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conjunto de genes que definen pero podra albergar un gen de virulencia diferente,
por la presente se refiere como "gen de virulencia complementaria". Todos los
aislamientos de E. coli fueron sometidos a varios ensayos de PCR para identificar
los genes diciembre definitorias y los genes de virulencia complementarias (SVG).
Para todos los ensayos de PCR, lisados bacterianos se prepararon resuspendiendo
una sola colonia en 1 ml de agua desionizada (MilliQ) en un tubo de polipropileno,
seguido por ebullicin durante 1 min. Dos ensayos de PCR mltiplex descritos
anteriormente se utilizaron para la identificacin de genes que definen DEC-(Tabla
1). PCR 2 tambin identifica dos de los SVG, AAP y los genes que codifican para la
AATA Dispersando y su translocador Aat, anteriormente conocido como sonda de
AA, respectivamente [38]. Cepas STEC se caracterizaron adicionalmente para la
expresin del gen del antgeno lipopolisacrido O157 y enterohemolisina (hlyA)
utilizando un kit de aglutinacin de partculas de ltex (Oxoid Limited, Basingstoke,
Reino Unido), y PCR, respectivamente.
Desarrollo de un ensayo de PCR para la identificacin de cuatro genes de la toxina
de E. coli
Hemos desarrollado un tercer multiplex PCR para identificar otros cuatro E. coli SVG
utilizando cebadores descritos anteriormente para Asta, cdt, mascotas y SubAB que
codifican toxinas EAST1, CDT, mascotas y subtilasa, respectivamente. Para fines
de normalizacin, se utiliz ADN de cepas de referencia CEEA 042 (ASTA,
mascota) y EPEC O86: H34 (CDT). Tambin utilizamos el ADN de 98NK2 cepa
(SubAB), proporcionada por el Dr. Pablo Okhuysen (Universidad de Texas,
Houston). Los mejores resultados se obtuvieron utilizando una mezcla de cebadores
en las siguientes concentraciones: 16 pmol de cebadores Asta, 6 pmol para
mascotas, 10 pmol de SubAB y 5 pmol tanto Cdt1 y Cdt2 conjunto de cebadores.
En resumen, cada tubo de PCR contena 21 l de mezcla de reaccin de las
siguientes concentraciones: 2 mM Tris-HCl (pH 8,0), 10 MEDTA, 100 MDTT, 50%
(vol / vol) de glicerol, MgCl2 1,6 mm, 0.75U / 25 l Ampli Taq polimerasa (Invitrogen)
y 200 Meach dATP, dCTP, dGTP y dTTP (Invitrogen); 2 l de la mezcla de cebador
y 2 l de lisado bacteriano. Los tubos de PCR se sometieron a continuacin a las
siguientes condiciones de ciclo: 95 C (1 min, 1 ciclo); 95 C, 62 C (1 min a cada
temperatura) y 72 C, 1 min 20 s todo durante 35 ciclos; y una etapa de extensin
final (10 min, 72 C) en un termociclador (Bio-Rad). 5l de productos de PCR se
visualizaron despus de la electroforesis en un gel de agarosa 3% en tampn de
etidio y tincin con bromuro de Trisacetate- EDTA. Slo la presencia de la del
tamao correcto producto (s) de genes se interpret como una prueba positiva. Fig.
1 ilustra los tamaos de amplificacin de productos de PCR para todos los loci 4
utilizando una mezcla de control de ADN que contena 1,5 l de lisado bacteriano de
042 y O86: H34 cepas, adems de 0,5 l de ADN subtilasa en una concentracin
final de 0,212 g / l.
El Anlisis Estadstico
Los grupos se compararon mediante la prueba de chi-cuadrado de dos colas.
Cuando el anlisis se vio limitado por los valores bajos esperados, se emple la
prueba exacta de Fisher. Odds ratio (OR) y los intervalos de confianza del 95% (IC)
para la probabilidad de co-deteccin se calcularon utilizando el software GraphPad
PRISM1version 5.0b.
