DE LOS NUCLEOS ATOMICOS

A LAS PROTEINAS

2013

ALUMNOS:

DOCENTES:

CURSO:

Biologa celular y molecular.

CICLO:

VI.r

INTRODUCCION
12/09/2013

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PROTEINAS 3

Las leyes que gobiernan los fenmenos fsicos no dependen del

lugar ni de la direccin a la que se refieren. Todo ello tambin es aplicable a las
partculas (electrones, tomos, fotones, etctera).

A la homogeneidad y la isotropa del espacio fsico se debe que los electrones en

rbita alrededor del ncleo atmico se muevan de tal forma, que el producto de su
momento por su distancia al centro del tomo, momento angular, sea proporcional
a un nmero natural (0, 1, 2...). En el lenguaje de la mecnica cuntica se dice que
los electrones tienen en el tomo un momento angular definido, cuantizado.

De hecho, en este sistema la accin de todos los nucleones sobre uno de ellos
forma una suerte de "jaula" esfrica (campo medio), tal como quiere la isotropa
del espacio, donde los nucleones describen rbitas con momento angular (0, 1,
2). Pero de vez en cuando, a causa del efecto de la polarizacin de los
nucleones que se mueven con trayectorias con un momento angular elevado
(orbitales calientes), el campo medio se deforma, por un fenmeno que se puede
provechosamente asimilar al movimiento de las mareas por efecto del campo
gravitatorio de la Luna.

El sistema empieza a girar en su conjunto, haciendo que el sistema sea istropo.

En la frecuencia ms baja permitida, promediando entre las diversas
orientaciones, se produce un sistema dinmico de simetra esfrica y dotada de un
momento angular nulo que constituye el estado fundamental, o de energa mnima.
Junto con los estados de momento angular ms elevado, correspondientes a
frecuencias de rotacin cuantizadas, el estado fundamental forma una banda
rotacional.

La existencia de un campo medio que controla el movimiento independiente de

las partculas y que, al deformarse, origina familias de estados rotacionales
relacionados, con la misma estructura espacial estabilizada por los orbitales
calientes del sistema, constituye la sntesis de la investigacin sobre sistemas
cunticos finitos de muchos cuerpos en general y sobre el ncleo atmico en
particular.
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TOMO:

El tomo es un constituyente de materia ordinaria, con propiedades qumicas bien

definidas, formado a su vez por constituyentes ms elemental sin propiedades
qumicas bien definidas. Cada elemento qumico est formado por tomos del
mismo tipo (con la misma estructura electrnica bsica), y que no es posible dividir
mediante procesos qumicos.

Actualmente se conoce que el tomo est compuesto por un ncleo atmico, en el

que se concentra casi toda su masa, rodeado de una nube de electrones. Esto fue
descubierto a principios del siglo XX, ya que durante el siglo XIX se haba pensado
que los tomos eran indivisibles, de ah su nombre a-tom- 'sin partes'. Poco
despus se descubri que tambin el ncleo est formado por partes, como los
protones, con carga positiva, y neutrones, elctricamente neutros. Los electrones,
cargados negativamente, permanecen ligados a este mediante la fuerza
electromagntica.

PROTENAS:
La palabra protena proviene del griego protop (lo primero, lo principal, lo ms
importante). Las protenas son las responsables de la formacin y reparacin de
los tejidos, interviniendo en el desarrollo corporal e intelectual.

Las protenas son biopolmeros (macromolculas orgnicas), de elevado peso

molecular, constituidas bsicamente por carbono (C), hidrgeno (H), oxgeno (O) y
nitrgeno (N); aunque pueden contener tambin azufre (S) y fsforo (P) y, en
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menor proporcin, hierro (Fe), cobre (Cu), magnesio (Mg), yodo (Y), entre otros
elementos.

Estos elementos qumicos se agrupan para formar unidades estructurales

(monmeros) llamados aminocidos (aa), a los cuales se consideran como los
"ladrillos de los edificios moleculares proteicos". Estos edificios macromoleculares
se construyen y desmoronan con gran facilidad dentro de las clulas, y a ello debe
precisamente la materia viva su capacidad de crecimiento, reparacin y
regulacin.

