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Hay dos modelos sobre la forma en que el sustrato se une al sitio activo de la
enzima:
el modelo llave-cerradura Este supone que la estructura del sustrato y la del
sitio activo son complementarias, de la misma forma que una llave encaja en una
cerradura. Este modelo es vlido en muchos casos, pero no es siempre correcto.
.el modelo del ajuste inducido En algunos casos, el sitio activo adopta la
conformacin idnea slo en presencia del sustrato. La unin del sustrato al sitio
activo de la enzima desencadena un cambio conformacional que da lugar a la
formacin del producto.
COFACTORES ENZIMTICOS.
Algunos enzimas necesitan para llevar a cabo su actividad cataltica de una o ms sustancias
de naturaleza no proteica que reciben el nombre de cofactores. No debe entenderse que los
cofactores son sustancias que meramente potencian la actividad enzimtica sino que, en
determinados enzimas, son absolutamente imprescindibles para que sta se realice. En
ausencia de cofactor el enzima resulta catalticamente inactivo y recibe el nombre de
apoenzima; la combinacin de apoenzima y cofactor da el holoenzima catalticamente activo.
Existen dos tipos de cofactores enzimticos: los iones metlicos y los coenzimas.
Los iones metlicos que actan como cofactores enzimticos son generalmente cationes mono
o divalentes. Pueden actuar de varias maneras: 1) En algunos enzimas el ion metlico
constituye el verdadero centro cataltico; en estos casos el ion suele presentar por s solo una
cierta actividad cataltica, que se ve incrementada cuando forma parte del enzima.
2) En otros enzimas el ion metlico constituye un grupo puente para unir el sustrato al centro
activo.
3) A veces el ion metlico no forma parte del centro activo sino que se encuentra en un lugar
del enzima muy alejado del mismo, actuando como agente estabilizador de la conformacin
nativa del enzima
VITAMINAS.
Las vitaminas son una serie de sustancias de naturaleza qumica variada
que, en 18 cantidades mnimas, son necesarias para el normal desarrollo
y funcionamiento de muchos organismos. Su importancia biolgica se
manifest debido a que algunos organismos no las pueden sintetizar y
deben adquirirlas por tanto de procedencia exgena. Desde muy antiguo
se saba que determinados alimentos tenan propiedades curativas o
preventivas para determinadas enfermedades. El fraccionamiento
qumico de estos alimentos condujo al aislamiento y purificacin de las
sustancias responsables de este efecto preventivo, las cuales recibieron
el nombre de vitaminas debido a que la primera que se identific era una
amina (de "vital amina"). Pudo constatarse entonces su variada
naturaleza qumica, siendo clasificadas en hidrosolubles y liposolubles
segn su mayor o menor afinidad por el agua o por las sustancias
lipdicas.
CINTICA ENZIMTICA
La cintica enzimtica estudia la velocidad de las reacciones catalizadas por
enzimas. Estos estudios proporcionan informacin directa acerca del mecanismo de
la reaccin cataltica y de la especifidad del enzima. La velocidad de una reaccin
catalizada por un enzima puede medirse con relativa facilidad, ya que en muchos
casos no es necesario purificar o aislar el enzima.
La medida se realiza siempre en las condiciones ptimas de pH, temperatura,
presencia de cofactores, etc, y se utilizan concentraciones saturantes de sustrato. En
estas condiciones, la velocidad de reaccin observada es la velocidad mxima (Vmax).
La velocidad puede determinarse bien midiendo la aparicin de los productos o la
desaparicin de los reactivos.
Siendo:
en donde la expresin (k2+k3)/k1 se ha sustitudo por KM, o constante de
Michaelis-Menten. Este enlace nos aporta una explicacin sobre las razones que
hacen de la KM un parmetro cintico importante.
Se puede distinguir entre enzima libre (E) y enzima unido al sustrato (ES), de
forma que la concentracin total de enzima, [ET], (que es constante a lo largo de
la reaccin) es:
[ET] = [E] + [ES]
INHIBICIN ENZIMATICA.
