Estructura de las Protenas

1 de Abril de 2016

Dr. Ricardo Cabrera

Laboratorio de Bioqumica y Biologa Molecular

Departamento de Biologa
Facultad de Ciencias Universidad de Chile
ricabrer@uchile.cl
Qu es un aminocido?

Un tipo de molcula que posee un C central unido

por enlaces simples a:
grupo amino
grupo carboxilo

Carbono alfa grupo variable

un tomo de H

20 variantes de R en las
protenas
polimerizacin

H
O
plegamiento
O

C
aminocido
H
H C

H C
C
N H
C
H
H H
H
Estado plegado
Estado na8vo
H Estado desplegado
Estado desnaturado Estructura terciaria:
Ubicacin de los tomos
en el espacio cuando la
protena est plegada

Estructura

Funcin
Carbono alfa es asimtrico

R = me/lo

Levogiro Dextrgiro

Simtrico pero no
equivalente
Tipos de grupo R

20 variantes de R en las
protenas
Tipos de grupo R
Aminocidos con cadenas laterales apolares
Formacin el enlace pep=dico
Cadenas polipep=dicas de aminocidos

cadena principal (backbone)

cadenas laterales
Diferentes segmentos de la cadena principal pueden formar puentes de H

N
En las alfa hlices los puentes de hidrgeno se establecen con un patrn regular

Enlaza al siguiente cuarto residuo

hebras beta antiparalelas
hebras beta paralelas
El agua y sus interacciones

Energa requerida para romper

el enlace

23 kJ/mol
5.6 kcal/mol
existe una atraccin electrosttica
entre un oxgeno de una molcula y
un hidrgeno en otra 470 kJ/mol
114 kcal/mol

A temperatura ambiente el
tiempo promedio de un
puente de H es 1-20 ps y uno
nuevo se forma en 0,1 ps
tensin superficial
Ordenamiento del solvente alrededor de una molcula hidrofbica
Interior hidrofbico de las protenas solubles

La estructura de las protenas resulta directamente de sus interacciones con su

ambiente acuoso. En estas condiciones las protenas poseen un interior hidrofbico
Interior hidrofbico de las protenas solubles

las protenas solubles

poseen un interior apolar, es
decir, las cadenas laterales
apolares principalmente se
encuentran alejadas de la
superficie

en las protenas
asociadas a
membrana, las
regiones de la
protena expuestas
al interior apolar de
la bicapa, pueden
exponer cadenas
laterales apolares
en la superficie
qu clase de residuos se encuentran atravesando la bicapa de
la membrana celular?
interacciones intramoleculares
interacciones intramoleculares

enlaces disulfuro

enlaces inicos

puentes de hidrgeno

interacciones apolares
Estructura cuaternaria:

interaccin entre aminocidos que estn en diferentes cadenas polipeptdicas

Protenas que poseen mltiples subunidades

Las interacciones que estabilizan la estructura cuaternaria son las mismas que estabilizan la estructura terciaria
Puentes de hidrgeno, puentes salinos, interacciones hidrofbicas (puentes disulfuro)
Las interacciones que
permiten asociacin
entre cadenas
polipepIdicas
diferentes
son de la misma
naturaleza que las
que permiten las
interacciones
intramoleculares en
una sola cadena
polipepIdica plegada