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con PubMed
Autores:
Mara sobrido Prieto
Carlos Gonzlez Guitian
Biblioteca del Complexo Hospitalario
Universitario de A Corua (CHUAC).
SERGAS.
ndice
1. Qu
es
2. Cmo
de
Contenidos
PubMed?................................................................................. 5
PubMed?.................................................. 5
3. Cmo
4. Visualizacin
de resultados. .................................................................13
5. Recursos
adicionales de inters.............................................................19
6. Mapeo
1. Qu
es
PubMed?
2. Cmo
PubMed?
Para iniciar la bsqueda en PubMed, esta base de datos ofrece dos posibilidades:
b. Truncamiento
Permite recuperar todos los trminos que poseen la misma raz. Si colocamos un asterisco (*) al final de un trmino, busca todas las palabras que
tengan la misma cadena de letras como raz.
Si escribimos neurol* se incluyen los trminos neurology; neuroleptic;
neurolekin; neurologic; etc. PubMed usa las primeras variantes del trmino
truncado.No localiza frases, por ejemplo infection* incluye infections,
pero no infection control.
c. Calificadores de campos o etiquetas/tags
Cada campo de la referencia se identifica mediante una etiqueta, que indica el campo especfico al que corresponde. Para emplearlos se escribe el
trmino seguido de la abreviatura.
Tabla 1. Calificadores de campos o etiquetas/tags.
Nombre del campo Abreviatura
Descripcin
Affiliation-Direccin
[AD, AFFL]
[ALL]
[AU, AUTH]
[CRF]
[CRI]
[RN, ECNO]
Author NameAutores
Contina
www.fisterra.com
Abreviatura
Descripcin
Erratum for
[EFR]
[FAU]
[FIR]
Full Investigator
[GN]
Grant Number
[GR]
Issue-Nmero
[IP, ISSUE]
Investigator
[IR]
[TA, JOUR]
La abreviatura del ttulo de la revista, el ttulo completo o el nmero ISSN (ej., J Biol Chem, Journal of
Biological Chemistry, 0021-9258).
[JT]
Language-Idioma
MeSH Major TopicMeSH tpico principal
[LA, LANG]
[MAJR]
[MH,MESH]
Other Abstract
[OAB]
Other Copyright
Information
Other ID
[OCI]
[OID]
Original Report In
[ORI]
Other Term
[OT]
[OTO]
Owner
[OWN]
Page-Pgina
[PG, PAGE]
[PS]
Place of Publication
[PL]
www.fisterra.com
Abreviatura
Descripcin
[DP, PDAT]
La fecha en que el artculo fue publicado en el formato aaaa/mm/dd (ej. 1984/10/06). Un ao con solo
un mes (ej. 1984/03) mostrar todo lo de ese mes.
Las fechas de publicacin no estn estandarizadas
entre las publicaciones.
Publication Type-Tipo
de publicacin
[PT, PTYP]
Publishing Model
[PUBM]
[SFM]
Subheading-Subenca[SH]
bezado
Subset-Subgrupos
[SB]
Status Tag
[STAT]
Text Words-Palabras
del texto
[TW, WORD]
Title Words-Palabras
del ttulo
[TI, TITL]
Volume-Volumen
[VI, VOL]
PubMed Identifier
(PMID) & MEDLINE
Unique Identifier (UI)
a. History
Muestra todas las bsquedas segn el orden en que se hicieron precedidas del
signo #. Para ver los resultados pulse en el nmero de resultados. Puede guardar
hasta 100 bsquedas. Se pierde despus de 6 horas de inactividad.
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b. Search Builder
3. Cmo
Full Text, Free Full Text, and Abstracts: limita la bsqueda a resultados que incluyan el vnculo al texto completo o resmenes.
Humans or Animals: restringe la bsqueda a un grupo de estudio especfico. Excluye los artculos que se encuentran in process y los supplied
by Publisher , al no haber completado el proceso de indizacin en la base
de datos.
