Documentos de Académico
Documentos de Profesional
Documentos de Cultura
Experimento 5 Catalasa 06-04 PDF
Experimento 5 Catalasa 06-04 PDF
ENZIMA CATALAZA
ACTIVIDAD ENZIMATICA. FACTORES QUE LA AFECTAN.
DETERMINACION DE LA CONSTANTE DE
MICHAELIS-MENTEN. EFECTO DE INHIBIDORES SOBRE LA
ACTIVIDAD ENZIMATICA.
REQUISITOS
Repasar la deduccin
de la frmula de
Michaelis-Menten, sus
premisas y aplicacin.
Balance de ecuaciones
y titulacin
1.
OBJETIVOS
Describir algunas
caractersticas de las enzimas.
Determinar la actividad
enzimtica de las catalasas, su
Km y el efecto de inhibidores
sobre la actividad enzimtica.
FUNDAMENTOS
Las enzimas son catalizadores biolgicos de naturaleza proteica. Esto significa que son protenas cuya
funcin es acelerar las reacciones bioqumicas. Aunque se trata de protenas muchas requieren, para ser
activas, un componente no proteico conocido como coenzima o grupo prosttico, segn se encuentre
dbil o firmemente asociado a la matriz proteica. La estructura de este componente no proteico va a
++
++
++
variar desde un ion (Ca , Mg , Mn , y otros) hasta molculas complejas como NAD+, NADP+ y
FAD. En estos casos la actividad enzimtica va a depender de la presencia simultnea de una porcin
proteica (apoenzima) y una porcin no proteica (coenzima) y el conjunto activo apoenzima mas
coenzima, se conoce como holoenzima.
La actividad enzimtica se estudia en el equilibrio, donde no hay cambio neto en la cantidad de sustrato
o de producto. En los sistemas biolgicos, las enzimas abaten la energa de activacin y permiten que
se produzcan reacciones, que de otro modo, no ocurriran a velocidades mesurables. Las enzimas no se
consumen en el proceso y las reacciones catalizadas no alteran la naturaleza de la reaccin, solo
disminuyen la energa de activacin. (Figura 1)
60
Figura 1
Una consecuencia del hecho de que las reacciones bioqumicas sean catalizadas por enzimas es la
especificidad de stas hacia el substrato: una enzima cataliza la transformacin de un solo tipo de
molcula o de unos tipos diferentes de molculas estructuralmente muy relacionadas, la especificidad
representa una ventaja para la clula.
Las enzimas dependiendo de las reacciones que catalizan, se han clasificado por la comisin
internacional de enzimas (E.C) en cuatro dgitos que anteceden al nombre recomendado para la enzima,
este nombre esta compuesto por uno corto unido al nombre de la reaccin que cataliza, los dgitos son:
el primero se refiere a la clase y van del 1 al 6, representan la reaccin general catalizada, el segundo la
sub-clase, el tercero la sub-subclase y el cuarto designa a cada enzima especifica. En la tabla a
continuacin se muestra la clasificacin solamente del primer dgito:
61
62
Como protenas que son, las enzimas, son molculas de uso delicado por ser fcilmente
desnaturalizables. Debido a esto, deben manipularse bajo condiciones que no favorezcan la
desnaturalizacin puesto que sta conduce a la inactivacin. Entre las condiciones que se deben
controlar durante la manipulacin de las enzimas, cabe destacar:
1.1
La temperatura: La estructura terciaria de una protena es muy sensible a los cambios de la temperatura
ya que, como sabemos, se mantiene gracias a fuerzas no covalentes altamente sensibles al calor. Esto
hace que la actividad enzimtica muestre una dependencia de la temperatura como la representamos en
la figura. 2.
Figura. 2
Actividad Enzimatica
U/L
10
11
12
13
14
1.1.1. El pH: Debido a que los cambios de pH modifican las concentraciones de los iones H y OH de
la solucin, las interacciones electrostticas intra e intermoleculares as como las interacciones entre las
molculas de protenas y la solucin de un valor de pH a otro, modificndose as tambin la
estructura tridimensional y la actividad de la protena. La grfica que se obtiene cuando se estudia la
actividad enzimtica en funcin del pH se parece a la obtenida en el pargrafo anterior como se puede
notar en la siguiente figura.
63
Figura. 3.
