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Conceptos bsicos de biologa molecular, II

Dr. Eduardo A. R ODRGUEZ T ELLO


C INVESTAV-Tamaulipas

23 de mayo del 2013

Dr. Eduardo R ODRGUEZ T. (C INVESTAV)

Conceptos bsicos de biologa molecular

23 de mayo del 2013

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cidos nucleicos
Mecanismos de la gentica molecular
Transcripcin, traduccin y sntesis de protenas

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cidos nucleicos

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cidos nucleicos
Mecanismos de la gentica molecular
Transcripcin, traduccin y sntesis de protenas

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cidos nucleicos

cidos nucleicos

Los organismo vivientes contienen dos clases de cidos


nucleicos: cido ribonucleico (ARN) y cido
desoxirribonucleico (ADN)
Las molculas de ADN estn formadas por dos cadenas de
molculas ms simples llamadas hebras (strands)
Cada hebra tiene un esqueleto consistente en repeticiones de la
misma unidad bsica llama nucletido
Esta unidad est formada por una molcula de azcar llamada
20 desoxiriibosa, un grupo fosfato y una base nitrogenada

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cidos nucleicos

cidos nucleicos
La molcula de azcar contiene 5 tomos de Carbono
etiquetados 10 a 50
H
HO 50 H
40

base

O
H

H 30

20

HO

10

El enlace que crea el esqueleto est entre el Carbono 30 de un


nucletido, el grupo fosfato y el Carbono 50 del nucletido
siguiente
Por esta razn las molculas de ADN tienen una orientacin, la
cual por convencin inicia en 50 y termina en 30
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cidos nucleicos

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En cada Carbono 10 del esqueleto se encuentra enlazada una base
nitrogenada: Adenina (A), Timina (T), Citosina (C) o Guanina (G)

azucar

N
C

azucar

N
H+

Timina

C
N

azucar
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O
CH3

Guanina

C O
C

H+

N
C

H
C N

C
H

Adenina

H+
H

H+

N C

O C
Citosina
azucar

H
N
C

C
H

H
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cidos nucleicos

cidos nucleicos
Las bases A y G pertenecen a un grupo ms grande de
substancias llamadas purinas
Mientras que las bases C y T pertenecen a las pirimidinas
Aun cuando las bases y los nucletidos no son lo mismo, cuando
hablamos del tamao de una molcula de ADN podemos decir por
convencin que tiene por ejemplo 200 bases o 200 nucletidos
Las molculas de ADN en la naturaleza son muy largas, mucho
ms que las protenas
En una clula humana, puede tener cientos de millones de
nucletidos

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cidos nucleicos

cidos nucleicos
Como ya hemos mencionado las molculas de ADN se
componen de dos cadenas o hebras
Las dos hebras se enroscan sobre s mismas formando una
especie de escalera de caracol, denominada doble hlice

Esta estructura fue propuesta en 1953 por James Watson y


Francis Crick1
1

Watson JD; Crick FHC. Molecular Structure of Nucleic Acids: A Structure for Deoxyribose Nucleic Acid. Nature

171(4356):737-738 (1953)
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cidos nucleicos

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El xito de ste modelo radic en su consistencia con las


propiedades fsicas y qumicas del ADN
Watson y Crick demostraron que las dos hebras de ADN estn
enlazadas entre s porque cada base en una cadena est
apareada (enlazada) con una base de la otra cadena
La base A siempre est enlazada con la base T y la base G con C
Por esta razn decimos que A y T son bases complementarias
al igual que G y C

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cidos nucleicos

cidos nucleicos

Estos pares de bases son conocidos como pares de bases


Watson-Crick
Los pares de bases constituyen la unidad de longitud ms
utilizada para referirnos a las molculas de ADN (100kbp)

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cidos nucleicos

cidos nucleicos
Durante este curso generalmente consideraremos el ADN como
una cadena de caracteres, donde cada carcter representa una
base
Por ejemplo la doble hebra de una secuencia de ADN puede ser
representada de la siguiente forma:
50 TACTGAA 30
30 ATGACTT 50
Observemos que el extremo 30 de una hebra corresponde al 50 de
la otra
Esta propiedad se conoce como antiparalelismo de las hebras

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cidos nucleicos

cidos nucleicos

La consecuencia fundamental de esta estructura es que es


posible inferir la secuencia de una hebra dada la otra
La operacin que permite realizar esto es llamada
complementacin inversa
Por ejemplo dada la hebra s = AGACGT en la direccin cannica
se realiza lo siguiente para obtener su complemento inverso:
Se invierte s, obteniendo s0 = TGCAGA
Se remplaza cada base por su complemento s = ACGTCT

