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Genmica,

bioinformtica
y evolucin
Una alianza estratgica para la
biologa del nuevo siglo
Hernn Dopazo
Centro de Investigacin Prncipe Felipe, Valencia

Genmica, bioinformtica y biologa de sistemas son recientes ramas de la


biologa que se apoyan firmemente en la visin darwiniana de la evolucin,
al tiempo que arrojan nueva luz sobre ella.

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ARTCULO

uando entr en el estudio de Darwin, en la casa


de campo que habit con su familia durante cuarenta aos en la pequea localidad de Downe, en
Kent, experiment solo una sensacin: admiracin. All
estaban todas sus cosas: su mesa de estudio, sus instrumentos, su viejo silln, el espejo, las fotografas de sus
amigos Charles Lyell y Joseph Hooker, sus libros. All
Darwin pens, planific y escribi la mayor parte de sus
trabajos, en especial el que consider ms importante, y
que cambiara el rumbo del conocimiento humano para
siempre: El origen de las especies. Esa habitacin fue centro
neurlgico de su actividad hasta el final de sus das.
Cmo hubiera trabajado Darwin de haber tenido acceso
a internet, correo electrnico y una base de datos? Algunos
imaginan que hubiese sido aun ms innovador, pero, en mi
opinin, poco habra cambiado. Quiz no hubiera tardado
veinte aos en dar a conocer su idea ms original: el mecanismo de seleccin natural como explicacin del origen
de las adaptaciones de los organismos a su ambiente. Pero
quiz hubiese necesitado un buen tiempo de todos modos,
porque las ideas requieren maduracin, independientemente de la tecnologa de que disponga quien las concibe.
La tecnologa, sin embargo, impone tiempos al desarrollo
cientfico y se convierte en directriz de gran parte del nuevo conocimiento. Las tcnicas moleculares que aprend hace
poco ms de veinte aos como estudiante de biologa estn
hoy obsoletas: lo ocurrido en esa disciplina en tan corto perodo provoca escalofros, concretamente, por el trnsito de
una produccin artesanal de datos genticos a una produccin industrial de datos genmicos. Esa transformacin convirti a las investigaciones biolgicas en multidisciplinarias
y cambi el paisaje demogrfico en nuestros laboratorios.
En la actualidad, los bilogos comparten sus mesadas con
matemticos, qumicos, fsicos e informticos.
Qu ensear hoy a los estudiantes? Dnde poner las
prioridades? La mejor imagen para representar la actual produccin de datos genmicos es la de un tsunami que empieza a tomar forma. Pero con tantos datos, se est generando
nuevo conocimiento? Ha llevado esta revolucin tecnolgica a nuevas teoras en algn campo de la biologa? S y no.
Las preguntas principales siguen siendo las mismas, pero
ha cambiado la dimensin de las respuestas. Cmo pasamos de la constitucin gentica de individuo o su genotipo a
sus caractersticas individuales o su fenotipo? Cmo pasamos
de la informacin contenida en secuencias del ADN de un
genoma a la diversidad de formas, funciones y comportamientos de los seres vivos? Cmo, dnde y por qu se
producen las fallas frecuentes que generan enfermedades?
Cul es la relacin de parentesco entre todos los seres vivos? Es decir, cul es la forma final del rbol de la vida?
Estas preguntas han estado desde siempre en la mente de
los bilogos, pero actualmente la mayora de las respuestas,
tanto en el campo de la fisiologa como en el de la evolucin,
estn en completa revisin. Constituyeron la exitosa biologa
del siglo XX, centrada en la accin individual de los genes.

Estudio de Darwin en Down House, la casa de campo en la que vivi durante cuarenta
aos, situada en el condado de Kent, cerca de la localidad de Downe, unos 26km del
centro de Londres en direccin sudeste.

A pesar de la reciente metamorfosis de la biologa, las nuevas respuestas a esas preguntas seguirn descansando en una
actualizada teora evolutiva, cuyos pilares construy Darwin
hace ciento cincuenta aos en aquel estudio de Downe.

