BIOQUIMICA

Introduccin al estudio de la bioqumica

La Bioqumica es una ciencia que
estudia la composicin qumica de los
seres vivos, especialmente las
protenas, carbohidratos, lpidos y
cidos nucleicos, adems de otras
pequeas molculas presentes en las
clulas y las reacciones qumicas que
sufren estos compuestos (metabolismo)
que les permiten obtener
energa(catabolismo) y generar
biomolculas propias (anabolismo).

Bioqumica
Adems es la ciencia que estudia la base qumica de la vida: las
molculas que componen las clulas y los tejidos, que catalizan las
reacciones qumicas del metabolismo celular como la digestin, la
fotosntesis y la inmunidad, entre otras muchas cosas. La bioqumica
se basa en el concepto de que todo ser vivo contiene carbono y en
general las molculas biolgicas estn compuestas principalmente de
carbono, hidrgeno, oxgeno, nitrgeno, fsforo y azufre.

La clula Procariota

La clula Eucariota

BIOQUMICA Y DIVERSIDAD CELULAR

COMPOSICION QUIMICADE LA MATERIA VIVA

La materia viva est constituida por unos 70 elementos, prcticamente la totalidad de los elementos estables que hay
en la Tierra, excepto los gases nobles. Alrededor del 95% de la masa de las clulas est constituida por los elementos
organogenos C, H, O, y N, que son mucho ms abundantes en la materia viva que en la corteza terrestre. Tipos de
bioelementos.

ELEMENTOS ORGANOGENOS
1. Bioelementos primarios o organogenos: C, H, O, N: constituyen el 95% de la
masa total de los seres vivos, funcin estructural.

2.Bioelementos secundarios: S, P, Mg, Ca, Na, K, Cl, funcin estructural y cataltica

Los encontramos formando parte de los seres vivos, y en una proporcin del 4,5%.

3. Oligoelementos. Fe, Mn, Cu, Zn, F, I, B, Si, V, Cr, Co, Se, Mo y Sn. el requerimiento es
de 100 mg para el buen funcionamiento de las clulas, se han aislado unos 60
oligoelementos, pero 14 de ellos pueden considerarse comunes en los seres vivos.
Nuestras clulas son atacadas por el estrs oxidativo: el cansancio, los disgustos y
las enfermedades, el consumo de estos elementos qumicos activan dos sistemas
que luchan en contra de estos radicales que envejecen, perjudican nuestras clulas
llamados: enzimticos (actividad controlada por la disponibilidad del cu, mg, zn y
se) nono enzimticos (antioxidantes como la vitamina C y E).

BIOMOLCULAS
Inorgnicas:
Agua
Sales minerales
Orgnicas:
Glcidos
Lpidos
Protenas
cidos nucleicos
Enzimas
vitaminas

Propiedades fsico qumicas del agua

Poder disolvente.
El agua es el liquido que mas sustancias disuelve,
razn por lo que se dice disolvente universal, esta
propiedad es la ms importante para la vida, se debe
a su capacidad para formar puentes de hidrogeno.
En el caso de las disoluciones inicas los iones de las
sales son atrados por los dipolos del agua, quedando
atrapados y recubiertas de molculas de agua en
forma de iones hidratados o solvatados.
Las sustancias que se mezclan y se disuelven en el
agua como sales, azucares se llaman hidrfilas y las
que no se combinan bien con el agua son hidrfobas
como lpidos y grasas.
Debido a la existencia de puentes de hidrgeno

Elevada fuerza de cohesin-Lquido incompresible.

Los puente de hidrogeno mantiene las molculas de

agua fuertemente unidas, formando una estructura
compacta que la convierte en un liquido casi
incompresible, ofrece resistencia a romperse y acta
como una membrana elstica. Esta propiedad
controla las deformaciones citoplasmticas y permite
que el agua acte como esqueleto hidrosttico en las
clulas vegetales.

Elevada fuerza de adhesin. Unin entre molculas diferentes.

Es la capacidad de unirse a molculas de otras sustancias. Esto permite que el
agua ascienda por conductos estrechos (accin capilar) y la penetracin en
algunas sustancias como las semillas (imbibicin).