Gender: limita los estudios en humanos por sexo (mujer o varn). Excluye
los artculos que se encuentran in process y los supplied by Publisher , al
no haber completado el proceso de indizacin en la base de datos.
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Journal Groups:
1. Core Clinical Journals: seleccin de 120 revistas del desaparecido
Abridged Index Medicus. Su finalidad es limitar la bsqueda a un
reducido grupo de revistas relevantes para la prctica clnica.
2. Dental Journals: seleccin de 420 revistas del Index to Dental Literature.
3. Nursing Journals: seleccin de 330 revistas del Internacional Nursing
Index.
Topics:
1. AIDS: localiza referencias sobre Sida. Creada por la NLM y la base de
datos AIDSLINE.
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3. Cancer: limita la bsqueda al campo de la oncologa. Incluye las referencias de la desaparecida base de datos CancerLit del Nacional
Cancer Institute.
4. Complementary Medicine: restringe la bsqueda a materias de medicina alternativa. Las referencias provienen de The National Center
for Complementary and Alternative Medicine.
5. History of Medicine: historia de la Medicina. Elaborado por la seccin
de Historia de la Medicina de la NLM: History of Medicine Division.
6. Space Life Sciences: investigacin sobre ciencias del espacio. Lo elabora la NASA SPACELINE Office.
7. Systematic Reviews: estrategia diseada para recuperar revisiones
sistemticas, meta-anlisis, revisiones de ensayos clnicos, medicina
basada en la evidencia, conferencias de consenso, guas clnicas y
artculos procedentes de revistas especializadas en estudios de revisin de inters para clnicos.
Esta opcin tambin se encuentra disponible en el apartado Clinical
Queries.
8. Toxicology: limita la bsqueda al rea de toxicologa: efectos farmacolgicos, bioqumica y fisiolgicos de medicamentos. Si deseamos
realizar bsquedas ms amplias de toxicologa, recomendamos utilizar la base de datos TOXNET o Environmental Health and Toxicology.
More Subsets:
1. Medline: la base de datos ms importante de la NLM. Contiene ms referencias desde 1960. Cubre las disciplinas de medicina, enfermera,
odontologa, veterinaria, gestin y administracin sanitaria y ciencias
preclnicas.
2. OldMedline: contiene referencias bibliogrficas de revistas biomdicas
desde 1950 hasta 1965. Las referencias no contienen resmenes.
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4. Visualizacin
de resultados
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Limits activated: en este punto queda registrado los lmites que se han
utilizado para realizar la bsqueda.
Clipboard: en el caso de que se haya guardado algn registro a travs de
esta opcin.
Filter your results: Ofrece la posibilidad de filtrar los resultados. Por defecto aparecen seleccionados los filtros de revisiones y artculos a texto
completo. La opcin de manage filtres lleva al My NCBI, dnde permite
personalizar ms filtros.
Also Try: muestra otras estrategias de bsquedas similares a la lanzada por
el usuario, realizadas previamente por otros usuarios en varias ocasiones.
Find related data: permite reejecutar esta misma bsqueda en otras bases
de datos elaboradas por la NLM.
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Cmo buscar
Qu significa
PubMed - as
supplied by
publisher
publisher[sb]
PubMed - in
process
in process[sb]
medline[sb]
PubMed author
manuscript in
pubstatusnihms
PMC
PubMed
oldmedline[sb]
Epub ahead of
print
pubstatusaheadofprint
Abstract: referencia bibliogrfica completa, enlace con la sede del editor (si est disponible), ttulo, idioma del artculo si no se encuentra en
ingls, autores, direccin del autor, resumen (si est disponible), tipo de
publicacin (excepto Journal Article), PMID, status de la cita. Esta opcin
se encuentra en formato HTML, y en formato texto (txt), que es la ms
adecuada para imprimir el documento.
XML: formato en etiqueta XLM.
MEDLINE: cita completa con etiquetas que identifican cada campo. Se
utiliza para la utilizacin de gestores de referencias bibliogrficas.