10
11
12
13
Aumento del pH
1.1.2. La fuerza inica: Como la fuerza inica esta relacionada con la concentracin de los diferentes
iones de una solucin y stos pueden influir sobre la estabilidad y la actividad de una protena debe
mantenerse un control sobre este parmetro.
1.1.3. La agitacin: Las soluciones de protenas tienen baja tensin superficial, lo cual determina que
cuando estas soluciones se agitan violentamente, se forma espuma. la formacin de espuma es un factor
que favorece la desnaturalizacin.
1.2.
Cuando en el laboratorio se desea estudiar la actividad de una enzima particular, se comienza por
controlar algunos parmetros que van a determinar la reproducibilidad de los ensayos. Entre estos
parmetros se pueden destacar:
1.2.1. Mtodos de deteccin: Lo primero de que se debe disponer es de un mtodo que permita
detectar y cuantificar el producto formado o el substrato remanente despus de la reaccin. Los
mtodos ms usados por su rapidez y sencillez, son los colorimtricos y espectrotofomtricos; luego se
encuentran la cromatografa en papel, en capa fina o de gases; titulacin, respirometra, otros.
1.2.2. Tiempo de incubacin: Para determinar una actividad enzimtica es necesario fijar un intervalo
de tiempo conveniente durante el cual se consuma una cantidad mensurable de substrato. Debe siempre
garantizarse que haya un exceso de sustrato. Para determinar el tiempo de incubacin, se mezclan los
reactantes en varios recipientes y se detiene la reaccin a diferentes tiempos.
Se consigue que mientras no ha ocurrido la saturacin de la enzima por el substrato, la actividad es
proporcional al tiempo de incubacin; la saturacin provoca la prdida de la proporcionalidad; sin
64
embargo, no se debe confundir la situacin en que se alcanza la saturacin con la situacin en que se ha
agotado el substrato; por esto el substrato debe estar en exceso. La grfica que debe encontrarse es la
que se muestra en la figura 4.
Figura 4.
Para estudiar la reaccin, se puede elegir cualquier lapso comprendido dentro de la barra a y se debe
desechar el lapso representado por b, el tiempo debe ser tal que se pueda hacer una determinacin
confiable de la actividad.
1.2.3. Concentracin de la enzima: Determinado el tiempo de incubacin y en la seguridad de que la
concentracin de substrato es excesiva se incuban las mezclas de reaccin durante el tiempo
predeterminado pero con cantidades diferentes de enzimas; si el substrato se encuentra en exceso, se
debe hallar una proporcionalidad directa entre la actividad y la concentracin de enzima (Figura.5).
65
Figura 5
10
Concentracin de la enzima g
Se debe elegir una cantidad de enzima que permita una determinacin confiable de la actividad.
1.2.4. Concentracin del substrato: La determinacin de este parmetro es muy importante por dos
razones principales:
a.
b.
Por lo general, se considera saturante y se emplea rutinariamente una concentracin de sustrato [s] = 10
Km. Diga el estudiante a qu fraccin de Vmax corresponde la actividad enzimtica cuando [s] = 10 Km.
Como ya el estudiante debe imaginarse, esta determinacin se realiza empleando una cantidad fija de
enzima e incubando durante un mismo lapso de tiempo pero con diferentes concentraciones de sustrato.
Al hacer esto hay que tomar en ciertas precauciones prcticas: Debe cuidarse con las concentraciones
inferiores que no se agote el sustrato en el lapso de tiempo fijado con la cantidad de enzima usada. Para
evitar esto hay varias alternativas: aqu las mencionaremos y el estudiante deber averiguar como se
justifican:
a.
b.
c.
d.
e.
1.2.5. Temperatura de incubacin: Sabemos que la velocidad de una reaccin qumica aumenta al
elevarse la temperatura; esto tambin es cierto para las reacciones enzimticas pero el rango de
activacin por la temperatura es limitado, generalmente 0C y 45C; aunque estas cifras no son
absolutas, por lo general a menos de 0C la actividad es prcticamente indetectable mientras que a
ms de 45C la enzima se inactiva, por las razones expuestas previamente. La temperatura ptima de
reaccin se determina incubando bajo condiciones constantes de los parmetros previamente
determinados y a temperaturas diferentes; la grfica es la mostrada en la Figura 2.