La revolucin genmica
En 1974 Frederick Sanger (dos veces premio Nobel
de qumica, en 1958 y en 1980) cre un mtodo de
secuenciacin del cido desoxirribonucleico o ADN por
terminacin de cadenas. Su idea consisti en obtener todas las
secuencias posibles de una cadena de ADN con un nico
nucletido de diferencia, para luego leerlas e inferir la
secuencia completa de pares de bases de un gen.
Esta tcnica se aplic manualmente en los laboratorios durante toda la dcada del 1980. Dada su baja resolucin, afortunados eran aquellos que, repitiendo tres
veces el experimento, lograban leer con pocas dudas mil
pares de bases, es decir, un poco menos que el tamao
medio de un pequeo gen bacteriano.
En la siguiente dcada, los avances tcnicos automatizaron el mtodo, redujeron los errores de lectura, permitieron la produccin en paralelo, e imprimieron al costo de
secuenciacin una carrera descendente que an contina.
En 1998 un secuenciador automtico procesaba un milln
de pares de bases por da. Ese ao el consorcio pblico
del proyecto del genoma humano se pona como objetivo
secuenciar ochenta millones de ellas. Dos aos despus se
haba duplicado el rendimiento, y en 2001 se present pblicamente el primer esquema de nuestro genoma.
Esto no constituy ms que la punta del iceberg de una
nueva forma de hacer biologa, cuyo objetivo inmediato
fue la secuenciacin de todos los genes humanos (alrededor de veintitrs mil), en especial aquellos asociados con
enfermedades, que constituyen perlas para la medicina. Sigui el estudio de su regulacin y expresin, para lo cual
no solo interesan los genes, sino sus secuencias reguladoVolumen 19 nmero 113 octubre - noviembre 2009 89

ras; los intermediarios o transcriptos de sus productos finales,


las protenas; las secuencias que separan un gen de otro, y
un conjunto de otros elementos, algunos repetidos desde
unas pocas decenas hasta miles de veces, que no hace mucho formaban parte de lo completamente desconocido del
genoma de un organismo eucariota superior.
Para comprender nuestro genoma y experimentar con
l debemos entender nuestras diferencias con otras especies, como gusanos, moscas, peces, ratones y nuestros parientes primates ms cercanos, lo que llev a la genmica
comparativa. Esta revolucin no solo tiene consecuencias
para la medicina o la industria farmacutica sino, tambin,
para reas como agricultura, ganadera, piscicultura e ingeniera forestal. Modifica preguntas y mtodos en todos
los campos del conocimiento biolgico, desde la biologa
del desarrollo a la sistemtica, desde la microbiologa al
comportamiento, y desde la gentica de poblaciones a la
conservacin de especies. Institutos como el Sanger en Inglaterra o empresas como Celera en los Estados Unidos son
en la actualidad centros robotizados dedicados a la generacin masiva de datos genmicos.
Ante estas nuevas posibilidades, en un mar de A, C, T
y G como se simbolizan las cuatro bases de los cidos
nucleicos, cmo distinguir las partes que tienen alguna
funcin de las que no la tienen? Con qu herramientas manejar y guardar esa enorme informacin? Cmo
hacer accesibles los datos a investigadores y a otros interesados? Ya habr supuesto el lector que de eso se ocupa
la bioinformtica, a la que nos referiremos despus de
comentar brevemente la tecnologa de los chips de expresin.