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cidos nucleicos

cidos nucleicos

Es precisamente este mecanismo que permite al ADN en una


clula la replicacin
Por lo tanto tambin permite a un organismo que inicia su vida
como una clula crecer hasta contener millones de clulas
Donde cada una de estas clulas tiene una copia de las
molculas de ADN de la clula original

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cidos nucleicos

cidos nucleicos

En organismos procariotas (bacterias y arqueas) cuyas clulas no


tienen un ncleo, el ADN se encuentra flotando libre dentro de
cada clula
En organismos eucariotas (animales, plantas, y hongos) el ADN
se encuentra dentro del ncleo y en los elementos celulares
llamados mitocondrias (animales y plantas) y plastos (slo
plantas)

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cidos nucleicos

cidos nucleicos

Las molculas de ARN son muy similares a las de ADN, con las
siguientes diferencias bsicas de composicin y estructura:
En el ARN la molcula de azcar es ribosa y no 20 desoxiriibosa
En el ARN no encontramos la base Timina (T); en vez de eso el
Uracilo (U) est presente (U-A)
El ARN no forma una doble hlice (una sola hebra lineal)

Otra diferencia es que el ADN realiza slo una funcin (codificar


informacin), mientras que como veremos puede haber diferentes
tipos de ARN en la clula, desarrollando diferentes funciones

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cidos nucleicos
Comparativa entre el ADN y el ARN

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Mecanismos de la gentica molecular

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cidos nucleicos
Mecanismos de la gentica molecular
Transcripcin, traduccin y sntesis de protenas

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Mecanismos de la gentica molecular

Mecanismos de la gentica molecular

El ADN es de gran importancia para construir cada protena o


ARN presente en un organismo, debido a que en l se encuentra
codificada la informacin necesaria para ello
A continuacin describiremos esta codificacin de informacin y
cmo una protena es construida a partir del ADN (sntesis de
protenas)
Adems, veremos cmo la informacin en el ADN (informacin
gentica) es pasada de los padres a los hijos

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Mecanismos de la gentica molecular

Mecanismos de la gentica molecular


Cada clula en un organismo tiene unas pocas molculas muy
largas de ADN llamadas cromosomas
Ms adelante daremos ms detalles acerca de los cromosomas,
por ahora nos concentraremos en estudiar la codificacin de la
informacin gentica a partir de esas largas molculas de ADN
(el ADN)
El primer punto importante que debemos conocer acerca del ADN
es que ciertas porciones continuas de ste, llamadas genes,
codifican informacin para la construccin de protenas (exn),
pero algunas otras no (intrn)
Adems a cada tipo diferente de protena en un organismo
usualmente corresponde uno y solomante uno de estos genes
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Mecanismos de la gentica molecular

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Un gen (de 41 bases), dentro de la estructura en doble hlice del
ADN que al comprimirse forma un cromosoma (derecha)
Es un gen eucariota (el procariota carece de intron)

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Mecanismos de la gentica molecular

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Por lo tanto podemos decir que un gen es una porcin de ADN
que contienen la informacin necesaria para construir una
protena o una molcula de ARN
La longitud de un gen es muy variable, pero en el caso de los
humanos un gen puede tener algo as como 10,000 bp (pares de
bases)
Tal y como vimos la clase pasada una protena es una cadena de
aminocidos
Por lo que para especificar una protena todo lo que tiene que
hacerse es enlistar cada aminocido que contiene

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Mecanismos de la gentica molecular

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Esto es precisamente lo que el ADN hace con un gen, utilizando


tripletas (codn) de nuclotidos para especificar aminocidos
La siguiente tabla enlista las correspondencias entre cada posible
tripleta y cada aminocido, y es lo que se conoce como el cdigo
gentico

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2a. base
1a. base
U

2
3
4
5

U
UUU Fenilalanina
UUC Fenilalanina
UUA Leucina
UUG Leucina
CUU Leucina
CUC Leucina
CUA Leucina
CUG4 Leucina
AUU Isoleucina
AUC Isoleucina
AUA Isoleucina
AUG5 Metionina
GUU Valina
GUC Valina
GUA Valina
GUG Valina

C
UCU Serina
UCC Serina
UCA Serina
UCG Serina
CCU Prolina
CCC Prolina
CCA Prolina
CCG Prolina
ACU Treonina
ACC Treonina
ACA Treonina
ACG Treonina
GCU Alanina
GCC Alanina
GCA Alanina
GCG Alanina

A
UAU Tirosina
UAC Tirosina
UAA Ocre Parada
UAG3 mbar Parada
CAU Histidina
CAC Histidina
CAA Glutamina
CAG Glutamina
AAU Asparagina
AAC Asparagina
AAA Lisina
AAG Lisina
GAU cido asprtico
GAC cido asprtico
GAA cido glutmico
GAG cido glutmico

En algunos microorganismos, UGA codifica como selenocistena.


