Microsatlites Strs Definicin: Secuencias de DNA que se repiten una tras otra con una longitud de 2 a 6 pb.

Se encuentran en muc os eucariotes! cloroplastos " plantas. #ueden ser: $epetidos puros! compuestos e interrumpidos. %ualquier combinacin es posible. &os m's utili(ados son: Di! )ri " )etrant! %A " *A! *A)A " *A%A! los alelos son dados por amplificaciones en #%$ por migraciones elctroforeticas! " comparacin con patrones #+$,-. -SA$ S)$s/ 0 1. *ran n2mero de S)$s e3istentes. 0 2. *ran 4ariabilidad: #or el gran n2mero de alelos " la alta eterocigocidad. 0 5. &oci de S)$s est'n distribuidos en todo el genoma. 0 6. 7'cil interpretacin de resultados. No dudosos. 0 8. -so de #%$. 0 6. Muestras degradadas " antiguas. M9%$+SA):&9).S M;S -)9&9<AD+S %+M+ MA$%AD+$.S *.N:)9%+S S9S).MA + &+%-S 7*A )#+A A%## 715C %S71#+ 715A1 &#& )D+1 D16S85E D5S1F66 GHA D12S1IEI 7#S -N9DAD $.#.)9DA &+%A&9<A%9=N %$+M+S=M9%A >)))%? n 6q2@ >AA)*? n 2p25Bpter >AAA)? n 5q21Bqter AAA) 9q51Bq52.1 >A*A)? n 8q 55.5Bq56 >AAA)? n 6p26Bp28 >AAA? n @p22 >AA)*? n 11p 18.8 A*A) 16q26Bqter A*)) 5q26 >A*A)? n 12q 15.5Bq15.2 >)AA)? n 12q 12 >AAA)? n 18q28Bter

9N%+NG.N9.N).S %ambios o Mutaciones de No4o: B.3clusin de #rimer +rden: el supuesto iJo nposee un alelo ausente en padre " madre! o no se detecta ninguno de los alelos del ##! en etero(igosis. BDe segundo orden: ## e iJo omo(igotos para alelos distintos )asas de Mutacin! se debe tener en cuenta el n2mero de pasos

M9%$+SA).&9).S Definicin: Secuencias de DNA que se repiten una tras otra con una longitud de 2 a 6 pb. B&a tcnica que se utili(a es la e3traccin de DNA! #%$ " an'lisis por geles de secuenciamiento anali(ador autom'tico. GentaJas: B#oca cantidad de muestra! estabilidad " resistencia a la degradacin B$apide( " facilidad de interpretacin de los resultados BDisminucin de la posibilidad de error 9ncon4enientes: B%ontaminacin biolgica " falta de amplificacin. &os Microsatlites o Secuencias cortas repetidas >S)$s?! son secuencias de 2 a 6 pb! repetidas una a continuacin de otra! n 4eces! algunas 4eces este trmino se refiere a sondas sintticas repetidas en t'ndem capaces de detectar secuencias de Minisatlites. .sparcidas en todo el genoma " cada 18III pb. HISTORIA Y CARACTERISTICAS &os Microsatlites se detectaron en genomas eucariotes desde ace m's de 2I aKos! se an utili(ado en: a. #rogramas de mapeo b. .studio de la .structura *entica de las #oblaciones c. 9n4estigaciones de #arentesco BSon codominantes " se eredan con caracterLsticas mendelianas simples. BNeutrales. &a eterocigocidad promedio es del 8IM. )amaKo: precisin de un pb " los alelos son subsecuentemente caracteri(ados por el n2mero de repetidos en en el locus anali(ado. Distribucin: aleatoria! la densidad media dentro de las especies 4arLa pero a2n no se sabe las ra(ones de ello. Se an encontrado S)$s en regiones de ADN codificante. Se clasifican en tres familias: #uros: %A%A%A%A%A%A%A%A%A %ompuestos: %A%A%A%A*A*A*A*A 9nterrumpidos: %A%))%A%A%A))%A))%A %ualquier combinacin es posible! los S)$s mas utili(ados son aquellos cu"a secuencia central es de di! tri o tetrant. Son menos polimrficos los compuestos e interrumpidos. %aracterLsticas de los microsatlites mas estudiados. 1. $epetidos con secuencia central de dinucletidos

Mas utili(ados. Su densidad 4aria ampliamente en las especies. .n cada locus el n2mero de dinucletidos es generalmente menor de 5I. .n animales repetidos mas frecuentes son %A. .n plantas )A o *A. .l 28M de los loci son compuestos "No interrumpidos. 2. $epetidos con secuencia central de )rinucletidos .n plantas " animales. $elacin con enfermedades " c'nceres! dentro de e3ones! no rompen el marco de lectura. $epetidos *)* en la regin subtelomrica de los cromosomas umanos. .l n2mero de alelos " polimorfismo es similar a los dinucletidos. 5. $epetidos con secuencia central de )etranucletidos &a secuencia central mas com2n es *A)AN*A%A! en organismos superiores. .n el *D " del tomate se encuentran cerca a los centrmeros. $.A%%9+N .N %AD.NA D. &A #+&9M.$ASA >#%$? D.79N9%9+N: #rocedimiento por medio del cual se amplifica un segmento especLfico de DNA asta 1I@ 4eces. #$+%.D9M9.N)+ CAS9%+ B.quipo: Manual )ermociclador. B%omponentes de la $eaccin: +ligont! buffer! Taq DNA polimerasa! dN)#s! secuencias blanco. B#ar'metros de %iclamiento: )res temperaturas b'sicas: una de desnaturali(acin! alineamiento " e3tensin. Aplicaciones: *eneracin de secuencias especLficas utili(adas como sondas! *eneracin de sondas especLficas para genes no clonado! *eneracin de *enotecas de cDNA! *eneracin de grandes cantidades de DNA! An'lisis de mutaciones. GentaJas BMu" pequeKas cantidades de muestra B$apide( &imitacin BManipulacin )cnica o #rocedimiento por medio del cual se fabrican copias de fragmentos de ADN >*eneralmente asta 1I@ 4eces?. %oncebido por Oar" Mullis en 1E@5. 0 0 0 0 0 0 0 0 )res pasos: 1. Desnaturali(acin del DNA 2. Alineamiento de los #rimers o cebadores 5. .3tensin de los primers por la #olimerasa G.N)APAS 1. Amplificacin de ADN en indicios mu" pequeKos " afectados por procesos degradati4os " contaminantes. 2. 7acilidad de interpretacin de resultados 5 $apide(

6. Disminucin probabilidad de error

&9M9)A%9+N.S 0 1. %ontaminacin Ciolgica: %riminal o accidental! Manipulati4a! AnalLtica 0 2. No amplificacin del DNA