Instrumentacion de RMN

Un RMN es basicamente una radio de FM grande y cara. Bo

N
B1 Generador de frecuencias Detector

Iman

Computadora

Iman - Normamente superconductor. Algunos electroimanes e imanes permanentes (XL-100, T-60) se siguen usando. Generador de frecuencias - Crea la corriente alterna (a o) que induce al campo B1. Banda continua o pulsada. Detector - Substrae la frequencia base (constante y muy cercana a o) de la frequencia de salida. Nos da una seal con frecuencias mas bajas y mas simples de analizar. Computadora - Procesado, impresion, integrales, etc., etc.

Excitacion por banda continua

Completamente obsoleto, y solo util para espectros 1D. La misma idea que en UV. Barremos las frecuencias a velocidad constante (o el campo magnetico, ya que tiene el mismo efecto - = B), y registramos como las distintas componentes de Mo generan Mxy a diferentes frecuencias (o campos magneticos).

o o Bo

(Datos del querido T-60...)

o o Bo tiempo Obtenemos un efecto del dominio del tiempo en el espectro de frecuencias (el famoso ringing) porque no podemos barrer lo suficientemente lento.

Excitacion pulsada - Transformada de Fourier

Lo que se usa en todos los equipos de RMN modernos. La idea es simple. Tenemos dos formas de afinar un piano: Una involucra ir tecla por tecla grabando cada nota (i.e., cada frecuencia). La otra, muy mala para el piano, es darle un martillazo bien fuerte y grabar todo el ruido que haga. Todas las frecuencias (notas) van a estar en la grabacion. Lo que necesitamos es el equivalente al martillo. Algo que tenga todas las frecuencias del espectro. Un pulso corto de radiofrecuencia tiene estas caracteristicas. Para explicarlo, usamos una caja negra matematica, La transformada de Fourier: Transforma informacion del dominio del tiempo al de frecuencia (y vice versa).

S() =

- S(t) e

-it dt

S(t) = 1/2

0 S() e

it dt

Si nuestros datos en el tiempo son periodicos, basicamente nos da las coponentes de frecuencia. Extremadamente util en RMN, donde todas las seales son periodicas.

Tranformada de Fourier de ondas simples

Podemos explicar (o ver) algunas propiedades de la TF con funciones matematicas simples: Para cos( * t )

TF

Para sen( * t )

TF

Se dice que los cosenos dan lineas absortivas, mientras que los senos dan lineas dispersivas. Nos vamos a referir a esto cuando hablemos de la fase del espectro. Tambien nos tenemos que acordar de esto para entender deteccion de seales por cuadratura.

Volviendo a los pulsos

Ahora que sabemos como funciona la TF, podemos ver como funcionan los pulsos. Un pulso de radiofrecuencia es el producto de una onda (coseno) a o con una funcion escalon:

*
tp TF: 1 a o = 1 TF:

=
sen(tp) tp

o sinc(tp)

Esta es la forma del pulso en el eje de los tiempos. Para ver todas las frecuencias que tiene, hacemos una TF:

TF o

El resultado es una seal centrada en o que cubre un rango de frecuencias. Dependiendo del ancho de pulso tenemos rangos mas anchos (tp corto) o finos (tp largo). Hay que acordarse que f 1 / t.

Anchos y angulos de pulsos

El ancho de pulso no solo esta asociado con el rango de frequencias (o banda de barrido), pero tambien indica por cuanto tiempo el campo B1 esta prendido. Por lo tanto es el tiempo en que hay torque sobre la magnetizacion neta (Mo):

Mo B1
y

tp
y

tp
x

Mxy

tp = * tp * B1

Como el ancho de puslo para cierto angulo tp va a depender del equipo (B1), siempre nos referimos a los pulsos en terminos de cuanto rotan a la magnetizacion (tp). Tenemos pulsos de / 4 (o 45), / 2 (o 90), (o 180), etc., etc.

Algunos pulsos utiles

El pulso mas usado es el / 2, poque pone la mayor cantidad de magnetizacion posible en el plano <xy> (la seal mas grande que el instrumento puede detectar):
z z

Mo

/2
Mxy
y

El pulso tambien es importante, ya que tiene el efecto de invertir las poblaciones del sistema de espines...
z z

Mo

-Mo

Controlando el espectrometro podemos obtener basicamente pulsos de cualquier duracion y angulo que se nos ocurra.