1.2.6. pH de incubacin: Se procede igual que para determinar la temperatura ptima pero slo se
vara el pH de la mezcla de reaccin; la grfica que se obtiene es la mostrada en la Figura 2.
1.3.
enzimtica
Partiendo de la hiptesis de la formacin del complejo enzima sustrato de que la velocidad de
descomposicin del sustrato es proporcional a la concentracin
Michaelis y Menten derivaron una ecuacin que indica como vara la velocidad de reaccin en funcin
de la concentracin de sustrato.
Esta ecuacin tiene la expresin:
V max. [S]
v = -----------------Km + [S]
Km =
Vmax.
v = ---------------------Km + 1
-----------[S]
V max.
[S] ( --------------------V
- 1)
V. max.
Esta definicin proviene de la frmula de Km puesto que cuando v = ------------2
entonces Km = [S].
1.3.1 Mtodos para determinar la constante Michaelis-Menten.
1.
Si la velocidad inicial de la reaccin se grfica como funcin de las concentraciones del sustrato
graficar los recprocos de las velocidades de reaccin contra los recprocos de las concentraciones del
sustrato con lo cual se obtiene una lnea recta.
Vmax. [S]
Tomando la inversa de la ecuacin v = -------------------Km + [S]
Se obtiene
1
---- =
v
Km + [S]
--------------------Vmax. [S]
1
Km
------- = --------------------v
V. max. [S]
1
------v
[S]
------------------V. max. [S]
1
---------------V max.
Km
+
----------------V max.
(1)
[------ ]
[S]
-1
1
----- = -----Km
[S]
De este modo es posible obtener grficamente los valores de Vmax. (en la interseccin de 1/v) y calcular
el valor de Km. La siguiente figura representa
68
69
Figura 6
Michaelis-Menten y Lineaweaver-Burk
70
Figura 7
71
Figura 8
72
2.
Soportes Universales
Pinzas
Nueces
Buretas de 50 ml
Pipetas de 125 y 10 ml
Fiolas de 125 ml
Agua oxigenada (H2O2)
2.1
Procedimiento:
Embudos
Cronmetro (aportados por los alumnos)
cido sulfrico 2N
Permanganato de potasio 0,1N
Papel milimetrado (aportado por los alumnos)
Soluciones tampn a diferentes pH
+ H2O2 + H
O2 + Mn
++
+ H2O
El estudiante debe balancear la ecuacin y analizarla ya que a partir de ella se realizarn los clculos
que se van a necesitar durante la prctica. Igualmente el alumno deber repasar lo aprendido en
qumica inorgnica sobre titulacin.
2.2.3 Determinacin del volumen de enzima:
a.
H2O2 (ml)
H2O (ml)
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
1.5
1.5
1.5
1.5
1.5
1.5
1.5
1.5
1.5
1.5
8.0
8.0
7.5
7.5
6.5
6.5
5.5
5.5
4.5
4.5
H2SO4 (ml)
t = min
3
3
3
3
3
73
Enzima (ml)
0.5
0.5
1.0
1.0
2.0
2.0
3.0
3.0
4.0
4.0
H2SO4 2N (ml)
t = min.
3
3
3
3
3
b.
Si se trata de las fiolas 1, 3, 5, 7, 9, adales el H2SO4 al tiempo cero antes de aadir la enzima.
d.
e.
Espere el tiempo indicado (1 min) para aadir el cido. Mezcle y titule con la solucin
de
permanganato.
f.
Se hace una grfica representativa del nmero de moles de H2O2 descompuestos por minutos en
funcin del volumen de enzima empleado y en base a esa grfica el grupo escoger el volumen de
enzima que emplear en las experiencias siguientes.
2.2.4. Determinacin del tiempo de reaccin:
a.
H2O2 (ml)
H2O (ml)
enzima (ml)
t(min)
H2SO4 2N(ml)
1.5
8.0
1.5
8.5-x
1.5
8.5-x
1.5
8.5-x
1.5
8.5-x
4.
INFORME 6
(CATALASA)
Apellidos
Nombres
Grupo de prcticas
N del mesn
Fecha
N del estudiante
Calificaciones
Entrada
1.
Desarrollo
Informe
75
Definitiva
2.
continuacin.
3.
Nota: El informe debe ser entregado al finalizar la prctica, sin anexar hojas.
76