RNAs reguladores en bacterias Lauren S.

Aguas y Gisela Storz * Informacin Autor Informacin de copyright y licencia Abstracto Reguladores de ARN en bacterias son un grupo heterogneo de molculas que actan por diferentes mecanismos para modular una amplia gama de respuestas fisiolgicas.Una clase comprende riboswitches, que son partes de los ARNm que regulan. Estas secuencias lder se pliegan en estructuras susceptibles de cambios conformacionales a la unin de molculas pequeas. Por lo tanto Riboswitches detectar y responder a la disponibilidad de varios nutrientes en la clula. Otros transcripciones pequeas se unen a las protenas, entre ellos los reguladores globales, y antagonizan sus funciones. La mayor y ms ampliamente estudiado conjunto de pequeos ARN reguladores actan a travs de la base de sincronizacin con ARN, por lo general la modulacin de la traduccin y la estabilidad del ARNm. La mayora de estos pequeos RNAs de regular las respuestas a los cambios en las condiciones ambientales. Por ltimo, un grupo recientemente descubierto de los reguladores de ARN, conocida como los ARN de CRISPR, contiene regiones cortas de homologa con las secuencias de plsmido y bacterifago. RNAs CRISPR interfieren con la infeccin por bacterifagos y plsmidos de conjugacin apuntando el ADN homloga extranjera a travs de un mecanismo desconocido. Aqu hablamos de lo que se sabe acerca de estos reguladores de ARN, as como las muchas preguntas interesantes que quedan por abordar. Molculas de ARN que actan como reguladores eran conocidos en las bacterias durante aos antes de que se descubrieron los primeros microRNAs (miRNAs) y ARN corto de interferencia (siRNAs) en eucariotas. En 1981, los ~ 108 nucletidos de ARN que se encontr para bloquear la replicacin del plsmido ColE1 por apareamiento de bases con el RNA que se escinde para producir el iniciador de replicacin ( Stougaard et al, 1981. ; . Tomizawa et al, 1981 ).Este Trabajo FUE Seguido por El Descubrimiento 1983 de la ONU ~ 70 Nucletidos de ARN Que se transcribe a partir del promotor Pout del transposn Tn10 y vuelva a cebar la Transposicion MEDIANTE la Prevencin de la Traduccin del ARNm de la transposasa ( Simons y Kleckner, 1983 ). La Primera Pequea Regulador de ARN Codificada En El Cromosoma, s inform en 1984, FUE EL 174 Nucletidos de Escherichia coli MicF ARN, Lo Que inhibe L Traduccin del ARNm Que codificacin L membrana externa principal de porina OmpF ( Mizuno et al., 1984 ). Ests Primeros pequeos ARN Reguladores, y sin Puado de Otros, were identificados porcin Anlisis en gel debido un su abundancia, POR fenotipos Mltiples Copias, o Por casualidad (Revisado en ( Wassarman et al., 1999 )).

MIENTRAS Que algunos ARN Reguladores bacterianas were identificados desde el Principio, Su prevalencia y soste las Contribuciones a numerosas RESPUESTAS fisiolgicas no fuern inicialmente apreciados. En 2001-2002, cuatro Grupos informaron de la identification de MUCHOS soles pequeos RNAs a Travs de busquedas Sistemticas computacionales prrafo la Conservacin y El hurfano Secuencias promotoras terminadoras en Las REGIONES intergnicas de E. coli(Revisado en ( Livny y Waldor, 2007 )). ARNs ADICIONALES were descubiertos porcin deteccion directa utilizando Tcnicas de clonacin o microarrays basados en sondas en las REGIONES intergnicas (Revisado en ( Altuvia, 2007 )). Las Variaciones de ESTOS Enfoques, ayudados Por La disponibilidad Se de los muchas Nuevas Secuencias del genoma bacteriano, Han Llevado a la identification de los ARN reguladoras en la ONU Nmero Cada Vez Mayor de bacterias. Habilitado Por los Avances Tcnicos recientes, incluyendo busquedas computacionales MULTICAPA (Livny et al, 2008. ; . Weinberg et al, 2007 ), en el Fondo La Secuencia ( Sittka et al, 2008. ), y de microarrays de baldosas con Cobertura del genoma completo ( Landt. et al, 2008 ), Ya Se han del predicho cientos de genes Candidatos de ARN reguladoras de Diversas bacterias. En E. coli en solitario, ~ 80 Pequeas Transcripciones Han Sido verificadas, EL AUMENTO DEL NUMERO totales de genes identificados porcin Este Organismo en un 2%. En Esta revisin, nos centraremos nuestro de Anlisis en los pequeos RNAs de bacterias Que actuan Como Reguladores. Un Nmero Limitado de pequeos RNAs de Llevar a cabo Funciones de Mantenimiento Especficos, un sable, el Componente de ARN 4.5S de la partcula de Reconocimiento de Seal , la RNasa P ARN responsable del procesamiento de ARNt y Otros ARNs, y tmRNA, Que Acta Tanto Como un ARNt y ARNm prrafo etiquetar incompletamente traducido Protenas Para La degradacion y Liberar estancado ribosomas (Revisado en ( Holbrook, 2008 ;Kazantsev y Pace, 2006 , Moore y Sauer, 2007 .)) No Vamos A Hablar de Ests ARN MAS, un Pesar de Sus Acciones, Asi Como las de algunos tRNAs, pueden Tener Consecuencias reglamentarias. Ademas, algunas Caractersticas definitorias hijo Dignos de Mencin desde el Principio.Riboswitches hijo instancia de parte del ARNm Que Regulan, Por lo general, s encuentra Dentro de la regin 5 'no traducida (5'-UTR), y Por lo Tanto actuan en cis .La Mayora de los ARN Reguladores Que actuan en trans MEDIANTE el emparejamiento de bases con Otros ARN s sintetizan COMO Transcripciones Discretos con promotor Dedicado y Secuencias de terminacin. Teniendo en Cuenta Que El mas largo de ESTOS ARN, ARNIII de Staphylococcus aureus , es todavia SLO 514 Nucletidos (Revisado en ( Novick y Geisinger, 2008 )), Los ARN s denominan comnmente CoMo Pequeos RNAs (sRNAs). Nosotros preferimos el Trmino de "no codificante ARN", el Trmino USADO con Frecuencia en los eucariotas, ya Que las

Naciones Unidas, Nmero de los sRNAs, incluyendo RNAIII, tambien codifican Protenas. In Contraste Con Los sRNAs de apareamiento de bases, algunos sRNAs Que modulan L ACTIVIDAD DE LA PROTENA, ASI DE COMO LOS ARN de CRISPR s Procesan de Transcripciones Mas Largos. Ir a: Funciones reguladoras del ARN bacteriano ARNs Reguladores pueden modular la Transcripcin, la Traduccin, la Estabilidad del ARNm, y el Mantenimiento de ADN o El silenciamiento. Ellos Alcanzar Ests Resultados Diversos una Variedad de Mecanismos, incluyendo Cambios en la conformacin de unin de ARN, Protena, la base Travs De Una apareamiento con Otros ARN, y las Interacciones con el ADN. Riboswitches Tal vez los elementos reguladores de ARN ms simples bacterianas son secuencias en el extremo 5 'de los ARNm, o con menos frecuencia en el extremo 3', que pueden adoptar diferentes conformaciones en respuesta a seales ambientales, incluyendo estancado ribosomas, los tRNA no cargados, temperaturas elevadas, o una molcula pequea ligandos (revisado en ( Grundy y Henkin, 2006 )). Estos elementos fueron descritos por primera vez hace dcadas en estudios elegantes caracterizar la atenuacin transcripcin. En este proceso, estancado ribosomas conducen a cambios en la estructura de ARNm, que afecta a la transcripcin de elongacin a travs de la formacin de estructuras de terminacin o antiterminator en el ARNm. Estudios posteriores mostraron que las secuencias encontradas en las transcripciones que codifican ARNt sintetasas, denominado "Tboxes", se unen los tRNA no cargados correspondientes, y que otras secuencias lder, conocidos como "ARN termmetros", de plegado de una manera que es sensible a la temperatura. En ambos de estos casos, las estructuras alternativas conducen a cambios en la expresin del gen corriente abajo. Ms recientemente, se encontr que las secuencias lder pueden unirse a molculas pequeas y adoptar diferentes conformaciones en la presencia o ausencia de metabolitos (revisado en ( Mandal y Breaker, 2004 ; Montange y Batey, 2008 ; Nudler y Mironov, 2004 )). Estos sensores de metabolitos, denotado "riboswitches", regulan directamente los genes implicados en la absorcin y uso del metabolito. De hecho, en algunos casos, la presencia de un riboswitch aguas arriba de un gen no caracterizado o mal anotada ha ayudado a aclarar la funcin fisiolgica del producto gnico. Un nmero cada vez mayor y la variedad de riboswitches estn siendo identificados en bacterias, as como en algunos eucariotas. Por ejemplo, tantos como 2% de todos los genes de Bacillus subtilis estn regulados por riboswitches que se unen metabolitos

que van desde mononucletido de flavina (FMN) y pirofosfato de tiamina a Sadenosilmetionina, lisina y guanina. Riboswitches generalmente constan de dos partes: la regin del aptmero, que se une el ligando, y la llamada plataforma de expresin, que regula la expresin gnica a travs de estructuras de ARN alternativos que afectan a la transcripcin o traduccin (revisado en ( Mandal y Breaker, 2004 ; Montange y Batey , 2008 ; Nudler y Mironov, 2004 )) ( Figura 1A ). Tras la unin del ligando, la riboswitch cambia de conformacin. Estos cambios por lo general implican estructuras de horquilla alternativos que forman o interrumpen terminadores de la transcripcin o antiterminators, o que ocluir o exponer los sitios de unin a ribosomas ( Figura 1A ).En general, la mayora de riboswitches reprimen la transcripcin o la traduccin en presencia del ligando metabolito; slo unos pocos riboswitches que activan la expresin de genes se han caracterizado.