Miles de experimentos en dos


centmetros cuadrados
La hibridacin de cidos nucleicos es una tcnica de laboratorio
usada por la biologa molecular que detecta la expresin de
un gen por medio de la concentracin del ARN mensajero
que da lugar a la produccin de una protena. La tcnica se
aplicaba manualmente durante las dcadas de 1980 y 1990.
Actualmente hay empresas que venden unas pequeas placas de vidrio o chips que concentran en poco ms de dos
centmetros cuadrados todos lo genes de un genoma, sea
humano, de ratn o de mosca.
La cuantificacin de ARN mensajero con estos chips de
ADN, llamados microarrays, permite medir la expresin
de todos los mensajeros de los genes de un genoma sometido a una o ms condiciones experimentales y compararlo
con un genoma de control. En un solo experimento podemos obtener el transcriptoma (la totalidad de ARN mensajero
expresado en un genoma) de cualquier tipo de cncer, en
pacientes estratificados por edades, sexo y distintos tratamientos farmacolgicos. Podemos deducir cules genes son
responsables del crecimiento descontrolado de clulas, los
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que provocan el rendimiento de aceites en una planta, los


responsables genticos de que una abeja reina sea diferente
de una obrera o lo que sucede durante la metamorfosis de
un insecto. Esta tecnologa de chips no solo se aplica al anlisis de la expresin de genes; tambin sirve para deducir
prdidas y ganancias de material gentico en distintas regiones cromosmicas, para la deteccin de mutaciones de
un solo nucletido en poblaciones, para la interaccin entre protenas, etctera. Si bien las posibilidades de este tipo
de tecnologa son enormes, lo relevante en esta revolucin
tecnolgica es haber pasado del anlisis individual de unos
pocos genes al anlisis masivo de genes en paralelo.
Esta tecnologa ha robotizado los laboratorios genmicos y automatizado el trabajo tcnico. La toma de datos
est garantizada para un experimento genmico, por lo
que podemos responder de manera detallada a la pregunta
ms bsica de cualquier ciencia: en qu consiste el sistema en estudio. Sabiendo qu hay, podemos concentrarnos
en formular hiptesis acerca de cualquier observacin,
para estar en condiciones de responder qu hacen y por
qu estn all sus elementos, es decir, encontrar las causas
prximas (fisiolgicas) y ltimas (evolutivas) del estudio
biolgico. Pero para responder estas preguntas debemos
ser conscientes del tipo de dato que hemos producido.
Por ejemplo, en el anlisis de un cncer de un nico paciente con un chip de expresin se producen unas
25.000 filas de datos por una decena de variables primarias que, multiplicado por unas veinte rplicas de experimentos, arroja cinco millones de datos. Para el anlisis
de secuencias genmicas como para la lectura de experimentos de microarrays, no alcanza con el manejo de una
planilla de clculo de tipo Excel.
Recuerdo que, ante la oferta de dedicarme a la genmica
y bioinformtica, pregunt a quien sera mi mentor durante
algunos aos si la bioinformtica no era una moda pasajera,
fomentada por colegas poco afectos a las labores experimentales de laboratorios con tubos de ensayo, soluciones y
pipetas. A mis dudas sobre si desaparecera en poco tiempo,
me respondi sin vacilar que solo poda ir a ms. Tena razn: hoy no se puede hacer gentica, microbiologa, biomedicina o biologa evolutiva modernas sin conocimientos
de bioinformtica. La acumulacin de datos de secuencias
moleculares y la imperiosa necesidad de dar sentido a la
diversidad de informacin que comenz a generarse con las
nuevas tcnicas de secuenciacin de protenas y, despus,
de cidos nucleicos produjeron su nacimiento y alimentan
su desarrollo (vase el recuadro La bioinformtica).

Filogenmica: una visin


genmica del rbol de la vida
Las relaciones de parentesco entre humanos, moscas y
gusanos no segmentados o nematodos fueron definidas des-