Existen una serie de sustancias, llamadas inhibidores, que inhiben o anulan la accin de los enzimas sin
ser transformados por ellos. Su estudio resulta de gran utilidad a la hora de comprender los mecanismos de
catlisis, la especificidad de los enzimas y otros aspectos de la actividad enzimtica.
La inhibicin enzimtica puede ser irreversible o reversible, esta ltima comprende a su vez tres tipos:
inhibicin competitiva, acompetitiva y no competitiva
INHIBICIN IRREVERSIBLE.
Algunos inhibidores se combinan de modo permanente con el enzima unindose
covalentemente a algn grupo funcional esencial para la catlisis con lo que el enzima queda
inactivado irreversiblemente. El estudio de este tipo de inhibidores ha resultado de gran utilidad
para identificar los grupos funcionales esenciales para la catlisis en aquellos enzimas a los que
inactivan.
Este tipo de inhibicin se conoce tambin como "envenenamiento" del enzima. Por ejemplo
algunos compuestos organofosforados txicos llamados venenos nerviosos, que se utilizan
como insecticidas, actan inhibiendo irreversiblemente al enzima acetilcolinesterasa, la cual
interviene en la actividad del sistema nervioso. Se sabe que estos compuestos
organofosforados inactivan al enzima formando un enlace ster fosfrico con el grupo hidroxilo
de un determinado resto del aminocido serina, lo que demuestra que ese grupo funcional es
esencial para la catlisis
INHIBICIN NO COMPETITIVA.
EI
ESI
ENZIMAS REGULADORES.
La clula es una mquina qumica que debe ser capaz de autoajustarse o regular su
propio funcionamiento para no desperdiciar tiempo ni energa en realizar procesos que
no le son tiles en un momento dado, siguiendo as un principio de mxima economa
molecular. Este autoajuste se lleva a cabo a varios niveles entre los que destaca la
regulacin de la propia actividad enzimtica. Todos los enzimas presentan propiedades
que los hacen candidatos a constituir elementos reguladores del metabolismo. Estas
propiedades son su sensibilidad a los cambios de pH, a la concentracin del sustrato o
a la concentracin de otras sustancias accesorias que denominaremos cofactores. Sin
embargo, existen una serie de enzimas que, adems de estas propiedades comunes a
todos ellos, poseen otras que les confieren un papel especficamente regulador del
metabolismo: son los enzimas reguladores. Existen dos tipos principales de enzimas
reguladores: los enzimas alostricos y los enzimas modulados covalentemente. Ambos
tipos son responsables de alteraciones en el estado metablico de las clulas en
intervalos cortos de tiempo (los enzimas alostricos en cuestin de segundos, los
modulados covalentemente en cuestin de minutos).
ENZIMAS ALOSTRICOS.
Los enzimas alostricos son aquellos que, adems del centro activo mediante el
cual interactan con el sustrato, poseen otro centro de unin llamado centro
alostrico mediante el cual interactan con otra molcula denominada efector o
modulador (la palabra "alostrico" hace referencia a la existencia de ese "otro
lugar"). La interaccin del modulador con el centro alostrico es tan especfica
como lo es la interaccin del sustrato con el centro activo y tambin est basada
en la complementariedad estructural . Los enzimas alostricos presentan pesos
moleculares en general superiores a los de otros enzimas y en la mayor parte de
los casos son protenas oligomricas, es decir estn formados por varias
subunidades E + I
EI ES + I
ESI 15 (normalmente en nmero par). Los
moduladores alostricos pueden ser de dos tipos: unos estimulan la actividad del
enzima al unirse al centro alostrico, reciben el nombre de moduladores positivos
o activadores; otros la inhiben y se llaman moduladores negativos o inhibidores.