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Nombre
Descripcin
AB
Abstract
Resumen
AD
Affiliation
AID
Article Identifier
AU
Author Name
CI
Copyright Information
Copyright
CIN
Comment In
CN
Collective Name
CON
Comment On
CY
Country
DA
Date Created
DCOM
Date Completed
DEP
Date of Electronic
Publication
DP
Publication Date
EDAT
Entrez Date
EIN
Erratum In
GS
Gene Symbol
ID
Identification Number
IP
Issue
IS
ISSN
JC
JID
NLM Unique ID
LA
Language
LR
MH
MeSH Terms
MHDA
MeSH Date
PG
Page Number
Contina
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Nombre
Descripcin
PHST
Publication History
Status Date
PMID
PubMed Unique
Identifier
PS
Personal Name as
Subject
PST
Publication Status
Categora de la publicacin.
PT
Publication Type
Tipo de artculo.
RF
Number of References
RIN
Retraction In
Retraccin de un artculo.
RN
EC/RN Number
Number assigned by the Nmero asignado por la Enzyme Commission para designar una encima particular
o por el Chemical Abstracts Service (CAS) para el
Registry Numbers.
ROF
Retraction Of
Artculo retractado.
RPF
Republished From
Artculo original.
RPI
Republished In
SB
Journal Subset
Secondary Source
Identifier
SO
Source
TA
Ttulo abreviado.
TI
Title Words
TT
Ttulos de artculos en alfabetos no latinos que se encuentran transliterados o ttulos en su lengua original.
UI
MEDLINE Unique
Identifier
UIN
Update In
Artculo actualizado.
UOF
Update Of
VI
Volume
Volumen de la revista.
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Clipboard (Portapapeles) permite guardar y ver ms adelante, para imprimir, enviar por e-mail o volcar, las citas seleccionadas de una o varias
bsquedas. El nmero mximo de citas que se puede guardar es de 500.
Para agregar citas en el portapapeles, pulse en el cuadro a la izquierda de
la cita y luego seleccione en Send to la opcin Clipboard.
Para recuperar todas las referencias almacenadas en el Portapapeles, debemos pulsar en la parte superior derecha de la pantalla (slo aparecer
una vez hayamos guardado alguna referencia). El Clipboard se pierde despus de 8 horas de inactividad en PubMed.
Las citas en el clipboard se pueden guardar e imprimir de la misma manera
que las opciones de bsqueda. Para borrar las citas del clipboard, puede
seleccionar la opcin remove all tems de la parte superior de la pantalla
o seleccionar remove from clipboard de cada una de las referencias.
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Para imprimir los resultados de una bsqueda puede utilizar la opcin imprimir desde el navegador. Pulse en el men Archivo y seleccione Imprimir.
Related Articles: las citas tienen un vnculo que mostrar una seleccin de
artculos que comparten palabras clave con el artculo seleccionado. PubMed
compara las palabras del ttulo, resumen y trminos MeSH. Las citas se muestran
de mayor a menor concordancia, no respeta un orden cronolgico.
4.4. Acceso al texto completo del artculo
5. Recursos
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adicionales de inters
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El Medical Subject Headings (Descriptores de Ciencias de la Salud) es un vocabulario controlado de trminos biomdicos que identifican el contenido de cada
artculo en la base de datos MEDLINE. La bsqueda en el MeSH Database permite
mostrar trminos MeSH en una estructura jerrquica a partir de 15 grandes
categoras, seleccionar los trminos MeSH para la bsqueda, limitar los trminos
MeSH a un concepto mayor (tema principal). Los descriptores MeSH pueden ser
utilizados con subheadings, subencabezamientos que permiten concretar en uno
o varios aspectos especficos el trmino.
Cuando introducimos un trmino que no es MeSH, el sistema nos indicar que
no es un trmino MeSH, o bien mostrar el trmino aceptado.
Ej. si introducimos Mongolism, mostrar Down syndrome.