ARTCULO

de los inicios del siglo XX gracias a una caracterstica que


surgi durante la evolucin de los dos primeros grupos
de organismos y que no se ve en el tercero: el celoma. Este
es una cavidad embrionaria caracterstica de moluscos,
gusanos segmentados o anlidos, artrpodos y vertebrados, que supuestamente habra surgido una nica vez en
el ancestro comn de todos estos organismos.
El estudio filogentico o historia evolutiva molecular de
los organismos mencionados estableci una nueva clasificacin, pues postul la existencia de los ecdisozoos (Ecdysozoa),
un grupo distinto que rene a moscas y gusanos, es decir, a
artrpodos y nematodos en una sola clase. La existencia de
los ecdisozoos, que forman uno de los grupos mayores del
mundo animal, postula la existencia de un ancestro comn
diferente entre estos organismos. En la vieja clasificacin los
humanos, lo mismo que los cerdos y las serpientes, estbamos ms cerca de las moscas y araas que de los gusanos no
segmentados. En la nueva clasificacin, con el grupo de ecdisozoos quedamos a igual distancia de los insectos que de
cualquier gusano parsito nematodo. As, desde mediados
de la dcada de 1970, la informacin proporcionada por la
biologa molecular pas a dominar la sistemtica.
La nueva clasificacin fue inicialmente aceptada por
algunos y discutida por otros, segn qu genes utilizaran
para el anlisis. En 2003, cuando este autor comenz accidentalmente a analizar el problema, se contaba ya con
los genomas completos de los tres conjuntos de organismos nombrados, as como de otros muchos que tienen
un lugar en el rbol de la vida, desde unicelulares como
el Plasmodium (el parsito causante de la malaria) hasta los
humanos. Ahora, gracias al soporte estadstico proporcionado por ms de 11.000 secuencias de los genomas de
diferentes organismos, el grupo de los ecdisozoos qued
firmemente establecido. La filogenmica, es decir, la historia de la vida reconstruida sobre bases genmicas o de
miles de genes, aporta as una visin estadstica ms robusta de las relaciones genealgicas entre las especies. Requiere el manejo masivo de genes y la concatenacin de
miles de anlisis filogenticos por medio de programas
informticos en lenguajes como Perl, Phyton o C++.

Seleccin natural y deteccin


genmica de enfermedades
En 2005 comenzamos a trabajar en la prediccin de enfermedades humanas mediante el anlisis evolutivo de presiones selectivas en protenas, es decir, midiendo la fuerza
con que un aminocido es descartado de una poblacin. El
razonamiento que utilizamos se bas en el hecho de que,
del mismo modo que la seleccin natural puede mantener
el cambio adaptativo de la informacin gentica de una
protena, su trabajo frecuente es descartar mutaciones que
deterioran la informacin gentica transmitida de padres

La bioinformtica

a bioinformtica utiliza algoritmos informticos y modelos


probabilsticos para dar sentido a los datos contenidos
en las bases de datos biolgicas. Entre las ms conocidas
podemos mencionar: (1) la de genes de enfermedades humanas
(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=OMIM); (2) la de
ontologas gnicas (http://www.geneontology.org/), que emplea
un vocabulario de trminos semijerrquicos organizados por
procesos biolgicos, componentes celulares y funciones biolgicas,
y (3) la de genomas completos (http://ensembl.org). Entre las
herramientas ms populares, estn las que buscan secuencias
parciales o completas (exones, motivos, genes o regiones
genmicas) en diferentes bases de datos (como http://blast.ncbi.
nlm.nih.gov/Blast.cgi). Entre los modelos probabilsticos estn
los ocultos de Markov, que sirven para buscar patrones definidos
de secuencias. Tambin las regresiones logsticas, los modelos
basados en mxima verosimilitud y el clculo de probabilidades
bayesianas para el ajuste del modelo a los datos biolgicos.
El trabajo principal del bioinformtico es el manejo de la
informacin biolgica. Pero no alcanza con saber buscar datos en
un mar de letras y nmeros: se debe saber qu hacer con ellos, es
decir, formular hiptesis y ponerlas a prueba. El Departamento de
Bioinformtica y Genmica de la institucin en que se desempea el
autor en Valencia (http://bioinfo.cipf.es) ha desarrollado herramientas
que integran soluciones a problemas diversos. Por ejemplo, para el
anlisis funcional de genes (http://www.babelomics.org/), que permite
la caracterizacin funcional de experimentos de microarrays, y su
lectura (http:g/www.gepas.org). El programa que estudia la formacin
de redes mnimas de protenas (http://snow.bioinfo.cipf.es/cgi-bin/
snow.cgi), el que deduce estructuras terciarias de protenas por
comparacin con secuencias con otras especies (http://salilab.org/
modeller/), el que se encarga del anlisis de la evolucin molecular,
filogenia y adaptacin de las secuencias moleculares (http://www.
phylemon.org), y el que busca mutaciones funcionales en el genoma
humano y el de ratn (http://pupasuite.bioinfo.cipf.es/).
Estas herramientas y muchas otras son utilizadas en internet
por una amplia comunidad de investigadores alrededor del mundo
(http://bioinfo.cipf.es/toolsusage/). Las herramientas bioinformticas
representan en esta poca lo que fueron para la gentica las tcnicas
de biologa molecular en las dcadas de 1980 y 1990. Dado que no se
puede hacer un experimento si no se tiene una hiptesis de trabajo y
una definicin explcita de cmo manejar los nmeros, resulta obvio
que los poseedores de este conocimiento sern jugadores clave en la
generacin de la biologa de este siglo.