Figura 1 Acuerdo Gene y las funciones reguladoras del ARN reguladoras ligando y la protena de unin Debido a la naturaleza modular de riboswitches, el mismo dominio de aptmero puede mediar diferentes resultados reguladores o de operar a travs de mecanismos diferentes en diferentes contextos (revisado en ( Nudler y Mironov, 2004 )). Por ejemplo, la cobalamina riboswitch, que se une a la forma de la coenzima de la vitamina B 12, funciona mediante la terminacin de la transcripcin de los genesBTub en bacterias Gram-positivas, pero modula la iniciacin de la traduccin para los operones mazorca de las bacterias Gramnegativas. Algunas transcripciones llevan riboswitches tndem, que pueden integrar seales fisiolgicas distintas y una notable riboswitch, la secuencia lder glmS, aunque acta como una ribozima para catalizar la autodivisin. Tras la unin de su cofactor glucosamina-6-fosfato, la glmS riboswitch escinde en s y la inactiva el ARNm que codifica la enzima que genera la glucosamina-6-fosfato, por lo tanto efectuar un bucle de realimentacin negativo para los niveles de metabolitos ( Collins et al., 2007 ). En principio, riboswitches se podran utilizar en conjuncin con cualquier reaccin asociada con el ARN, no slo la transcripcin, la traduccin y el procesamiento del ARN, sino tambin la modificacin de ARN, la localizacin o corte y empalme. En general, los riboswitches en bacterias Gram-positivas afectan atenuacin transcripcional, mientras que los riboswitches en bacterias Gram-negativas con ms frecuencia inhiben la traduccin (revisado en ( Nudler y Mironov, 2004 )). Es posible que el uso preferente de terminacin de la transcripcin en los organismos Gram-positivas est relacionado con el hecho de que los genes

se agrupan en grandes operones biosintticos que se desperdicia ms recursos si se sintetiza la transcripcin de longitud completa. Organismos Gram-positivos tambin parecen confiar ms en riboswitches actan en cis que los organismos Gram-negativas, por las que se conocen los reguladores sRNA ms que actan en trans. Direcciones de investigacin llevadas a cabo en los estudios de los diferentes organismos, sin embargo, puede sesgar estas generalizaciones. sRNAs que modulan la actividad de la protena Tres sRNAs de unin a protenas tienen actividad intrnseca (RNasa P) o contribuyen funciones esenciales para una partcula de ribonucleoprotena (4.5S y tmRNA). En contraste, otros tres sRNAs de unin a protenas (CsrB, 6S, y GlmY) actuar de una manera reguladora a antagonizan las actividades de sus protenas afines al imitar las estructuras de otros cidos nucleicos ( Figura 1B ). Los ARN csrB y CSRC de E. coli modulan la actividad de Csra, una protena de unin al ARN que regula el uso de carbono y la motilidad bacteriana tras la entrada en fase estacionaria y otras condiciones pobres en nutrientes (revisado en ( Babitzke y Romeo, 2007 )). Csra dmeros se unen a motivos GGA en el 5 'UTR del ARNm diana, lo que afecta la estabilidad y / o la traduccin del ARNm. El CsrB y RNAs CSRC cada uno contienen mltiples sitios de unin GGA, 22 y 13 respectivamente, para CSRA. As, cuando CsrB y CSRC aumentan los niveles, los sRNAs secuestran eficazmente la protena Csra lejos de los lderes de ARNm. La transcripcin de los genes y la csrB csrCes inducida por el Bara-UvrB de dos componentes reguladores cuando las clulas se encuentran con condiciones de crecimiento pobres en nutrientes, aunque no se conoce la seal para esta induccin. El CsrB y ARN CSRC tambin estn regulados a nivel de la estabilidad a travs de la protena DREG, una protena de unin di-GMP cclico, que recluta RNasa E para degradar la sRNAs ( Suzuki et al., 2006 ). Se ha encontrado que csrB y CSRC homlogos (tales como RsmY y RsmZ) para antagonizar las actividades de homlogos Csra en una gama de bacterias incluyendo Salmonella, Erwinia, Pseudomonas, Vibrio y donde impacto metabolismo secundario, la deteccin de qurum y la invasin de clulas epiteliales (revisado en ( Lapouge et al, 2008. ; . Lucchetti-Miganeh et al, 2008 )). La E. coli 6S ARN imita un promotor abierto para unirse a y secuestrar la ARN polimerasa que contiene 70 (revisado en ( Wassarman, 2007 )). Cuando 6S es abundante, especialmente en la fase estacionaria, que es capaz de complejo con gran parte de la -70 unido, forma de limpieza de la ARN polimerasa, pero no est asociado con la forma S-enlazado, fase estacionaria de la ARN polimerasa ( Trotochaud y Wassarman, 2005 ). La interaccin entre 6S y 70holoenzima inhibe la transcripcin a partir de cierta 70 promotores y la transcripcin de algunos aumentos Spromotores regulados, en parte,

mediante la alteracin de la competencia entre -70 y unin a los promotores de S-holoenzima. Curiosamente, el ARN 6S puede servir como una plantilla para la transcripcin de ARN de productos 14-20 nucletidos (pRNAs) por ARN polimerasa, especialmente durante consecuencia de la fase estacionaria ( Gildehaus et al, 2007. ; Wassarman y Saecker, 2006 ). De hecho, se piensa que la transcripcin a partir 6S cuando aumentan las concentraciones de NTP puede ser una manera de liberar 70-ARN polimerasa ( Wassarman y Saecker, 2006). No se sabe si las propias pRNAs tienen una funcin. El RNA 6S se procesa de una transcripcin ms tiempo y se acumula durante la fase estacionaria, pero los detalles de este reglamento no se han dilucidado (revisado en ( Wassarman, 2007 )). Hay mltiples homlogos 6S en una serie de organismos, incluyendo dos en B. subtilis (Trotochaud y Wassarman, 2005 ). Las funciones de estos homlogos de nuevo no se conocen, pero es tentador especular que inhiben la actividad de alternativa formas de factor de RNA polimerasa. Una sRNA adicional, GlmY, se ha propuesto recientemente para tener un modo de unin a protenas de la accin y est pensado para funcionar con titulacin de un factor de procesamiento de ARN de distancia de una homloga sRNA, GlmZ (revisado en ( Grke y Vogel, 2008 )). Tanto GlmZ y GlmY promover la acumulacin de la sintasa GlmS glucosamina-6-fosfato, sin embargo lo hacen por mecanismos distintos.Los GlmZ ARN pares de bases de longitud total y activa con la traduccin del ARNmglmS. Aunque el ARN GlmY es altamente homloga a GlmZ en secuencia y estructura secundaria predicha, GlmY carece de la regin que es complementaria a la diana de ARNm glmS y no activa directamente traduccin glmS. En cambio, la expresin GlmY inhibe un evento de procesamiento GlmZ que hace GlmZ incapaz de activar traduccin glmS. Aunque todava no est demostrado de forma concluyente, GlmY ms probable es que estabiliza la GlmZ de longitud completa por competir con GlmZ para la unin a la protena que se dirige a YhbJ GlmZ para su procesamiento.El RNA GlmY tambin se procesa y sus niveles estn regulados negativamente por poliadenilacin ( Reichenbach et al, 2008. ; Urbana y Vogel, 2008 ). CsrB RNA simula un elemento ARNm, 6S imita la estructura del ADN, y GlmY imita otro sRNA, planteando la cuestin de qu otras molculas de cido nucleico o sRNAs lo contrario, sin embargo, podra no caracterizados imitan? Cis-codificados sRNAs apareamiento de bases En contraste con las pocas sRNAs de unin a protenas conocidas, la mayora de los sRNAs caracterizados regulan la expresin gnica mediante apareamiento de bases con el ARNm y se dividen en dos clases generales: los que tienen un gran potencial para el emparejamiento de bases con su diana de ARN ( Figura 2A ) y los que tienen complementariedad ms limitado ( Figura 2B ). Primero nos centraremos en sRNAs que estn codificados en cis en la

cadena de ADN opuesta al ARN diana y regiones extendidas de las acciones de complementariedad completa con su objetivo, a menudo 75 nucletidos o ms ( Figura 2A ) (revisado en ( Brantl de 2007 , Wagner et al ., 2002)). Mientras que las dos transcripciones estn codificados en la misma regin de ADN, que se transcriben a partir de hebras opuestas como especies de ARN y la funcin discreta en trans como molculas difusibles. Para los pocos casos en los que se ha examinado la interaccin inicial entre el sRNA y ARN objetivo implica slo el emparejamiento limitada, aunque el duplex posteriormente se puede ampliar. Los ejemplos mejor estudiados de la sRNAs cis-antisentido codificados residen en plsmidos u otros elementos genticos mviles, se encuentran cada vez versiones sin embargo cromosmicas de estos sRNAs.

