ANLISIS DE LA VARIABILIDAD GENTICA

Vara el perfil gentico de una especie,

apareciendo nuevas. La variabilidad genet, de
una especie es una ventaja en su fitness (permite
que la sp se adapte al entorno). La variabilidad
genet. Producto de la endogamia no favorece al TRASLOCACIN INVERSIN
fitness, colpaso de la poblacin. -Cuando la froma correcta de divisin de la celula
no se da cuando se quiere, ya sea en profase,
La variablid genet. Entre ancestro y descendiente metafase, anafase, telofase. En la metafase se da
misma especie se produce por divisiones la separacin de cromosomas, aqu se da la
celulares, meiosis, en clulas sexuales o gametos. mutacion de las ISOCROMOSOSMAS
Esta es una transferencia vertical de genes. -Cromosomas en anillos: Los cromosomas tienen
Tambien hay una transferencia horizontal que se los telmeros, lo protegen, si pierden esa zona se
da entre sp distintas. Puede darse por fragmentos pueden deformar
de ADN en el medio, por un virus, y atraves de b) Mutaciones gnicas (puntuales) Solo en un
contacto celular (en bacterias- intercambio nucletido o dos mx.
material gentico. -Espontneas: errores en la replicacin, perdida
de bases nitrogenadas, desaminacion de bases.
PASOS: -inducidas: mutagenos fsicos (radiaciones),
qumicos (formol)
1. Preparacin del acido nucleico (DNA, RNA).
- Liberacin pasiva (ADN en el espacio, aire) -
Bases nitrogenadas Purinas: Adenina, Guanina
Replicacin del plsmido (fragmento de ADN) -
Bases nitrogenadas Pirimidnas: Tiamina, Citosina
Utilizar un bacterifago (virus)
2. Transferencia
ADN: A,T,C,G ARN: A,G,C,U
3. Entrada del cido nucleico al receptor
4. Establecimiento
-Regiones intergnicas: mutaciones silenciosas
- Autoreplicacin - Recombinacin
-Expresion de los genes:
5. Herencia estable
Codon sinnimo: No se afecta la informacin -
Codn no sinnimo: Cambio de sentido
Resistenica bacteriana a antibiticos:
(aminocido distinto); Sin sentido (C. de
Bacterias resistentes transfieren genes a bacteria
terminacin: Genera UAG, UGA, UAA) Sin sentido
sensible a antibiotico, via plasmido y pillis
(C. terminacin eliminado)
(reproduccin asexual, porque son entre dos sp
TIPOS:
distintas, trasnferencia horizontal de gen), el
TRANSICIN: Purina-purina, pirimidina-pirimidina
plasmido se duplica y pasa atraves del pilli.
TRANSVERSIN: Purina-Pirimidina, Pirimidina-
-poblaciones aisladas tienen ms bacterias con
Purina
gran resistencia a antibiticos, al ser sedentanrios
estn en contacto con la naturaleza, puede
trasnferirle bacterias con gran resisterncia a
antibiotics vpia alimento, agua, etc