Free Induction Decay (FID)

Nos olvidamos de la muestra. Estamos interesados en analizar la seal que aparece en la bobina receptora despues de que la magnetizacion neta queda en el plano <xy> (despues de un pulso / 2). Dijimos antes que la magnetizacion va a volver al equilibrio (z) precesionando. En el sistema rotatorio, la frecuencia de la precesion es - o. La relajacion de Mo en el plano <xy> es exponencial (mas luego...). Por lo tanto, la bobina receptora detecta una seal cosinusoidal que decae (para un solo tipo de espin): Mxy = o

- o > 0

Mxy

tiempo

tiempo

FID (continuado)
En una muestra real tenemos decenas de sistemas de espines con frecuencias distintas, y distintas a la de B1 (la frecuencia portadora). Como usamos un pulso logramos excitar a todas estas frequencias simultaneamente, y por lo tanto todas estan combinadas en la bobina receptora. A esta seal la llamamos Free Induction Decay (o FID):

La TF de esta seal nos da el espectro de RMN:

Adquicision de datos
Eso fue un poco rapido. Hay ciertas cosas que tenemos que tener en cuenta antes y despues de tomar una FID (o el espectro, la FID no es tan util depues de todo...). Algunas dependen del sistema de deteccion. Como vamos a usar una computadora para adquirir los datos, solo podemos tomar cierto numero de muestras de la seal (velocidad de sampleado o sampling rate, SR). Cuantas va a depender de las frecuencias que tengamos en la FID. El Teorema de Nyquist dice que tenemos que samplear al menos dos veces mas rapido que la seal mas rapida (o el ancho de espectro o spectral width, SW):

SR = 1 / (2 * SW)

Si sampleamos al doble de la frecuencia, donde estan los puntos , no hay problema. Ahora, si vamos muy lento y sampleamos a la mitad de la velocidad (los puntos ), la seal queda digitada en la computadora a 1/2 de la frecuencia real. Estos picos se meten en el espectro con fuera de fase (fold-over). Esto se conoce como aliasing.

Deteccion en cuadratura
En los primeros equipos de RMN-TF, la frecuencia de B1 (portadora) se ponia mas arriba (o abajo) de las posibles frecuencias del espectro. Esto se hacia para que todas las seales fuesen o mas rapidas o mas lentas que la portadora, de modo que la computadora siempre supiese el signo de las frecuencias en la FID.

portadora

Dos problemas. Uno es ruido, que siempre esta ahi, y que si no lo sampleamos bien se mete en el espectro. Tambien, para exitar seales lejos de la portadora necesitamos pulsos de muy buena calidad, cosa que no siempre se puede hacer. Considerando esto, el mejor lugar para la portadora es en el medio del espectro:

portadora

Hay que considerar algunas cosas para poder hacer esto.

Deteccion en cuadratura (continuado)

Como podemos decidir si la freqcuencia va mas rapido o mas lento que la portadora? Ponemos 2 bobinas receptoras a 90 grados (con una diferencia de fase de 90 grados): Fase = 0 L L Fase = 90 R (B1) R

Fase = 0

Fase = 90

La fase de la seal Rapida es opuesta a la de la seal Lenta, y la computadora usa esto para determinar los signos.

Procesado de datos - Funciones de ventana

La seal esta en la computadora sampleada correctamente. Ahora hay muchas cosas que se pueden hacer facilicimo. Una es filtrado. La parte jugosa de la FID esta al principio. A medida que Mxy decae, tenemos mas y mas ruido: Seal + ruido... Ruido...

Generalmente, el ruido es de alta frecuencia, y por eso es que los espectros de RMN tienen la linea de base que tienen. Que tal si pudiesemos filtrar seales con frecuencias mas altas que cierto valor? Usamos filtrado digital. Intuitivamente, mutiplicamos la FID con algo que haga disminuir el ruido al final: 1

Funciones de ventana (continuado)

En este caso, se llama multiplicacion exponencial, y tiene la siguiente forma matematica:

F(t) = 1 * e - ( LB * t )

-o-

F(t) = 1 * e - ( t / )

Porque elimina el ruido de alta frecuencia? En realidad, lo que hacemos es una convolucion de los datos en el dominio de frecuencias con la TF de una exponencial que decae. La TF de esta funcion es una Lorentziana con ancho de pico a media altura (APMA) igual a la constante de decaimiento, o ensanchado de linea (line broadening, LB), en Hz.

LB

La convolucion hace que todo lo que tenga APMA menor que el LB desaparezca del espectro (mas o menos).

Si usamos un LB negativo, la exponencial crece en vez de decaer, y deja que seales mas finas pasen, mejorando la resolucion pero empeorando el cociente seal/ruido.