La figura 2 Acuerdo Gene y las funciones reguladoras de la base de sincronizacin RNAs reguladores La mayora de los sRNAs antisentido cis-codificados expresadas a partir de bacterifagos, plsmidos y transposones funcin para mantener el nmero de copias apropiada del elemento mvil (revisado en ( Brantl, 2007 ; . Wagner et al, 2002 )).Esto lo logran a travs de una variedad de mecanismos, incluyendo la inhibicin de la formacin de imprimacin replicacin y traduccin transposasa, como se ha mencionado para el plsmido ColE1 ARN I y Tn10 ARN Pout, respectivamente. Otro acto grupo comn como antitoxinas para reprimir la traduccin de protenas txicas que matan clulas de las que se ha perdido el elemento mvil. En general, las funciones fisiolgicas de los sRNAs antisentido ciscodificadosexpresadas a partir de los cromosomas bacterianos son menos bien entendidos. Un subconjunto promover la degradacin y / o reprimen la traduccin de los ARNm que codifican protenas que son txicas en niveles altos (revisado en ( Fozo et al, 2008a. ;Gerdes y Wagner, 2007 )). En E. coli, tambin hay dos sRNAs, Istr y OHSC, que se codifican directamente adyacente a los genes que codifican protenas potencialmente txicas. Aunque estos sRNAs no son verdaderos ARN antisentido, que no contienen regiones extendidas de complementariedad perfecta (19 y 23 nucletidos) con los mRNAs de toxina. Curiosamente, la mayor parte de estos sRNAs parecen estar expresado constitutivamente. Algunos de los sRNAs antitoxina cromosmicas son homlogas a sRNAs antitoxina plsmido (por ejemplo, los loci Hok / Sok presentes en el cromosoma de E. coli) o estn

situados en regiones adquiridos a partir de elementos mviles (por ejemplo, los ARN Rata de B. subtilis encontraron en un remanente de un profago crptico). Estas observaciones indican que la antitoxina sRNA y genes de la toxina correspondientes podran haber sido adquiridos por transferencia horizontal.Las versiones cromosmicas pueden ser simplemente restos no funcionales. Sin embargo, algunos sRNAs antitoxina antisentido ciscodificados no tienen homlogos conocidos en elementos mviles. Adems, dado que las bacterias tienen mltiples copias de varios loci, todos los cuales se expresan en los casos examinados, es tentador especular que la antitoxina protenas sRNAs-toxina codificada en el cromosoma proporcionan funciones beneficiosas ( Fozo et al., 2008b ) . A pesar de los altos niveles de las toxinas matan a las clulas, los niveles ms moderados producidos a partir de los loci de una sola copia en condiciones de induccin slo pueden retrasar el crecimiento.Por lo tanto un modelo propone que los mdulos de la toxinaantitoxina cromosmicas inducen el crecimiento lento o estasis en condiciones de estrs para permitir que las clulas tiempo para reparar los daos o de otra manera adaptarse a su entorno ( Kawano et al, 2007. ; Unoson y Wagner, 2008 ). Otra posibilidad es que ciertos mdulos pueden ser retenidos en cromosomas bacterianos como una defensa contra los plsmidos que llevan homloga mdulos, suponiendo que el sRNA antisentido cromosmica puede reprimir la expresin de la toxina codificada por plsmidos. Otro grupo de sRNAs cis-codificados antisentido modula la expresin de genes en un opern. Algunos de estos sRNAs se codifican en regiones complementarias a la secuencia de intervencin entre los ORFs ( Figura 2A ). Por ejemplo, en E. coli, el apareamiento de bases entre la fase estacionaria inducida Gady antisentido sRNA y el ARNm gadXW conduce a la escisin del dplex entre los genes y GadX gadW y el aumento de los niveles de una transcripcin GadX ( Opdyke et al, 2004. ; . Tramonti et al, 2008 ). Para el plsmido de virulencia pJM1 de Vibrio anguillarum, la interaccin entre el RNA sRNA antisentido y el ARNm fatDCBAangRT conduce a la terminacin de la transcripcin despus de que el gen Fata, reduciendo de este modo la expresin de los genes aguas abajo angRT ( cigea et al., 2007 ). En Synechocystis,el hierro-estrs reprimidos ISRR antisentido sRNA pares de bases con secuencias dentro de la regin de codificacin Isia de la transcripcin isiAB y conduce a la disminucin de los niveles de una transcripcin Isia ( Dhring et al., 2006 ). En este caso, no se sabe si la expresin ISIB tambin se ve afectada. La lista de sRNAs cis-antisentido codificados est lejos de ser completa, sobre todo para las versiones cromosmicas y otros mecanismos de accin estn seguros de ser encontrado. Trans-codificados sRNAs apareamiento de bases

Otra clase de sRNAs de apareamiento de bases es la sRNAs transcodificados, que, en contraste con los sRNAs cis-antisentido codificados, slo comparten complementariedad limitada con sus ARNm diana. Estos sRNAs regulan la traduccin y / o la estabilidad de los ARNm diana y son, en muchos aspectos, funcionalmente anloga a miRNAs eucariotas (revisado en ( Aiba, 2007 ; Gottesman, 2005 )). La mayor parte de la regulacin por parte de las conocidas sRNAs transcodificacines negativo (revisado en ( Aiba, 2007 ; Gottesman, 2005 )). El apareamiento de bases entre el sRNA y su ARNm diana por lo general conduce a la represin de los niveles de protena a travs de inhibicin de la traduccin, la degradacin del ARNm, o ambos ( Figura 2B ). Las bacterias sRNAs caracterizado hasta la fecha se unen principalmente a la 5 'UTR del ARNm y ms a menudo ocluir el sitio de unin a ribosoma, aunque algunos sRNAs tales como GcvB y RyhB inhiben la traduccin a travs de apareamiento de bases aguas arriba lejos de el AUG del gen reprimido ( Sharma y col ., 2007 ; Veerek et al, 2007. ). El dplex sRNA-ARNm es entonces frecuentemente sujetos a la degradacin por RNasa E. Para las pocas interacciones sRNA de ARNm caracterizado, la inhibicin de la unin a ribosomas es el principal contribuyente a la reduccin de los niveles de protena, mientras que se cree que la posterior degradacin de los dplex sRNA ARNm para aumentar la robustez de la represin y hacer que la regulacin irreversibles ( Morita et al., 2006 ). Sin embargo, sRNAs tambin pueden activar la expresin de los ARNm diana a travs de un mecanismo antiantisentido mediante el cual el apareamiento de bases del sRNA interrumpe una estructura secundaria inhibidor que secuestra el sitio de unin al ribosoma (( Hammer y Bassler, 2007 ; Prvost et al, 2007. ; Urbana y Vogel, 2008 ) y revisado en ( Gottesman, 2005 ;. Prvost et al, 2007 )) ( Figura 2B ). Tericamente, el apareamiento de bases entre un sRNA transcodificado y su objetivo podra promover la terminacin de la transcripcin o antitermination, como se ha encontrado para algunos sRNAs cis-codificados, o alterar la estabilidad del ARNm a travs de cambios en poli-adenilacin. Para sRNAs trans-codificados, hay poca correlacin entre la localizacin cromosmica del gen y el gen sRNA ARNm diana. De hecho, cada uno sRNA trans-codificadostpicamente pares de bases con mltiples ARNm (revisado en ( Gottesman, 2005 ; . Prvost et al, 2007 )). La capacidad para mltiples interacciones de emparejamiento de bases resulta del hecho de que sRNAs trans-codificados hacen contactos ms limitados con sus ARNm diana en parches discontinuos, en lugar de tramos largos de la complementariedad perfecta, como para sRNAs cis-antisentido codificados. La regin del potencial de apareamiento de bases entre sRNAs trans-codificados y mRNAs objetivo general abarca ~ 10-25 nucletidos, pero en todos los casos en los que se ha examinado slo un ncleo de los nucletidos parecen ser crticas para la regulacin. Por ejemplo, aunque el SgrS sRNA tiene el potencial para formar

23 pares de bases con el ARNm ptsG travs de un tramo de 32 nucletidos, slo cuatro mutaciones individuales en SgrS significativamente afectada downregulation de ptsG (Kawamoto et al., 2006 ). En muchos casos, el ARN chapern Hfq es requerido para transcodificada regulacin sRNA mediada, presumiblemente para facilitar las interacciones ARN-ARN debido a la complementariedad limitado entre el sRNA y ARNm diana (revisado en ( Aiba, 2007 ; Brennan y Link, 2007 ; ValentinHansen et al., 2004 )). El anillo de Hfq hexamrica, que es homloga a las protenas Sm y Sm-como involucrados en el empalme y la decadencia ARNm en eucariotas, puede remodelar activamente los ARN para fundir estructuras secundarias inhibitorios. Hfq tambin puede servir pasivamente como una plataforma para permitir sRNAs y mRNAs para muestrear potencial de complementariedad, el aumento efectivo de las concentraciones locales de sRNAs y mRNAs. Cabe sealar que cuando el E. coli SgrS ARN se prerecocido con el ARNm ptsG in vitro, la protena Hfq ya no es requerida ( Maki et al., 2008 ). Sin embargo, in vivo en E. coli, sRNAs no regular sus mRNAs diana en cepas mutanteshfq y todos sRNAs base de sincronizacin transcodificados examinados hasta la fecha co-inmunoprecipitacin con Hfq. De hecho, el enriquecimiento de sRNAs de co-inmunoprecipitacin con Hfq result ser un enfoque fructfero para identificar y validar nuevos sRNAs en E. coli ( Zhang et al., 2003 ) y se ha extendido a otras bacterias, como S. typhimurium ( Sittka et al., 2008 ). Ms all de facilitar el apareamiento de bases, Hfq contribuye a Srna regulacin a travs de los niveles sRNA modulacin (revisado en ( Aiba, 2007 , Brennan y Link, 2007 ; . Valentin-Hansen et al, 2004 )). Algo contra de la intuicin, la mayor parte E.sRNAs coli son menos estables en ausencia de Hfq, presumiblemente porque Hfq sRNAs protege de la degradacin en ausencia de apareamiento de bases con el ARNm.Una vez que la base se combina con los ARNm diana, muchos de los pares sRNA mRNA conocidos estn sujetos a la degradacin por RNasa E, y Hfq tambin puede servir para reclutar ARN degradacin de la maquinaria a travs de sus interacciones con RNasa E y otros componentes de la degradosome. Adems, la competencia entre sRNAs para la unin a Hfq puede ser un factor de control de la actividad sRNA in vivo. A pesar de todo E. caracterizado coli sRNAs trans-codificados requieren Hfq para la regulacin de sus objetivos, la necesidad de un chapern ARN no puede ser universal.Por ejemplo, vrrA RNA represin de la expresin de la protena OmpA en V. choleraeno se elimina en las clulas mutantes hfq, aunque el alcance de la represin es mayor en las clulas que expresan Hfq ( Song et al., 2008 ). En general, los tramos ms largos de la base de sincronizacin, como es el caso de los sRNAs cisantisentidocodificados que normalmente no requieren Hfq para la funcin y / o altas concentraciones de la sRNA puede obviar el requisito de chapern.

