Chromosomes

1 Prokaryotic
2 Circular
3 Very small
4 1 chromosome per cell
5 Some enzymes and proteins are associated with the DNA.
6 Not housed in a nucleus.
1
2
3
4
5
6
7
8

Eukaryotic
Linear
Fairly long
Several chromosomes per cell.
Histone proteins---spools. Same in all eukaryotes
Housed in a nucleus.
Nucleosome2 loops of DNA wrapped around 8 histone proteins.
Unity theme.

cromosomas
Prokaryotic
Circular
Muy pequea
1 cromosoma por clula
Algunas enzimas y protenas estn asociadas con el ADN.
No se encuentra en un ncleo.
Eukaryotic
Lineal
Bastante largo
Varios cromosomas por clula.
Las protenas histonas --- carretes. Lo mismo en todos los
eucariotas
Ubicado en un ncleo.
Nucleosome-2 bucles de ADN envuelto alrededor de 8 protenas
histonas.
Unidad temtica.

Nucleotides

The phosphate and sugar form the backbone of the DNA molecule, whereas
the bases form the rungs.
2 There are four types of nitrogenous bases.
Los nucletidos
1

El fosfato y azcar formar la columna vertebral de la molcula de

ADN, mientras que las bases forman los peldaos-.
Existen cuatro tipos de bases nitrogenadas.

FORCES THAT STABILIZE NUCLEIC ACID STRUCTURES

1 SUGAR-PHOSPHATE CHAIN CONFORMATIONS
2 BASE PAIRING
3 BASE-STACKING,HYDROPHOBIC
4 IONIC INTERACTIONS
FUERZAS QUE estabilizar las estructuras de cidos nucleicos
azcar-fosfato conformaciones de cadena
base de sincronizacin
BASE-apilamiento, HIDROFBICO
interacciones inicas

HYDROGEN BONDING
1 REQUIRED FOR SPECIFICITY OF BASE PAIRING
2 NOT VERY IMPORTANT IN DNA STABILIZATION
3 HYDROPHOBIC FORCES ARE THE MOST IMPT.
de enlace de hidrgeno
Necesario para la especificidad de apareamiento de bases
NO MUY IMPORTANTE EN EL ADN DE ESTABILIZACIN
Las fuerzas hidrofbicas SON LA MAYORA IMPT.

AMAZING DNA FACTS

1 D N A fr o m a single human cell extends in a single thread for almost 2
meters long!!!

It contains information equal to some 600,000 printed pages of 500 words

each!!!
(a library of about 1,000 books)
HECHOS ASOMBROSOS ADN ... de una sola clula humana se
extiende en hilo de casi 2 metros de largo! Contiene informacin
equivalente a unas 600.000 pginas impresas de 500 palabras cada
uno! (biblioteca de cerca de 1.000 libros)
El ADN de una sola clula humana se extiende en un solo hilo por
casi 2 metros de largo!
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de 500 palabras cada uno!
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Discovering the structure of DNA

1 DNA = Deoxyribose nucleic acid
1

Made out of sugars (deoxyribose), phosphates and nitrogen bases

El descubrimiento de la estructura del ADN

DNA = Deoxyribose cido nucleico
Realizada
nitrogenadas

en

azcares

(desoxirribosa),

fosfatos

bases

Watson JD and Crick FC (1953) Molecular Structure of Nucleic Acids: A Structure

for Deoxyribose Nucleic Acid. - 1962 Nobel Prize awarded to three men Watson,
Crick and Wilkins
Watson y Crick FC JD (1953) Estructura molecular de los cidos
nucleicos: Una estructura para el cido nucleico desoxirribosa. - 1962
- Premio Nobel otorgado a tres hombres - Watson, Crick y Wilkins

1953. Ao culminante: J . Wa tson y F. Crick resuelven la estructura

tridimensional del DNA (Nature 171: 737-738)
1953. Ao culminante: J. Watson y F. Crick resuelven la Estructura
tridimensional del ADN (la Naturaleza 171: 737-738)
J. Watson y F. Crick resuelven la Estructura tridimensional del ADN (la
Naturaleza 171: 737-738)

Regla de Chargaf
Adenina Timina debe vincular con
Guanina Citosina debe vincular con
sus cantidades en una
aproximadamente la misma.