La unin de un bajo nmero de aminocidos da lugar a un pptido; si el nmero

de (aa) que forma la molcula no es mayor de 10, se denomina oligopptido; si es
superior a 10, se llama polipptido y si el nmero es superior a 50 aa, se habla ya
de protena.

Se clasifican, de forma general, en Holoprotenas y Heteroprotenas segn estn

formadas, respectivamente, slo por aminocidos o bien por aminocidos ms
otras molculas o elementos adicionales no aminoacdicos.

Funciones y ejemplos de protenas

Las protenas determinan la forma y la estructura de las clulas y dirigen casi

todos los procesos vitales. Las funciones de las protenas son especficas de cada
una de ellas y permiten a las clulas mantener su integridad, defenderse de
agentes externos, reparar daos, controlar y regular funciones, etc.

Todas las protenas realizan su funcin de la misma manera: por unin selectiva a
molculas. Las protenas estructurales se agregan a otras molculas de la misma
protena para originar una estructura mayor. Sin embargo, otras protenas se unen
a molculas distintas: los anticuerpos, a los antgenos especficos; la hemoglobina,
al oxgeno; las enzimas, a sus sustratos; los reguladores de la expresin gentica,
al ADN; las hormonas, a sus receptores especficos; etc.
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A continuacin se exponen algunos ejemplos de protenas y las funciones que
desempean:

1. Funcin estructural

Algunas protenas constituyen estructuras celulares.

Ciertas glucoprotenas forman parte de las membranas celulares y actan
como receptores o facilitan el transporte de sustancias.
Las histonas, forman parte de los cromosomas que regulan la expresin de
los genes.
Otras protenas confieren elasticidad y resistencia a rganos y tejidos:
El colgeno del tejido conjuntivo fibroso.
La elastina del tejido conjuntivo elstico.
La queratina de la epidermis.
Las araas y los gusanos de seda segregan fibroina para fabricar las telas
de araa y los capullos de seda, respectivamente.

2. Funcin enzimtica

Las protenas con funcin enzimtica son las ms numerosas y

especializadas.
Actan como biocatalizadores de las reacciones qumicas del metabolismo
celular.

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3. Funcin hormonal

Algunas hormonas son de naturaleza proteica, como la insulina y el glucagn (que

regulan los niveles de glucosa en sangre), o las hormonas segregadas por la
hipfisis, como la del crecimiento o la adrenocorticotrpica (que regula la sntesis
de corticosteroides) o la calcitonina (que regula el metabolismo del calcio).

4. Funcin reguladora
Algunas protenas regulan la expresin de ciertos genes y otras regulan la divisin
celular (como la ciclina).
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5. Funcin homeosttica

Algunas mantienen el equilibrio osmtico y actan junto con otros sistemas

amortiguadores para mantener constante el pH del medio interno.

6. Funcin defensiva

Las inmunoglobulinas actan como anticuerpos frente a posibles antgenos.

La trombina y el fibringeno contribuyen a la formacin de cogulos
sanguneos para evitar hemorragias.
Las mucinas tienen efecto germicida y protegen a las mucosas.
Algunas toxinas bacterianas, como la del botulismo, o venenos de
serpientes, son protenas fabricadas con funciones defensivas.

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7. Funcin de transporte:

La hemoglobina transporta oxgeno en la sangre de los vertebrados.

La hemocianina transporta oxgeno en la sangre de los invertebrados.
La mioglobina transporta oxgeno en los msculos.
Las lipoprotenas transportan lpidos por la sangre.
Los citocromos transportan electrones

8. Funcin contrctil:

La actina y la miosina constituyen las miofibrillas responsables de la contraccin

muscular.
La dineina est relacionada con el movimiento de cilios y flagelos

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9. Funcin de reserva:

La ovoalbmina de la clara de huevo, la gliadina del grano de trigo y la hordena

de la cebada, constituyen la reserva de aminocidos para el desarrollo del
embrin.
La lactoalbmina de la leche.