En contraste con sRNAs cis-codificados, varios de los cuales se expresan constitutivamente, la mayor parte de los sRNAs trans-codificados se sintetizan bajo condiciones de crecimiento muy especficas. En E. coli, por ejemplo, estos RNAs reguladores son inducidas por deficiencia de hierro (fur-reprimida RyhB), el estrs oxidativo (OxyS OxyR activados), el estrs de membrana externa ( E inducida mica y RybB), elevacin de glicina (GcvA inducida GcvB), cambios en la concentracin de glucosa (PCR-reprimida Spot42 y CRPactivado CyaR), y los niveles de glucosa-fosfato elevadas (SgrS SgrRactivados) (( De Lay y Gottesman, 2008 ; Johansen et al, 2008. ; Urbanowski et al, 2000. ) y revisado en ( Grke y Vogel, 2008 ; Gottesman, 2005 )). De hecho, es posible que cada factor de transcripcin importante en E. colipueden controlar la expresin de uno o ms reguladores sRNA. Tambin es digno de mencin que un nmero de los sRNAs se codifican adyacente al gen que codifica su regulador de la transcripcin, incluyendo E. coli OxyR-Oxys, GcvAGcvB y SgrR-SgrS. El Hecho de Que sin sRNA la base de sincronizacion zcalo regula una Menudo Mltiples Objetivos significa Que Un Solo sRNA Florerias modular Una Respuesta fisiolgica a Nivel Mundial en concreto, en Mucho La Misma Manera Que sin factores de transcripcin, Pero en el Nivel post-transcripcional ( Revisado en ( Bejerano-Sagie y Xavier, 2007 ; Mass et al, 2007. ; . ValentinHansen et al, 2007 ).) Efectos Reguladores bien caracterizados de Ests sRNAs INCLUYEN L REGULACION A La Baja de Cluster hierro-azufre Que Contiene Enzimas Bajo las Condiciones de Bajo Contenido de hierro ( E. coli RyhB) La represin de las Protenas de membrana externa porin en Condiciones de Estrs membrana ( E. coli mica y RybB) y La represin de la deteccion de qurum de baja densidad celular ( Vibrio Qrr). El Hecho De que la Regulacin de la Retroalimentacin negativa directa o Indirecta, s la observacin de las Naciones Unidas, Nmero de sRNAs DESTACA Que sRNAs s Integran en circuitos de Regulacin. En E. coli , POR EJEMPLO, RyhB es reprimida CUANDO SE el hierro libera despues RyhB down-regula Enzimas hierro-azufre (Mass et al., 2005 ), y la mica y rybB hijo reprimidos CUANDO el Estrs de membrana s alivia un su baja Regulacin de porinas de membrana externa (Johansen et al, 2006. , . Thompson et al, 2007 ). Como Otro EJEMPLO, la Qrr sRNAs en Vibrio par de bases con e inhiben la Expresin de los ARNm Que codifican los FACTORES de transcripcin Responsables de la activation Los de Qrr genes (Svenningsen et al, 2008. ; . Tu et al, 2008 ). RNAs CRISPR Una Clase nica de ARN Reguladores recientemente descubiertos hijo los RNAs CRISPR, Que proporcionan Resistencia a los bacterifagos (Revisado en ( Sorek et al., 2008 )) y Evitar plsmido conjugacin ( Marraffini y Sontheimer, 2008 ). Sistemas CRISPR comparten ciertas similitudes con el

silenciamiento de genes eucariotas siRNA-conducido, a Pesar de Que Presentan Caractersticas Distintas, asi, y sin presentar nuevo y excitante campo de la Investigacin de ARN. Las Secuencias de CRISPR s de han encontrado en ~ 40% de las bacterias y ~ 90% de las arqueas secuenciado Hasta la Fecha ( Sorek et al., 2008 ), Haciendo Hincapi en la importancia de Gran Alcance. Secuencias CRISPR ( C lustered R egularly I nterspaced S hort P alindromic Repeats) hijo REGIONES de ADN Altamente variables de consistencia Que En Una Secuencia de 550 pb ~ Lder Seguido Por Una serie de unidades de repeticinespaciador ( Figura 3 ) (Revisado en ( Sorek et al., 2008 )). El ADN Repetido Florerias Variar from 24 Hasta 47 pares de bases, Pero La Misma Secuencia de repeticin Por lo general, aparece en Cada Unidad De Una matriz de CRISPR dado, y s Repite dos veces a 249. Las Secuencias de repeticin difieren de forma Significativa Entre las bacterias, Pero s pueden AGRUPAR es 12 Tipos Principales ya el menudo contienen Una base de corta 5-7 par palndromo. A Diferencia de Otras Secuencias repetidas en los cromosomas bacterianos, los CRISPR Se encuentran repartidas Regularmente con separadores nicas de 26 a 72 pares de bases, ESTOS Separadores No Se repiten habitualmente En Una Matriz de CRISPR zcalo. Aunque Las Repeticiones pueden servi Similares empre Las Especies, los espaciadores Entre las Repeticiones No Se conservan en Absoluto, un Menudo inclus Entre Diferentes cepas , y s encuentran Ms a Menudo prr servicios homlogos al ADN de fagos y plsmidos, Una Observacion Que FUE inicialmente desconcertante.

Figura 3 Acuerdo Gene y las Funciones reguladoras del ARN CRISPR Al lado de La Matriz de ADN CRISPR hijo VARIOS CRISPR-Asociado (CAS) genes (Revisado en ( Sorek et al., 2008 )). Dos a Seis genes Principales CAS parecen Estar Asociados con la Mayora de los Sistemas de CRISPR, Pero Diferentes SubTipos de CRISPR TAMBIEN TENER genes Especficos CAS codificados en La Regin flanqueante. Otros genes CAS, Que Nunca estan presentes en cepas Que CARECEN de las Repeticiones, s pueden ENCONTRAR en Lugares del genoma Distantes de la regin CRISPR (s). Las Funciones Moleculares de las Protenas CAS hijo en do alcalde instancia de parte oscura, Pero el menudo contienen una Dominios de ARN o ADN Vinculante, Motivos helicasa yo endo-Dominios exonucleasa.

Despues de Que el Informe Inicial de Secuencias de CRISPR en 1989, Varias hiptesis were different Avanzadas en Cuanto a las Posibles Funciones de ESTAS Repeticiones (Revisado en ( Sorek et al., 2008 ).) La propuesta de Que CRISPRs confieren Resistencia a los fagos s produj es 2005 Con Los Resultados Que los espaciadores el menudo contienen homologa con fagos o plsmidos. Otro avance Importante FUE El Descubrimiento De que las matrices de ADN de CRISPR s transcriben en bacterias (Brouns et al, 2008. ) y arqueas ( Tang et al , 2002. ; . Tang et al, 2005 ). La larga DURACIN de CRISPR de ARN inicialmente se Extiende la Longitud de Toda la matriz, Pero posteriormente SE PROCESA en Fragmentos Ms cortos del tamano de Una Sola Unidad de repeticin-espaciador. Recientemente, s demostro de Me E. coliK12 Protenas Casa-e se asocian prr Formar Una cascada denominada Complejo deC RISPR- Como Asociado C omplex de A ntiviral De Fensa ( Brouns et al., 2008 ). La protein Caso Dentro de la cascada Compleja es responsable del procesamiento de los de larga DURACIN ARN transcrito CRISPR. Es Importante destacar Que, s demostro Que Los Nuevos espaciadores correspondientes a las Secuencias de fagos estan Integrados en matrices de CRISPR existentes Durante la Infeccin del fago Y Que ESTOS Nuevos espaciadores confieren Resistencia a las Infecciones Posteriores con el fago afn, o de Otro fago Que lleva la Misma Secuencia ( Barrangou et al., 2007 ). Los Nuevos espaciadores s insertan al Principio de la matriz, de tal Manera Que el Extremo 5 'de la regin hipervariable de CRISPR es de Entre cepas y Transmite Informacin Sobre los mas recientes Infecciones de fagos, MIENTRAS Que el 3 'Separadores apoteosis hijo Consecuencias De Las Infecciones Mas Antiguas. Mutaciones puntuales de la ONU solo nucletido en los espaciadores bacterianas o el genoma del fago abolir Resistencia a los fagos y, AUN Ms, la Introduccin de Nuevas Secuencias de fagos de Como espaciadores de CRISPR en matrices de ingeniera de novo proporciona inmunidad a las bacterias Que Nunca s de han encontrado con this fago. Similares Observaciones were Hechas recientemente porcin espaciadores Encontrados prr corresponder a Secuencias presentes en plsmidos de conjugacin ( Marraffini y Sontheimer, 2008 ). Ests hallazgos, junto con la Observacion De que algunos genes codifican CAS Protenas con Funciones potencialmente anlogos a las Enzimas eucariotas RNAi (Makarova et al., 2006 ), de han conducido un Modelo de Naciones Unidas Para La Funcin del ARN de CRISPR ( Figura 3 ). La matriz de ADN de CRISPR s transcribe en ARN sin largo, Que es procesada por El Complejo de Protenas de la cascada de CAS en Una Sola Unidad de repeticin-espaciador Conocido Como un crRNA ( Brouns et al., 2008 ). Los crRNAs, Que hijo de Cadena sencilla una Diferencia de siRNAs de doble Cadena, s retienen en el Complejo Cascade ( Brouns et al., 2008 ). Por Analoga con los Sistemas eucariotas RNAi, Cascade u Otras Protenas efectoras CAS Florerias

