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EXPERIMENTOS DE RMN
Teodor Parella
Servei de Resonancia Magntica Nuclear, Universitat Autnoma de Barcelona
08193 Bellaterra, Barcelona
teodor.parella@uab.es
1. Introduccin
La resonancia magntica nuclear (RMN) ha sido tradicionalmente reconocida como
una herramienta poderossima en el anlisis estructural y dinmico de molculas en solucin,
tanto en el campo de la qumica como en bio-molculas, especialmente en el mundo de las
protenas. Su gran versatilidad tambin se ve reflejada en otros mbitos de la RMN bien
diferentes como pueden ser, por ejemplo, el anlisis de muestras en estado slido, en estado ni
slido-ni lquido (HR-MAS), la combinacin con otras tcnicas analticas (por ejemplo,
HPLC-RMN-MS), y en aplicaciones biomdicas, que van desde la espectroscopia in-vivo
(MRS) a tcnicas de micro y mini-imagen tanto en el mundo animal como en anlisis clnico
(MRI).
En cada una de estas aproximaciones juega un papel fundamental las caractersticas
tcnicas propias de la configuracin de cada equipo (imanes, sondas, componentes
electrnicos...) de manera que la mayora de espectrmetros suelen estar especializados en
una o diversas de estas aplicaciones, pero no en todas. Adems de la importancia del
desarrollo tecnolgico, la facilidad y la versatilidad con que se puede manipular los spins para
obtener un tipo de informacin estructural determinado define cada experimento de RMN que
viene caracterizado con la llamada secuencia de pulsos. Existe una infinidad de secuencias de
pulsos para cada una de las posibles tcnicas mencionadas anteriormente que permiten la
medida de algn parmetro de RMN (desplazamientos qumicos, constantes de acoplamiento
escalares o dipolares, efectos NOE, tiempos de relajacin T1 y T2, coeficientes de difusin,
forma de lnea...) que suele estar directamente relacionado con alguna caracterstica molecular
(entorno electrnico, interaccin a travs de los enlaces, interaccin intra- o inter-molecular a
travs del espacio, aspectos dinmicos como rotaciones de enlaces, cambios
conformacionales, intercambio qumico, movimientos rotacionales o traslacionales, ...).
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Pulsos de Radiofrecuencia:
Provocan rotaciones respecto a un eje determinado (x, y, -x, -y), normalmente de 90
o 180. Cuando la fase del pulso no se especifica en el diagrama, por defecto se
supone que se aplica desde el eje x.
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Los pulsos son aplicados a una frecuencia especfica (son particulares para cada
ncleo, representados en este caso por los canales de 1H y X), con una duracin
especfica y potencia determinada (en funcin de la selectividad y del hardware
disponible).
Cada pulso va asociado a un ciclo de fases (ver ms adelante).
Ciclo de fases:
La secuencia de pulsos se suele repetir un nmero determinado de veces cambiando
las fases relativas de uno o varios pulsos (en el ejemplo representado por 1=x,-x) en
consonancia con el detector (representado por rec=0,2), de manera que la seal
deseada se va sumando y la no deseada es eliminada al final del ciclo.
Gradientes de campo magntico:
Representados en la lnea Gz con los smbolos G1, G2 y G3.
Aunque son elementos opcionales y su uso depender de si se dispone de los
accesorios correspondientes, hoy en da pueden considerarse esenciales y suelen estar
incorporados por defecto en la configuracin estndar de la sonda.
En la inmensa mayora de experimentos de RMN modernos el uso de los gradientes
ofrece diversas mejoras y su uso puede clasificarse de rutinario.
En el diseo y anlisis de las secuencias de pulsos hay diversos factores importantsimos:
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(1)
I + = I x + iI y
(2a)
I = I x iI y
(2b)
+
(3a)
(3b)
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I z
I x
I x cos (I t ) + I y sin (I t ) =
1 + iI t
( I e + I eiI t )
2
(4)
Regla 3: Los rdenes de coherencia (p) slo cambian por el efecto de los pulsos. Durante los
perodos de tiempo de evolucin libre, el valor de p no se altera. La evolucin bajo los efectos
de desplazamiento qumico slo produce modulacin sen/cos:
tI
I
z I p cos ( p t ) iI p sin ( p t )
I p
I
I
(5)
y el acoplamiento escalar (J) slo genera trminos en fase/anti-fase bajo modulacin sen/cos:
Jt 2 I S
(6a)
z z 2 I S cos ( Jt ) m iI sin ( Jt )
2 I S z
z
(6b)
Jt 2 I S
i +
(I I )
2
1 +
(I + I )
2
(7a)
(7b)
Regla 6: Cualquier pulso de 180 nicamente cambia el signo del orden de coherencia de +p a
-p.