molcula

de

ADN

dada

ser

Watson y Crick Modelo

El ADN se compone de 2 cadenas de nucletidos que forman una
forma de doble hlice.
Las dos cadenas son antiparalelas.
El esqueleto de la molcula de ADN se compone de alternar grupos
fosfato y azcares.
Las bases nitrogenadas complementarias formar enlaces de
hidrgeno entre las cadenas.
A es gratuito a T y G es gratuito para C.
Watson & Crick Model
DNA is composed of 2 chains of nucleotides that form a
double helix shape.
The two strands are antiparallel.
The backbone of the DNA molecule
alternating phosphate groups and sugars.

is

composed

of

The complimentary nitrogenous bases form hydrogen bonds

between the strands.
A is complimentary to T and G is complimentary to C.

Estructura del ADN

Un gen es una seccin del ADN que codifica para una protena.
Cada gen nico tiene una secuencia nica de bases.
Esta secuencia nica de bases codificar para la produccin de una
protena nica.
Son estas protenas y la combinacin de protenas que nos den un
fenotipo nico.
DNA Structure
A gene is a section of DNA that codes for a protein.
Each unique gene has a unique sequence of bases.
This unique sequence of bases will code for the production
of a unique protein.
It is these proteins and combination of proteins that give us
a unique phenotype.

El ADN es una molcula compleja de gran tamao.

El ADN se encuentra dentro de los cromosomas.
Los genes (las instrucciones que forman los seres vivos) estn
hechos de ADN.
La molcula de ADN consiste en dos filamentos enrollados entre s
para formar una doble hlice .
The molecule of DNA consists of two strands coiled together
to form a double helix.
Cada una de las dos hebras se compone de pequeas
unidades llamadas nucelotides.
Each of the two strands is made up of small units called
nucelotides.
Cada nucletido est compuesto a su vez de tres grupos qumicos:

1.Phosphate
2.Sugar
3.A la base

Each nucleotide is itself made up of three chemical groups:

1.Phosphate
2.Sugar
3.A base
Existen cuatro tipos diferentes de base
1.Adenine (A)
2.Guanine (G)
3.Cytosine (C)
4.Thymine (T)
There are four different kinds of base
1.Adenine (A)
2.Guanine (G)
3.Cytosine (C)
4.Thymine (T)

DNA Double Helix

Los peldaos de la escalera de "Piernas" Piernas de escalera "y
fosfato columna vertebral de azcar
Fosfato y azcar Backbone
Rungs of ladder Legs Legs of ladder Phosphate & Sugar Backbone
Phosphate & Sugar Backbone
Base nitrogenada (A, T, G o C)

Nitrogenous Base (A,T,G or C)

Si te imaginas la molcula de ADN como una escalera que ha dado la

vuelta trenzado.
Los bordes de la escalera estn hechos de las molculas de azcar y
fosfato.
Los peldaos de la escalera se hacen fuera de las cuatro molculas
de base.
If you imagine the DNA molecule as a ladder that has been
twisted round.
The edges of the ladder are made out of the sugar and
phosphate molecules.
The rungs of the ladder are made out of the four base
molecules.

Estructura del ADN

Fbonding es especfico: bond pirimidinas con purines
Fimplication: medios para la replicacin exacta
DNA STRUCTURE
Fbonding is specific: pyrimidines bond with purines
Fimplication: means for accurate replication

ADN GEOMETRA
Un polmero de desoxirribonucletidos

 doble cadena
trifosfatos desoxinuclesidos INDIVIDUALES se acoplan mediante
enlaces fosfodister
-esterificacin
-LINK carbono 3 'de la ribosa UNO CON 5' C DE OTRO
-Terminal: 5 'y 3'
A-DOBLE HELICOIDAL ESTRUCTURA
-AXIS COMN PARA LOS DOS HELICES
- Con que mano de hlices
-Antiparalela RELACIN ENTRE 2 hebras de ADN
DNA GEOMETRY
A POLYMER OF DEOXYRIBONUCLEOTIDES
DOUBLE-STRANDED
INDIVIDUAL
deoxyNUCLEOSIDE
TRIPHOSPHATES
COUPLED BY PHOSPHODIESTER BONDS
ESTERIFICATION
LINK 3 CARBON OF ONE RIBOSE WITH 5 C OF ANOTHER
TERMINAL ENDS : 5 AND 3
A DOUBLE HELICAL STRUCTURE
COMMON AXIS FOR BOTH HELICES
HANDEDNESS OF HELICES
ANTIPARALLEL RELATIONSHIP BETWEEN 2 DNA STRANDS