a hijos, causa principal de que los hijos se parezcan a sus


padres. Esta forma de seleccin se conoce como seleccin purificadora, y es la ms frecuente en todas las especies.
En un primer estudio, trabajamos con la protena P53,
que tiene un importante cometido en el control del ciclo celular y, por lo tanto, es fundamental para evitar el crecimiento de la mayor parte de cnceres humanos. Establecimos que
por debajo de cierto umbral de presiones selectivas sobre
Volumen 19 nmero 113 octubre - noviembre 2009 91

Pioneros de la bioinformtica

argaret Oakley Dayhoff (1925-1983), nacida en Filadelfia, escribi su tesis


doctoral en la Universidad de Columbia sobre la medicin de energas de
resonancia en compuestos orgnicos. Se vali de aplicaciones informticas que
usaban tarjetas perforadas. Qumica de profesin, se desempe en las universidades
Rockefeller, de Maryland y Georgetown. Invent el cdigo de aminocidos de una sola
letra y la matriz PAM para contabilizar el cambio evolutivo en secuencias de protenas.
Estos desarrollos la llevaron a construir el primer rbol filogentico por medio de
una computadora. Su Atlas de secuencias y estructuras de protenas, organizado por
familias gnicas, que le llev trece aos de trabajo desde 1965, fue su ms destacada
contribucin al desarrollo de la disciplina. El atlas dio origen a la base de datos PIR
(Protein Information Resource), hoy incluida en UniProt (http://www.uniprot.org/).
Walter Benson Goad (1925-2000), nacido en el estado norteamericano de Georgia,
fsico terico del laboratorio de Los lamos en Nuevo Mxico, desarroll el cdigo
informtico para la extraccin, almacenamiento y anlisis de secuencias de ADN, que
llev a conformar en 1982 la primera base de datos de nucletidos del mundo: Los Alamos
Sequence Data Bank, que se convertira en GenBank (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Genbank/
index.html). Junto con sus homlogas del Laboratorio Europeo de Biologa Molecular (http://
www.ebi.ac.uk/embl/) y la Base de datos de ADN del Japn (http://www.ddbj.nig.ac.jp/
index-e.html), actualizan su contenido diariamente y no han parado de crecer en forma
exponencial desde su creacin, con duplicacin de su contenido cada dieciocho meses.

un aminocido, podamos distinguir residuos de protenas


asociados con diferentes frecuencias de cnceres, e identificamos los residuos de unas cuarenta protenas con mayor
probabilidad de asociacin con cnceres y enfermedades inmunolgicas. Despus, trabajando en colaboracin con un
fsico, extendimos esos primeros anlisis a la construccin
de un sistema informtico que opera con los principios de
inteligencia artificial y pudimos, primero, ampliar el mtodo a todas las protenas de la base de datos UniProt (Universal
Protein Resource) y, luego, a todo el genoma humano. Finalmente, aplicamos el mtodo en la publicacin del consorcio
que secuenci los genomas de todas las cepas de ratones de
laboratorio. En todo esto, la combinacin de conocimientos
en evolucin, genmica y bioinformtica result clave para
validar y predecir con xito enfermedades.