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180( x )
I z
I z
(8a)
180( y )
(8b)
I
I
(9a)
(9b)
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12
Figura 2: Espectro terico de 1H para los diferentes istopos presentes en una seal de cido actico.
12
12
13
12
2. Un doblete (separado por el valor de JCH) debido al istopo CH3- COOH (0.55%
de intensidad cada uno), observado en experimentos de correlacin directa, como el
experimento HMQC y HSQC.
2
12
13
3. Un doblete (separado por el pequeo valor JCH) debido al istopo CH3- COOH
(0.55% de intensidad cada uno), observado en experimentos de correlacin a larga
distancia, como el experimento HMBC.
1
13
13
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12
13
13
12
Para sustraer estos dos espectros lo que se hace es invertir el receptor, de manera que la seal
de H- C se suma en los dos espectros mientras el H- C se resta, anulndose. En la prctica, la
resta de estas dos seales de H- C nunca es perfecta y, por lo tanto, imperfecciones tan solo
del 1-2% son del mismo rango que la seal que se desea detectar.
1
13
12
12
Por eso, es necesario alternativas que refuercen este proceso de sustraccin como pueden ser
un ciclo de fases ms largo y ms elaborado que minimiza dichos artefactos (por ejemplo, ver
scan 3 y scan 4), el uso de una secuencia BIRD-periodo de recuperacin que minimiza la
seal de H- C inicial, el uso de periodos de spin-lock o, como veremos posteriormente, el uso
de gradientes.
1
12
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El mtodo alternativa de
seleccin a los ciclos de fase o
espectroscopia diferencia son los
gradientes de campo magntico. Un
gradiente se define como un corto
periodo de tiempo (del orden de
milisegundos)
dnde
el
campo
magntico esttico B0 se hace
espacialmente no homogneo en una
direccin especfica, normalmente el eje
(B(z)). Despus de aplicar un gradiente
duracin , esta dependencia espacial, X
(r,), viene definida por:
(r , ) = sBg (r ) p j j
z
de
(10)
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(11)
Figura 3: Diagramas de secuencias de pulsos y efecto de los gradientes de campo magntico en la adquisicin de
la seal. Ver el texto para comentarios.
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Para evitar el efecto de la evolucin del desplazamiento qumico durante la aplicacin de los
dos gradientes, se puede introducir un pulso de 180 en medio de los dos gradientes,
formndose la conocida secuencia eco de spn con gradientes, PFGSE (fig. 3D) El pulso de
180 lo que hace es invertir el sentido de rotacin de los espines despus del gradiente G1, por
lo que luego aplicando un gradiente G2=G1 es suficiente para reenfocar la seal deseada. Esta
secuencia PFGSE es la base de una serie de experimentos muy importantes, en el que el pulso
de 180 puede ser reemplazado por cualquier elemento de inversin. La figura 4 muestra el
esquema general y el gran nmero de aplicaciones de RMN basadas en el eco de spin.
6.2. La condicin de reenfoque.
La base principal de la seleccin de coherencias mediante gradientes de campo
magntico es la llamada condicin de reenfoque:
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Figura 4: Esquema general de las secuencias de pulsos y experimentos homonucleares basados en un eco de spn
en funcin del elemento de inversin utilizado.
Slo se detectarn aquellos caminos de coherencia que sean reenfocados justo antes de
empezar la adquisicin. Aquellos caminos que hayan adquirido una fase neta diferente de
cero, sern completamente ausentes.
n
sG ( p
i =1
i i
ij
ij
)=0
(12)
Dicho de otra manera, no sern detectados todos aquellos CTCs que hayan adquirido una fase
neta diferente de cero. Si asumimos que los gradientes que intervienen en la misma secuencia
tienen la misma duracin y forma, la eq. (13) se simplifica a
n
G ( p
i =1
ij
ij
)=0
(13)
Esta expresin es fundamental a la hora de optimizar las intensidades relativas entre los
diferentes gradientes que intervienen en cualquier secuencia de pulsos. Aunque no ser
discutido aqu, es interesante desde el punto de vista experimental, que los gradientes de
desfase y reenfoque no estn muy separados en el tiempo. Esto podra provocar prdidas
debido a efectos de difusin que podran afectar a la sensibilidad del espectro resultante.
