismas dos hormonas del ejemplo anterior, adrenalina y glucagn, activando
exactamente la misma va de sealizacin, pueden acabar provocando una respuesta diferente.
As, la protein quinasa A puede fosforilar y activar a la hormona sensitiva de lipasa, dando
lugar a una ruta alternativa que concluye con la disociacin de triacilglicridos en glicerol y
cidos grasos. Ahora bien, como en el
caso anterior, tambin se movilizan
reservas energticas.
No todos los procesos de sealizacin estn mediados por hormonas. As, el enzima AMPK
(protein-quinasa activada por AMP) es un sensor del nivel de AMP de la clula que se activa
cuando ste es alto (carga energtica baja), por ejercicio o por hormonas producidas en el tejido
adiposo. Estando activada, la enzima inhibe rutas anablicas en varios tejidos para ahorrar
energa al tiempo que activa rutas catablicas (oxidacin de glucosa y cidos grasos) en otros.
Tambin acta sobre el hipotlamo provocando sensacin de hambre para impulsar la ingesta de
comida.
Otra enzima, la mTORC1, detecta de modo similar el nivel de aminocidos en la clula. Cuando
las condiciones no son nutricionalmente favorables, acta sobre la traduccin, inhibindola, para
evitar el despilfarro de aminocidos.
Tanto una como otra pueden acabar activando genes relacionados con los procesos que
controlan, como gluconeognesis o biosntesis mitocondrial en el caso de AMPK o adipognesis
y gluclisis en el caso de mTORC1.