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CONTEO Y CARACTERIZACIN DE REGIONES

COMPLETAS EN IMGENES 2D: APLICACIN A
NCLEOS CELULARES
ARTICLE JANUARY 2002

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4 AUTHORS, INCLUDING:
Gustavo Adolfo Osorio

Fabiola Angulo

National University of Colombia

National University of Colombia, Manizales

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REVISTA COLOMBIANA DE FSICA, VOL. 34, No. 1. 2002

CONTEO Y CARACTERIZACIN DE REGIONES COMPLETAS EN IMGENES

2D: APLICACIN A NCLEOS CELULARES
Y. Sossa, G. Osorio, F. Prieto, F. Angulo
Grupo de Percepcin & Control Inteligente (PCI)1
Universidad Nacional de Colombia Sede Manizales
Cra 27 No. 64-60, A.A.127 Fax (57)(6)8743033
RESUMEN
En el presente trabajo se realiza la descripcin de los procedimientos utilizados para realizar
la deteccin y caracterizacin de regiones completas en imgenes 2D, mediante tcnicas de
visin artificial. El proceso est dividido en las siguientes etapas: Adquisicin, Preproceso,
Segmentacin, Caracterizacin y Clasificacin. En las primeras etapas se busca producir
imgenes de bordes que representen de una manera aproximada los contornos que delimitan
cada una de las regiones de inters. Posteriormente se obtiene la firma, que es un mtodo
empelado para realizar la descripcin y representacin de contornos, para finalmente
proceder con el reconocimiento de cada uno de las regiones en la imagen. Se presentan
adems, los resultados obtenidos en la segmentacin y clasificacin de ncleos de clulas, en
las imgenes al microscopio de citologas del epitelio escamoso.

INTRODUCCIN
Este trabajo se realiz al interior del Grupo de Percepcin & Control Inteligente en la
Universidad Nacional de Colombia Sede Manizales, y dentro del proyecto que tiene como
propsito desarrollar un sistema para el anlisis de muestras a nivel del epitelio vaginal
mediante el proceso digital de imgenes.
Dentro de las diferentes tareas que se deben realizar en el anlisis de citologas cervico-vaginales,
uno de los primeros pasos es observar que porcentaje de clulas de las capas germinales llegan a la
capa superficial, y para lograrlo se deben tener en cuenta diferentes parmetros (forma, tamao y
color) del ncleo y del citoplasma en cada una de las clulas analizadas. Estos parmetros tambin
deben ser empleados para determinar anomalas en la estructura celular, lo cual suministra
informacin determinante para el diagnstico de diversas enfermedades.
Basados en lo anterior, se desarrollaron algoritmos que realizan la segmentacin y
caracterizacin del ncleo y citoplasma de clulas, en imgenes al microscopio del epitelio
escamoso del crvix.
Para las adquisicin de las imgenes se utilizo una cmara JAVELIN SYSTEMS (JE3942-A)
acoplada a un microscopio MEIJI TECNO con un lente 0.25 160/0.17 que entrega los datos a
una tarjeta digitalizadora ZOLTRIX TV MAX, el tamao mximo de las imgenes obtenidas
es de 500x500 pxeles.
1

E-mail: pci@nevado.manizales.unal.edu.co

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PREPROCESAMIENTO
Se realizaron pruebas con diferentes tipos de filtros suavizantes [1][2], con el fin de atenuar las
componentes de alta frecuencia que no pertenecen a los contornos y que podran causar
problemas para la obtencin de los mismos.
En la figura 1, se muestran los resultados de aplicar sobre la imagen de una clula
diferentes filtros suavizantes (Mediana, Kuwahara[3] y Promedio).

Figura 1. a. Imagen Original. b. Mediana. c. Kuwahara. d. Promedio.

De los resultados obtenidos se puede decir que el filtrado de mediana produce imgenes con
mejores condiciones de homogeneidad, reduccin de ruido y mayor contraste entre el ncleo, el
citoplasma y el fondo. Teniendo en cuenta que los contornos del ncleo y del citoplasma pueden
ofrecer informacin suficiente para realizar la segmentacin y caracterizacin de los mismos, se
implementaron tres tipos de filtros para la deteccin de los bordes[4][6]. En la figura 2 se muestran
los resultados obtenidos al aplicar los operadores de Roberts, Prewitt y Sobel a una imagen despus
de ser suavizada empleando en dos ocasiones un filtro de mediana.

Figura 2. a. Imagen original. b. Sobel. c. Prewitt. d. Robert.

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SEGMENTACIN
La siguiente etapa en el proceso consiste en determinar las componentes de bordes que
corresponden a los ncleos. Para esto se implement un algoritmo basado en la conectividad
que agrupa todos los elementos de borde pertenecientes a un mismo contorno. Posteriormente
se calcul el tamao (Nmero de pxeles) y la dispersin de las distancias de los punto que
conforman el contorno respecto a su centroide.
La figura 3 muestra la distribucin de las clases con las caractersticas escogidas. Las lneas
indican el valor del umbral para clasificar un contorno como ncleo.

Figura 3. Distribucin de clases.

En la figura 4, se puede observar el resultado de aplicar el proceso descrito a la imagen de

la figura 2c.

Figura 4. Contrornos clasificados como ncleos.