Mejora de sensibilidad y/o resolucion

Para una FID virgen sin procesado, podemos usar factores de LB positivos o negativos y ver que pasa despues de la TF:

LB = 5.0 Hz

LB = -1.0 Hz

TF

TF

Otras funciones de vantana utiles

Gaussiana/Lorentziana: Mejora la resolucion sin empeorar mucho la sensibilidad. Preferible a usar solo LB negativo:
2 2 F(t) = e - ( t * LB + t / 2 )

Hanning: Otra ventana para mejorar sensibilidad/resolucion:

F(t) = 0.5 + 0.5 * cos( t / tmax )

Coseno/Seno: Se usan para espectros 2D/3D:

F(t) = cos( t / tmax )

La funcion de ventana adecuada depende del experimento, y hay que jugar mucho con los parametros...

Tamao de datos y zero-filling

Otra cosa importante es el tamao (en bytes) de nuestros datos (data size, SI). Hay que acordarse que estaba relacionado con el ancho del espectro (la velocidad de sampleado). Tambien esta relacionado con el tiempo total en el que sampleamos la FID. Mas tiempo significa mas datos. Cuando empezo el RMN-TF, las computadoras tenian poca memoria. La mayoria solo dejaban samplear 16K (16384) puntos, lo que significaba que si queriamos buena resolucion, solo podiamos tomar datos por poco tiempo. Inclusive teniendo mucha memoria, mas tiempo de sampleo reduce las repeticiones que podemos hacer en cierto tiempo. Definimos la resolucion digital (digital resolution, DR) como el numero de Hz por punto en la FID para cierto SW:

DR = SW / SI

DR - digital resolution SW - spectral width (Hz) SI - data size (puntos)

Entonces, con un SW de 5 KHz y una FID de 16K, tenemos una resolucion digital de 0.305 Hz/punto. Un problema obvio es que si tenemos un SW grande y un SI chico, la resolucion puede no ser suficiente para distinguir algunas lineas en el espectro.

Zero-filling (continuado)
Hay alguna forma en que podamos mejorar la resolucion digital (i.e., el numero de puntos) sin tener que samplear por periodos largos? El truco se llama zero-filling. Lo que hacemos es aumentar el numero de puntos antes de hacer la TF agregando ceros al final de la FID. Generalmente agregamos una potencia de 2 de ceros (8K, 16K, etc.). FID de 8K 8K de ceros

FID de 8K

FID de 16K

Asi aumentamos el radio de Hz/punto, y en muchos casos podemos mejorar el espectro. Ahora, si la FID es una chanchada para empezar, no podemos mejorarla mucho (la resolucion real no mejora sin samplear lo suficiente).

Fenomenos de relajacion
Hasta ahora no hablamos del fenomeno que retorna a la magnetizacion al equilibrio. La relajacion se encarga de esto. Hay dos tipos, y los dos son procesos de decaimiento exponencial en funcion del tiempo. Relajacion longitudinal o espin-red (T1): Afecta componentes de la magnetizacion alineados con el eje z (Mz). Mz
z x

y - Perdida de energia del sistema a los alrededores (red) como calor. - Acople dipolar con otros espines, interaccion con particulas paramagneticas, etc...

Relajacion transversa o espin-espin (T2): Actua sobre componentes de la magnetizacion que esten en el plano <xy> (Mxy). - Interacciones espin-espin (J) hacen que Mxy se desfase. - Inhomogeneidades del campo del iman (fanning out). - No puede ser mayor a T1.
z x y

Mxy

Para entender los procesos de relajacion desde un punto de vista fenomenologico usamos las ecuaciones de Bloch, que describen la evolucion de un sistema de espines en el tiempo bajo los efectos de campos magneticos y relajacion.

Equaciones de Bloch
Los campos magneticos interactuan con la magnetizacion (o el momento angular) generando un torque que la hace girar. Generalmente pensamos en B1 en el plano <xy> y Mo en el eje z. Las ecuaciones de Bloch son para cualquier caso, y describen variacion de M con el tiempo: dMx(t) / dt = [ My(t) * Bz - Mz(t) * By ] - Mx(t) / T2 dMy(t) / dt = [ Mz(t) * Bx - Mx(t) * Bz dMz(t) / dt = [ Mx(t) * By - My(t) * Bx

] - My(t) / T2

] - ( Mz(t) - Mo ) / T1

El aparece porque es L (el momento angular) que genera el torque. Sin tratar de entender muy bien de donde vienen, vemos que la variacion de M en un eje depende de lo que pase en los otros dos. Analizamos las soluciones de las ecuaciones diferenciales para un caso ideal en el que tenemos magnetizacion solo en el plano <xy> (despues de un pulso / 2 y para cierta ): Mx(t) = Mo * cos( efft ) * e - t / T2 My(t) = Mo * sen( efft ) * e - t / T2 Mz(t) = Mo * ( 1 - e - t / T1 )

(eff = o - )

Equaciones de Bloch (continuado)

Graficamente vemos lo siguiente: Mx(t) = Mo * cos( efft ) * e - t / T2

My(t) = Mo * sen( efft ) * e - t / T2

Mz(t) = Mo * ( 1 - e - t / T1 )

De estas ecuaciones se puede deducir que el mejor factor de LB que podemos usar es 1 / T2...