RESULTADOS
La Prevalencia De Enteropatgenos Bacterianos Y Grupos DEC
Un total de 831 nios menores de cinco aos de edad fueron reclutados entre enero
de 2007 a enero de 2009 y desde enero de 2010 a diciembre de 2011. Uno o ms
enteropatgenos bacterianos fueron identificados en 463 (56%) nios; Dec el grupo
ms prevalente bacteriana (28%), seguido por Salmonella spp (12%), mientras que
los no-O1 Vibrio cholerae (2%) era el menos prevalente (Fig. 2A). De los 232 nios
con diciembre, estaban coinfectados 61 con otras bacterias patgenas (Salmonella,
27; Shigella, Campylobacter; 24, 6; Vibrio, 4).
La distribucin de los grupos DEC aisladas a partir de 232 nios se muestra en la
Fig. 2B; una gran proporcin de estos DAEC albergado (35%) y los grupos de la
CEEA (24%), mientras que los grupos EIEC y STEC eran raros. Ninguna de las
cepas STEC O157 eran. La mayora de los nios tenan infecciones simples DEC
(infecciones en las que slo un grupo dec aislado de heces del paciente).
El diez por ciento de los pacientes haba mezclado infecciones DEC (ms de un
grupo DEC el mismo paciente). De los 23 nios con infecciones mixtas, seis
albergaba DAEC + cepas CEEA, cinco DAEC + ETEC, cinco + ETEC CEEA y tres
DAEC + aEPEC. Adems, se identificaron CEEA + aEPEC, ETEC + aEPEC y ETEC
+ tepec cepas en un paciente cada uno, y un nio estaba infectado con tres cepas
diferentes (DEC DAEC + CEEA + ETEC). Otros tres nios (1%) tenan infecciones
hbridos causadas por cepas de E. coli que llevan genes que definen por ms de un
diciembre; dos pacientes llevaban una cepa DAEC-CEEA y un nio llevaron a una
cepa aEPEC-ETEC.
En la mayora de los pacientes con infecciones simples DEC, al menos tres de las
cinco cepas de E. coli recogidos por paciente fueron positivos para los genes
diciembre definitorias. Esto se observ en el 67%, 64%, 62,5%, 62% y 59% de los
pacientes positivos para tepec, DAEC, CEEA, aEPEC y ETEC, respectivamente.
Distribucin De Grupos DEC Por Edad
De los 831 nios, el 17% eran menores de 6 meses, el 31% tenan entre 6-12
meses, el 32% tenan entre 13-24 meses y el 20% eran mayores de 24 meses. Los
episodios de diarrea DEC se produjeron con una frecuencia similar en todos los
grupos de edad: 23%, 30%, 27% y 31%, respectivamente (Tabla 2). Hubo una
asociacin estadsticamente significativa entre la edad y la infeccin con un grupo
especfico de diciembre de la siguiente manera: 1) la diarrea CEEA se observ con
mayor frecuencia entre los nios en los 6-24 meses de edad que los nios menores
de seis meses de edad (8,3% vs. 2,1% , P = 0,008, OR = 4,2; IC del 95%, 1,3-13,9)
y 2) los nios en el grupo de edad de 13-24 meses tenan infecciones DEC menos
mixtos que los nios de los otros grupos de edad (0,7% vs 3,7%, P = 0,012, OR =
0,19; IC del 95%, 0,04-0,8) (Tabla 2). Se observ una tendencia para los nios
menores de 6 meses de edad que estn infectados con mayor frecuencia con cepas
tepec (2,8% vs 0,72%, p = 0,052, OR = 4,2 IC 95%, 1,3-14).
Distribucin De Grupos DEC Por La Estacionalidad, Las Precipitaciones Y La
Temperatura
La distribucin de los grupos de DEC por la estacionalidad, las precipitaciones y la
temperatura para el perodo de cuatro aos (promedio) se muestra en la figura. 3.