Elevado calor especfico

funcin termorreguladora. el agua tiene
gran capacidad para absorber energa.
Absorbe grandes cantidades de "calor"
que utiliza para romper los puentes de
hidrgeno, por lo que la temperatura se
eleva muy lentamente. Por ello, es un
buen estabilizador trmico del organismo
frente a los cambios bruscos de
temperatura del medio. Esto permite que
el citoplasma acuoso sirva de proteccin
ante los cambios de temperatura.

Elevada constante dielctrica

Por tener molculas dipolares, el agua es un gran medio disolvente de
compuestos inicos, como las sales minerales, y de compuestos covalentes
polares como los glcidos.

Ionizacin del agua

dos molculas polares de agua pueden ionizarse debido a las fuerzas de
atraccin por puentes de hidrogeno que se establecen entre ellas.

Un ion hidrogeno se disocia de su tomo de oxigeno de la molcula (unidos por enlace covalente), y pasa a unirse con el
tomo de oxgeno de la otra molcula, con el que ya mantena relaciones mediante el enlace de hidrgeno.
Como vemos, el agua no es un lquido qumicamente puro, ya que se trata de una solucin inica que siempre contiene
algunos iones H3O+ y OH- . (Se utiliza el smbolo H+, en lugar de H3O+).

Bajo grado de ionizacin

De cada 107 de molculas de agua, slo una se encuentra ionizada.
H2O
H3O+ + OHEsto explica que la concentracin de iones hidronio (H3O+) y de los iones
hidroxilo (OH-) sea muy baja. Dado los bajos niveles de H3O+ y de OH-, si al
agua se le aade un cido o una base, aunque sea en poca cantidad, estos
niveles varan bruscamente.

pH
El producto [H+][OH-]= 10-14, se
denomina producto inico del agua, y
constituye la base para establecer la
escala de pH, que mide la acidez o
alcalinidad de una disolucin acuosa ,
es decir, su concentracin de iones
[H+] o [OH-] respectivamente.
Definimos el pH como:
pH=-log[H+]
El pH del agua es 7 y lo consideramos
neutro. Valores mayores sern
bsicos o alcalinos y valores menores
cidos.

pH importancia biolgica
Las reacciones qumicas : determinado pH.
Generacin de energa en la mitocondria : [H +] ATP.
Estructura y funcin de protenas y cidos nucleicos: influenciada por la [H+] del
medio.
Equilibrio hidro-electroltico: comprometido a altas [H+] y pH extremos.

Sistema buffer o tampn

Los sistemas tampn o amortiguadores son sistemas acuosos que tienden
a resistir o impedir la variacin del pH cuando se aaden pequeas
cantidades de iones acido (H+) o base (OH-) consisten en un par cido-base
conjugada que actan como dador y aceptor de protones,
respectivamente ej tampones biolgicos par carbonato-bicarbonato y el
par monofosfato- bifosfto. Un sistema amortiguador consiste de un cido
dbil (dador de protones) y su base conjugada (aceptor de protones).
sistemas tampn o buffer que mantienen el pH constante, mediante
mecanismos homeostticos. Las variaciones de pH, afectan a la estabilidad
de las protenas y, en concreto, en la actividad cataltica de las enzimas,
pues en funcin del pH, pueden generar cargas elctricas que modifiquen
su actividad biolgica.

Carbohidratos

Clasificacin de los hidratos de carbono

Monosacridos: (CH2O)n.
Disacridos: C12H22O11
Oligosacridos
Los polisacridos

Monosacridos
Los monosacridos son sustancias blancas, de sabor dulce, cristalizable y soluble en agua. Se
oxidan fcilmente, transformndose en cidos, por lo que se dice que poseen poder
reductor (cuando ellos se oxidan, reducen a otra molcula).
Qumicamente son polialcoholes es decir cadenas de carbono con un grupo OH cada carbono,
en los que un carbono forma un aldehdo o un grupo cetona.

Monosacridos

Los monosacridos se clasifican en base a dos criterios:

Grupo funcional
Nmero de tomos de carbono
En base al grupo funcional los monosacridos se clasifican en dos grupos:
Aldosas: Contienen en su estructura un grupo formilo (grupo de aldehdos).
Cetosas: Contienen en su estructura un grupo oxo (grupo de cetonas).