'entonces' Dirigir el apareamiento de bases de la Secuencia de espaciador crRNA con el fago o plsmido dianas de cido nucleico. Hasta HACE Poco, no sabia si s los crRNAs estarian dirigidos a ADN o ARN, Pero espaciadores de CRISPR generados a partir de embajado cadenas de genes del fago Florerias conferir Resistencia a los fagos efectivamente ( Barrangou et al, 2007. ; . Brouns et al, 2008 ). Ademas, la Insercin de la ONU intrn en el ADN del gen diana en la ONU plsmido conjugativo Suprime la interferencia porcin crRNAs, un Pesar de Que la Secuencia diana ininterrumpida s regeneracin en el ARNm empalmado ( Marraffini y Sontheimer, 2008 ). Resultados Ests apuntan a ADN COMO Objetivo directo, Pero como los crRNAs interactan con el ADN y Lo Que ocurre posteriormente AUN SE desconocen. Otros Estudios Relacionados con los Detalles de los Mecanismos Moleculares Detrs de CRISPR RNA mediada "silenciamiento" de ADN extrao y Como. Los Nuevos espaciadores s seleccionan y LUEGO ADQUIRIDA s Esperan con Inters y proporcionar Una alcaldesa Comprensin de las similitudes y Diferencias con la maquinaria RNAi eucariota. El Sistema de CRISPR Tiene Amplias implications evolutivas. La extrema variabilidad de las matrices de CRISPR Entre Organismos e inclus cepas de la Misma espcie proporciona Herramientas tiles Para Los Investigadores un genotipo de las cepas y el prrafo Estudiar la Transferencia horizontal de genes y micro-Evolucin ( Revisado en ( Sorec et al., 2008 )). Los loci CRISPR grabar La historia de Infeccin Reciente fago y permiten la diferenciacin Entre cepas de la Misma espcie. This Propiedad Se Puede utilizar el prrafo IDENTIFICAR las cepas bacterianas patgenas y pista de Progresin de la Enfermedad en TODO EL MUNDO, AS COMO prr monitorear la Dinmica de Poblaciones de bacterias no patgenas ( Horvath et al., 2008 ). Ademas, la Presencia de Secuencias de fago Dentro de las matrices de CRISPR Que confieren Resistencia Frente a la Infeccin proporciona Una Fuerte pressure selectiva Para La mutacin de los genomas de fagos y Puede Ser la base de parcialmente la TASA de mutacin fago Rpida ( Andersson y Banfield, 2008 ). RNAs de dobles Funcin Las Distinciones Entre algunas de las Categorias de ARN Reguladores discutidos anteriormente, la ASI COMO Entre los Reguladores de ARN y Otros ARNs pueden servi borrosa. Por EJEMPLO, algunas de las trans -codificados sRNAs de apareamiento de bases codifican proteinas ademas de apareamiento de bases con el ARNm diana. El S. aureus ARNIII s ha demostrado Que el par de bases con mRNAs Que codifican FACTORES de virulencia ONU factores de transcripcin ( Boisset et al., 2007 ), SINO QUE TAMBIEN codificacin ONU pptido de -hemolisina de 26 Aminocidos. Del Mismo Modo, la E. coli SgrS ARN, Que bloquea la Traduccin de laptsG ARNm Que codificacin sin transportador de azcar-fosfato, s difaman prrafo Producir la protein SgrT aminocido 43 ( Wadler y Vanderpool, 2007 ). En Este

Caso, s cree Que la protein SgrT prrafo reforzar la Regulacin ejercida porcin SgrS de forma independiente Por La Regulacin negativa de la Absorcin de glucosa a Travs de la inhibicin directa o Indirecta de la protein PTSG. Prevemos Que se encontraran Otros sRNAs reguladoras prrafo codificar Protenas Pequeas y Que a la inversa algunos mRNAs Que codifican proteinas Pequeas s Encontro Que Tienen FUNCIONES ADICIONALES DE COMO Reguladores sRNA. TAMBIEN MERECE UNA Mencin Que algunos de los cis sRNAs codificados antisentido, ademas de ordinario do mRNA SENTIDO afn, Florerias basar la par con Otros ARNm MEDIANTE la complementariedad o limitada, es de Los papeles Independientes, las Protenas s Unen a afectar a Otras Funciones. Del Mismo Modo, MIENTRAS Que riboswitches s sintetizan Como instancia de parte de la ONU ARNm, los pequeos Transcripciones Que se generan Por La Transcripcin de atenuacin o autoescisin potencialmente podria SEGUIR prr realizar Otras Funciones COMO SUS Propias Entidades. FACTORES Que influyen en el reglamento por El ARN De Si bien ha habido UNA GRAN EXPLOSIN En El Descubrim iento Caracterizacin de ARN Reguladores de bao LOS ULTIMOS DIEZ Jahr, Una serie de criticas Tienes dudas? About suspensin Mecanismos de Regulacin Aun No Se Han Contestado. Las Estructuras de ARN, Niveles y Localizacin Cuales hijo las Estructuras de los RNAs y Como hacer Que El impacto Ligando, L proteina ARNm Vinculante? Estructuras tridimensionales prrafo VARIOS riboswitches, Tanto en la Presencia y Ausencia de Sus respectivos ligandos, s han de RESUELTO bao LOS ULTIMOS Jahr ( Montange y Batey , 2008 ). Ests Estudios de han demostrado Que algunos riboswitches TIENEN UN Bolsillo simple, LOCALIZADA de unin al Ligando. En ESTOS Casos, los Cambios conformacionales inducidos Por La unin de Ligando s limitan a Una Pequea regin. En Otras riboswitches, El Sitio de unin al Ligando no est Compuesto de al Menos dos sitios distintos, de tal Manera Que los Resultados de unin de un Ligando en los Ms Cambios sustanciales en la Estructura terciaria global. En contraste, no heno Estructuras tridimensionales s Han RESUELTO prrafo sRNAs bacterianas. De Hecho, las Estructuras secundarias prr Solo Un Nmero Limitado de sRNAs s de han investigado experimentalmente. Otra CANTIDAD generalmente Desconocida, Que Tiene implications Importantes prr Como un ARN interacta con Otras Molculas, es la Concentracin del ARN. despues de la induccin, el ARN OxyS s ha Estimado una Estar presentes en 4.500 Molculas porcin clula ( Altuvia et al., 1997), Pero no se sabe si ESTO es tpico de Otros sRNAs y si TODAS las Molculas de sRNA Estan Activos. Hacer, modificaciones en Nucletidos o de unin de metabolitos Alteran la abundancia o Actividades de CUALQUIERA de

los sRNAs? Also es intrigante prrafo Preguntar si algno de los ARN reguladoras muestran la Localizacin subcelular Especfica o inclus s secretan. En eucariotas, la Localizacin de los ARN reguladoras de las Estructuras subcelulares Especficos, cuentos de Como P rganos y Organismos Cajal , no est Conectado a Funciones sus (Revisado en ( Pontes y Pikaard, 2008 )). Es verosmil de Me Localizacin subcelular de Manera similares afecta la Funcin Regulador del ARN en bacterias. En Apoyo of this idea, RNasa E s ha encontrado prrafo obligar a las membranas in vitro ( Khemici et al., 2008 ), y la Orientacin de membrana de la ptsG s Requiere ARNm-protein Codificada prrafo SgrS Eficiente sRNA La represin of this Transcripcin ( Kawamoto et al., 2005 ).Otra atractiva, Pero no probado, la hiptesis es Que los ARN bacterianas pueden servi secretadas En Una clula huesped Donde s podrian modular Funciones de las Clulas eucariotas. Protenas implicadas Que proteinas s asocian concentraciones RNAs Reguladores y las Protenas de Como afectan las Acciones de los ARN? Hasta Ahora, Gran instancia de parte de la atencion s ha Centrado En La chaperona de ARN. Hfq de Aun Asi, Los Detalles de como esta proteina s une a sRNAs e de Impactos Que SUS FUNCIONES hay Claras hijo. Por EJEMPLO, los Estudios Estructurales y Mutaciones Indican Que Ambas caras de la rosquilla Hfq hexamer pueden HACER Contactos con el ARN (Revisado en ( Aiba, 2007 , Brennan y Link, 2007 )), Pero no no est claro si la sRNA y el ARNm s Unen Ambas caras simultaneamente, si el sRNA y el ARNm s Unen caras particulares, y si el apareamiento de bases s ve facilitada Por los Cambios en la Estructura del ARN o de Proximidad Entre los dos ARN o de yunque. La proteina Hfq s ha demostrado Que copurifican Con La Protena ribosomal S1, Componentes de la RNasa E degradosome, y polinucletido fosforilasa ( Mohanty et al, 2004. ; . Morita et al, 2005 ; Sukhodolets Garges, 2003 ), Entre Otros , Pero Todos ESTOS hijo Abundantes Protenas de unin al ARN y la Relevancia in vivo de ESTAS Interacciones es Poco Conocido.Ademas, Solo La Mitad de TODAS las Especies Gram-Negativas y Gram-Positivas secuenciados y uno archaea Tienen homlogos Hfq (Revisado en ( Valentin-Hansen et al., 2004 )). Sin Otras Protenas sustituto de Hfq es LOS ORGANISMOS QUE TIENEN no homlogos, o no apareamiento de bases empre sRNAs y Sus mRNAs diana no Requiere UNA chaperona de ARN es Ests Casos? Es probable Que todavia Otras Protenas Que actuan sobre o en conjuncin con los ARN reguladoras Aun No Se Han Descubierto. La RNasa E y III endonucleasas RNasa SE SABE Que escinden sRNAs apareamiento de bases y Sus Objetivos ( Viegas et al., 2007 ) , Pero no pueden servi ESTOS LOS UNICOS ribonucleasas prrafo degradar LOS ARN. estafadores sRNAs etiquetados Indican Que Otras Protenas Experimentos desplegable, cuentos de Como ARN polimerasa ( Windbichler et al., 2008 ), also s Unen los