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Esta opcin permite buscar las revistas indizadas en Medline por diversos criterios: por ttulo, abreviatura o el ISSN (International Standard Serial Number), o
bien aquellas que permiten acceder al texto completo desde PubMed.
Ejemplo: por ttulo completo: Enfermedades Infecciosas y Microbiologa Clnica; por la abreviatura internacional: Enferm Infecc Microbiol Clin; o tambin por
su ISSN: 0213-005X.
Una vez localizada una revista, si deseamos que recupere todas las referencias incluidas en PubMed, pulsamos Link y seleccionamos PubMed.
5.3. Single Citation Matcher
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Permite buscar los nmeros PMID (PubMed IDs) que identifican a cada artculo o
de varios artculos a la vez, de forma similar al Single Citation Matcher. Requiere
datos bibliogrficos (revista, volumen, pgina, etc.) en un formato especfico.
Ttulo abreviado revista| ao publicacin | volumen|
primera pgina | nombre autor | ???
proc natl acad sci u s a|1991|88|3248|mann bj|P32022-1|
Para ejecutarlo debemos realizar los siguientes pasos:
1. Recuperamos la referencia en el Batch Citation Matcher.
2. Copiamos el IDs, lo marcamos y pulsamos en Edicin copiar.
3. Marcamos la referencia donde deseamos vincularlo (tambin suele ponerse a continuacin de la referencia [Medline] [Resumen]
4. Seleccionar la opcin de insertar hipervnculo y aceptamos. La palabra o
texto seleccionado queda vinculado al nmero del resumen de Medline.
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Medical Genetics: recupera registros relacionados con la gentica mdica. Se pueden aplicar diferentes criterios de bsqueda: Diagnosis, Differential Diagnosis
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5.6. My NCBI
Para activar esta opcin, debemos registrarnos previamente en Register (recuadro parte superior derecha de la pgina). Si ya nos hemos registrado, para
activar la opcin de My NCBI, debemos introducir nuestras claves en Sign In
(parte superior derecha de la pgina).
Permite:
My saved data
Collections: Esta opcin permite crear una coleccin o listado de referencias que se guardarn de modo permanente por temas. Este listado o
coleccin bibliogrfica se crea o agrega a partir del resultado final de una
bsqueda bibliogrfica.
My bibliography: es una opcin para los autores, que les ayuda a buscar
y reunir las referencias bibliogrficas de sus publicaciones y combina las
prestaciones de guardar una estrategia de bsqueda y guardar referencias
bibliogrficas en una coleccin. Adems de permitir crear tu bibliografa,
aadir citas manualmente y actualizarlas, etc... Cada bibliografa creada de
esta forma puede aadir hasta 1500 referencias.
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Archivarlas en la propia pgina de PubMed. Para recuperar las actualizaciones, desde el men PubMed Services, seleccionar My NCBI y
recuperamos las bsquedas guardadas.
Establecer hasta cinco filtros personalizados. Para visualizar los filtros de PubMed, pulsar el icono , por defecto aparecen:
Clinical Trial.
English.
Free Full text.
Full text.
Humans.
tems with Abstracts.
Publisher in the last 5 years.
Review.Esta opcin tambin est disponible desde el men lateral My
NCBI Resources, desde la opcin Filters y seleccionando PubMed.
Podemos modificar las opciones de este filtro pulsando la pestaa de
Browse y establecer filtros personalizados:
Linkout: permite acceder a filtros externos, incluido la coleccin de
revistas de una Biblioteca. Para ver la relacin de Centros que han
activado esta opcin, pulsar Libraries. Las opciones de acceso a los
textos completos, est disponible en Miscellaneous.
Links: vnculos a otras bases de datos.
Properties: filtro por reas de inters: edades, genero, idioma (incluido espaol), tipos de estudio, fecha de publicacin, reas de
inters (enfermera, odontologa, historia de la medicina,).
Una vez definidos los filtros, en los resultados de cada bsqueda, los filtros
activados.
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Common preferences
6. Mapeo
automtico de trminos
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