LAS MOLÉCULAS

La mayoría de lo que nos rodea está formada por grupos de átomos

unidos que forman conjuntos llamados moléculas. Los átomos que se
encuentra en una molécula se mantienen unidos debido a que comparten
o intercambian electrones.

Las moléculas están hechas de átomos de uno o más elementos. Algunas

moléculas están hechas de un sólo tipo de átomo. Por ejemplo, dos
átomos de oxígeno se unen para formar una molécula de O2, la parte del
aire que necesitamos para respirar y vivir. Otras moléculas son muy
grandes y complejas. Por ejemplo, las moléculas de proteína contienen
cientos de átomos.

Aún las moléculas muy grandes son tan pequeñas que no seríamos
capaces de ver a una molécula de una sustancia. Pero cuando cientos de
moléculas se encuentran juntas, podrían estar en forma de un vaso de
agua, el árbol de un bosque, la pantalla de la computadora; dependiendo
del tipo de moléculas que sean.

Aún cuando una pelota de futbol esté inmóvil, las moléculas en ella se
están moviendo constantemente. Quizás sean muy pequeñas para poder
verlas, pero las moléculas están en constante movimiento, y se moverán
más rápidamente a medida que la temperatura aumenta. En química, se
llama moléculas a las partículas neutras formadas por un conjunto
estable de al menos dos átomos enlazados covalentemente. [1] [2] No es
posible exagerar la importancia del concepto de molécula para la química
ordinaria, especialmente para la química de la vida. Casi toda la química
orgánica y buena parte de la química inorgánica se ocupan de la síntesis
y reactividad de moléculas y compuestos moleculares. La química física
y, especialmente, la química cuántica también estudian,
cuantitativamente, en su caso, las propiedades y reactividad de las
moléculas. La bioquímica está íntimamente relacionada con la biología
molecular, ya que ambas estudian a los seres vivos a nivel molecular. El
estudio de las interacciones específicas entre moléculas, incluyendo el
reconocimiento molecular es el campo de estudio de la química
supramolecular. Estas fuerzas explican las propiedades físicas como la
solubilidad o el punto de ebullición de un compuesto molecular.Las
moléculas rara vez se encuentran sin interacción entre ellas, salvo en
gases enrarecidos. Así, pueden encontrarse en redes cristalinas, como el
caso de las moléculas de H2O en el hielo o con interacciones intensas
pero que cambian rápidamente de direccionalidad, como en el agua
líquida. En orden creciente de intensidad, las fuerzas intermoleculares
más relevantes son: las fuerzas de Van der Waals y los puentes de
hidrógeno. La dinámica molecular es un método de simulación por
computadora que utiliza estas fuerzas para tratar de explicar las
propiedades de las moléculas.

Tipos de moléculas
Las moléculas se pueden clasificar en:

Moléculas discretas, constituídas por un número bien definido de átomos,

sean estos del mismo elemento (moléculas homonucleares, como el
dinitrógeno o el fullereno) o de elementos distintos (moléculas
heteronucleares, como el agua). Molécula de dinitrógeno, el gas que es el
componente mayoritario del aire. Molécula de fullereno, tercera forma
estable del carbono tras el diamante y el grafito. Molécula de agua,
"disolvente universal", de importancia fundamental en innumerables
procesos bioquímicos e industriales. Representación poliédrica del anión
de Keggin, un poli anión molecular. Macromoléculas o polímeros,
constituídas por la repetición de una unidad comparativamente simple -o
un conjunto limitado de dichas unidades- y que alcanzan pesos
moleculares relativamente altos. Representación de un fragmento de
ADN, un polímero de importancia fundamental en la genética. Enlace
peptídico que une los péptidos para formar proteínas. Representación de
un fragmento lineal de polietileno, el plástico más usado. Primera
generación de un dendrímero, un tipo especial de polímero que crece de
forma fractal.

Descripción

La estructura molecular puede ser descrita de diferentes formas. La

fórmula química es útil para moléculas sencillas, como H2O para el agua
o NH3 para el amoníaco. Contiene los símbolos de los elementos
presentes en la molécula, así como su proporción indicada por los
subíndices.

Para moléculas más complejas, como las que se encuentran comúnmente

en química orgánica, la fórmula química no es suficiente, y vale la pena
usar una fórmula estructural, que indica gráficamente la disposición
espacial de los distintos grupos funcionales.
Cuando se quieren mostrar variadas propiedades moleculares... (como el
potencial eléctrico en la superficie de la molécula), o se trata de sistemas
muy complejos, como proteínas, ADN o polímeros, se utilizan
representaciones especiales, como los modelos tridimensionales (físicos
o representados por ordenador). En proteínas, por ejemplo, cabe
distinguir entre estructura primaria (orden de los aminoácidos),
secundaria (primer plegamiento en hélices, hojas, giros...), terciaria
(plegamiento de las estructuras tipo hélice/hoja/giro para dar glóbulos) y
cuaternaria (organización espacial entre los diferentes glóbulos). Figura 1.
Representaciones de la terpenoide, atisano, 3D (centro izquierda) y 2D
(derecha). En el modelo 3D de la izquierda, los átomos de carbono están
representados por esferas grises; las blancas representan a los átomos
de hidrógeno y los cilindros representan los enlaces. El modelo es una
representación de la superficies molecular, coloreada por áreas de carga
eléctrica positiva (rojo) o negativa (azul). En el modelo 3D del centro, las
esferas azul claro representan átomos de carbono, las blancas de
hidrógeno y los cilindros entre los átomos son los enlaces simples.