Efecto nuclear Overhauser (NOE)

El NOE es otra de las rutas por las cuales cierto espin puede intercambiar energia. Por lo tanto, esta muy relacionado con los procesos de relajacion. En particular, el NOE se relaciona con el intercambio de energia entre dos espines que no esten acoplados escalarmente (JIS = 0), pero con acople dipolar. Se evidencia por la intensificacion de ciertas seales en el espectro cuando el equilibrio (poblaciones) de otros espines en las cercanias son alterados. Usamos un diagrama de de energia para un sistema de dos espines para explicarlo:

IS ()
W1I () IS W1S W0IS W1I W2IS W1S

IS ()

IS ()
W representa la probabilidad de transicion, o la velocidad a la que cierta transicion sucede. Para el sistema en equilibrio podemos tener transiciones W1I y W1S, que representan procesos de un solo cuanto. W0IS y W2IS son transiciones de cero y dos cuantos, que estan prohibidas y tienen probabilidad mucho menor.

Efecto nuclear Overhauser (continuado)

Las transiciones W1I y W1S estan relacionadas con la relajacion longitudinal (o espin-red). Aca vemos que la relajacion por acople dipolar tiene lugar cuando los espines liberan energia en procesos que ocurren a frecuencia cercanas a = * Bo, que incluyen la reorientacion (translacion, rotacion) y colision de espines. Ahora saturamos la transicion S, osea igualamos los dos niveles de energia. Las poblaciones de las transiciones de S son iguales:

I S ( )
W1I () IS W1S W0IS W1I W2IS W1S

IS ()

IS ()
Las transiciones W1S no son posibles (tenemos las mismas poblaciones en estos niveles), y las W1I no ocurren (no afectamos al equilibrio de este espin). Las transiciones W0IS y W2IS son la unica forma en que S se puede relajar. Estas rutas de relajacion de S involucran transiciones de I, y por eso la seal de I intensifica. Si W2IS domina, tenemos intensificacion positiva de I, y si W0IS domina, negativa.

Efecto nuclear Overhauser (mas...)

W2IS y W0IS no se pueden detectar, pero afectan la forma en que el sistema de espines se relaja. Una ocurre a frecuencias cercanas al doble de , y la otra cerca a cero. Por ende, una esta relacionada con movimientos rapidos de la molecula, y la otra con movimientos muy lentos... Si ponemos todo esto en una equacion grande (la ecuacion de Solomon) nos da algo que nos sirve para analizar al NOE en diferentes casos:

= I / S *

W2IS - W0IS 2 * W1S + W2IS + W0IS

Primero, si la molecula se mueve/reorienta rapido (cosas de los organicos), vemos que si saturamos las transiciones de I W2IS va a dominar, y la inensificacion maxima para S es I / S. Si estamos mirando 13C y desacoplando (saturando) los 1H, tenemos un NOE teorico de ~ 4. Si la molecula se mueve lento (proteinas), el W0IS domina y tenemos un NOE maximo de - I / S. Como aca estamos interesados en 1H - 1H, el NOE teorico maximo es ~ -1.

Efecto nuclear Overhauser (...y mas)

Esto es todo en teoria, porque hay que acordarse que hay otros procesos de relajacion que ocurren a la misma vez. Los casos que estan en el medio no son tan claros, y los veremos en otra ocasion. Es util comparar la frecuencia del sistema de espines con la velocidad de reorientacion (tumbling) de la molecula, o el tiempo de correlacion, c. * c << 1 - La molecula se mueve rapido, y tenemos NOEs positivos. Se le llama el extreme narrowing limit (moleculas, chicas, solventes no-viscosos). * c >> 1 - La molecula se mueve lento, y tenemos NOEs negativos. Se le llama el limite de difusion (difussion limit - proteinas, solventes viscosos). * c 1 - Estos son los que estan en el medio. Podemos tener situaciones en que el NOE es cero. Se da para moleculas de tamao medio dependiendo de la frecuencia del RMN. Hay una cosa importante que dejamos fuera por ahora. El NOE va a depender de la distancia entre los nucleos I y S.