Reguladores de ARN, Pero de nuevo No Se conoce la Relevancia fisiolgica of this Interaccin. Ademas, los Estudios Genticos apuntan a la implicacin de Protenas cuentos de Como YhbJ, Que antagoniza la Actividad GlmY y GlmZ, aunque la Actividad of this protein es todavia misteriosa ( Kalamorz et al, 2007.; urbana y Vogel, 2008 ). Requisitos Para El apareamiento de bases Productivo Cules son las reglas de apareamiento de bases productivas? SRNAs Transcodificados se unen a sus mRNAs diana mediante contigua e imperfecto apareamiento de bases, de los cuales a menudo slo un conjunto bsico de las interacciones es preguntas esenciales, estimulantes en cuanto a cmo se imparte especificidad entre sRNAs y ARNm y cmo tales emparejamiento limitada puede causar inhibicin de la traduccin o la degradacin del ARN. Varios algoritmos para las predicciones de los objetivos de apareamiento de bases para sRNAs trans-codificados se han desarrollado (( Tjaden, 2008 ) y revisado en ( Pichon y Felden, 2008 ; Vogel y Wagner, 2007 )). Sin embargo, la exactitud de estas predicciones ha sido variada. Para algunos sRNAs, como RyhB y GcvB, hay distintas regiones de cadena sencilla conservadas, que parecen ser necesarios para la base de sincronizacin con la mayora de los objetivos y que estn relacionadas con las predicciones ms precisas ( Sharma et al, 2007. ; . Tjaden et al, 2006 ). Para otros sRNAs tales como OMRA y OmrB, unos objetivos conocidos se predijo en bsquedas iniciales ( Tjaden et al., 2006 ). Mutacional estudios para definir la base de sincronizacin interacciones con conocidos omra y objetivos OmrB ( Guillier y Gottesman, 2008 ) ponen de relieve los posibles obstculos a las predicciones computacionales. Estos pueden incluir la falta de conocimiento acerca de los dominios sRNA necesarias para el apareamiento de bases, limitadas interacciones de apareamiento de bases, y el apareamiento de bases con el ARNm regiones fuera de la vecindad inmediata del sitio de unin al ribosoma. Anlisis sistemtico reciente indica sRNAs pueden bloquear la traduccin por el emparejamiento con las secuencias en la regin de codificacin, en la medida de aguas abajo como el quinto codn (Bouvier et al., 2008 ). Otros factores tales como la posicin de unin Hfq y las estructuras secundarias de ARNm y tanto la sRNA tambin son propensos a tener un impacto apareamiento de bases en formas que no se han formalizado. Los estudios in vitro que exploran el papel de Hfq para facilitar la vinculacin entre la RprA y RNAs DsrA y el espectculo ARNm rpoS que la unin entre Hfq, el mRNA y los sRNAs est claramente influenciada por lo que parte de la rpoS lder 5 'se ensaya ( Soper y Woodson, 2008 ; Updegrove et al, 2008. ). Con un nmero cada vez mayor de objetivos validados que puedan servir como conjuntos de entrenamiento, la capacidad de predecir con precisin los objetivos deben mejorar significativamente.

Al igual que con los miRNAs y siRNAs eucariotas, puede haber diferencias mecnicas entre el trans -. Y cis-codificados sRNAs de apareamiento de bases en base a sus diferentes propiedades sRNAs Trans-codificados, que tienen base de sincronizacin imperfecta con sus objetivos como miRNAs, a menudo interactuar con Hfq. En contraste, sRNAs cis-codificados, que tienen complementariedad completa con objetivos como siRNAs, no parecen requerir Hfq, pero tienden a ser ms estructurado y pueden utilizar otros factores para ayudar en el apareamiento de bases. Estas diferencias pueden tener implicaciones ms amplias para los tipos de objetivos regulados, la naturaleza de las protenas requeridas, as como los detalles mecanicistas de apareamiento de bases. Nuevos mecanismos de accin Qu nuevos mecanismos de accin an no se han descubierto? La mayora de los sRNAs caracterizado hasta la fecha par de bases en el 5 'UTR del ARNm diana cerca del sitio de unin a ribosomas, sin embargo otras ubicaciones para el apareamiento de bases y los consiguientes mecanismos de regulacin son posibles. Se han descrito slo unos ribozimas bacterianas. Se encuentran otros sRNAs o riboswitches tener actividad enzimtica? Como ya se ha aludido, el mecanismo de accin crRNA en la orientacin e interfiriendo con el ADN no se entiende. Completamente nuevos mecanismos pueden ser revelados por otros estudios de las secuencias de CRISPR. Por ltimo, casi un tercio de la E. sRNAs coli identificados hasta la fecha, y la gran mayora de los de otros organismos, an no se han caracterizado en detalle significativo. Estos tambin pueden tener funciones y modos de accin no previstos. Roles fisiolgicos de RNAs reguladores Adems de avanzar en la exploracin de los mecanismos por los cuales riboswitches, sRNAs y crRNAs acto, vale la pena reflexionar sobre lo que se conoce, as como lo que no se entiende, sobre las funciones fisiolgicas de estos reguladores. Asociacin con respuestas especficas Varios temas estn surgiendo con respecto a las funciones fisiolgicas de riboswitches y sRNAs. En trminos generales, riboswitches, sRNAs de unin a protenas, trans-codificados sRNAs de apareamiento de bases y algunos de base-cis codificacin de emparejamiento sRNAs median en las respuestas a las cambiantes condiciones ambientales por vas metablicas o modulacin de respuestas de estrs. Riboswitches y T-cajas tienden a regular los genes biosintticos, como estos elementos detectan directamente las concentraciones de los distintos metabolitos, mientras que algunos termmetros de ARN, tales como la 5'-UTR del ARNm que codifica el factor sigma de choque de calor 32 ( Morita et al. , 1999 ), el control de reguladores transcripcionales. Los csrB

y 6S familias de sRNAs tambin controlan la expresin de un gran nmero de genes en respuesta a la disminucin de la disponibilidad de nutrientes por la represin de las actividades de los reguladores globales. Los transcodificados sRNAs de apareamiento de bases contribuyen principalmente a la capacidad de sobrevivir a varias agresiones ambientales mediante la modulacin de la traduccin de los reguladores o la represin de la sntesis de protenas que no sean necesarios. En particular, es interesante que un nmero desproporcionado de sRNAstrans-codificados a regular las protenas de membrana externa (mica, MICC, MicF, RybB, CyaR, omra y OmrB) o transportadores (SgrS, RydC, GcvB). Otros temas generalizados incluyen la regulacin mediada por ARN del metabolismo del hierro, no slo en las bacterias, sino tambin en eucariotas, as como ARN reguladores de la deteccin de qurum. Patognesis presenta un conjunto de comportamientos que cabra esperar que se rige por sRNAs ya que las infecciones bacterianas involucran mltiples rondas de respuesta rpida y coordinada a las condiciones cambiantes. El papel central de sRNAs en la modulacin de los niveles de protenas de membrana externa, que son objetivos principales para el sistema inmunolgico, as como otras respuestas importantes para la supervivencia en las condiciones que se encuentran en clulas husped, tales como los niveles de hierro alterados, tambin implica estos reguladores de ARN en la supervivencia bacteriana en las clulas husped. En efecto, aunque estos estudios an estn en las primeras etapas, varios sRNAs han demostrado que altera la infeccin.Estos incluyen miembros de la familia CsrB de sRNAs en Salmonella, Erwinia, Yersinia, Vibrio y Pseudomonas que se unen a protenas de la familia y antagonizan Csra que son los reguladores globales de los genes de virulencia de Shigella; RyhB que reprime un activador transcripcional de genes de virulencia; ARNIII deStaphylococcus que ambos pares de bases con el ARNm que codifican factores de virulencia y codifica el pptido -hemolisina, y los sRNAs Qrr de Vibrio que regulan quorum sensing (( Heroven et al, 2008. ; Murphy y Payne, 2007 ) y revisado en (Romby et al. , 2006 ; . ToledoArana et al, 2007 .)) hfq mutantes de una amplia gama de bacterias tambin muestran virulencia reducida (revisado en ( Romby et al, 2006. ;. Toledo-Arana et al, 2007 )). Algunos sRNAs, como un nmero de sRNAs codificados en las islas de patogenicidad de Salmonella y Staphylococcus, muestran expresin diferencial en condiciones patgenas ( Padalon-Brauch et al, 2008. ; Pfeiffer et al, 2007. ; Pichon y Felden, 2005 ). Otros sRNAs, tales como las cinco de Listeria monocytogenes, son especficos de las cepas patgenas ( Mandin et al., 2007 ). Por ltimo, sensores trmicos y riboswitches pueden tener papeles en como reguladores de la patognesis, regulacin por incremento de los genes de virulencia de la temperatura aumento encontrado en clulas husped o en las seales de unin, tales como el "segundo mensajero" di-GMP cclico ( Johansson et al, 2002. ; Sudarsan y col ., 2008). Estudios adicionales