Monosacridos. la reserva mas importante de glucosa en el organismo se

encuentra en el hgado y los msculos, pero sta no es muy abundante, por lo que
es importante incluir alimentos que contengan carbohidratos, que el organismo
transforma en glucosa, para un adecuado funcionamiento de nuestro cuerpo.

Tipo

Nmero
de tomos
de
carbono

Ejemplo

Triosa

Gliceraldehdo

Tetrosa

Eritrosa

Pentosas

Ribosa

Hexosa

Fructosa

Disacridos. formados por dos molculas de monosacridos que

pueden ser iguales o diferentes. Los disacridos no se utilizan como tales
en el organismo, sino que ste los convierte a glucosa. En este proceso
participa una enzima especfica para cada disacrido, lo rompen y se
.
producen los monosacridos que los forman. C12H22O11 son ismeros

Oligosacaridos

Funciones de los carbohidratos

A) Energtica. (glucgeno en animales y almidn en vegetales, bacterias y
hongos)

Reserva.
Los carbohidratos se almacenan en forma de almidn en los vegetales (gramneas, leguminosas y tubrculos) y
de glucgeno en los animales. Ambos polisacridos pueden ser degradados a glucosa.

Estructural. (como la celulosa en vegetales, bacterias y

hongos y la quitina en artrpodos)

Funciones de los carbohidratos

d) precursores. Los carbohidratos son precursores de ciertos lpidos,
protenas y dos factores vitamnicos, el cido ascrbico (vitamina C) y el
inositol.

e) seales de reconocimiento (como la matriz extracelular)

Los carbohidratos intervienen en complejos procesos de
reconocimiento celular, en la aglutinacin, coagulacin y
reconocimiento de hormonas.

LIPIDOS
Tienen carcter anfiptico, ya que los cidos grasos
tienen dos zonas diferentes; el grupo carboxilo
es polar y la zona de la cadena hidrocarbonada es no
polar, que tiende a establecer enlaces de Van der Waals
con otras cadenas semejantes. El tamao de la cadena
saturada es el responsable de la insolubilidad en agua
de estas molculas en un medio acuoso tienden a
dispersarse en forma de lminas o micelas (monocapa o
bicapa), de modo que constituyen emulsiones. Aqu las
zonas polares establecen los puentes de hidrgeno con
el agua y los no polares se alejan de esta. La
zona polar es zona hidrfila o lipfoba (soluble en
agua) y la zona no polar es la zona lipfila o hidrfoba
(repele el agua).

ACIDOS GRASOS

ACIDOS GRASOS
Un cido graso es una biomolculas orgnica de naturaleza
lipdica formada por una larga cadena hidrocarbonada lineal, de
nmero par de tomos de carbono, en cuyo extremo hay un
grupo carboxilo.
Cada tomo de carbono se une al siguiente y al precedente por
medio de un enlace covalente sencillo doble y triple.
Al tomo de su extremo le quedan libres tres enlaces que son
ocupados por tomos de hidrgeno (H3C-). Los dems tomos
tienen libres dos enlaces, que son ocupados igualmente por
tomos de hidrgeno (.. -CH2-CH2- CH2- ...).

cido butrico (cido butanoico)

cido isobutrico (cido 2-metilpropionico)
cido valrico (cido pentanoico)
cido isovalrico (cido 3-metilbutanoico) o
Cadena larga:
cido mirstico, 14:0 (cido tetradecanoico)
cido palmtico, 16:0 (cido hexadecanoico)
cido esterico, 18:0 (cido octadecanoico)

cido oleico: 18:1(9).

cido linoleico, 18:2(9,12)
cido linolnico, 18:3(9,12,15)
cido araquidnico, 20:4(5,8,11,14).

cidos grasos

cidos grasos esenciales (AGE)

cidos grasos esenciales: como el linoleico, linolnico o el araquidnico
que el organismo no puede sintetizar

LPIDOS

Los lpidos cumplen funciones

diversas en los organismos vivientes,
entre ellas la de reserva energtica
(triglicridos), la estructural
(fosfolpidos de las bicapas) y la
reguladora (esteroides).
Los Lpidos tambin funcionan para el
desarrollo de la materia gris, el
metabolismo y el crecimiento.