ESTRUCTURA DE LAS PROTENAS

1. Estructura primaria:
Las protenas son polmeros lineales formados por la unin de un grupo carboxilo de un aminocido al grupo amino de otro aminocido por medio de un
enlace peptdico, la formacin de un dipptido a partir de dos aminocidos va
acompaada de la perdida de una molcula de agua, por lo que la biosntesis de
enlaces peptdicos necesita de un aporte de energa libre, una serie de
aminocidos unidos por enlaces peptdicos forman una cadena polipeptdica y
cada una de las unidades que la conforman se denomina residuo.
Por convencin se considera que el extremo amino terminal es el comienzo de la
cadena polipeptdica, por ello la secuencia de aminocidos de una cadena
polipeptdicas se escribe comenzando con el residuo amino terminal. El esqueleto
polipeptdico tiene gran capacidad de formar puentes de hidrogeno ya que cada
residuo tiene un grupo carbonilo que es un buen aceptor de puentes de hidrogeno.

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2. Estructura secundaria:
La estructura secundaria es la disposicin de la secuencia de aminocidos en el
espacio. Los aminocidos, a medida que van siendo enlazados durante la sntesis
de protenas y gracias a la capacidad de giro de sus enlaces, adquieren una
disposicin espacial estable, la estructura secundaria.
Existen dos tipos de estructura secundaria:
a) La hlice :
Este tipo de estructura secundaria se mantiene por uniones por puentes de
hidrogeno (enlace que se establece entre dos tomos electronegativos) en la
cadena polipeptdica en hidrogeno que se halla unido al nitrgeno de un residuo
amino se ve atrado por el oxigeno de un grupo carbonilo. En la hlice, los grupos
=CO pueden formar este tipo de enlaces con el grupo =NH de un residuo
aminoacdico que se halla 4 lugares ms adelante en la cadena, luego de que esta
haya dado una vuelta completa y ambos grupos hayan quedado vecinos, el
puente se forma gracias a que dichos grupos quedan en posicin trans.

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b) Lmina :
Son estructuras laminares que presentan un plegamiento en zigzag, se forman por
el apareamiento de cadenas, establecindose para ellos puentes de hidrogeno
entre grupos =NH de una cadena con grupos =CO de otra. Si las cadenas
apareadas tienen el mismo sentido (N-terminal- C-terminal) se denominan
paralelas y si no se les llama antiparalela. En algunos casos una cadena puede
hacer un giro y envolverse sobre si misma formando una horquilla, en este caso el
apareamiento es antiparalelo.

3. Estructura terciaria:
El plegamiento de la cadena principal de las protenas es complejo y asimtrico,
de acuerdo con su forma final, las protenas pueden ser fibrosas o globulares.
En las protenas fibrosas toda la molcula puede disponerse en una hlice o en
una lmina plegada.
En cambio en las protenas globulares adems de adoptar estructuras en hlice o
lmina plegada, se necesitan segmentos al azar para poder alcanzar los
plegamientos necesarios para la conformacin esferoidal.
La disposicin tridimensional finalmente adoptada por una protena se mantiene
gracias a uniones e interacciones de las cadenas laterales de residuos
aminoacdicos del polipptido, las fuerzas que se encargan de mantener la
estructura terciaria son de distintos tipos:
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Fuerzas de atraccin o repulsin electrosttica, los grupos que presentan
cargas opuestas se pueden enfrentar formando enlaces inicos de tipo
salino, estos pueden mantener cerca zonas lejanas de la cadena.
Los puentes de hidrgeno
Las cadenas hidrofbicas o hidroflicas: En un entrono acuoso, el
plegamiento de las protenas est dirigido por la tendencia de los residuos
hidrofbicos a ser excluidos del agua; la cadena se pliega por tanto para
que sus cadenas hidrofbicas laterales estn en el interior y sus cadenas
polares cargadas estn en la superficie. Cuando cadenas apolares se
encuentran prximas se generan, entre sus grupos, fuerzas de atraccin
llamadas de van der Waals.
Puentes disulfuro: este tipo de enlace fija muy cercanamente dos zonas a
veces muy alejadas en la secuencia.