ADN GEOMETRA
PERIFERIA DE ADN
-Azcar-fosfato CADENAS
CENTRO DE ADN
-BASES se apilan en forma paralela

ARE

REGLAS-Chargaf
A=T
G=C
- COMPLEMENTARIA apareamiento de bases
DNA GEOMETRY
PERIPHERY OF DNA
SUGAR-PHOSPHATE CHAINS
CORE OF DNA
BASES ARE STACKED IN PARALLEL FASHION
CHARGAFFS RULES
A = T
G = C
COMPLEMENTARY BASE-PAIRING

GROOVES MAYORES Y MENORES

MENOR
EXPONE-Edge de que los tomos C1 'se extienden
MAYOR
-EXPONE borde opuesto de pares de bases
El patrn de H-POSIBILIDADES DE BONOS es ms especfico y
discriminar MAS en el surco mayor
MAJOR AND MINOR GROOVES
MINOR
EXPOSES EDGE FROM WHICH C1 ATOMS EXTEND
MAJOR
EXPOSES OPPOSITE EDGE OF BASE PAIR
THE PATTERN OF H-BOND POSSIBILITIES IS MORE SPECIFIC
AND MORE DISCRIMINATING IN THE MAJOR GROOVE

Major Minor vs Groove - ambientes muy diferentes - importante para

el reconocimiento y unin
Mayor
-Richer en los sustituyentes de base
Menor
-Hidrofbicas tomos de hidrgeno de los grupos de ribosa forman
sus paredes
Major vs Minor Groove distinctly diferent environments important
for recognition and binding
Major
Richer in base substituents
Minor
Hydrophobic H atoms of ribose groups forming its walls

la topologa del ADN

Las propiedades topolgicas de DNA HELP EE.UU. PARA EXPLICAR
-DNA en el ncleo COMPACTACIN
-Anulacin de ADN TENEDOR EN LA REPLICACIN
-FORMACION Y MANTENIMIENTO DE LA BURBUJA DE TRANSCRIPCIN
Gestionar el superenrollamiento EN LA BURBUJA DE TRANSCRIPCIN
AVANZANDO
DNA TOPOLOGY
THE TOPOLOGICAL PROPERTIES OF DNA HELP US TO EXPLAIN
DNA COMPACTING IN THE NUCLEUS
UNWINDING OF DNA AT THE REPLICATION FORK
FORMATION AND MAINTENANCE OF THE TRANSCRIPTION BUBBLE
MANAGING THE SUPERCOILING IN THE ADVANCING TRANSCRIPTION
BUBBLE

la topologa del ADN

Despus de completar los 13 ejercicios IN-CLASS, TRATE DE
CONTESTAR LAS SIGUIENTES PREGUNTAS:
(1) EL EJE DE HLICE DE UN DUPLEX ADN circular cerrado se
ve obligado a estar en un plano. HAY 2340 pares de bases en
este pedazo de ADN y, cuando se restringe al avin, el giro es
212.
-Determinar-L ,-W y-T PARA EL FORMULARIO con y sin
restricciones de este ADN.
(2) Un ADN CERRADO DUPLEX CIRCULAR tiene un segmento
de 100 pb del ALTERNA Y RESIDUOS C G. Traslado a un
solucin con una concentracin elevada de sal, EL SEGMENTO
DE MARCA LA TRANSICIN DEL B-FORM A LA Z-FORM. QU ES
EL CAMBIO DE ACOMPAANTE EN-L ,-W . Y-T ?
DNA TOPOLOGY
AFTER COMPLETING THE 13 IN-CLASS EXERCISES, TRY TO
ANSWER THE FOLLOWING QUESTIONS:
(1) THE HELIX AXIS OF A CLOSED CIRCULAR DUPLEX DNA IS
CONSTRAINED TO LIE IN A PLANE. THERE ARE 2340 BASE
PAIRS IN THIS PIECE OF DNA AND, WHEN CONSTRAINED TO
THE PLANE, THE TWIST IS 212.
DETERMINE L, W AND T FOR THE CONSTRAINED AND
UNCONSTRAINED FORM OF THIS DNA.
(2) A CLOSED CIRCULAR DUPLEX DNA HAS A 100 BP
SEGMENT OF ALTERNATING C AND G RESIDUES. ON TRANSFER
TO A SOLUTION WITH A HIGH SALT CONCENTRATION, THE
SEGMENT MAKES A TRANSITION FROM THE B-FORM TO THE ZFORM. WHAT IS THE ACCOMPANYING CHANGE IN L, W.
AND T?