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Cmo mtodo de purga, en el cual los gradientes son situados en lugares estratgicos
dentro de la secuencia para desfasar y, por tanto, eliminar la magnetizacin no deseada
(p 0) mientras las deseadas no son afectadas porque se encuentran temporalmente en
el eje z (p=0). Esta aproximacin no afecta a la sensibilidad global del experimento y
suele ser utilizada cuando la sensibilidad debe ser maximizada, como es el caso de
aplicaciones sobre muestras de baja concentracin.
I z ( p = 0) 0
I + ( p = +1) + I
I ( p = 1) I
I1+ I 2 z ( p = +1) + I
I1+ I 2+ ( p = +2) +2 I
I1+ I 2 ( p = 0) 0
Caso heteronuclear:
I z S ( pI = 0; pS = 1) S
I + S ( pI = +1; pS = 1) + I S
I z S z ( pI = 0; pS = 0) 0
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Figura 5: Secuencia de pulsos del experimento COSY 2D con gradientes y sus CTCs correspondientes.
90( x )
90( x )
t1
I1z
I1
I1 (1t1 ) + I1 I 2 z (1t1 )
I1 (1t1 ) + I1z I 2 (1t1 )
t2
(14)
p1G1 + p2G2 = 0
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(15)
I z
I +
I + S z
I + S
90( x , S )
t2
I S z (S t1 )
I (S t1 )
I (S t1 ; I t2 )
I S (S t1 )
(16)
G ( p
i
i =1
ij ij
)=0
(17)
(18)
Una relacin entre los gradientes G1:G2:G3 de 2:2:1 selecciona dicho CTC, mientras
una relacin 2:2:-1 seleccionara el CTC marcado con lneas discontinuas (datos anti-eco:
p1,X=p2,X=-1).
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Figura 7: Secuencia de 3 pulsos de 90. La diferente optimizacin de los gradientes G1, G2 y G3 permiten la
seleccin de los diferentes CTCs esquematizados en los experimentos A, B ,C, D y E.
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(19)
Experimento A:
G1 + 2G2 G3 = 0
(20)
Relacin 1:1:3
Cmo durante G1 aplicamos un gradiente, dar un espectro en modo magnitud.
Es un experimento 2D COSY-DQF en modo magnitud. El trmino DQF viene porque
durante el gradiente G2 seleccionamos coherencias DQ (p=+2).
Experimento B:
G1 + 3G2 G3 = 0
(21)
Relacin 1:1:4
Cmo durante G1 aplicamos un gradiente, dar un espectro en modo magnitud.
Es un experimento 2D COSY-TQF en modo magnitud. El trmino TQF viene porqu
durante el gradiente G2 seleccionamos coherencias TQ (p=+3).
Experimento C:
2G2 G3 = 0
(22)
Relacin 0:1:2
Cmo durante G1 no aplicamos un gradiente, dar un espectro sensible a la fase.
Es un experimento 2D COSY-DQF sensible a la fase. El trmino DQF viene porqu
durante el gradiente G2 seleccionamos coherencias DQ (p=+2).
Experimento D:
G1 G3 = 0
(23)
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Relacin 1:0:1
Cmo durante G1 aplicamos un gradiente, dar un espectro en modo magnitud. El
valor de G2 tiene que ser 0 porque seleccionamos los dos CTC durante este gradiente
Es un experimento 2D RELAY en modo magnitud, relacionado al experimento COSY
descrito en la seccin anterior.
Experimento E:
1.
T. Parella, Magn. Reson. Chem. 36, 467 (1998). Este artculo de revisin, aunque escrito hace algunos
aos, sigue siendo totalmente vlido para la mayora de aplicaciones que se utilizan normalmente hoy
en da.
2. T. Parella, Bruker Pulse Program Catalogue (2005). Incluido dentro del software NMRGuide v4.0 /
TOPSPIN v1.3 (BRUKER). El catlogo incluye alrededor de 800 secuencias de pulsos diferentes que
engloban la mayora de experimentos 1D/2D/3D. Los experimentos se encuentran descritos en la
enciclopedia de RMN que forma parte de NMRGuide v4.0.