Permanova

Tcnicas de Anlisis Multivariante

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Introduccin Algoritmo para medir la respuesta simultnea de una o varias variables a uno o varios factores en un diseo experimental ANOVA, basado en cualquier medida de distancias y usando anlisis de permutaciones Tcnica de anlisis multivariante (sobre medidas de distancia) con varios factores (balanceados) (MANOVA) Aplica anlisis de permutaciones sobre las matrices de distancia (PERmutaciones) PerMANOVA

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Ejemplo Unifactorial

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Ejemplo Unifactorial

Pseudo F-ratio

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Permanova P-valor La idea es calcular el p-valor usando permutaciones. Si no hubiera diferencias entre los valores se podra permutar los valores (todos iguales) Calcular la cantidad de permutaciones que pueden resultar con valores mas extremos

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Permanova P-valor depende del Nmero de permutaciones Si slo podemos hacer 10 permutaciones (i.e. 2 grupos x 3 rplicas) (6!)/[2!(3!)2]= 10 El mnimo p-valor = 0.10 Resultara insuficiente para anlisis estadstico clsico

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Permanova Requisitos Similares a los de ANOVA: Independencia del trmino del error Normalidad de los mismos Homogeneidad sus varianzas (muy sensible a la heterocedasticidad entre varianzas entre niveles de factores) Aditividad de los tratamientos (factores)

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Permanova - Medidas de distancia

Disimilaridad de Bray-Curtis

Chi square metric

RS Bray-Curtis

Distancia de Hellinger

Distancia Eucldea

Disimilaridad de Gower

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Permanova - Resumen Tcnica de anlisis multivariante (sobre medidas de distancia) con varios factores (balanceados) (MANOVA) Aplica anlisis de permutaciones sobre las matrices de distancia (Permutaciones) para obtener p-valor Limitado por el nmero de permutaciones posibles Nmero de permutaciones recomendable (entre 200 y 1000) (cuantas ms, mejor :) Tambin funciona con otras medidas de distancia (o incluso con valores de variables) pero debemos tener en cuenta el significado del test