BIOLOGA MOLECULAR E INMUNOLOGA

Tema 1: Genoma Humano

Hasta mediados del siglo XX no se conoca cual era la molcula encargada de la transmisin gentica. En los aos 50 se desarrollaron experimentos muy importantes que llevaron a descubrir que era el ADN. Uno de los descubrimientos ms importantes en este tema fue la estructura del ADN. El dogma central de la biologa molecular explica el flujo de la transmisin gentica y las relaciones entre sus diferentes formas intermedias.

Se entiendo por genoma el conjunto de todo el material heredable de una clulas a partir de sus progenitores. Incluye ADN nuclear y ADN extranuclear. El tamao del genoma (en pares de bases nitrogenadas) no se correlaciona con la escala evolutiva. Adems, el tamao del genoma no se correlaciona con el nmero de cromosomas. Nuclear Tamao Tipo de ADN N de cromosomas Presencia de nucleosomas Protenas asociadas ADN codificante ADN repetitivo N de genes Presencia de intrones 6,6x10^9 pb Lineal, doble hebra 23 distintos Si Histonas y otras protenas 3-5% Abundante (30%) 50.000 En la mayora Mitocondrial 16,5 Kb Circular, doble hebra 1 con decenas de copias No Libre de protenas >93% Prcticamente nulo 37 Ausentes

Durante la mayor parte del ciclo celular el material gentico se encuentra en una forma semicondensada conoca como cromatina. Durante la replicacin se descondensa para duplicar la carga gentica. Antes de entrar en mitosis el material gentico se condensa para formar los cromosomas. Se realizan en torno a 10^17 divisiones mitticas a lo largo de la vida. Condensacin del ADN Comprende dos mecanismos: - Superenrollamiento: frecuente en genoma bateriano aunque tambin en ser humanos. - Empaquetamiento: se puede dividir en cuatro etapas: o Fibra de 10 nm. El material gentico se compacta seis veces. Su unidad bsica de est compactacin es el nucleosoma. El nucleosoma se forma por la unin de protenas (octmero de histonas) con el

BIOLOGA MOLECULAR E INMUNOLOGA ADN. El octmero est formado por cuatro parejas de protenas histonas diferentes (H2a, H2b, H3, H4) sobre el que se asocian 200 pb. Las diferencias entre las histonas no son muy grandes y comparten la presencia alta de aminocidos bsicos que reducen la acidez del ADN (las cargas positivas de la lisina y la arginina interaccionan con las cargas negativas de los grupos fosfatos). Las histonas se encuentran altamente conservadas a lo largo de la evolucin y son muy especficas de cada especie. Las histonas juegan un papel importante en el grado de la expresin gnica. De modo que el grado de acetilacin de ellas afecta a la expresin. Si los residuos de lisina son contrarrestado con grupos acetato provoca una disminucin de la carga positiva, facilitando la separacin del ADN y favoreciendo la expresin de genes. Controlar y entender el mecanismo de expresin de genes es muy importante para determinar el tipo de clula. o Fibra de 30 nm. Implica un grado de condensacin 40 sobre el ADN nativo. La condensacin es el resultado del enrollamiento de 6 nucleosomas por vuelta. Se le conoce con el nombre de selenoide. La histona H1 es la protena que permite este enrollamiento. o Eucromatina o cromosoma interfsico. Tiene un grado de condensacin de 5000 grados. Es el estado de cromatina en el que se encuentra la mayor parte del material gentico. Implica la formacin de bucles o de asas de la fibra de 30 nm entorno a un esqueleto nuclear de protenas no histonas (protenas de andamiaje). Posteriormente se forma la heterocromatina por un superenrollamiento de la cromatina formado bucles. Los genes que tienen regulacin comn y con igual funcin se encuentran en los mismo bucles de 30 nm o en bucles cercanos. o Cromosoma. Compactacin mxima de la cromatina. Ayuda de las topoisomeras.

Tema 2: La replicacin del ADN

Se define como el proceso por el cual una molcula de ADN da lugar a dos molculas de ADN hijas de igual secuencia. Sus caractersticas son: - Semiconservadora: se obtienen dos copias hijas de igual secuencia pero implica que cada una porta una cadena original y una cadena complementaria. - Simultnea: ocurre a la vez en ambas cadenas. - Secuencial: la adicin de nucletidos sigue un patrn en secuencia. - Bidireccional: ocurre en las dos hembras tanto en la cadena 5-3 como e la 3-5. - Semidiscontinua: la direccin de sntesis siempre es del extremo 5 (-P) al 3 (-OH) . La hebra 5-3 necesita duplicarse a saltos en fragmentos de Okazaki mientras que la 3-5 lo hace de forma continua.