La topologa del ADN

-superenrollamiento : DNA-LA ESTRUCTURA TERCIARIA
L =-ENLACE NMERO

-A topolgica INVARIANTE
-El # de veces que se enrolla el ADN HILO EN EL OTRO
L=T+W
-T ES EL TWIST El # de vueltas completas que una cadena de ADN HACE
ALREDEDOR DEL EJE DUPLEX
-W es la retorcerse-
EL # DE VECES EL EJE GIRA ALREDEDOR DE DUPLEX EN EL EJE
superhelical
THE TOPOLOGY OF DNA
SUPERCOILING : DNAS TERTIARY STRUCTURE
L = LINKING NUMBER
A TOPOLOGIC INVARIANT
THE # OF TIMES ONE DNA STRAND WINDS AROUND THE OTHER
L = T + W
T IS THE TWIST
THE # OF COMPLETE REVOLUTIONS THAT ONE DNA STRAND MAKES
AROUND THE DUPLEX AXIS
W IS THE WRITHE
THE # OF TIMES
SUPERHELICAL AXIS

THE

DUPLEX

AXIS

Estructura del ADN

Fhelical estructura de ADN
Fmajor y arboledas de menores
F10A radio y dimetro 20A
F3.4 entre pares de bases de nucletidos
F34 / vuelta de 360

TURNS

AROUND

THE

F10 pares de bases de nucletidos / giro de 360

DNA STRUCTURE
Fhelical structure of DNA
Fmajor & minor groves
F10 radius & 20 diameter
F3.4 between nucleotide base pairs
F34 / 360 turn
F10 nucleotide base pairs / 360 turn

ESTRUCTURA DE LA DOBLE HLICE

TRES FORMAS PRINCIPALES
-B-DNA
-A-ADN
-Z-ADN
B-DNA es biolgicamente la ms comn
-Diestro (20 (dimetro))
Complementario de apareamiento de bases (Watson y Crick)
A-T
G-C
-Cada par de base tiene la misma anchura ~
10,85 A PARTIR C1 'A C1'
A-T y los pares del G-C SON INTERCAMBIABLES
- PSEUDO-DYAD eje de simetra
STRUCTURE OF THE DOUBLE HELIX
THREE MAJOR FORMS
B-DNA
A-DNA

Z-DNA
B-DNA IS BIOLOGICALLY THE MOST COMMON
RIGHT-HANDED (20 ANGSTROM (A) DIAMETER)
COMPLEMENTARY BASE-PAIRING (WATSON-CRICK)
A-T
G-C
EACH BASE PAIR HAS ~ THE SAME WIDTH
10.85 A FROM C1 TO C1
A-T AND G-C PAIRS ARE INTERCHANGEABLE
PSEUDO-DYAD AXIS OF SYMMETRY

STRUCTURAL VARIANTS OF DNA

1 DEPEND UPON:
1 SOLVENT COMPOSITION
2 WATER
3 IONS
4 BASE COMPOSITION
Variantes estructurales de DNA
depender de:
-SOLVENTE COMPOSICIN
AGUA
CIONES
-BASE COMPOSICIN

GEOMETRY OF B-DNA
1 IDEAL B-DNA HAS 10 BASE PAIRS PER TURN
2 BASE THICKNESS
1 AROMATIC RINGS WITH 3.4 A THICKNESS TO RINGS
3 PITCH = 10 X 3.4 = 34 A PER COMPLETE TURN
4 AXIS PASSES THROUGH MIDDLE OF EACH BP
5 MINOR GROOVE IS NARROW