Los inhibidores alostricos no responden a ninguno de los modelos de inhibicin
enzimtica estudiados en el apartado anterior
Zimgeno
zimgeno o proenzima es un precursor enzimtico inactivo, es decir, no cataliza ninguna reaccin
como hacen las enzimas. Para activarse, necesita de un cambio bioqumico en su estructura que le
lleve a conformar un centro activo donde pueda realizar la catlisis. En ese momento, el zimgeno
pasa a ser una enzima activa. La cadena de aminocidos que se libera por la activacin se llama
pptido de activacin.
Funcin
Los zimgenos son utilizados en muchas reacciones biolgicas, como en la digestin o en
la coagulacin sangunea. Son un brillante ejemplo de regulacin endgena de las enzimas, de
cmo controlar su funcin. Las modificaciones que sufren los zimgenos son irreversibles, por lo que
para poder detener las reacciones que llevan a cabo es necesario un inhibidor de la enzima a la que
dan lugar. Cabe destacar el ejemplo del tripsingeno (zimgeno), que da lugar a la tripsina (enzima),
que a su vez activa otros zimgenos. Para poder detener la activacin de los zimgenos, la tripsina
no se puede volver a convertir en tripsingeno, sino que debe secretarse un inhibidor de la tripsina
para detener su accin.
ZIMOGENOS DIGESTIVOS
Ejm.
El tripsingeno es una proenzima (zimgeno) secretada por el pncreas, precursora de la tripsina.
Tras ser producido por el pncreas, pasa a travs de la bilis al intestino delgado, donde se activa y
se convierte en tripsina. El paso de tripsinogeno a tripsina es posible gracias a la
enzima enteropeptidasa secretada por las clulas de la mucosa duodenal, esta enzima extrae el
hexapeptido N terminal del tripsingeno y lo convierte en tripsina, la forma activa. Las pequeas
cantidades de tripsina que se forman mediante este proceso actan como catalizador de la reaccin
y forman a su vez ms tripsina, por ello el paso de tripsingeno a tripsina es una
transformacin autocataltica.1
El quimotripsingeno es una peptidasa precursora (zimgeno) de la enzima digestiva quimotripsina. Es
una cadena polipeptdica simple que cuenta con 245 residuos aminocidos. Es sintetizada en las
clulas acinares del pncreas y es almacenada dentro de grnulos membranosos en el pice de la
clula acinar. La clula es posteriormente estimulada por una seal hormonal o un impulso nervioso y
el contenido de los grnulos es vertido en un conducto que comunica con el duodeno.
El quimotripsingeno debe ser inactivo hasta que llegue al tracto digestivo, para prevenir daos en el
pncreas y otros rganos (de no estar inactivado, el pncreas se destruira a s mismo por la accin de
la peptidasa). Es activado por otra enzima llamada tripsina. La forma activa es llamada -quimotripsina
y es utilizada para crear -quimotripsina. La tripsina escinde el quimotripsingeno en el enlace
peptdico entre la arginina y la isoleucina. Esto crea dos molculas de -quimotripsina. Una molcula
de -quimotripsina acta sobre la otra rompiendo el enlace peptdico entre la leucina y la serina. Esta
reaccin produce la -quimotripsina.
Isoenzima
Las isoenzimas o isozimas son enzimas que difieren en la secuencia de aminocidos, pero que catalizan la
misma reaccin qumica. Estas enzimas suelen mostrar diferentes parmetros cinticos (i.e. diferentes
valores de KM), o propiedades de regulacin diferentes. La existencia de las isoenzimas permite el ajuste del
metabolismo para satisfacer las necesidades particulares de un determinado tejido o etapa del desarrollo.
En bioqumica, las isoenzimas son isoformas (variantes estrechamente relacionadas) de las enzimas. En
muchos casos, son codificadas por genes homlogos que han divergido con el tiempo. Las isoenzimas
representan enzimas de diferentes genes cuyos productos catalizan la misma reaccin, los dos trminos se
suelen usar indistintamente.
Ejemplo de isoenzima