4. Estructura cuaternaria:

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Esta estructura se refiere al ordenamiento espacial de las subunidades
polipeptdicas y la naturaleza de sus interacciones.
Las fuerzas responsables de mantener en posicin a las diferentes subunidades
son puentes de hidrgenos, atracciones electrostticas, interacciones hidrofbicas
puentes disulfuro entre cistenas, etc.
La forma ms simple de estructura cuaternaria es un dmero, que consta de dos
subunidades idnticas, aunque tambin son comunes estructuras ms
complicadas con ms de un tipo de subunidades y a proporciones variables.

DESNATURALIZACIN DE UNA PROTENA

La desnaturalizacin de las protenas se produce a causa de diversos factores,
entre ellos la polaridad del disolvente, el pH del medio o condiciones extremas de
temperatura, que pueden provocar que las protenas pierdan su estructura original
llamada tambin estructura nativa, lo cual incide en el cambio de las propiedades
fisicoqumicas y en su optimo funcionamiento.
La desnaturalizacin, en la estructura primaria, interrumpe la secuencia de
aminocidos, mientras que en caso de la estructura secundaria provoca que la
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protena pierda todos los patrones de repeticin regulares que dan lugar a la
forma - hlice y se genera formas aleatorias.
Cuando la desnaturalizacin afecta a una protena con estructura terciaria se
interrumpen los enlaces covalentes entre las cadenas de aminocidos, los enlaces
dipolo-dipolo entre cadenas laterales polares de aminocidos y los dipolo
inducidos entre cadenas laterales no polares de aminocidos.

En la estructura cuaternaria, la desnaturalizacin provoca que las subunidades

de protenas se separen o que se altere su posicin espacial.
Las protenas se desnaturalizan cuando pierden su estructura tridimensional
(conformacin espacial) y as el caracterstico plegamiento de su estructura.
Las protenas son filamentos largos de aminocidos unidos en una secuencia
especfica. Son creadas por los ribosomas que "leen" codones de los genes y
ensamblan la combinacin requerida de aminocidos por la instruccin gentica,
en un proceso conocido como transcripcin gentica. Las protenas recin creadas
experimentan una modificacin posmodificacin en la que se agregan tomos o
molculas adicionales, como el cobre, zinc e hierro. Una vez que finaliza este
proceso, la protena comienza a plegarse sin alterar su secuencia
(espontneamente, y a veces con asistencia de enzimas) de forma tal que los
residuos hidrfobos de la protena quedan encerrados dentro de su estructura y
los elementos hidrfilos quedan expuestos al exterior. La forma final de la protena
determina cmo interaccionar con el entorno.
Si la forma de la protena es alterada por algn factor externo (por ejemplo,
aplicndole calor, cidos o lcalis), no es capaz de cumplir su funcin celular. ste
es el proceso llamado desnaturalizacin.
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Cmo la desnaturalizacin afecta a los distintos niveles?
En la desnaturalizacin de la estructura cuaternaria, las subunidades de protenas
se separan o su posicin espacial se corrompe.
La desnaturalizacin de la estructura terciaria implica la interrupcin de:
Enlaces covalentes entre las cadenas laterales de los aminocidos (como los
puentes disulfuros entre las Cistenas).
Enlaces no covalentes dipolo-dipolo entre cadenas laterales polares de
aminocidos.
Enlaces dipolo inducidos por fuerzas de Van Der Waals entre cadenas laterales no
polares de aminocidos.
En la desnaturalizacin de la estructura secundaria las protenas pierden todos los
patrones de repeticin regulares como las hlices alfa y adoptan formas aleatorias.
La estructura primaria, la secuencia de aminocidos ligados por enlaces
peptdicos, no es interrumpida por la desnaturalizacin.
Prdida de funcin
La mayora de las protenas pierden su funcin biolgica cuando estn
desnaturalizadas, por ejemplo, las enzimas pierden su actividad cataltica, porque
los sustratos no pueden unirse ms al centro activo, y porque los residuos del
aminocido implicados en la estabilizacin de los sustratos no estn posicionados
para hacerlo.