Qu nos hace humanos y no


chimpancs?
El sueo de conocer las diferencias genticas completas entre humanos y nuestros parientes vivientes ms
cercanos se hizo posible en 2005, cuando se public la
primera versin del genoma del chimpanc. Los bilogos evolutivos de esta generacin tenemos la enorme
fortuna de poder responder cientficamente a uno de los
interrogantes que desde siempre ms han interesado a la
humanidad: qu nos hace humanos?
Con ese propsito abordamos un anlisis comparativo
de trece mil genes de cinco especies de mamferos. El traba92

Representacin esquemtica de la estructura


tridimensional de la protena P53.

jo consisti en el alineamiento automtico de esos genes, su


ajuste a modelos estadsticos y la estimacin de tasas o velocidades de cambio evolutivo para cada uno de ellos en cada
una de las especies y en sus ancestros. Trabajamos en total
con unos noventa mil genes y unas cincuenta variables a las
que aplicamos diferentes pruebas para estimar si en el linaje
humano haba grupos de genes que cumplan funciones especficas y estaban cambiando de manera adaptativa.
Los resultados de trabajos similares venan siendo poco
esclarecedores y el nuestro confirm lo mismo: que no
se han encontrado caractersticas genticas que nos hagan
distintos de un chimpanc. Sabemos algo ms despus
de nuestro estudio: que desde la separacin genealgica
de nuestro ancestro comn, los chimpancs cambiaron
su genoma de manera adaptativa o darwiniana en mayor
medida que los humanos. Asimismo, hay evidencia de que
los humanos experimentaron cambios adaptativos mucho
ms relevantes en protenas testiculares que cerebrales. Si
eso no resulta sorprendente, s lo es descubrir que el linaje
de chimpanc tuvo muchos ms cambios adaptativos en
sus protenas cerebrales que nuestro linaje.
El uso de casi cinco millones de datos genticos ofreci perspectivas desconcertantes sobre lo ocurrido en los
ltimos cinco millones de aos de evolucin de nuestra
especie. Esos resultados, por fin verificados de manera
completa, hicieron cambiar el rumbo de las investigaciones hacia otras regiones del genoma. En 2007 se encontraron las primeras diferencias de constitucin gentica entre
humanos y chimpancs en materia de cambio de dieta y
actividad cerebral, no en protenas sino en las regiones del
genoma que regulan la expresin de los genes.

ARTCULO

Del gen a la biologa de sistemas


Cabe preguntarse si los avances realizados en los ltimos veinte aos en genmica y bioinformtica aplicadas a la evolucin llevaron a la biologa a un estadio del
conocimiento proporcionado al esfuerzo invertido. Es
conveniente tener en cuenta que, en el estudio de la evolucin y posiblemente en el resto de la biologa seguimos pensando y aplicando mtodos de la era pregenmica a los nuevos datos genmicos. Si antes aplicbamos
una prueba de seleccin a una decena de genes, ahora lo
hacemos a miles con la ayuda de la bioinformtica. Los
tres ejemplos anteriores muestran esa prctica.
Sin embargo, poco a poco va calando la idea de que
este enfoque no es suficiente. Los datos genmicos muestran un comportamiento de la naturaleza que no era evidente cuando el anlisis abarcaba unos pocos genes. Aqu
es donde entra la biologa de sistemas, una nueva rama de
la biologa conocida desde hace tiempo tambin como
biologa integrativa o biologa holstica, que tom impulso con
la revolucin genmica. La disciplina, sin embargo, no
resulta de la mera negacin de la visin ms simplista o
reduccionista creada por razonar sobre pocos genes, sino
de considerar las caractersticas propias del sistema complejo del que ahora tenemos datos.
Para dar un ejemplo, volvamos a la comparacin de genomas entre especies que cambian con relativa rapidez y
constituyen casos de adaptacin molecular. En ellas, el anlisis de los genes individuales con mtodos anteriores a la
era genmica impide conceder validez estadstica al hecho
de que hay, en cada especie, funciones diferentes asociadas
con el cambio adaptativo. Pero reconociendo que los genes
no son independientes, hemos sido capaces de encontrar
esas diferentes funciones. Los genes que se modifican en
forma ms acelerada muestran caractersticas biolgicas
que no pueden ser explicadas considerndolos de manera
individual, como su localizacin en los cromosomas, ms
cercanos entre ellos, o la formacin de redes ms apretadas, que aquellos que se modifican de manera ms lenta.
Es decir, existen propiedades biolgicas imposibles de explicar solo por la accin de genes individuales.

