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Genoma Mexico
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El comienzo oficial del Proyecto Genoma Humano (PGH) en Estados Unidos fue anunciado
el 1 de octubre de 1990. Sin embargo, el proceso
intelectual y administrativo responsable por el
inicio del proyecto ya haba estado operando
varios aos antes. Los orgenes del PGH se remontan a un encuentro en Alta, Utah, en 1984, donde
la discusin se centr sobre el anlisis del ADN
con el propsito de detectar mutaciones entre los
sobrevivientes de las explosiones atmicas.
Poco despus de este encuentro, el concepto
de un programa comprensivo de estudio del
genoma fue desarrollado por dos grupos. Primero, una conferencia en 1985 en Santa Cruz,
California, fue convocada para examinar la
viabilidad de secuenciar el genoma humano.
Luego, Charles De Lisi inici discusiones dentro
del Departamento de Energa sobre las ventajas
de secuenciar el genoma en gran escala. Debido
a su inters sobre los efectos en la salud de las
radiaciones y otros tipos de daos ambientales,
el Departamento de Energa evalu establecer
la secuencia del genoma humano como
crticamente importante para los programas que
apuntaban a monitorear los cambios en la secuencia del ADN.
De Lisi adems afirm que el Departamento
de Energa con su experiencia en una diversidad
de campos complementarios (por ejemplo, qumica analtica, fsica aplicada, ingeniera y computacin) y experiencia en dirigir proyectos en
larga escala, sera un importante participante
para tal esfuerzo. Un apoyo adicional para el
PGH provino independientemente de Renato
Dulbecco, quien argument en 1986 que secuenciar el genoma humano e identificar todos
los genes codificados sera un modo eficiente
para facilitar la investigacin sobre el cncer.
Dulbecco enfatiz que sera ms deseable elucidar toda esta informacin de una vez, en lugar
de obtenerla paso a paso en un extendido perodo de tiempo.
Dos informes que influyeron mucho publicados en 1988 guiaron el desarrollo de la estructura y alcance de estas fases iniciales del PGH en
Estados Unidos. Uno, producido por el Consejo
Nacional de Investigaciones, sobre el mapeo y
secuenciamiento del genoma humano, y, otro,
por un comit operando bajo los auspicios de la
Oficina de Evaluacin Tecnolgica del Congreso de Estados Unidos. Estos documentos apelaban a un esfuerzo sistemtico de mapear y
secuenciar el genoma humano y produjeron
recomendaciones sobre el alcance y objetivos
del esfuerzo, subrayando los roles del Instituto
Nacional de Salud y del Departamento de Energa en administrar el proyecto en Estados Unidos
y recomendaron niveles de financiamiento para
el emprendimiento. El programa general seal
que estos trabajos han permanecido vigentes, a
pesar de los numerosos avances en las tecnologas disponibles para el anlisis del genoma.
La oficina de salud e investigacin ambiental del Departamento de Energa inici su programa formal en 1987. La oficina para la investigacin sobre el genoma humano en el Instituto
Nacional de Salud fue creada en 1988 y ese
mismo ao se transform en el Centro Nacional
para la Investigacin del Genoma Humano. Las
sumas consignadas para el Departamento de
Energa y los programas del Instituto Nacional
de Salud fueron aportadas en 1988 (aunque el
programa del Departamento de Energa comenz en el ao previo usando fondos derivados de
otras fuentes). El primer conjunto de objetivos
formales para el proyecto en Estados Unidos
fueron establecidos en 1990, cuando el proyecto
comenz oficialmente.
Aunque las races histricas del PGH estn
ampliamente localizadas en Estados Unidos, el
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tigadores con experiencia en disciplinas no biolgicas (por ejemplo, ingeniera, qumica, fsica).