de estos y otros ARN reguladoras asociadas con la patognesis podran dar lugar a oportunidades para interferir con la enfermedad. Un subconjunto de los cis sRNAs antisentido codificados expresadas a partir de los cromosomas bacterianos ACTUAR COMO antitoxinas, Pero sos Funciones fisiolgicas no Claras hijo. Also pueden Estar Implicados en la Alteracin del METABOLISMO celular en Respuesta a las Diversas Tensiones Que permiten la Supervivencia.Alternativamente, pueden Jugar sin Papel en la Proteccin Contra el ADN extrao.Esto Es claramente la Funcin de los ARN de CRISPR, Que se Han demostrado prrafo reprimir bacterifago y plsmido post in la clula, y, en Principio, Podria Ser utilizado prr Silenciar genes de Otros Elementos Mviles. Funciones fisiolgicas de Varias Copias Algunos sRNAs incluyendo omra / OmrB, Prr1/Prr2, Qrr1-5, 6S homlogos, homlogos csrB, GlmY / GlmZ, y Varios mdulos de la toxina-antitoxina estan presentes en Mltiples Copias En Una bacteria determinada. A Pesar de las Ventajas fisiolgicas de LOS sRNA genes repetidas slo s entienden en la ONU subconjunto de los Casos, Copias Mltiples pueden Tener Varias Funciones Diferentes ( Figura 4 ).

Figura 4 Posibles Funciones de los genes del RNA Duplicados En Primer Lugar, Homologa ARN pueden ACTUAR de forma redundante, Que SIRVE COMO Copias de Seguridad en Vas criticas o prrafo Aumentar la Sensibilidad De Una Respuesta. En V. cholerae , Cualquier Sola Qrr ARN it Suficiente prr reprimir L deteccion de qurum MEDIANTE L REGULACION HACIA ABAJO EL factores de transcripcin HapR, y La supresin de Todos Los Cuatro Qrr s Requiere prrafo ACTIVAR LOS genes constitutivamente los comportamientos de deteccion de qurum ( Lenz et al ., 2004 ). Dado Que la Eficacia de la Regulacin sRNA no est directamente Relacionada con do relativea abundancia de ARNm Objetivos, this redundancia s ha Propuesto prr permitir Una Respuesta ultrasensible, Interruptor-Como prr la deteccion de qurum en V. cholerae y Florerias Ayudar a amplificar Una Pequea Seal De Entrada prr lograr Una Gran Salida. En Segundo Lugar, los ARN repetidas pueden ACTUAR de forma aditiva, Como en el Caso de la V. harveyi Qrr sRNAs ( Tu y Bassler, 2007 ). En Este Caso, Los Cinco Qrrgenes Tienen REGIONES promotoras Divergentes y s

expresan diferencialmente, lo Que sugiere CADA Qrr sRNA Puede del respondedor a Diferentes Indicadores metablicos de INTEGRAR Varias Seales Ambientales. La supresin de los genes Individuales Qrr afecta a la Medida de los comportamientos de deteccion de qurum, Lo Que Indica Que no actuan de forma redundante. Por el contrario, la CANTIDAD totales de Qrr sRNAs en V. harveyi producen Niveles distintos de los genes regulados, cuentos de Me Alteracin de la abundancia de Cualquier zcalo Qrr sRNA Cambia la magnitud de la Respuesta. This Regulacin de aditivos s Piensa prr permitir el perfeccionamiento de luxR Niveles a Travs de la ONU gradiente de Expresin, Dando un Lugar Cantidades Precisas, A MEDIDA de la Expresin genica. Es Sorprendente Que Dentro del Mismo Sistema de percepcin de qurum en dos Especies Relacionadas de Vibrio , los Mltiples sRNAs Qrr Operan de Acuerdo a dos Mecanismos distintos . MIENTRAS QUE LA RAZN de sto no no est claro, La Diferencia Ilustra L Capacidad de evolucion de los Reguladores de ARN y Los Matices reguladoras Que pueden servi proporcionados porciones Tener Copias mltiples. De Una Tercera it POSIBILIDAD QUE LOS ARN Duplicados pueden Actuar deforma independiente el uno del Otro. sto podria ocurrir de Varias Formas. Prr sRNAs de apareamiento de bases, Cada sRNA podria regular de la ONU Conjunto Diferente de genes, muy probablemente de Una Manera algoritmo superposicin. Para sRNAs de unin a Protenas, homlogos de Diferentes podrian interactuar con Protenas Distintas, Dando Lugar de Variaciones en los Complejos de Ncleo. Como s mencion anteriormente, varios B. subtilis isoformas 6S podian reprimir la RNA polimerasa Ligado a different FACTORES . Homlogos espcie de ARN also s pueden emplear muy Diferentes Mecanismos de Accin, se del como observaciones Para La E. coli GlmY GlmZ RNAs ( Urbano y Vogel, 2008 ). GlmZ Funciones Por El apareamiento de bases, MIENTRAS Que los Actos Que puedan GlmY COMO imitan al titular de DISTANCIA YhbJ y Otros FACTORES Que GlmZ inactiva. In algunos Casos todavia it desconcertante Por Que s mantienen Copias mltiples.EJEMPLO Un hijo de los mdulos de la toxina-antitoxina, Que No SOLO ESTAN codificados porciones Mltiples genes es E. coli cromosomas, SINO QUE Florerias Variar En El numero de genes, inclus Dentro De la Misma espcie (Revisado en (Fozo et al., 2008a )). ARN redundantes pueden SIMPLEMENTE Indicar ONU Evento Evolutivo Reciente, Que Aun no ha Sido sometida a Variaciones, to select Nuevas Funciones. Como alternativa, Los genes pueden ADICIONALES servicio Seleccionados Por La pressure prr mantener al Menos Una Copia a Traves De Una Poblacin. Respuesta Completa de A la pregunta de Por Qu Varios genes de ARN Reguladores s duplican Esperan Mas Caracterizacin de CADA CONJUNTO de ARN. Ventajas de ARN reguladoras

ARN Reguladores Tienen Varias Ventajas Sobre los Reguladores de Protenas. Ellos hijo Menos costosos de la clula y Puede Ser Ms Rpido de Producir, ya Que Son Mas Cortas Que la Mayora de los ARNm (~ 100-200 Nucletidos en comparacion con 1000 Nucletidos el prrafo PROMEDIO de ~ 350 Aminocidos de E. coli protein) y no require el paso Adicional de la Traduccin. Los Efectos de los Reguladores de ARN pueden Mismos also servicio muy rapido. Paracis riboswitches de Accin prolongada, el Acoplamiento de la ONU sensor directamente a la ONU ARNm permite Que Una clula prrafo que responde a la Seal De Una Manera Rpida y extremadamente sensible. Del Mismo Modo , ya qu sRNAs Son Ms Rpidos de Producir Que las Protenas y acto post-transcripcional, s Prev Que, a Corto Plazo, Que podrian APAGAR o encender la Expresin Ms rapidamente Que los FACTORES de transcripcin de una base de Protenas. En Realidad this Expectativa s apoya en algunas Simulaciones Dinmicas ( Mehta et al, 2008. ; . Shimoni et al, 2007 ). Otros Aspectos Unicos de la Regulacin sRNA Revelados Por los Estudios de Modelos recientes estan Relacionados con La Respuesta lineal umbral proporcionado porcin sRNAs, en contraste con la Respuesta lineal recta proporcionada porcin FACTORES de transcripcin ( Legewie et al, 2008. ; . Levine et al, 2007 ; . Mehta et al, 2008 ). La Mayora de los sRNAs caracterizan Hasta Ahora ACTUAR estequiomtricamente a Travs de los Mecanismos catalticos de la degradacion del ARNm o La inhibicin COMPETITIVA DE LA TRADUCCIN, Reacciones En Las Que Las Concentraciones relativas de La sRNA ARNm Crticos hijo. ASI, POR sRNAs negativamente de Accin prolongada, Cuando [sRNA] [ARNm], la Expresin del gen no est estrechamente Apagado , Pero CUANDO [ARNm] [sRNA], la sRNA Tiene Poco efecto Sobre la Expresin. Este Establecimiento de umbrales de sRNA Represin sugiere Que sRNAs generalmente ningn hijo tan Eficaces Como las Protenas de transduccin de Seales de Entrada de Pequeas o transitoria. En contraste, Cuando las Seales de Entrada hijo Grandes y persistente, sRNAs hijo la hiptesis de servicios Mejor que los FACTORES de transcripcin en los Niveles de Represin fuertemente y de forma FIABLE las Protenas, Asi Como en el Filtrado de ruido. Por Otra Parte, s cree Que la Regulacin sRNA basado prr servicio ultra-sensibles a los Cambios en los Niveles de mRNA sRNA y Alrededor del umbral Crtico, especialmente en el Caso de Mltiples sRNAs redundantes Como en el V. cholerae Sistema de qurum sensing Qrr, Que se PROPONE Llevar un switch to-Como "todo o nada" el COMPORTAMIENTO ( Lenz et al., 2004 ). Las Caractersticas de ADICIONALES Diferentes SUBCONJUNTOS de los Reguladores de ARN proporcionan Otras Ventajas. riboswitches Algunos Conducen a la terminacin de transcripcin o auto-divisin y algunos sRNAs de base de sincronizacion Dirigir la divisin de Sus Objetivos, la Prestacin de Sus Efectos Reguladores irreversible. Para los cis sRNAs antisentido codificados y