MUTACIONES
Puede darse en miles de genes (nivel
cromosmico) o mutacin puntual (nivel gentico)
a) Mutaciones cromosmicas Transmisin de la informacin gentica
DUPLICACIN DELECCIN -Fase replicacin: de 5-> 3. Replica fragmentos
de ADN, accin de la polimerasa (denaturar: se
comienza a abrir; alienar; elongar)
-Fase transcripcin (con el ARN) y traduccin
CODON STOP, indican el final de la cadena: UAA,
UAG, UGA, GGU, GGC, GGA, GGG.
EXN: Secuencia del ADN que si codifica. INTRON:
Gen no codificado, se desconoce la funcin que
codifica, puede ser evidencia de que el gen
proviene de tranferencia horizontal
Gen =EXON+INTRON+EXON
(nucletido, gen, adn, histonas, cromosoma,
nucleo de clula)
Regiones intergnicas: entre genes, en los
intrones. Si se da ah no se le stribuye ningn mal
en la funcin porque no codifica nada.
Sustitucin silenciosa: mutacion entre codones
sinonimos GGU (Gly)-> GGC (Gly) No altera la
funcionalidad del organismo.
Sustitucion sin sentido: GGU-> UGU (Cys)
Otro ejemplo es cuando la mutacion genera un
codon stop, la secuencia se cirta antes de
terminar de replicar.
TASAS Y FRECUENCIAS DE MUTACION:
Tasa de mutacion: mutaciones acumuladas en
generaciones. (generaciones/ciclos celulares)
Frecuencia de mutaciones: en base a individuos
presentes o celulas. Ejemplo: 5 indv con mutac en
20 indv presentes
Ley de Hardy- Weinberg
P^2+2pq+q^2=1
FRECUENCIAS GENOTPICAS Y FRECUENCIAS
ALLICAS
Alelo A o alelo a, genotipo Aa
VARIACION GENETICA
HETEROCIGOSIS Aa
POLIMORFISMO: diferentes formas de un gen
MEDIDA DE LA VARIACION GENETICA
-Electroforesis protenas:mide proporcin de
heterocigosis y polimorfismo, se limita por las
mutaciones silenciosas.
TCNICAS PARA LA MANIPULACIN DEL ADN
1) Gel de electroforesis: tiene microesporas y
los fragmentos pequeos caen al fondo. Para
ver si hay presencia de heterocigotos.
2) Replicacin de fragmentos de ADN: Analisis
de PCR (cadena de reaccin de la polimerasa)
Una muestra de saliva, sangre, ADN, lo
amplifica para ver compatibilidad con el
genoma de alguien
3) Marcadores de ADN
RFLPs: Polimorfismo de longitud de
fragmentos de restriccin. Para determinar
heterocigosis. Una enzima corta a la mitad el
alelo dominante, el recesivo sigue igual. En el
gel estos fragmentos caern por peso, si
ambos alelos son dominantes caer ms, sino
es que es que ambos son recesivos.
SNPs (Poliformismo de nucletido simple):
evindecia si hay mutacion puntual.
ANLISIS MOLECULAR Dos indiv de la misma sp.
Compara secuencia de nucletidos. Estudiar
relaciones de parecntesco entre especies. Ayuda
a determinar a dos sp q se parecen pero resultan
ser distintas. La ms eficaz es la comparacin
alineando secuencias. Es importante porque
determino que los humanos ms emparentados a
primates
ADN EN EL AMBIENTE: Al dejar cabello, clulas de
piel dejamos muetras de ADN, pero estas tienen
un tiempo de vida, en condiciones frias puede
perdurar hasta aos. Fragmentos de ADN en el
aire, agua y suelo conforman el ADN ambiental.
Se toman muestras del ambiente para ver que
especies estuvieron ah. Fecas tambin
ANALISIS DE LA DIVERSIDAD BIOLOGICA I
DEFINICIONES
-Comunidad: Grupo de poblaciones de diferentes
especies q viven en un mismo lugar
-Categoras de organismos segn sus nichos:
-Gremio: Agrupacion segn el tipo de
funcin ecolgica que cumple (frugvoros,
nectavoros, depredadores) Sin importar su nivel
taxonmico
-Forma de vida: arboles, arbustos,
herbceas, epifitas.
-Ensamblaje (Asamblea): Agrupar de acuerdo al
nivel taxonmico (orden o clase). (el ensamblaje
de aves, ensamblaje de chiropterea)
-Conjunto: Grupo de igual funcin ecolgica pero
de igual taxn (aves carroeras, hymenopteras
que se alimentan de abejas)
-Funcin ecolgica: Cmo interactua con otros
organismos (colibr: polinizadora; lobo:
depredador; aves y hormigas: dispersor de
semillas o funcin frugorifica, consumir un fruto)
-Composicin de especies: Descripcin
taxonmica: Clase, orden, familia, gnero,
especie.
-Riqueza de especies: # especies presentes en la
comunidad
-composicion de spp: detallar en cuanto a niveles
taxonmicos. Cuantas familias (orden, clase) pero
mencionar cuales son
-Abundancia: # de sp que conforma cada sp
-Abundancia relativa: esta vamos a registrar. Diversidad gamma: es la riqueza total de especies
Toamos una muestra q representa la sp existente en un rea mayor
-Abundancia absoluta: todo DIVERSIDA ALFA
Ejmplos: 2 indv/ 11 trampas de hoyo (indicar und Sp esperadas
Sp Observadas
(MTODOS NO
de esfuerzo) (INDICES)
PARAMETRICOS
Riqueza especfica Riqueza especfica
Estandarizacin de datos: Para compara -0D -CHAO2
abundacias relativas. Elgimos una unidad en -Jackknife 1er orden
medio entre las unidades q estn medidas, en -Jackknife 2do orden
Estructura Estructura
base 10 (10trampas, 100 trampas)
-H -CHAO1
Densidad relativa Densidad absoluta -J
-D
Riqueza de especies:
-Curvas Diversidad de orden cero: aumenta con la
-Und de esfuerzo vs #sp acumuladas (esta graf abundancia de especie
permite ver si tu und de esfuerzo es estable en
resultados hasta q punto)
- especies vs #indv (de sp con mayor indv a la sp Mtodos no paramtricos (prediccin): No se
con menor, curva decreciente, de especies asume un tipo de distribucin al conjunto de
comunes a raras) datos. Requieren datos de presencia-ausencia.
- Datos de incidencia Chao2:
S obs: Especies observadas (valor real) S est:
Especies estimadas (valor calculado).
-Rarefaccin de especies: se utiliza en caso de
tener muestras de tamao desigual. Si se desea Jackknife de 1er orden:
compararlas, este mtodo calcula el nmero
esperado de especies de cada muestra al
reducirlas a un tamao igual para todas, es decir,
reduce el tamao de la muestra mayor para
equipararla con la muestra menor Jackknife de 2do orden:

ESTRUCTURA: mtodos no paramet. (prediccin)

Chao1: esta influenciado por las especies raras

Desventajas: no podemos comparar aves-

mamiferos mamif grandes y pequeos. Se esta
interpolando, se lleva al menor valor, se pierde
infromacion de indiv.. Deben ser mismos nivel
taxn. Las formaciones vegetales de donde se
obtienen las muestras deben ser similares
CLASIFICACIN DE LA DIVERSIDAD
Diversidad alfa: diversidad espceifica. # de sp de
una misma localidad o cobertura vegetal, rea
pequea
Diversidad beta: es la medida del grado de
cambio o reemplazo en la composicin de
especies entre las comunidades que se
encuentran en un rea mayor
Uno de los grandes problemas de medir la
diversidad a travs de la riqueza especfica, a
pesar de ser sencilla, es que el # de sp est
fuertemente influenciado por el tamao de la
muestra. Es muy posible que si se aumenta el
esfuerzo de muestreo, se obtenga un mayor # de
sp, por lo que es difcil comparar muestras de
diferentes tamaos o esfuerzos de muestreo. Sin
embargo, una forma de evaluar la diversidad alfa
a partir de inventarios con diferentes esfuerzos
de muestreo, es a travs de curvas de
acumulacin, en los cuales se puede estimar el #
de sp esperadas para un tamao de muestra
determinado.
DIVERSIDAD ALFA: Indice de diversidad de orden 2 (2D): Vienen de
Simpson. Da ms peso a especies dominantes,
B) OBSERVADO: ms comunes.
a) RIQUEZA ESPECFICA:
b) ESTRUCTURA:

Indice de Shannon- Wiener (H): Influye las

especies raras o escasas. Mide can homogneo
es el luga, en cuanto a distribucin de especies. *Caso: Cmo deciden que esta rea se debe
No tiene unidades que sirva desde el punto de proteger ms que la otra?*
vista ecolgico. La unidad depende de la base del
logaritmo. Valor De cero signifca q solo hay una INDICE DE OCURRENCIA
sp.

pi=fi= numero de individuos de especie sp1/

numero total de individuos entre todas las sp

Indice de Pielou (J): Mide la proporcin de la

diversidad observada con respecto a la mxima
diversidad esperada. Vale 1 cuando todas las sp
tienen igual numero de indv INDICE DE ACTIVIDAD

Indice de Simpson (D): Da ms peso a especies

ms comunes. Valor de dominancia(?. Cuanto
ms heterogneo D es mas alto. D= representa
heterogeneidad, 1-D= homogeneidad. Vale cero
cuando hay una especie, baja diversidad. DIVERSIDAD BETA:

Ver como era el recambio de spp entre dos zonas.