Clasificacin de los lpidos

Lpidos con cidos grasos (saponificables).
simples: cidos grasos
Acilgliceridos: mono glicridos, di glicridos y triglicridos.
Cridos: ceras de miel.
Complejos: Fosfolpidos: fosfoglicerido y esfingolipido.
Glucolipidos: bicapas lipidicas de las membranas.
Lpidos sin cidos grasos (insaponificables).
Terpenos: Esencias vegetales: eucalipto, mentol, alcanfor, vainilla
vitaminas A,E,K.
pig. Vegetales: caroteno-anaranjado, Xantofila-amarillo,
licopeno-rojo.
Esteroides: Esteroles. colesterol y vitaminas D.
Hormonas esteroideas: H. suprarrenales. cortisona y las
H sexuales: progesterona y testosterona
Prostaglandinas: produccin de sustancias que regulan la coagulacin de la sangre y cierre de
las heridas.

Triacilgliceridos - triglicridos
La glicerina est unida a tres cidos grasos; son los ms importantes, constituyen
la principal reserva energtica de los animales, en los que constituyen las grasas;
en los vegetales constituyen los aceites. El exceso de lpidos es almacenado en
grandes depsitos en el tejido adiposo de animales.
Se encuentran en las grasas (el sebo) y en los aceites se encuentran los restos de
cidos grasos con cadenas de 14 a 18 tomos de carbono. Si en el triglicrido
predominan los cidos grasos saturados, este ser slido a temperatura ambiente
(el sebo y la manteca=> grasas). Si predomina los cidos grasos insaturados, el
triglicrido ser lquido a temperatura ambiente, como los aceites vegetales.

FOSFOLIPIDOS
Funciones de los Fosfolpidos.se encuentran presentes principalmente en
las membranas biolgicas, cumplen funciones vitales en la clula:
Regulando la permeabilidad celular.
Interviniendo en la solubilizacin de compuestos poco polares.
En el proceso de coagulacin sangunea.
Formando parte de la vaina de mielina de neuronas y de partculas
transportadoras de electrones.
Participando en las vas de sealizacin celular.

Funciones de los lpidos

Los lpidos desempean diferentes tipos de funciones biolgicas:
Funcin de reserva energtica. Los triglicridos son la principal
reserva de energa de los animales ya que un gramo de grasa
produce 9,4 kilocaloras en las reacciones metablicas de
oxidacin, mientras que las protenas y los glcidos slo producen
4,1 kilocaloras por gramo.
Funcin estructural. Los fosfolpidos, los glucolpidos y el
colesterol forman las bicapas lipdicas de las membranas celulares.
Los triglicridos del tejido adiposo recubren y proporcionan
consistencia a los rganos y protegen mecnicamente

Funciones de los lpidos

Funcin reguladora. Las vitaminas liposolubles son de naturaleza
lipdica (terpenos, esteroides); las hormonas esteroides regulan el
metabolismo y las funciones de reproduccin; los glucolpidos
actan como receptores de membrana.
Funcin transportadora. El transporte de lpidos desde el intestino
hasta su lugar de destino se realiza mediante su emulsin gracias a
los cidos biliares y a las lipoprotenas.
Funcin biocatalizadora. Los lpidos favorecen o facilitan las
reacciones qumicas que se producen en los seres vivos. Cumplen
esta funcin las vitaminas lipdicas y las hormonas esteroideas y las
prostaglandinas.

proteinas

AMINOACIDOS

NIVELES DE ORGANIZACIN ESTRUCTURA DE LAS PROTEINAS

La estructura primaria: es la secuencia de aminocidos de la protena.
Nos indica qu aminocidos componen la cadena polipeptdica y el
orden en que dichos aminocidos se encuentran. La funcin de una
protena depende de su secuencia y de la forma que sta adopte.

Estructura secundaria: Es la disposicin de la secuencia de aminocidos

en el espacio.
Los aminocidos, a medida que van siendo enlazados durante la sntesis de
protena, adquieren una disposicin espacial estable. Existen dos tipos de
estructura secundaria:
La (alfa)-hlice.
La conformacin beta o lmina plegada.

Estructura terciaria.
La estructura terciaria informa sobre la disposicin de la estructura
secundaria de un poli pptido al plegarse sobre s misma originando una
conformacin globular. Esta conformacin globular facilita la solubilidad en
agua y as realizar funciones de transporte, enzimticas, hormonales, etc.

