FUOC PID_00231381 40 Introduccin a la neuroimagen

5.3. Los formatos NIFTI y ANALYZE 7.5

El nombre de formato NIFTI viene de las siglas en ingls neuroimaging infor-

matics technology initiative. Este formato de archivo fue concebido hace una
dcada como un reemplazo para el entonces generalizado, y algo problem-
tico, formato ANALYZE 7.5. El principal problema con el formato ANALYZE
7.5 era la falta de informacin adecuada acerca de la orientacin en el espa-
cio, de modo que los datos almacenados no podan ser interpretados de forma
inequvoca. Aunque el formato fue utilizado por muchos software diferentes,
la falta de informacin adecuada sobre la orientacin oblig a algunos desa-
rrolladores a realizar modificaciones. Por ejemplo, en SPM para cada imagen
se incluy un archivo adjunto adicional de extensin .mat (el formato estn-
dar en MATLAB, sobre el cual se ejecuta SPM) que brinda informacin sobre
la orientacin de la imagen.

El formato NIFTI se defini en 2003 por miembros del Instituto Nacional de

Salud de Estados Unidos. Los representantes de algunos de los programas ms
populares de neuroimagen acordaron que este formato incluyera la nueva in-
formacin.

Una consecuencia importante de la falta de informacin de orientacin du-

rante los aos en que el formato ANALYZE 7.5 era dominante fue la confusin
reinante entre el lado izquierdo y derecho de las imgenes cerebrales. En esos
aos, los investigadores definieron dos convenios para describir la orientacin
de una imagen: la orientacin neurolgica y la radiolgica. Estos trminos
han sido inadecuados porque, en ausencia de informacin de la orientacin,
un archivo puede ser mostrado en la orientacin neurolgica en un softwa-
re y en orientacin radiolgica en otro. Resulta interesante saber que, aun-
que hay una convencin adoptada por casi todos los fabricantes de equipos
radiolgicos para mostrar el lado izquierdo del paciente en la parte derecha de
la imagen (orientacin radiolgica, donde la imagen se muestra como si el
paciente estuviera siendo observado en la cama desde los pies hacia la cabeza,
frontalmente cara a cara), no se sabe si los neurlogos acreditados en realidad
se reunieron para crear la convencin neurolgica que es justo lo contrario
de la radiolgica (la imagen se muestra como si se estuviera mirando al pa-
ciente desde la parte superior de la cabeza hacia los pies, de la forma en que
lo hara un cirujano).

En el formato ANALYZE 7.5 una nica imagen almacenada requiere dos archi-
vos: un encabezado con extensin .hdr, para almacenar metainformacin y los
datos de la imagen en s, con extensin .img. Para mantener la compatibili-
dad, los datos almacenados en formato NIFTI tambin utilizan un par de archi-
vos, .hdr / .img. Sin embargo, el formato NIFTI aade otras mejoras. Este per-
mite el almacenamiento de la imagen en un archivo nico con extensin .nii.
Trabajar con un solo archivo por imagen es ms cmodo y menos propenso a
errores de manipulacin. Algunos paquetes de anlisis, como el FSL, tambin