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PLEGAMIENTO DE LAS PROTENAS

La secuenciacin del genoma humano, encontrara significado cuando se puedan
convertir las secuencias genticas y estructuras de protenas.
En este desarrollo se pueden acotar fases y niveles sucesivos: el plegamiento de
las secuencias polipeptidicas para formar estructuras globulares dotadas de
propiedades asociativas y esteroespesificas; las interacciones asociativas entre
protenas o entre protenas y otros constituyentes para la formacin de orgnulos
celulares ; la interaccin entre clulas para constituir tejidos y rganos; la
coordinacin y la diferenciacin ; de las actividades qumicas mediante
interacciones de tipo alosterico , en las que una enzima cambia de conformacin
en respuesta a la interaccin con una pequea molcula (efector).
El secreto de la vida debe buscarse a nivel de organizacin qumica, en particular
en la relacin existente entre la estructura lineal unidimensional desnaturalizada
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(D) de la protena y la estructura nativa tridimensional 8N) biolgicamente activa,
en la que la secuencia lineal una vez fabricada en el ribosoma se pliega en un
tiempo comprendido entre el micro segundo y el segundo
El conocimiento de los mecanismos en que se basa el plegamiento permitira
predecir la estructura nativa de una protena a partir de la secuencia de sus veinte
tipos de aminocidos.
Existe una solucin que se basa en el plegamiento inverso de la protena, es decir
dada una estructura nativa se puede averiguar la secuencia lineal de los
aminocidos que la componen.
En este modelo cada aminocido est representado por una esfera limitada en su
movimiento a uno de los vrtices en el retculo en interaccin con los aminocidos
ms prximos. La solucin al problema inverso del plegamiento es fcil: la
secuencia de aminocidos que se repliega en una estructura nativa dada es la
secuencia que en esta estructura alcanza el valor mnimo de energa. En esta
condicin se puede formular de forma menos restrictiva, precisando que la
secuencia encuentre en la estructura nativa un valor de energa suficientemente
pequeo, esto es , menor que la energa mnima Ec asociada al conjunto de
conformaciones tridimensionales compactas que sean estructuralmente distintas
de la nativa.

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LECCIONES DEL PROBLEMA INVERSO
El principal resultado experimental a propsito del plegamiento de las protenas
mono globulares radica en el carcter sbito, del todo o nada de la transicin
entre el estado desnaturalizado y el nativo, fenmeno anlogo al observado en las
transiciones de fase de diversos sistemas fsicos.
En el proceso de plegamiento este carcter parece sorprendente, por cuanto las
protenas son sistemas muy poco homogneos, estructuralmente mas asimilables
a un solido desordenado que a un cristal.
La inhomogeneidad una propiedad esencial de los sistemas finitos, se halla
presente tambin en el ncleo atmico, donde los orbitales se caracterizan por
valores de momento angular muy distintos entre s.
Para entender las propiedades de las protenas diseadas segn el modelo del
plegamiento inverso, hay que empezar por identificar los sitios calientes. A este fin
se introducen mutaciones en cada sitio sustituyendo el aminocido de la
secuencia de baja energa por uno de los otros 19 aminocidos y se estudia el
comportamiento dinmico de la protena.

