Guanajuato se encuentra dentro de 2 regiones hidrolgicas.
La regin Nmero 26 del panuco ocupa parcialmente una pequea parte
del norte del estado de Guanajuato La regin Numero 12 Lerma Santiago ocupa la mayor parte del estado de Guanajuato, junto con Michoacn, Jalisco, Quertaro, estado de Mxico y zacatecas.
Dentro de las regiones hidrolgicas estn las cuencas hidrogrficas
El estado se encuentra ocupado por 8 cuencas la mayora de ellas
corresponden a la regin hidrolgica numero 12 Lerma Santiago. Cuenca de cuitzeo, Ptzcuaro, laguna de yurira Cuenca del rio Lerma- Toluca Cuenca del Lerma- Chapala Cuenca Lerma- salamanca Cuenca del rio laja Cuenca de Moctezuma Cuenca del rio verde grande Dentro de la regin hidrolgica numero 26 ocupada por una pequea parte del norte del estado Cuenca del rio tamuin SUBCUENCAS
Dentro de las cuencas estn las subcuencas
Cuenca del rio laja Subcuenca RIO LAJA PEUELITAS Subcuenca PRESA ALLENDE Subcuenca RIO LAJA CELAYA Subcuenca RIO APASEO Cuenca de Moctezuma Subcuenca RIO EXTORAZ Cuenca del rio tamuin Subcuenca RIO SANTA MARA Subcuenca RIO SANTA MARA BAJO Cuenca Lerma - salamanca
Subcuenca RIO TURBIO-PRESA PALOTE
Subcuenca RIO TURBIO MANUEL DOBLADO Subcuenca RIO TURBIO- CORRALEJO Subcuenca RIO GUANAJUATO Subcuenca RIO TEMASCATIO Subcuenca RIO SALAMANCA RIO ANGULO Subcuenca SOLIS- SALAMANCA Cuenca del Lerma Toluca Subcuenca RIO TIGRE Subcuenca PRESA SOLIS Cuenca del Lerma Chapala Subcuenca RIO ANGULO-RIO BRIZEAS Cuenca de Ptzcuaro cuitzeo laguna de Yuriria Subcuenca LAGO DE YURIRIA Cuenca del rio verde grande Subcuenca CERRADA DE OCAMPO Subcuenca RIO DE LOS LAGOS