Se puede ver en la similitud (cuantas spp
coinciden especies compartidas) y disimilitud
(spp no compartidas, exclusivas de cada zona)

Por las unidades de H,D, se modifico los ndices. A) SIMILITUD:

Indice de diversidad de orden 1 (1D): Se expresa Jaccard: Expresa el grado en que las dos
en numero efectivo de especies. Permite muestras son semejantes por las especies
comparar mejor y ver cual localidad tiene mas presentes en ellas
especies efectivas, comparar la magnitud de
diversidad. Exponencial de Shannon. Todos los
trata con el mismo peso, no hay especies
dominantes.

Sorensen cualitativo: Cun semejante es una

localidad con respecto a otras. Le da un peso
mayor a sp compartidas. Indica que hay una
mayor similitud entre las zonas

Sorensen cuantitativo: Es un ndice simple que
emplea las abundancias relativas o nmero de
individuos de las especies. Compara datos de
abundancia
Morisita Horn: Afectado por sp dominantes o
comunes. ndice basado en la abundancia, no
est influido por el tamao de muestra o riqueza
B) DISIMILITUD:
Complementariedad
Complementariedad:
APLICACIN DE LA BIOTECNOLOGA EN LA
BIODIVERSIDAD
Transicion de la biotecnologa:
Tradicional: ancestral en las comunidades locales.
Domesticacion de plantas y animales, procesos
fermentativos para obtencin de pan, vino,
produccin de lcteos. Industria farmacutica.
Convencional (microbiologa, gentico; medicina,
alimentos, remediacin) Mejoramiento de razas
y variedades. Procesos fermentativos
controlados (biogs). Cultivos de tejidos (salud,
alimentacin). Mapeo gentico. Bioremediacin:
remediacin de suelos contaminados con
metales, obtencin de energa de aguas
residuales, degradacin de residuos toxicos,
plsticos biodegradables por bacterias
modificadas
Transgnesis (biologa molecular, bioinformtica;
medicina, alimentos, conservacin) Precisa,
aplica mtodos directos. Clonacion de genes,
ingeniera genetica o ADN recombinante.
Obtencion de transgnicos. Clonacin celular:
obtener copias de ADN . Clonacin de clulas:
obtener celular iguales, en medicina para
reparar tejidos. Clonacin de organismos
completos: obtener individuos genticamente
idnticos
Organismos genticamente modificados (GMO)
-Seleccin y obtencin del gen
-Seleccin de un vector.
-Formacin de un ADN recombinante.
-Seleccin de una clula anfitriona.
-Sntesis y obtencin de protenas
correspondientes al gen manipulado.
-Transferencia gentica con el "can de
partculas" (Biobalstica)
-Variacin en la insercin del gen, nmero d
clulas con el nuevo material gentico.
-Etapas posteriores: Cultivos y desarrollo
similares
Principales cultivos transgnicos en el mundo:
Soybean, cotton, maize, canola
Beneficios
Aumento de la productividad agrcola y
maricultura.Seguridad alimentaria. Reduce uso
de elementos qumicos. Captacin del carbono
frente al cambio climtico. Desarrollo de vacunas
comestibles Medicina: Insulina, Factores de
coagulacin, Vacunas
Riesgos de los GMO
Riesgos de cruzamiento y/o contaminacin
gentica. Competencia con especies nativas,
GMO puede adquirir un carcter invasor.
Impacta en el ecosistema. Se pieden
componentes nutricionales. Dependencia
econmica.
Incognitas: Probable generacin de toxinas o
componentes alrgicos, esteralidad, cncer.
Instituciones involucradas
MINAM, punto focal del protocolo de Cartagena
sobre bioseguridad. MINAGRI, a travs del INIA,
en lo referente a recursos genticos agrarios.
Ministerio de Produccin, encargado de los
recursos hidrobiolgicos. MINSA, a travs de
DIGESA. SUNAT
Normativa Nacional
-Convenio de la diversidad biolgica: Encuentro
de Rio 1992 Cumbre de la Tierra. Conservacion
de la diversidad biol, uso sostenible y trato
equitativo
-Ley N 27104: Ley de prevencin de riesgos
derivados del uso de la biotecnologa (1999): El
Estado, a travs de sus organismos competentes,
evaluar los impactos negativos a la salud
humana, al ambiente y a la diversidad biolgica,
que ocasiones la liberacin intencionada de un
determinado OVM (organismo vivo modificado)
Proteger la diversidad biolgica frente a los
organismos modificados geneticamente
-Ley N29811: Ley que establece la moratoria al
ingreso y produccin de organismos vivos
modificados al territorio nacional por un periodo
de 10 aos) Ollanta Humala
-Decreto Supremo 010-2014-MINAM: control de
ingreso al territorio nacional de organismos vivos
modificados : rganos de control: SENASA,
SANIPES, OEFA, MINAN, etc.
-Decreto Supremo 007-2005-SA: El rtulo o
etiqueta de los sucedneos debe tener lo
siguiente: c) Composicin y anlisis del producto,
la declaracin si contiene algn ingrediente
transgnico o grasa trans
-Decreto Supremo 007-2005-SA: Proteccin de
los consumidores en los alimentos Etiquetado de
alimentos genticamente modificados
-Decreto Supremo N 039-2000-ITINCI: Proveedor
debe informar sobre los productos y servicios
ofertados. Informar sobre los ingredientes y
componentes.
-Ley N 29571 (2010): Los alimentos que
incorporen componentes genticamente
modificados deben indicarlo en sus etiquetas.
PARMETROS BIOLGICOS DE LOS
ECOSISTEMAS
Indicadores ambientales:
Resilencia:
Plasticidad
Relevancia ecolgica: Nivel ecosistema, nivel
comunidad (comunidades y poblaciones), nivel
organismo (etologa: comportamiento,
reproductivas) , nivel sub organismo (fisiolgicas,
bioenergticas, bioqumicas, genticas,
inmunolgicas)
A) Indicadores biolgicos:
1) Biomarcadores: Cambios transitorios o
permanentes a nivel fisiolgico, bioqumico,
histolgico, gentico. Ejem Hydropsyche
exocellata
2) Bioacumuladores: No presentan efectos
visibles de la contaminacion. Ejemplo:
acumuladores de DDT
Especies estenoicas: Son muy exigentes, poco
tolerantes, tiles como indicadores
Caracteristicas: Distribucin, abundantes ,
Fidelidad, especificidad, Baja variabilidad
gentica, Taxonoma clara, fciles de identificar y
bien estudiadas en su ecologia, Estrategia de
nutricin clara, Respuesta rpida a los estresores
ambientales, Rango de tolerancia limitado,
Comparable en situaciones similares
B) Indicadores ambientales
Biolgicos: Organs sensibles a los estresores
ambientales. Son estimadores del status o de
otras sp o de condc ambientales. Permite ver el
estado de recuperacin del ecosistema
Fisicoqumicos: Caracterzacion fina. Informacion
til para un tiempo dado. No da info de
recuperacin de un ecosistema. Ejemplo: se basan
en parmetros fsicos o qumicos del agua como
pueden ser el pH, los slidos en suspensin, la
temperatura, la DBO5, etc. o en un conjunto de los
mismos
Limitaciones: Espacio y tiempo determinado,
precisin limitada, medicin indirecta de las
variables abiticas, grupos taxonmicos no
determinados, interpretacin de resultados
subjetiva.