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Si la mutacin impide la transicin del estado desnaturalizado al nativo, un
fenmeno que se ha observado en alrededor de 8 % de los casos, la mutacin se
a producido en un sitio caliente, en general bien protegido y ocupado por
aminocidos apolares ( hidrfobos) .
Por el contrario si la secuencia resultante de la insercin de una mutacin se
pliega sobre la propia estructura nativa empleada para disear la protena, algo
que sucede en un 92 por ciento de los casos, la mutacin (denominada neutra) ha
ocurrido en un sitio templado o frio.
Distintas secuencias, por tanto, pueden corresponder a la misma estructura nativa.
En particular, mutaciones nicas y mltiples de composicin constante
(intercambio de aminocidos) en la secuencia S36 dan lugar a 1030 secuencias
que se repliegan en la misma estructura nativa de S36; esta familia de secuencias
es el equivalente, en el ncleo atmico, al conjunto de estados que forman una
banda rotacional.
En otras palabras, un ncleo atmico encuentra un estado de energa mnima
colocando sus nucleones en orbitales que corresponden no a un momento angular
definido, sino a una combinacin lineal de momentos angulares (rotura
espontnea de la simetra de rotacin). De la misma manera, una protena
disminuye su energa al instalar en cada sitio de su estructura nativa, no un
aminocido definido, sino una combinacin lineal de aminocidos (rotura
espontnea de la conservacin del contenido de los aminocidos).
La recuperacin de estas simetras, como exige la mecnica cuntica, engendra
bandas rotacionales y familias de protenas con la misma estructura intrnseca y
nativa, respectivamente.
La estabilidad de la protena, en definitiva, viene determinada por los aminocidos
presentes en los sitios calientes, comunes a las 1030 secuencias (aminocidos
conservados).
Pero no slo por ellos: los sitios calientes determinan tambin la jerarqua de los
contactos que se establecen en el proceso de plegamiento de la protena. De
hecho, siguiendo la evolucin de una secuencia de aminocidos diseada, de la
configuracin lineal desnaturalizada a la estructura nativa, se observa una
sucesin de pasos perfectamente determinada.

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En primer Lugar se asiste a la formacin, casi instantnea, de estructuras locales
elementales, estabilizadas por la Interaccin entre aminocidos calientes.
A continuacin, se verifica la formacin del ncleo de plegamiento pos crtico,
resultante del engarce de las estructuras locales, que contiene el mnimo nmero
de contactos nativos que aseguran el plegamiento.
Por ltimo, en un lapso brevsimo tras la formacin del ncleo de plegamiento,
aparece la relajacin de los aminocidos restantes en la estructura nativa que da
lugar a un solo sistema de energa menor que Ec.

ROTURA ESPONTANEA DE LA SIMETRIA de una protena, esto es, del

contenido de aminocidos de cada sitio. La distribucin gaussiana en cada sitio
representa las distintas proyecciones (20) del contenido de aminocidos, una
magnitud que puede considerarse un "cuasl-espn, en analoga con el espin de
los nucleones. El sistema alinea estos cuasi-espines, con la minimizacin
consiguiente de la energa del sistema y la rotura espontnea de la simetra.
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MECANO MOLECULAR O PLEGAMIENTO DE LAS PROTENAS.
No est controlado por cada aminocido, lo controlan las estructuras locales
elementales que funcionan como diminutas piezas de un mecano molecular. Si se
combinan correctamente, originan el ncleo de plegamiento y por tanto, el mnimo
numero de contactos nativos que aseguran el plegamiento llevando al sistema del
estado desnaturalizado a una estructura que se encuentra ms all de la barra
energtica que los separa del estado nativo.

Se trata de una regin donde, desde el punto de vista energtico, todos los pasos
posteriores son cuesta abajo. La analoga utilizada explica tambin el mecanismo
de plegamiento de los dmeros incluso la agregacin de protenas en placas
amieloides, el fenmeno observado en los que parecen la enfermedad del
alzheimer o la de creutzfeldt- Jakob. En este caso y siguiendo con la analoga, la
piezas de una protena se unen fuertemente a las de otra y dan lugar a un sistema
tan estable, que no puede plegarse y ponen las bases para la formacin de un
deposito amieloide.
Las protenas tau
Son protenas microtubulares que abundan en las neuronas, siendo mucho menos
frecuentes fuera del sistema nervioso central. Su principal funcin es la
estabilizacin de los microtbulos axonales a travs de la interaccin con
la tubulina.
Sin embargo, cuando la cinesina se adhiere a las tiras de la protena tau, el motor
tiende a desprenderse completamente del microtbulo. De esta forma, la protena
tau ayuda a regular el equilibrio del trfico de clulas nerviosas, lo que puede
explicar que las alteraciones de tau se asocien con las patologas
neurodegenerativas.
La modulacin diferencial de la motilidad de la dinena y de la cinesina sugieren
que las protenas asociadas al microtbulo pueden regular espacialmente el
equilibrio del transporte axonal dependiente del microtbulo. Dixit ha indicado que
el objetivo de estudio ha sido analizar cmo la protena tau controla el balance del
transporte neuronal.
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Las tau fueron descubiertas en 1975 en la Universidad de Princeton en el
laboratorio de Marc Kirschner.