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tructura, el desarrollo de las tecnologas requeridas y la generacin de los inventarios necesarios de datos. Al mismo tiempo, los objetivos han
pretendido ser visionarios, flexibles e integrados
con el proceso de planificacin en marcha, pero
abiertamente transitorios en su naturaleza, debido a los avances continuos en las tecnologas
para el anlisis del genoma. Finalmente, la formulacin de estos objetivos ha estado acompaada por las discusiones crticas de los planes
evolutivos para el proyecto de algunos de los
participantes clave.
Numerosos puntos importantes sobre estos
objetivos merecen ser resaltados. Primero, completar la secuencia del genoma humano para el
2003 representaba el objetivo prioritario. De
hecho el inicio de este esfuerzo ocurri dos aos
antes de lo originariamente previsto. Segundo,
asociado con la secuenciacin del genoma humano existen planes para mejorar las tecnologas
de secuenciamiento del ADN as como para
secuenciar otros genomas y resecuenciar el ADN
humano tan efectivamente como sea posible en
lo econmico. Los planes para catalogar las variantes a la secuencia humana ordinaria estn
incluidas en el PGH por primera vez. Los estudios
sobre la variacin de la secuencia humana representan un rea de evolucin rpidamente creciente en la gentica humana. Nuevas iniciativas incluirn la construccin de una tercera
generacin, mapas genticos del genoma humano. Tambin se enfatiz dentro de los objetivos del PGH en una serie de actividades
incluidas en la categora de gentica funcional, un rea de la investigacin del genoma que
ampliamente trata del desarrollo e implementacin de tecnologas para explotar la secuencia
genmica completa. Por ejemplo, esto incluye
tcnicas para examinar la expresin gentica en
una escala enorme del genoma. Al frente de
muchas reas de la genmica funcional estn los
genetistas, quienes trabajaron en completar la
secuencia genmica de sus organismos de estudio. Incluidas entre las numerosas iniciativas en
la genmica funcional, estn los esfuerzos para
generar mejoradas bibliotecas de ADN y deducir secuencias completas del ADN con conjuntos comprensivos de genes humanos y de otras
especies.
El PGH continuar enfatizando en el anlisis comparativo del genoma de organismos modelo, incluyendo por primera vez los emprendimientos en apoyar una variedad de actividades
asociadas y aquellas que apuntan a alentar el
desarrollo de herramientas genmicas en computacin, todas ellas enfatizando la importancia
tica, legal y social relacionada con el mapeo y
secuenciamiento del genoma, y aquellas que
apoyan el entrenamiento de los individuos en la
investigacin sobre el genoma. Lo ltimo, intencionalmente, incluir el reclutamiento de inves-
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Secuenciamiento
del genoma humano
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to de la estructura en
doble hlice del ADN
por James Watson y
Francis Crick.
Dentro del PGH, el
secuenciamiento del genoma humano est siendo desarrollado usando
un mtodo clon por clon,
donde clones individuales son secuenciados,
ms a menudo a travs
de una estrategia secuenciadora en disparo
(shotgun strategy). Sin
embargo, otras opciones
han sido consideradas.
Por ejemplo, algunos han
propuesto la aplicacin
de una estrategia secuenciadora en disparo al genoma humano entero en masa. Mientras que se
han levantado fuertes argumentos contra esta
estrategia, al menos una empresa privada est
avanzando en el plan general usando un instrumento de secuenciacin recientemente desarrollado.
Las regiones genmicas especficas que han
sido secuenciadas en centros de secuenciamiento individual se anunciaron anticipadamente, teniendo esa informacin en la web. En
segundo lugar, todos los datos de la secuencia
que han sido generados dentro del PGH se
hicieron disponibles en la web sobre una base
regular (habitualmente por la noche). Debe
notarse que esto incluye los datos de la secuencia final de clones individuales as como los datos
preliminares de aquellos clones cuyo anlisis
est siendo procesado. Esta poltica de liberacin inmediata de datos ha sido ampliamente
apoyada por los grupos participantes, aunque
esto no se ha hecho sin debatir la conveniencia
de este procedimiento. Se ha tenido precaucin
en proteger a los individuos cuyo ADN est
siendo secuenciado por el PGH. Especficamente, algunas nuevas bibliotecas BAC designadas
para el uso en la secuenciacin han sido construidas a partir del ADN de individuos annimos.