Durante los cuatro aos los casos DAEC eran ms frecuentes en primavera (31/81,
38%), la temporada con las ms altas temperaturas y la precipitacin ms baja
(precipitacin promedio = 34,4 mm). Por el contrario, ETEC (11/21, 52%) CEEA
(20/56, 36%) y EPEC (16/46, 35%) fueron ms frecuentes durante el verano, que
es la temporada de lluvias (precipitacin promedio = 169 mm) en Yucatn.
La gravedad de la DEC episodios diarreicos datos clnicos completos estaban
disponibles para 126 nios con infecciones simples o mixtas DEC (ningn otro
patgeno bacteriano). Dieciocho nios (14%) tenan diarrea severa que requiere
rehidratacin intravenosa y 14 (11%) tenan diarrea sanguinolenta con fiebre
(DAEC, 7; CEEA, 5 y EPEC, 2). Episodios diarreicos graves se observaron con
mayor frecuencia en nios con EPEC (26%) y DAEC (18%). La mayora de los nios
(71%) fueron hospitalizadas por menos de 24 horas, pero 7 (6%) fueron ingresados
durante ms de 72 horas (Tabla 3).
DISCUSIN
A pesar de la gran cantidad de informes cientficos sobre las enfermedades
diarreicas en nios menores de cinco aos de edad, este estudio es uno de los
pocos que incluir la identificacin de patgenos bacterianos de rutina y los seis
identificado con frecuencia patgeno bacteriano en nios con diarrea. Las posibles
explicaciones para estas diferencias geogrficas incluyen variaciones en las
condiciones socioeconmicas, infraestructura de laboratorio y climticos. Nuestro
estudio encontr fuertes patrones estacionales para casi todos DEC-grupos. DAEC
fue altamente prevalente durante los meses calurosos y secos, mientras que ETEC,
CEEA y EPEC fueron ms frecuentes durante la estacin de lluvias, que es con
otros estudios realizados en Mxico.
con diarrea en nios japoneses sugieren fuertemente que estas cepas tienen el
potencial de causar enfermedades.
La presencia de SVG, tanto en diciembre y no diciembre cepas son indicativos de
la transferencia horizontal de genes continua entre cepas de E. coli. El intercambio
gentico entre cepas patgenas y no patgenas que comparten el mismo nicho
ecolgico tambin se ha demostrado en otros gneros bacterianos. Una
comparacin entre el comensal humano y de genomas de Neisseria patgenos,
revel que el ex sirven como reservorios de genes de virulencia y de participar
activamente en la transferencia horizontal de genes con sus homlogos patgenos.
Del mismo modo, los estudios evolutivos de Streptococcus pneumoniae y sus
parientes cercanos comensales han demostrado que ambos linajes bacterianos
probablemente evolucionaron de un ancestro patgeno que perdi ciertos genes de
virulencia durante la adaptacin de acogida a un estilo de vida comensal. La
transferencia gentica horizontal en cepas de E. coli, presumiblemente, pueden dar
lugar a resultados diferentes, incluyendo: 1) cepas hbridas DEC como el aislado
virulento hbrido CEEA-STEC, E. coli O104: H4, que caus un gran brote en Europa
en 2011, 2) cepas con mayor virulencia que pueden causar grandes cambios
epidemiolgicos en la diarrea diciembre (posiblemente-lt producir ETEC), y 3) las
cepas virulentas que no pertenece a ningn grupo diciembre bien definido, como es
probable en el caso de muchos no-diciembre aislamientos recuperados de
pacientes con diarrea.
En resumen, nuestros resultados muestran que los grupos DEC son una causa
importante de moderada a diarrea grave en los nios mexicanos. La presencia de
mltiples SVG en estas cepas, que son ms frecuentes en nios mayores, sugiere
que la capacidad patgena de estas cepas puede ser conferida por una
combinacin de genes de virulencia en lugar de la presencia o ausencia de un solo
gen.