La enfermedad de Alzheimer afecta a dos protenas, llamadas beta amiloide y tau,

que cooperan para obstruir las funciones del cerebro y afectar a las
funciones cognitivas.
En la enfermedad de Alzheimer se observan al microscopio unas placas y ovillos
neurofibrilares en los axones formados por pptidos beta amiloides y protenas
tau.
El pptido beta amiloide provoca una especie de atasco en el trfico axonal en las
neuronas enfermas y Vossel y sus colegas han estudiado gracias a tcnicas de
imagen in vivo con un microscopio de fluorescencia cmo actan las protenas tau
(que se acoplan a los microtbulos celulares) para facilitar el trfico axonal de
mitocondrias (orgnulos celulares con genoma propio encargados de suministrar
la mayor parte de la energa necesaria para la actividad celular) y de otras
substancias.

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El mecanismo de plegamiento de las protenas explicado trasciende incluso viejas
cuestiones relacionadas con las protenas. De entrada la paradoja de levinthal,
segn la cual el nmero de las posibles conformaciones de una cadena polimrica
de 100 aminocidos supera la edad del universo expresada en segundos. Parece
evidente que, en la naturaleza, para alcanzar su estructura nativa una cadena
polipeptdica no pasa por todas las posibilidades de configuracin; teniendo
encuenta un lapso de tiempo mnimo para pasar de una a otra, el tiempo
empleado seria mucho mayor del que realmente se observa. De la misma manera
parase superfluas las consideraciones sobre la importancia relativa de los
contactos nativos locales y no locales; si reviste mayor inters el criterio de
replegabilidad (muchas secuencias que se repliegan en la misma estructura
tridimensional en un tiempo corto). Y el de diseo (muchas secuencias que tienen
como estado ms bajo de energa aquel en que la secuencia se repliega en la
estructura nativa)

La simplicidad y la economa con las que el modelo de los sitios calientes y de las
estructuras locales explique el plegamiento de las protenas han permitido
desarrollar un protocolo para resolver el problema del plegamiento en un retculo.
Para su aplicacin es preciso conocer adems de la secuencia de aminocidos, su
interaccin. El protocolo se estructura en tres puntos:

1.- determinacin de las posibles estructuras locales elementales con un nmero

limitado de aminocidos de un 10 a un 20 % respecto al nmero de monmeros
de la protena;
2.- determinacin de los posibles ncleos de plegamiento con energa de unin
elevada juntando dos o ms estructuras locales elementales.
3.- relajamiento de los restantes aminocidos.
Entre las estructuras resultantes la nica con energa menor que EC es la
estructura nativa.
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La aplicacin de esta estrategia a todos los ejemplos de cadenas de aminocidos

proyectados ha producido sin excepcin, el resultado correcto. Cabe sealas que
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esta es la primera solucin del problema del plegamiento de las protenas en un
retculo. A un mas el protocolo empleado est particularmente adaptado para su
generalizacin al caso de las protenas reales. Para ello es necesario calcular ab
initio la interaccin entre los escasos aminocidos calientes en presencia de la
solvente (agua). El empeo no es fcil, pero se ha identificado una va de llevarlo
a buen puerto gracias a la experiencia acumulada en el clculo de los principios
primeros de las propiedades de las agregaciones moleculares y en particular de
los fullerenos.

BIBLIOGRAFIA:
1. WHAT IS LIFE? Erwin schrodinger. Cambridge University Press;
Cambridge, 1944.
2. NUCLEAR STRUCTURE, vol II A. Bohr. B. R. Mottelson. Benjamin.
Nueva York, 1975.

UNIVERSIDAD NACIONAL DE TRUJILLO | BIOLOGIA CELULAR Y MOLECULAR

DE LOS NUCLEOS ATOMICOS A LAS 201

PROTEINAS 3
3. STRUCURE AND MECHANISM IN PROTEIN SCIENCE. A. Fersht. W. H.
And Co., Nueva York, 1999.

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