En algunas bacterias el codn UAG codifica como pirrolisina.
CUG inicio para uno de los 2 productos alternativos del gen c-myc humano
AUG codifica para metionina, y adems sirve como sitio de iniciacin

G
UGU Cistena
UGC Cistena
UGA2 palo Parada
UGG Triptfano
CGU Arginina
CGC Arginina
CGA Arginina
CGG Arginina
AGU Serina
AGC Serina
AGA Arginina
AGG Arginina
GGU Glicina
GGC Glicina
GGA Glicina
GGG Glicina

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Mecanismos de la gentica molecular

Mecanismos de la gentica molecular

En total hay 64 codones que codifican para 20 aminocidos y 3


seales de parada de la traduccin
Esto hace que el cdigo sea redundante, lo que se denomina
cdigo degenerado, y que haya varios codones diferentes que
codifican para un slo aminocido.

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Mecanismos de la gentica molecular

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Aminocido

Codones

Aminocido

Ala/A

GCU, GCC, GCA, GCG

Leu/L

Arg/R

Lys/K

Asn/N
Asp/D
Cys/C
Gln/Q

CGU, CGC, CGA, CGG, AGA,


AGG
AAU, AAC
GAU, GAC
UGU, UGC
CAA, CAG

Met/M
Phe/F
Pro/P
Ser/S

Glu/E
Gly/G
His/H
Ile/I
INICIO

GAA, GAG
GGU, GGC, GGA, GGG
CAU, CAC
AUU, AUC, AUA
AUG

Thr/T
Trp/W
Tyr/Y
Val/V
PARADA

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Codones
UUA, UUG, CUU, CUC, CUA,
CUG
AAA, AAG
AUG
UUU, UUC
CCU, CCC, CCA, CCG
UCU, UCC, UCA, UCG, AGU,
AGC
ACU, ACC, ACA, ACG
UGG
UAU, UAC
GUU, GUC, GUA, GUG
UAG, UGA, UAA

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Mecanismos de la gentica molecular

Mecanismos de la gentica molecular

Un punto importante que debemos observar es que el cdigo


gentico est escrito usando las bases del ARN (A, U, C, y G) y
no las del ADN (A, T, C, y G)
Esto se debe a que las molculas del ARN son las que proveen la
liga entre el ADN y la sntesis de protenas en un proceso que
describiremos a detalle a continuacin

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Transcripcin, traduccin y sntesis de protenas

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cidos nucleicos
Mecanismos de la gentica molecular
Transcripcin, traduccin y sntesis de protenas

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Transcripcin, traduccin y sntesis de protenas

Transcripcin, traduccin y sntesis de protenas

Un mecanismo en la clula reconoce el inicio de un gen o grupo


de genes gracias a un promotor
El promotor de un gen es la seccin de ADN que controla la
iniciacin de la transcripcin del ARN como producto de ese gen
El codn AUG tambin seala el inicio de un gen
Una vez que es reconocido el inicio de un gen o grupo de genes,
se realiza una copia del gen en una molcula de ARN

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Transcripcin, traduccin y sntesis de protenas

Transcripcin, traduccin y sntesis de protenas

El ARN resultante es llamado ARN mensajero (ARNm) y tiene


exactamente la misma secuencia que una de las hebras del gen
pero substituyendo la base U por T
Este proceso es llamado transcripcin
El ARNm ser entonces usado en los ribosomas (orgnulos
celulares) para fabricar una protena

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Transcripcin, traduccin y sntesis de protenas

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Debido a que el ARN est formado por una sola hebra y no dos
como el ADN, el ARNm producido es identico en secuencia a slo
una de las hebras del gen, siendo complementario a la otra
(tomando en cuenta que T es remplazado por U)
La hebra que es similar al ARNm producido es llamada la hebra
codificante, y la otra hebra no-codificante o hebra molde
La hebra molde es aquella que realmente se transcribe, porque el
ARNm est compuesto al unir ribonucletidos complementarios a
esta hebra
Este proceso siempre construye molculas de ARNm del extremo
50 al extremo 30 , mientras que la hebra molde es leda del extremo
30 al 50
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Transcripcin, traduccin y sntesis de protenas