MAJOR GROOVE IS WIDE

GEOMETRA DE B-DNA
IDEAL B-ADN tiene 10 pares de bases por vuelta
BASE DE ESPESOR
AROMATICOS-ANILLOS CON ESPESOR DE 3,4 A PARA ANILLOS
PITCH = 10 X 3.4 = 34 POR UN GIRO COMPLETO
AXIS PASA POR MEDIO DE CADA BP
surco menor es estrecho
surco mayor es amplia

right handed helix

1 planes of bases are nearly perpendicular to the helix axis.
Sugars are in the 2 endo conformation. Bases are the anti conformation.
Bases have a helical twist of 36 (10.4 bases per helix turn)
1 Helical pitch = 34 A
B-DNA
1 3.4 A rise between base pairs
Wide
and
deep
Narrow
and
deep
HOOOHNNNH2OHOOH
(OH)HOBASE1'3'2'5'7.0 A
1 helical axis passes through base pairs
23.7 A
hlice diestro
planos de las bases son casi perpendicular al eje de la hlice.
Los azcares se encuentran en la conformacin 2 'endo. Las bases
son la conformacin anti. Las bases tienen un giro helicoidal de 36
C (10,4 bases por vuelta de hlice)
helicoidal pitch = 34 A
B-DNA
Un aumento de 3,4 entre pares de bases
Amplio y profundo
Estrecho y profundo
HOOOHNNNH2OHOOH (OH) HOBASE1'3'2'5 '
7.0 A

 helicoidal eje pasa a travs de pares de bases

23,7 A
Canonical B DNA
1 First determined experimentally by fiber diffraction (Arnott)
2 C2-endo sugar puckers
3 High anti glycosidic angles
4 Right handed 10 base pairs per turn
5 Bases perpendicular to the helix axis and stacked over the axis
6 Overall bending as much as 15 degrees (result of base morphologies twist
and roll) {machine learning sequence vs overall conformation?}
7 Over 230 structures 25 with base mis-pairing only cause local perturbations
8 Strong influence of hydration along spine
Canonical B ADN
En primer lugar determinarse
difraccin de fibra (Arnott)

experimentalmente

mediante

C2 'endo-arrugas azcar
Altas anti-glucosdicos ngulos
diestro - 10 pares de bases por vuelta
Bases perpendiculares al eje de la hlice y apilado sobre el eje
En general doblar hasta 15 grados (resultado de morfologas
comunes - giro y balanceo) - {machine learning - secuencia vs
conformacin global}
Ms de 230 estructuras de base 25 con errores de emparejamiento slo causan perturbaciones locales
Fuerte influencia de la hidratacin a lo largo de la columna vertebral
A-form helix: dehydrated DNA; RNA-DNA hybrids Top View Right
handed helix
1 planes of bases are tilted 20 relative the helix axis.
1 2.3 A rise between base pairs
Sugars are in the 3 endo conformation. Bases are the anti conformation.
11 bases per helix turn
1 Helical pitch = 25.3 A
25.5 A
Una forma de hlice-: ADN deshidratado; hbridos RNA-DNA
Vista desde arriba
Diestro hlice

 planos de bases estn inclinados 20 con respecto al eje de la

hlice.
Un aumento de 2,3 entre pares de bases
Los azcares son en el 3 'conformacin endo. Las bases son la
conformacin anti. 11 bases por vuelta de hlice
helicoidal pitch = 25,3 A
25,5 A
A-DNA has a shallow minor groove and a deep major groove
Un ADN tiene una ranura poco profunda y una menor surco
mayor profundidad
A-DNA
1 RIGHT-HANDED HELIX
2 WIDER AND FLATTER THAN B-DNA
3 11.6 BP PER TURN
4 PITCH OF 34 A
1 AN AXIAL HOLE
5 BASE PLANES ARE TILTED 20 DEGREES WITH RESPECT TO
HELICAL AXIS
1 HELIX AXIS PASSES ABOVE MAJOR GROOVE
2 DEEP MAJOR AND SHALLOW MINOR GROOVE
6 OBSERVED UNDER DEHYDRATING CONDITIONS
Un ADN diestro HELIX
Ms ancho y ms plano que B-DNA
BP 11,6 por turno
PASO DE 34 A
- un orificio axial
PLANES Base estn inclinados 20 grados con respecto al eje de la
hlice
-Hlice eje pasa por encima surco mayor
- surco profundo y superficial Menor Mayor
observada bajo condiciones de deshidratacin
A-DNA
1 WHEN RELATIVE HUMIDITY IS ~ 75%