Indicadores biolgicos- atmosfricos

Contaminantes medio-ambientales: lluvia cida,
por metales pesados, por SO2. Cambios
climticos: Radiacin UV, Incremento ozono
troposfrico. Lquenes (asociacin de hongo y
alga. utilizados como indicador biolgico de la
calidad del aire debido a su longevidad y porque
obtienen la mayor parte de sus nutrientes del
aire, lo que los hace muy sensibles a las
impurezas presentes en el medio, como por
ejemplo su susceptibilidad a la presencia de
dixido de azufre en el medio. Se puede
transplantar lquenes para monitorear otras
zonas,
Indicadores bilogicos acuticos
Condiciones de anoxia. Condiciones de pH.
Estratificacin trmica y de oxigeno en la
columna de agua. Turbulencia del agua.
Eutrofizacin natural. Grado de mineralizacin
del agua

Macroinvertebrados: Plecoptera, Cladocera,

Ephemeroptera, Odonata

Indicadores biolgicos terrestres

Utilizados en procesos de restauracin ecolgica
1. Anfibios, aves (bioacumuladores)
2. Anfibios, aves, mamferos (bioindicadores
ecotoxicolgicos): Malformaciones, Alteracin
metamorfosis (anfibios)
3. Anfibios, aves, mamferos (biomonitores)