los ARNs CRISPR, la Amplia complementariedad con los cidos nucleicos diana imparte extremadamente alta especificidad. En contraste, la palabra capacidad de trans -sRNAs codificados prrafo regulares MUCHOS genes Diferentes permite Que ESTOS sRNAs Para El Control de Redes fisiolgicos enteras con Diversos Grados de rigurosidad y Los Resultados. El Alcance y la Calidad de apareamiento de bases con sRNAs pueden priorizar los ARNm Objetivo de la Regulacin diferencial y podria Ser utilizada porcin las Clulas prrafo Integrar los Diferentes ESTADOS en los Programas de Expresin genica ( Mitarai et al., 2007 ). Ademas, Cuando Varios mRNAs Objetivo de la ONU sRNA zcalo s expresan en Una clula, do abundancia Relativa y Afinidades de unin pueden influir fuertemente en la Expresin de uno al Otro a Travs de la diafona ( Levine et al, 2007. ; Mehta et al, 2008. ; . Shimoni et al, 2007 .) Por el contrario, es probable Que altere la Dinmica Dentro De Una red de Regulacin de la Competencia Entre los Diferentes sRNAs prrafo Hfq o sin ARNm especifico. Por Ultimo, la base de de la FLEXIBILIDAD emparejamiento presumiblemente also permite Una Rpida Evolucin de sRNAs y Objetivos de ARNm. Por Otra Parte, aunque no es Una Ventaja per se , Reguladores de ARN actuan generalmente una ONU Nivel Complementario a los Reguladores de Protenas, lo mas a el menudo funcionan en el Nivel post-transcripcional en Lugar De FACTORES de transcripcin Que actuan Antes de sRNAs o Enzimas cuentos de Como quinasas o proteasas Que actuan despues de sRNAs. Las Diferentes Combinaciones de ESTAS Protenas ARN Reguladores pueden proporcionar UNA Variedad de Resultados reguladoras, cuentos de Como La represin muy apretado, UNA EXPANSIN DE LOS genes regulados en Respuesta a Una nica Seal o porciones el contrario sin AUMENTO en el Nmero de Seales detectada Por Un gen zcalo ( Shimoni et al., 2007 ). Evolucin de los ARN reguladoras Todavia no sabemos SI TODAS LAS bacterias contienen Arns Reguladores o SI ESTAN LLEGANDO CERCA DE HABER IDENTIFICADO Todos Los sRNAs riboswitches es bacterias bien estudiadas. Dada L redundancia es LOS sRNAs Que se encuentran, Las busquedas de ciertas Clases de sRNAs, es sRNAs Particulares codificadas es REGIONES intergnicas expresado es las Condiciones Normales de laboratorio, aparecen cerca Buscar De La saturacin es E. coli . Sin embargo, Otros Tipos de sRNAs, Como cis sRNAs antisentido codificados y sRNAs Cuya Expresin no est estrechamente Regulado, todavia pueden Estar ausentes de las Listas de ARN identificados Reguladores. Son ARN Reguladores rests del Mundo de ARN o Los genes hijo Adiciones recientes a los genomas de bacterias? Proponemos Que La Respuesta a this pregunta es a la Vez.Algunos de los Reguladores de Como riboswitches y Sistemas de CRISPR, Que se conservan de Manera muy Amplia , es probable Que Tengan Antiguos Orgenes evolutivos. Por el contrario, MIENTRAS Que la

Regulacin por El apareamiento de bases Florerias Siempre Han existido, los Reguladores Individuales antisentido, del tanto cis - y trans . sRNAs codificados pueden Ser adquiridos recientemente y de Rpida Evolucin ESTO SE ejemplifica Por La mala Conservacin De Las Secuencias de sRNA a Travs de bacterias. Por EJEMPLO, los ARN Prr de Pseudomonaspracticamente no Tienen Ninguna semejanza Con El Equivalente RyhB sRNA de E.coli , aunque Ambos hijo reprimidos Por La Piel y actuan Sobre Objetivos Similares (Wilderman et al., 2004 ). Se podria Imaginar Que la Expresin De Una Transcripcin no Esencial, ya mar antisentido o con complementariedad limitada sin un ARNm de buena fe, Que proporciona Alguna Ventaja selectiva podria fijarse facilmente En Una Poblacin. Es interesante OBSERVAR Que los Reguladores de ARN Diferentes s de han utilizado prr resolver los Problemas de Regulacin Especficos, Haciendo Hincapi en la Capacidad de Penetracin y la Capacidad de Adaptacin de la Regulacin mediada porcin de ARN. Por EJEMPLO, es B. subtilis , la glmS ARNm s inactiva Por La auto-escisin de la glucosamina-6-fosfatosensata cis de Accin riboswitch ( Collins et al., 2007 ), MIENTRAS Que en E. coli , el glmS ARNm no est Regulada Positivamente Por los dos trans Accin sRNAs GlmY y GlmZ ( Urbano y Vogel, 2008 ). Como Otro EJEMPLO, COMO RyhB- trans -sRNAs codificados reprimen la Expresin de Enzimas Que contienen hierro Durante la inanicin de hierro en Diversas bacterias, MIENTRAS Que el cis -isir Codificada sRNA de Synechocystis cebar la Expresin de la Protena Isia, Una antena de recoleccin de luz, bajo hierro repleta Condiciones (Revisado en ( Mass et al., 2007 )). Aplicaciones de ARN reguladoras El Papel Central jugado Por los Reguladores de ARN en la fisiologa celular Hacen atractivas prrafo do USO COMO Herramientas Para SERVIR COMO biosensores o prrafo Controlar el Crecimiento bacteriano, Ya mar Positiva o negativamente. RNAs endgenos podrian SERVIR COMO Seales Sobre el Estado del Medio Ambiente de . la clula Por EJEMPLO, los Niveles de la RyhB e OxyS sRNAs, respectivamente, hijo potentes Indicadores de la Condicin del hierro y la Concentracin de peroxido de Hidrgeno En Una clula ( Altuvia col, 1997. ; masa y Gottesman, 2002 ). Secuencias CRISPR proporciona Una visin de la Historia del ADN extracelular Encontrada Por La bacteria y s de han utilizado prr las cepas del genotipo Durante los Brotes de Enfermedades Infecciosas (Revisado en ( Hebert et al, 2008. ; . Sorek et al, 2008 )).En Cuanto al Control del Crecimiento celular bacteriana, uno de Como Se Puede Imaginar podrian servicio explotadas riboswitches COMO Frmaco Objetivos zcalo do potencial prrafo uniRSE un Una Amplia Variedad de Compuestos (Revisado en (Blount y Breaker, 2006 )). Del Mismo Modo, ya de Me interferencia con las Funciones de algunos de los sRNAs es perjudicial Para El Crecimiento y Varios sRNAs contribuyen a la virulencia, ESTOS

Reguladores y Sus Protenas Que interactan also podrian Ser el blanco de terapias antibacterianas. Alternativamente, la Expresin ectpica de los ARN reguladoras Especficas podria servicios utilizado prr Aumentar la Resistencia al Estrs y facilitar la Supervivencia bacteriana en Diversos Entornos industriales o Ecolgicos. ARN also presentacin sin Sistema de Gran Alcance Para El Diseo racional, ya Que es modular, facilmente sintetizado y manipulado, y Florerias Alcanzar Una Enorme Diversidad de Secuencia, Estructura y Funcin. Aunque Menos desarrollados Que en los eucariotas, la Aplicacin de los ARN Sintticos s no est Explorando en bacterias (Revisado en ( Hebert et al, 2008. ; . Isaacs et al, 2006 )). Por EJEMPLO, los Elementos riboswitch Han Sido Diseados prr utilizar Nuevos ligandos, y sRNAs Han Sido Diseados Para El par de bases con Transcripciones Nuevas. Diseado Repeticiones CRISPR Presentan sin MECANISMO Obvio MEDIANTE EL Cual prrafo reprimir la Captacin de Secuencias de ADN Especficas. Las limitations un ESTOS INCLUYEN Enfoques La represin Incompleta observada prrafo los riboswitches Sintticos y sRNAs de apareamiento de bases Hasta El Momento, FUERA de los Efectos de Destino, ASI COMO Problemas en La Entrega de los Reguladores de ARN en Clulas en Los Que podrian servicio de alcalde Utilidad. Sin embargo, los ARN Sintticos Tienen el potencial de proporcionar Una Variedad de Herramientas y tiles Teraputicos en el Futuro. Perspectivas En Resumen, las Molculas de ARN Sirven prr Una Amplia Gama de Funciones de Regulacin en bacterias y modulan CASI Todos Los Aspectos del METABOLISMO celular. Ejemplos de ESTOS Reguladores de ARN s conocen los antes Mucho del Descubrimiento de los Reguladores Similares en eucariotas, aunque no en s Prev Que el gran Nmero de riboswitches, sRNAs, y ARN de CRISPR, ASI COMO do Correspondiente gran importancia a la fisiologa celular y Mecanismos de Defensa,.Muchas bacterias hijo Sistemas Experimentales y faciles Tienen genomas pequeos, Que Ayudan a las Predicciones computacionales y el Desarrollo de Modelo Slido.Ademas, cientos de Secuencias del genoma bacteriano, Que representan UNA AMPLIA Diversidad de Especies estafadores UNA Gran Variedad de Estilos de Vida y Los Nichos Ecolgicos DISPONIBLES. Ests FACTORES Hacen Que las bacterias de la ONU Sistema ideales prrafo profundizar en Cuestiones Mecnicas , fisiolgicas evolutivas Sobre ARN Reguladores.