y dependen de mltiples variables. Por primera vez estas


pueden ser tomadas en conjunto para proporcionar una
explicacin ms satisfactoria del fenmeno biolgico.
Tenemos hoy un mejor conocimiento de la evolucin
que ayer. La teora neutralista de evolucin molecular sostena que la velocidad de cambio de las protenas est ntimamente relacionada con su funcin. Hoy sabemos, gracias
a experimentos masivos de expresin, que las velocidades
de cambio de las protenas estn inversamente relacionadas
con la cantidad de ARN mensajero en sus clulas.
A mayor expresin, menor cambio evolutivo; a menor
concentracin de ARN mensajero en la clula, mayor cantidad de cambio por unidad de tiempo. A pesar de estos
detalles, la teora evolutiva contina siendo la que goza
de mayor credibilidad en toda la biologa, simplemente
porque ha sido la que ms batallas ha ganado durante ms
de un siglo de investigacin. Se cuentan por miles los experimentos realizados para refutar sus mltiples hiptesis.
Muchos de sus postulados sern modificados con el tiempo y la acumulacin de datos genmicos. Es lgico y fructfero que as sea. No obstante, los pilares de la evolucin
biolgica ya estn tan slidamente afianzados que hablamos crecientemente de la realidad de la evolucin y menos de
teora evolutiva. Son indicios que proporciona el lenguaje.
Para el futuro desarrollo de la biologa y la puesta a
prueba de sus hiptesis, desde la biologa celular a la ecologa del comportamiento, necesitamos investigadores con
caractersticas diferentes de los que hoy se forman en muchas universidades del mundo. Deben poseer conocimientos mnimos de informtica y no tan mnimos de estadstica, genmica y evolucin. Si queremos ser partcipes del
conocimiento biolgico futuro, no debemos dar la espalda
a esta nueva revolucin del conocimiento humano.CH

Lecturas sugeridas
HIGG PG & ATTWOOD TK, 2005, Bioinformatics and Molecular Evolution,
Blackwell Publishing, Oxford.
LESK AM, 2007, Introduction to Genomics, Oxford University Press.
LYNCH M, 2007, The Origins of Genome Architecture, Sinnauer.
PAGEL M & POMIANKOWSKI A (eds.), 2008, Evolutionary Genomics and

Conclusiones
He intentado en estas lneas resumir algunos de los
avances de las nuevas tecnologas genmicas. El sueo
de un conocimiento biolgico completo empez a rodar
con la miniaturizacin y paralelizacin de experimentos.
Esto habra sido imposible sin el simultneo desarrollo
de la bioinformtica. Mucho ha cambiado en la manera
de interpretar el comportamiento celular: pasamos de
una visin lineal de la informacin gentica al estudio
de cientos de genes que interactan en redes complejas

Proteomics, Sinnauer.

Hernn Dopazo
Doctor en ciencias biolgicas, Universidad Autnoma de Madrid.
Jefe de investigacin, Centro de Investigacin Prncipe Felipe, Espaa.
Profesor del Master de Bioinformtica, Universidad Complutense de Madrid.
Profesor del Master Genomes and Systems, Universidad Pompeu Fabra en Barcelona.
Secretario de la Sociedad Espaola de Biologa Evolutiva.

http://hdopazo.bioinfo.cipf.es

Volumen 19 nmero 113 octubre - noviembre 2009 93

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