BIOLOGA MOLECULAR E INMUNOLOGA Los requisitos enzimticos para que se pueda realizar la duplicacin son: - Sustratos: se utilizan desoxinucletidos-5-trifosfatos. No sirven el resto de nucletidos. - Cofactores: sales de cationes divalentes como sales de Mg2+ - Molde o plantilla: una de las hebras progenitores acta de molde. - Cebador o primer: las ADN-polimerasas no pueden empezar a adicionar nucletidos por si solas; necesitan una cadena nucleotdica de pequeo tamao para que les aporte el extremo OH libre. La telomerasa humana esta formada por un molde de ARN (hTR) y por una carcsa proteica donde reside la actividad enzimtica. La telomerasa es una transcriptasa inversa que ayuda a completar el telmero acortado y adems realiza translocaciones. Esta ees la historia de un sabadooooooo No importa que mees Como un hombre sentado al piano No Hoy es noche dee xexo Me vuelvo a la vidaaa Lo qu Pobre diablaaaaa se dice k se ta vihto por la calle vagandoo Llorando por un pobre k no valeh un sentaaaaavo Pobre diaaablaa llora por un pobre diablooo

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TEMA 3: MUTACIONES
Una mutacin es una alteracin en la secuencia del ADN. Pueden deberse a fallos en la replicacin o alteraciones espontneas por agentes internos o externos. Es la principal fuente de variabilidad gentica y, por tanto, causa evolutiva. Se generan al azar, y existe la misma susceptibilidad de mutacin en todas las regiones del genoma, las que ocurren sobre el ADN codificante (3%) tienen peores consecuencias. Y se que hay un torrente Dando vueltas en tu mente Ya lo ves La vida es asi Tu te vas y yo em quedo aqu Llover y ya no ser tuya Sere la gata bajo la luviaaaaaa

BIOLOGA MOLECULAR E INMUNOLOGA TEMA 4: TRANSCRIPCIN Proceso por el cual se sintetiza una cadena de ARN complementaria y antiparalela a un molde de ADN. Las enzimas que realizan la transcripcin reciben el nombre general de transcriptasas o ARN-polimerasas. Hay algunos virus que son capaces de sintetizar ADN a partir de ARN por lo que este proceso se conoce como transcripcin reversa (accin de transcriptasas inversas). El proceso de transcripcin es muy distinto dependiendo de la especie. Entre procariotas y eucariotas las diferencias son muy notorias: - En procariotas el material gentico est disperso en el ncleo por lo que la sntesis de ARN se acopla con la sntesis de protenas (traduccin). - En eucariotas el material gentico se encuentra encerrado en el ncleo y debe salir de l para llegar al citoplasma donde tiene lugar la traduccin. Adems se llevan acabo modificaciones pre y post-traduccionales. En general, en primer lugar se sintetizan transitos primarios o pre-ARN. Despus estos transitos maduran por ribonucleoproteinas nucleares pequeas dando lugar a ARN maduros que pueden salir al citosol. En la mitocondria (procariota) se sintetizan nicamente 3 pre-ARN de los cuales se derivan 37 ARN maduros que se traducen cotranscripcionalmente. Son ARN que en su mayora sintetizan para protenas de los procesos enzimticos que tienen lugar a su interior; el resto de protenas las importan del citosol. Todo los pasos de la transcripcin estn muy regulados para que se mantenga un equilibrio: factores de transcripcin, moduladores El concepto de gen ha ido evolucionando a lo largo de las dcadas y se ha ido ampliando cada vez ms. Actualmente se acepta que un gen es una secuencia de ADN que codifica para una protenas incluyendo zonas que aunque no se transcriben a productos o protenas si participan en la regulacin de stas. La zona estructural y reguladora del gen no se pueden separar. Estas zonas reguladoras se llaman promotores y no tienen porque encontrarse cerca de la secuencia estructural que se transcribe. Sobre estas zonas reguladoras actan los factores de transcripcin (TF), habiendo algunos que aumentan la velocidad de la transcripcin y otros que la disminuyen. Se distinguen dos tipos de genes dependiendo de su producto final de sntesis: - Gen tipo I/III: son genes que se transcriben a ARN de productos gnicos que pueden ser protenas o no. - Gen tipo II: son genes que se transcriben a ARNm, es decir, ARN que se traduce a protenas. Las cadenas de ARN poseen en sus extremos una caperuza y una cola de poliadenila que son necesarios para la salida del ncleo y para la estabilidad de la molcula. Terminologa De la hebra que sirve de molde (35) se origina una hebra complementaria y antiparalela (53). Se conoce como hebra codificante a la otra hebra de ADN (la que no es molde; 53), es decir, una hebra igual al transcrito pero cambiando timina por uracilo. Hebra codificante = hebra no trasncrita = hebra informativa = hebra positiva

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El punto a partir de donde se inicia la transcripcin se conoce como +1. El nucletido anterior al +1 se llama -1. No existe el 0. - Hablamos de corriente abajo cuando leemos la secuencia en sentido 53, es decir, todo lo que hay por delante del inicio de la transcripcin. - Hablamos de corriente arriba cuando leemos la secuencia 35, es decir, del inicio de transcripcin para atrs. Las dos hebras de ADN portan informacin para la sntesis de transcritos. Hay genes que no comparten secuencias (genes no solapantes), mientras que hay algunos que si la comparten (genes solapantes) pero al leerse en sentido distinto van a dar a un producto tambin distinto. Existen 4 ARN-polimerasas en los humanos: - ARN-polimerasa II: sntesis de transcritos de mensajeros (pre-ARNm) que dan lugar a protenas - ARN-polimerasa I: origina un transcrito grande que da lugar a 3 de los 4 tipos de ARNr. - ARN-polimerasa III: da lugar al otro ARNr restante y a todos los ARNt. - ARN-polimerasa: da lugar a ARNm, ARNt y ARNr de las mitocondrias (y cloroplastos). Es la nica que compartimos con los procariotas. La ARN polimerasa I y la ARN polimerasa mitocondrial no se inhibe cuando se trata con cantidades de amanitina. La ARN-poli II tiene una fuerte inhibicin y la ARN-poli III tiene una dbil inhibicin.