1 B-DNA A-DNA (REVERSIBLE)

2 MOST SELF-COMPLEMENTARY OLIGONUCLEOTIDES OF < 10 bp CRYSTALLIZE IN A-DNA CONF.
1 A-DNA HAS BEEN OBSERVED IN 2 CONTEXTS:
1 AT ACTIVE SITE OF DNA POLYMERASE (~ 3 bp )
2 GRAM (+) BACTERIA UNDERGOING SPORULATION
3 SASPs INDUCE B-DNA TO A-DNA
4 RESISTANT TO UV-INDUCED DAMAGE
5 CROSS-LINKING OF PYRIMIDINE BASES
Un ADN Cuando la humedad relativa es de aproximadamente un 75%
-B-DNA A-DNA (reversible)
OLIGONUCLEO-MOST libre complementarios
MAREAS DE <10 pb cristalizar en un DNA-CONF.
El ADN se ha observado en dos contextos:
-AT sitio activo de la polimerasa de ADN (~ 3 pb)
-Gram (+) BACTERIAS EN FASE DE esporulacin
SASPs INDUZCA B-ADN para A-DNA
Resistente a la radiacin UV-inducida por dao
-El entrecruzamiento de bases de pirimidina
Canonical A DNA
1 C3-endo sugar puckers brings consecutive phosphates closer together 5.9A
rather than 7.0
2 Glycosidic angle from high anti to anti
3 Base pairs twisted and nearly 5A from helix axis
4 Helix rise 2.56A rather than 3.4A
5 Helix wider and 11 base pairs per repeat
6 Major groove now deep and narrow
7 Minor grove wide and very shallow
Canonical Un ADN
C3 'endo-arrugas azcar - fosfato consecutivos trae ms cerca 5.9A
en lugar de 7,0
glucosdico ngulo de anti-alta a la lucha contra
Los pares de bases torcido y casi 5A de eje de la hlice
2.56A Helix subida en lugar de 3.4A

 Helix ms ancho y 11 pares de bases por repeticin

surco mayor ahora profunda y estrecha
Menor arboleda muy ancho y poco profundo
Z-DNA
1 Helix has left-handed sense
2 Can be formed in vivo, given proper sequence and superhelical tension, but
function remains obscure.
3 Narrower, more elongated helix than A or B.
4 Major "groove" not really groove
5 Narrow minor groove
6 Conformation favored by high salt concentrations, some base substitutions,
but requires alternating purine-pyrimidine sequence.
7 N2-amino of G H-bonds to 5' PO: explains slow exchange of proton, need for
G purine.
8 Base pairs nearly perpendicular to helix axis
9 GpC repeat, not single base-pair
1 P-P distances: vary for GpC and CpG
2 GpC stack: good base overlap
3 CpG: less overlap.
10 Zigzag backbone due to C sugar conformation compensating for G glycosidic
11 bond conformation
12 Conformations:
13 G; syn, C2'-endo
14 C; anti, C3'-endo
Z-ADN
Helix tiene zurdo sentido
Puede ser formado in vivo, dado secuencia correcta y la tensin
superhelicoidal, pero la funcin sigue siendo oscuro.
Ms angosto, hlice ms alargada que A o B.
Mayor "groove" en realidad no surco
Reduzca surco menor
Conformacin favorecido por altas concentraciones de sal, algunas
sustituciones de bases, pero requiere alterna purina-pirimidina
secuencia.
N2-amino de G H-bonos a 5 'PO: explica lento intercambio de
protones, la necesidad de purina G.
Los pares de bases casi perpendiculares al eje de la hlice
La repeticin GPC, no solo par de bases

-P-P distancias: variar por GPC y CpG

-GPC pila: buena superposicin de base
-CpG: una menor superposicin.
Zigzag columna vertebral debido a la compensacin de C
conformacin de azcar para G glicosdicoconformacin de bonos
Conformaciones:
-G; syn, C2 'endo-C; anti, C3 '-endo
Z-DNA
1 Convex major groove
2 Deep minor groove
3 Alternate C then G
4 Spine of hydration
Z-ADN
Convex surco mayor
surco menor Profundo
Alternativa C entonces G
Columna de hidratacin
Z-DNA
1 A LEFT-HANDED HELIX
2 SEEN IN CONDITIONS OF HIGH SALT CONCENTRATIONS
1 REDUCES REPULSIONS BETWEEN CLOSEST PHOSPHATE
GROUPS ON OPPOSITE STRANDS (8 A VS 12 A IN B-DNA)
3 IN COMPLEMENTARY POLYNUCLEOTIDES WITH ALTERNATING
PURINES AND PYRIMIDINES
1 POLY d(GC) POLY d(GC)
2 POLY d(AC) POLY d(GT)
4 MIGHT ALSO BE SEEN IN DNA SEGMENTS WITH ABOVE
CHARACTERISTICS
Z-ADN
Una hlice ZURDO
VISTO EN CONDICIONES DE altas concentraciones de sal
-Reduce repulsiones entre grupos ms cercanos fosfato en cadenas
opuestas (8 A 12 A VS IN B-DNA)