La imagen resultante entrega la ubicacin aproximada de los posibles ncleos. Debido a que los
contornos obtenidos no son una buena representacin de los lmites existentes, se implement un
algoritmo que realiza el anlisis de los perfiles.
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Los perfiles son cortes a travs del centroide de cada contorno midiendo la intensidad de los
pxeles en la imagen original.
Para realizar una deteccin ms confiable de los lmites, se implement un filtro con histresis. Por
medio de comparaciones entre la intensidad de un pxel en la imagen original y dos umbrales, es
posible determinar si pertenece al ncleo, al citoplasma, o al fondo. El objetivo es evitar las
oscilaciones entre niveles por pequeas variaciones de intensidad.
En la figura 5 se pueden observar cuatro perfiles en diferentes orientaciones, y los niveles de los
filtros de histresis.

Figura 5. Perfiles y filtros con histresis.

En la figura 5 se pueden observar los diferentes niveles, el nivel inferior corresponde a los puntos
ms oscuros que representan los ncleos, el nivel del medio contiene los puntos pertenecientes a
el citoplasma y finalmente el nivel superior que contiene los puntos del fondo.
En la figura 6 se pueden observar los resultados obtenidos al realizar el proceso completo
(filtrado, deteccin de bordes, clasificacin de contornos, anlisis de perfiles) en imgenes de
clulas aisladas. Las regiones estn limitadas por los puntos donde la intensidad cambia de
nivel.

Figura 6. Regiones segmentadas.

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CARACTERIZACIN
En las imgenes segmentadas se busca identificar caractersticas de las clulas de epitelio del
crvix [5] tales como:

La maduracin de las clulas, desde la capa basal a la superficial, se caracteriza

por un aumento en el tamao del citoplasma y una disminucin concomitante del
tamao del ncleo.
Las clulas basales presentan un ncleo grande y una exigua orla citoplsmica o
desprovistas de la misma.
La capa externa las clulas basales tiene un anillo citoplsmico ms grande que el
dimetro mximo del ncleo y las clulas que la componen son ovales o redondas.
Las clulas de la capa intermedia ya no son redondas u ovales, sino que presentan
ngulos bien definidos.
Finalmente en la capa superficial el citoplasma queda reducido a una masa amorfa,
estando el ncleo reducido al mximo.

Examinando estas caractersticas se puede determinar que tipos y que porcentaje de clulas
se encuentran en una muestra de tejido de crvix, para poder determinar la clase y el grado
de la lesin. En la figura 7 se muestra un ejemplo en el que aparecen clulas de la capa basal
(interna) en la capa superficial (externa).

Figura 7. Clulas de la capa basal en la capa superficial

De acuerdo a los resultados encontrados en sistemas que realizan anlisis similares

[7], y a los problemas que aparecen al tratar de segmentar el citoplasma cuando
existen solapes, se propone estudiar nicamente las caractersticas del ncleo para
determinar el tipo de clula.
RESULTADOS
Se obtuvieron los siguientes resultados analizando 9 imgenes citolgicas que cuentan con
un total de 170 ncleos. En el proceso de segmentacin se emple el filtrado de mediana
combinado con los operadores de Roberts, Prewitt y Sobel para realizar la deteccin de
bordes en las diferentes componentes de color RGB y en la imagen de intensidad (I).
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Filtro
Realzante
Roberts
Prewitt
Sobel

R
78.4 %
84.7 %
84 %

Ncleos Segmentados (%)

G
B
I
74 %
76.2 %
76.1%
77 %
78 %
77 %
75 %
78 %
81 %

Tabla 1. Porcentaje de deteccin de ncleos.

CONCLUSIONES
Fue posible segmentar alrededor del 80% de los ncleos existentes en las imgenes
analizadas, empleando la tcnica propuesta.
Este proceso est relacionado con la forma y el tamao de las clulas en las imgenes, que a
su vez depende de la etapa de adquisicin, por lo tanto es necesario controlar parmetros
tales como el aumento y la distancia en el sistema. Debido a que las imgenes no son
homogneas, es necesario emplear algoritmos que involucren umbrales dinmicos.
Las diferentes componentes de color, tanto en RGB como en HSI, juegan un factor
importante en la extraccin de informacin referente a la estructura de las clulas ya que
algunas de estas componentes pueden atenuar o realzar regiones de las clulas.
Debido a la complejidad de las imgenes y a la poca homogeneidad que tiene la superficie
de las clulas es necesario optimizar el desempeo de los algoritmos de crecimiento por
regiones.
AGRADECIMIENTOS
Los autores expresan su agradecimiento a la Universidad Nacional de Colombia Sede Manizales y al Grupo de
Investigacin en Cncer de Cuello Uterino y Mama de la Universidad de Caldas por la colaboracin prestada en
la realizacin del presente trabajo.

REFERENCIAS
[1] Rafael C. Gonzlez, Richard E Woods. Tratamiento digital de imgenes. AddisonWesley/Daz de Santos. 1996.
[2] Robert M. Haralick, Linda G. Shapiro. Computer and Robot Vision. Addison-Wesley.
1993.
[3] www.ph.tn.tudelft.nl/~bokhove/imap/library/wouter/kuwahara.html
[4] Emanuele Trucco, Alessandro Verri. Introductory Techniques for 3-D Computer Vision.
Prentice Hall. 1998.
[5] J. Montes, J. Ramrez. Sistema para la Segmentacin de Imgenes al Microscopio del
Epitelio Poliestratificado Vaginal. Universidad Nacional de Colombia. 2000
[6] H. Bassmann, P. Besslich. Ad Oculos: Digital Image Processing. International Thomson
Computer Press. 1995
[7] http://www.drscope.com/reutersnews/april1999/23.htm

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