Cuarta estructura
Esta estructura informa de la unin, mediante enlaces dbiles (no covalentes)
de varias cadenas polipeptdicas con estructura terciaria, para formar un
complejo proteico. Cada una de estas cadenas polipeptdicas recibe el nombre
de protmero.

Propiedades de las protenas

SOLUBILIDAD: Las protenas son solubles en agua cuando adoptan una
conformacin globular. La solubilidad es debida a los radicales (-R) polares libres
de los aminocidos que se encuentra en la parte externa que, al ionizarse,
establecen puentes de hidrgeno con las molculas de agua.
CAPACIDAD AMORTIGUADORA. Las protenas tienen un comportamiento
anftero y esto las hace capaces de neutralizar las variaciones de pH del medio,
ya que pueden comportarse como un cido o una base y por tanto liberar o
retirar protones (H + ) del medio donde se encuentran.

Desnaturalizacin de protenas
Es la prdida de las estructuras de orden superior (secundaria, terciaria y
cuaternaria), quedando la cadena polipeptdica reducida a un polmero Los
agentes que provocan la desnaturalizacin: agentes fsicos (calor) y
qumicos (detergentes, disolventes orgnicos, pH, fuerza inica). Por ende habr
perdida de solubilidad y funcin de la protena

Especificidad.
Es una de las propiedades ms caractersticas y se refiere a que cada
una de las especies de seres vivos es capaz de fabricar sus propias
protenas (diferentes de las de otras especies) y, an, dentro de una
misma especie hay diferencias proteicas entre los distintos individuos.
Esto no ocurre con los glcidos y lpidos, que son comunes a todos los
seres vivos. La especificidad de las protenas explica algunos
fenmenos biolgicos como: la compatibilidad o no de transplantes de
rganos; injertos biolgicos; sueros sanguneos; etc... o los procesos
alrgicos e incluso algunas infecciones.

Clasificacin de las protenas

Segn su forma:
Fibrosas: tiene cadenas polipeptdicas largas y una estructura secundaria
atpica. Son insolubles en agua ejm queratina, colgeno, fibrina.
Globulares: caracterizan por doblar sus cadenas en forma esfrica dejando
grupos hidrfobos hacia adentro y grupos hidrfilos hacia afuera, son solubles
en disolventes polares como el agua ejm enzimas, anticuerpos, algunas
hormonas y protenas de transporte.
Mixtas: posee una parte fibrilar (centro de la protena) y otra parte globular (
extremos).

Clasificacin de las protenas

Segn su composicin qumica:
Simples: su hidrolisis produce aminocidos. ejm insulina, colgeno
(globulares y fibrosas).
Conjugadas o heteroproteinas: hidrlisis produce aminocidos y otras
sustancias no proteicas como un grupo prosttico. Ej. Lipoprotenas su
G.P es un lpido. Aparecen en las paredes bacterianas y en el plasma
sanguneo, donde sirven como transportadores de grasas y colesterol:
HDL, LDL. Fosfoprotenas. Su G.P es el cido ortofosfrico.
Nucleoprotenas. Su G.P. est formado por cidos nucleicos.

Funciones de las protenas

Las protenas determinan la forma y la estructura de las clulas y dirigen casi
todos los procesos vitales. Las funciones de las protenas son especficas de
cada una de ellas y permiten a las clulas mantener su integridad, defenderse
de agentes externos, reparar daos, controlar y regular funciones, etc. Todas las
protenas realizan su funcin de la misma manera: por unin selectiva a
molculas. Las protenas estructurales se agregan a otras molculas de la
misma protena para originar una estructura mayor.

FUNCIONES DE LAS PROTENAS

Funcin ESTRUCTURAL: glicoprotenas forman parte de las membranas celulares y
actan como receptores o facilitan el transporte de sustancias.
Las histonas, forman parte de los cromosomas que regulan la expresin de los genes.
Otras protenas confieren elasticidad y resistencia a rganos y tejidos:
El colgeno del tejido conjuntivo fibroso.
La queratina de la epidermis.
Las araas y los gusanos de seda segregan fibroina para fabricar las telas de araa y los
capullos de seda, respectivamente.
Funcin ENZIMATICA: Actan como biocatalizadores de las reacciones qumicas del
metabolismo celular.
Funcin HORMONAL: insulina y el glucagn (que regulan los niveles de glucosa en
sangre)
Funcin REGULADORA: regulan la expresin de ciertos genes y otras regulan la divisin
celular (como la ciclina).