Impacto en el estudio
de la enfermedad humana
El PGH promete proveer beneficios en relacin
con la biologa y la clnica mdica. Esto incluye
una capacidad mejorada de aislar, caracterizar
y manipular a los genes involucrados en la fisiologa normal y en la enfermedad humana.
Muchas revisiones han detallado cmo el PGH
impactar en varias reas de la medicina clnica.
Miles de genes, es sabido, causan enfermedad cuando presentan una mutacin. Por su-
Avances en el diagnstico
molecular
El diagnstico molecular puede ser definido
como el testeo del ADN dentro de un contexto
clnico y esta disciplina mdica est creciendo
rpidamente en alcance e importancia. La aplicacin del diagnstico abarca una amplia gama
de enfermedades humanas, incluyendo tests
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con el PGH involucra el develar las bases genticas de la respuesta a las drogas. Especficamente esta disciplina, denominada farmacogentica,
enfoca en descubrir los determinantes genticos
que afectan la accin de las drogas, con el
objetivo a largo plazo de establecer pruebas
diagnsticas y regmenes teraputicos que permitirn que las drogas sean indicadas de modo
ms seguro y efectivo. Esto incluye correlacionar
la respuesta a las drogas con las variaciones
genticas, lo que frecuentemente ser sutil y
complejo. Los xitos en la farmacogentica ayudarn a remover la naturaleza emprica asociada
en muchos aspectos a la terapia farmacolgica,
y proveern estudios ms racionales para predecir la respuesta de los individuos a las particulares
modalidades teraputicas.
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pblico en general sern crecientemente convocados a considerar asuntos crticos relacionados con las pruebas genticas. En anticipacin a
estas situaciones, el programa ELSI ha iniciado
varios emprendimientos educacionales que
apuntan a entrenar a profesionales de la salud en
interpretar los nuevos tests diagnsticos basados
en el ADN, a incrementar el conocimiento
pblico en gentica en escuelas, medios de
comunicacin, alentar la discusin pblica sobre el tema y suministrar informacin a los
polticos. Una de las iniciativas es el establecimiento de la Coalicin Nacional para la Educacin de los Profesionales de la Salud en Gentica
(NCHPEG), un esfuerzo coordinado para promover la educacin de los profesionales de la
Conclusin
El PGH es uno de los proyectos ms importantes,
si no el ms importante de todos los tiempos en
la investigacin biomdica. Es fundamental un
emprendimiento que apunta a desarrollar herramientas para el estudio de la biologa
y la medicina. Esta herramienta refleja
un recurso informativo en la forma de
mapas de secuenciamiento, fsicos y
genticos del genoma, y de algunos organismos modelo, as como un nmero creciente de experimentos tecnolgicos que
se estn volviendo tecnologa estndar
en el arsenal de la investigacin
biomdica. A este respecto, una excitante revolucin gentica ha comenzado
y est cambiando permanentemente el
modo en como se desarrolla la investigacin. La nueva y poderosa informacin
gentica est posibilitando a los investigadores resolver complejos problemas relacionados con la enfermedad, el desarrollo y la evolucin que eran previamente inabarcables. El mapeo directo del
PGH en la clnica mdica est casi realizado, con la aceleracin dramtica en la
identificacin de los genes de la enfermedad humana y el desarrollo continuo
de nuevos intentos para analizar el ADN del
paciente. Finalmente, el verdadero legado del
PGH ser proveer a las futuras generaciones de
cientficos y clnicos la huella gentica humana que les permitir definir mejores bases genticas de la enfermedad y el uso de esa informacin para disear terapias ms efectivas. !
El genoma en la red
www.nhgri.nih.gov/ELSI
www.nhgri.nih.gov/ELSI/TFGT_final
www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP
www.genome.wi.mit.edu
genome-www.stanford.edu/Saccharomyces
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