 EN polinucletidos complementarios CON PURINAS alterna y

pirimidinas
POLY-d (GC) poli d (GC)
POLY-d (CA) poli d (GT)
TAMBIN PODRA VERSE EN segmentos de ADN con caractersticas
antes
Z-DNA
1 12 W-C BASE PAIRS PER TURN
2 A PITCH OF 44 DEGREES
3 A DEEP MINOR GROOVE
4 NO DISCERNIBLE MAJOR GROOVE
5 REVERSIBLE CHANGE FROM B-DNA TO Z-DNA IN LOCALIZED
REGIONS MAY ACT AS A SWITCH TO REGULATE GENE
EXPRESSION
1 ? TRANSIENT FORMATION BEHIND ACTIVELY TRANSCRIBING RNA POLYMERASE
Z-ADN
12 W-C de pares de bases por vuelta
A PASO DE 44 GRADOS
Un surco menor PROFUNDO
NO surco mayor discernible
CAMBIO DE REVERSIBLE B-ADN a Z-DNA en regiones localizadas
pueden actuar como un interruptor-A regular la expresin gnica
-? Formacin transitoria DETRS ACTIVAMENTE TRANTrazado ARN polimerasa
Z-form double helix: polynucleotides of alternating purines and
pyrimidines (GCGCGCGC) at high salt Left handed helix Backbone zigzags because sugar puckers alternate between 2 endo pyrimidines and 3
endo (purines) Bases alternate between anti (pyrimidines) and syn
conformation (purines). 12 bases per helix turn
1 Helical pitch = 45.6 A
1 planes of the bases are tilted 9 relative the helix axis.
Flat major groove Narrow and deep minor groove 18.4 A
1 3.8 A rise between base pairs
Z-forma de doble hlice: polinucletidos de purinas y pirimidinas
alternantes (GCGCGCGC) en alta salinidad

Hlice mano izquierda

Backbone zig-zags por frunces azcar alternan entre 2 'endo
pirimidinas y 3' endo (purines) Bases alternos entre los anti
(pirimidinas) y la conformacin syn (purines). 12 bases por vuelta
de hlice
helicoidal pitch = 45,6 A
planos de las bases estn inclinados 9 con relacin al eje de la
hlice.
ranura plana mayor surco menor estrecho y profundo
18,4 A
Un aumento de 3,8 entre pares de bases
GLYCOSIDIC TORSION ANGLES IN Z-DNA
1 ALTERNATING
1 PYRIMIDINE: ANTI
2 PURINE: SYN
2 WHAT HAPPENS WHEN B-DNA SWITCHES TO Z-DNA?
1 THE PURINE BASES ROTATE AROUND GLYCOSIDIC BOND
FROM ANTI TO SYN
2 THE SUGARS ROTATE IN THE PYRIMIDINES
3 THIS MAINTAINS THE ANTI CONFORMATIONS
Glucosdicos ngulos de torsin en Z-DNA
ALTERNA
-Pirimidina: ANTI
-Purina: SYN
Qu sucede cuando ADN B-Cambia a Z-DNA?
-Las bases de purina GIRA ALREDEDOR DE ANTI enlace glucosdico A
SYN
-Los azcares girar en las pirimidinas
Esto mantiene las conformaciones ANTI
DNA
1
2
3
4
5

Functions
1. Storage of genetic information
2. Self-duplication & inheritance.
3. Expression of the genetic message.
DNAs major function is to code for proteins.

Information is encoded in the order of the nitrogenous bases.

ADN
Funciones
1. Almacenamiento de la informacin gentica
2. Auto-duplicacin y la herencia.
3. Expresin del mensaje gentico.
La funcin principal del ADN es codificar para protenas.
La informacin est codificada en el orden de las bases
nitrogenadas.