FUNCIONES DE LAS PROTENAS

Funcin HOMEOSTATICA: mantienen el equilibrio osmtico y actan junto con
otros sistemas amortiguadores para mantener constante el pH del medio
interno.
Funcin DEFENSIVA: Las inmunoglogulinas actan como anticuerpos frente a
posibles antgenos. La trombina y el fibringeno contribuyen a la formacin de
cogulos sanguneos para evitar hemorragias.
Funcin de TRANSPORTE: La hemoglobina transporta oxgeno en la sangre de
los vertebrados.
Funcin CONTRACTIL: La actina y la miosina constituyen las miofibrillas
responsables de la contraccin muscular.
Funcin DE RESERVA: La ovoalbmina de la clara de huevo, La lactoalbmina
de la leche

ACIDOS NUCLEICOS

ACIDOS NUCLEICOS
Son macromolculas o polmeros formados por la unin
de unidades o monmeros denominadas nucletidos,
por ello podemos definirlos como polinucletidos.
PAPEL BIOLGICO. El papel biolgico fundamental de
los cidos nucleicos es participar en los mecanismos
moleculares mediante los cuales la informacin
gentica de los organismo se almacena, se replica,
recombinacin y se transcribe las caractersticas
hereditarias de una generacin a la siguiente y dirigir la
sntesis de protenas.
Mantienen la identidad de las especies.
Mantienen las diferencias individuales dentro de la
especie y un individuo no es exactamente igual a otro
de su misma especie.
Responsables de la diferenciacin de tejidos y clulas
dentro del organismo. (estructura y funcin determinada
por la expresin selectiva de ciertos genes).
La secuencia de cada protena est programada en los
c. Nucleicos de la propia clula.
Han permitido la evolucin por mutaciones.

ACIDOS NUCLEICOS

ESTRUCTURA QUMICA DE LAS BASES NITROGENADAS

TIPOS DE ACIDOS NUCLEICOS

Estructura qumica del ADN: dos cadenas de nucletidos conectadas mediante

puentes de hidrogeno, que aparecen como lneas punteadas

Estructura del acido ribonucleico

Sintesis de las proteinas

Diferencias del ADN y ARN

ADN

ARN

B.N: A, G, C, T.
Pentosa: desoxirribosa (C2-H)
Clulas Eucariotas: son de doble
cadena formada por millones de
nucletidos. ADN se lo encuentra slo
en el ncleo, ya sea formando a los
genes.
Masa molecular: mayor peso molecular.
Mientras que el ADN contiene la
informacin en una secuencia lineal de
nucletidos.
El ADN, por tanto, sera la "copia
maestra" de la informacin gentica,
que permanece en "reserva" dentro del
ncleo.

B.N: A, G, C, U.
Pentosa: ribosa (C2-OH)
Clulas Eucariotas: cadena sencilla o
monocatenaria, a veces es extendidaARNm, plegada-ARNt y ARNr. ARN se lo
puede encontrar tanto en el ncleo como
en el citoplasma.
Masa molecular: menor peso molecular.
el ARN expresa dicha informacin en una
secuencia lineal de aminocidos en una
protena.
El ARN, en cambio, sera la "copia de
trabajo" de la informacin gentica. Este
ARN que lleva las instrucciones (traduccin)
para la sntesis de protenas se denomina
ARN mensajero(ARNm).

 PROTEINAS ARTIFICIALES. Son creadas por el hombre. Estn formadas

por aminocidos capaces de unirse para formar un gel que permite el
crecimiento de cierto tipo de clulas. Para su elaboracin se usa un
hidrogel. Se utilizaran para hacer crecer cartlagos, huesos, rganos y
tejidos
PROTEINAS SORPRENDENTES. La tela de araa esta formada por 50%
de fibroina, compuesta por glicina y alanina. Esta seda es 5 veces ms
resistente que un filamento de acero y 2 veces ms elstica que el
nylon, es impermeable. El kevlar es utilizado en la fabricacin
chalecos a prueba de balas y neumticos para bicicletas resistentes a
las pinchaduras. El Kevlar junto al nomex sirve para ropa antillamas