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Transcripcin

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Transcripcin, traduccin y sntesis de protenas

Transcripcin, traduccin y sntesis de protenas

Debemos recalcar que la hebra molde para los genes no es


siempre la misma
Por ejemplo, la hebra molde para un cierto gen A puede ser una
de las hebras, y la hebra molde para otro gen B puede ser la otra
hebra
Para un gen dado, la clula puede reconocer la hebra molde
correspondiente gracias a un promotor
Aun cuando el complemento inverso de un promotor aparece en
la otra hebra, ste no es un promotor y por lo tanto no ser
reconocido como tal

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Transcripcin, traduccin y sntesis de protenas

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Una consecuencia importante de sto es el hecho de que los


genes del mismo cromosoma tienen una orientacin con respecto
a los otros
Dados dos genes, si ellos aparecen en la misma hebra entonces
tienen la misma orientacin; de lo contrario tienen orientacin
opuesta
Finalmente los trminos hacia arriba y hacia abajo son usandos
para indicar posiciones en el ADN en referencia a la orientacin
de la hebra codificante, con el promotor estando hacia arriba de
su gen

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Transcripcin, traduccin y sntesis de protenas

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Ahora abordemos la relacin entre el ARNm y la sntesis de


protenas
Como ya mencionamos la sntesis de protenas tiene lugar dentro
de los ribosomas
Los ribosomas estn hechos de protenas y una forma de ARN
llamado ribosomal ARNr que actua como catalizador en la
sntesis de protenas

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Transcripcin, traduccin y sntesis de protenas

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Los ribosomas funcionan como una lnea de ensamble en una


fbrica la cual usa como entrada una molcula de ARNm y otra
de ARN transferente o ARNt
Las molculas de ARNt son las que en realidad implementan el
cdigo gentico en un proceso llamado traduccin
stas hacen la conexin entre un codn y el aminocido
especfico que codifica

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Transcripcin, traduccin y sntesis de protenas

Transcripcin, traduccin y sntesis de protenas

Cada molcula de ARNt tiene, por un lado, una configuracin que


tiene alta afinidad por un codn especfico y, por otro lado, una
configuracin que se acopla facilemente al aminocido especfico
A medida que el ARNm pasa a travs del interior del ribosoma, un
ARNt correspondiente al codn actual (en el interior del ribosoma)
se acopla a ste creando el aminocido correspondiente

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Transcripcin, traduccin y sntesis de protenas

Transcripcin, traduccin y sntesis de protenas

La posicin 3D de todas estas molculas en ese momento es tal


que, a medida que el ARNt se acopla a su codn, su aminocido
adjuntado cae en el lugar justo despus del aminocido previo de
la cadena de protenica que est formandose
Una enzima adecuada entonces cataliza la adicin del
aminocido actual, liberandolo del ARNt
Las protenas son construdas residuo por residuo de esta manera
Cuando un codn de parada aparece, ningn ARNt se asocia con
l, por lo que la sntesis se detiene

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Transcripcin, traduccin y sntesis de protenas

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El ARNm es liberado y degradado por mecanismos de la clula


en ribonucletidos, los cuales sern despus reciclados para
hacer otras molculas de ARN
Uno pensara que existen igual nmero de ARNt que de codones,
pero no es el caso
El nmero de ARNt varia entre especies
La siguiente figura resume el proceso que acabamos de describir

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Transcripcin, traduccin y sntesis de protenas

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Dogma central de la biologa molecular


Replicacion

Transcripcion
ADN

Traduccion
ARN

Protena

Transcripcion inversa

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Transcripcin, traduccin y sntesis de protenas

Transcripcin, traduccin y sntesis de protenas

El dogma central de la biologa molecular es un concepto que


ilustra los mecanismos de transmisin y expresin de la herencia
gentica tras el descubrimiento de la codificacin de sta en la
doble hlice del ADN
Propone que existe una unidireccionalidad en la expresin de la
informacin contenida en los genes de una clula, es decir, que el
ADN es transcrito a ARN mensajero y que ste es traducido a
protena, elemento que finalmente realiza la accin celular

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Transcripcin, traduccin y sntesis de protenas

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El dogma tambin postula que slo el ADN puede replicarse y,


por tanto, reproducirse y transmitir la informacin gentica a la
descendencia
Fue propuesto por Francis Crick en 19706

Crick, F. (1970): Central Dogma of Molecular Biology. Nature 227, 561-563.

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