BIOINGENIERIA

Bioingeniera
Consiste en la aplicacin de las tcnicas y las ideas de la ingeniera a la biologa. La bioingeniera es la comprensin y aplicacin de los conocimientos en ciencias exactas, naturales y de la ingeniera, para el anlisis, diseo, simulacin, implementacin y optimizacin de sistemas y equipos que incorporen las diferentes tecnologas bioelectrnicas, biomecnicas y de los biomateriales con el fin de generar bienestar y desarrollo tecnolgico.

Campo de accin de la Bioingeniera

Binica
Es un procedimiento utilizado en el campo tecnolgico para descubrir nuevos aparatos inspirndose en los seres de la naturaleza.

Biologa Aplicada
Es la utilizacin de los procesos biolgicos extendidos a escala industrial para dar lugar a la creacin de nuevos productos. Automatizacin de bioreactores

Campo de accin de la Bioingeniera

Ingeniera Biomdica
Estudia el quehacer humano y a travs de la aplicacin directa de las ciencias exactas, la lgica, la creatividad y el diseo, a los problemas mdicos, con equipos, instrumentacin, prtesis y rganos inteligentes, mejora de la calidad de vida de las personas.

Ingeniera Ambiental
Contribuye a mantener la capacidad de sostenimiento del planeta y a garantizar, mediante la conservacin y preservacin de los recursos naturales, una mejor calidad de vida para la generacin actual y para las generaciones futuras. http://www2.epm.com.co/bibliotecaepm/biblioteca_virtual/PortalBioingenieria-LaBioingenieria.htm

BIOINFORMATICA

La bioinformtica, es la aplicacin de tecnologa de computadores a la gestin y anlisis de datos biolgicos Las principales aplicaciones: -El alineamiento de secuencias -Prediccin de genes -Estudio del genoma -Alineamiento estructural de protenas -Prediccin de estructura de protenas -Prediccin de la expresin gnica -Interacciones protena-protena -Estudio de evolucin molecular

Los sistemas informticos que se emplean en este campo son:

Bases de datos Software para visualizacin Programas para control de reactivos, geles y otros materiales Generacin y ensamblaje de secuencias Programas para anlisis de secuencias Programas para prediccin de estructura de protenas Paquetes de integracin y ensamblaje de mapas genticos Software para clasificacin y comparacin Tcnicas de Inteligencia Artificial Automatizacin de experimentos Ensamblaje de secuencias contiguas Prediccin de genes y dominios funcionales Alineacin de secuencias Evolucin molecular. rboles filogenticos
VIDEO

Biochips
Se basan en la ultraminiaturizacin y se concretan en chips de material biolgico de alta densidad de integracin vlidos para realizar distintos tipos de estudios repetitivos con muestras biolgicas simples. En los biochips se logra una alta densidad de integracin de material gentico en una oblea de silicio, cristal o plstico. Los biochips estn divididos en unas pequeas casillas que actan a modo de un tubo de ensayo en el que se produce una reaccin. El nmero de estas casillas es muy elevado, llegando incluso a los centenares de miles

Cada casilla del chip posee una cadena de un oligonucletido. Solo aquellos fragmentos de DNA que hibriden permanecern unidos tras los lavados y dado que se conocen las secuencias y posiciones de los oligonucletidos empleados, tras los lavados se produce el revelado, las cadenas son marcadas con un fluorocromo. Un ordenador analiza la informacin procedente del escner y ofrece el resultado.

La potencia de estos sistemas trae consigo la obtencin, en tiempos muy breves, de grandes volmenes de informacin, (secuencias, mutaciones, datos de expresin gnica, determinaciones analticas de inters clnico, screening con frmacos) que necesitan ser gestionados con tcnicas bioinformticas para extraer conocimiento de utilidad en la investigacin biomdica.

Aplicaciones de los Biochips

- Monitorizacin de expresin gnica - Deteccin de mutaciones y polimorfismos - Secuenciacin - Diagnstico clnico y deteccin de microorganismos - Screening y toxicologa de frmacos - Seguimiento de terapia - Medicina preventiva

Genmica
El objetivo de la genmica consiste en determinar la secuencia completa del material gentico contenido en el genoma completo de un organismo. Genmica funcional (a veces referido como la protemica funcional) tiene como objetivo determinar la funcin del proteoma (protenas codificadas por el genoma completo de un organismo). Genmica estructural: estudio sistemtico estructural de un conjunto definido de molculas( genes, protenas)

Una base de datos es una coleccin de datos que organiza la informacin para poder acceder a su contenido fcilmente, gestionar y modificar por bioinformtica
Ejemplos: - Base de datos de protenas SWISSPROT - GenBank.
PubMed http://www.ncbi.nih.gov/entrez/query.fcgi

Base datos Medline, contiene ms de 12 millones de citas incluyendo todos los artculos cientficos publicados en 4600 revistas biomdicas.

Base de datos Nucleotdica

1. EMBL: European Molecular Biology Laboratory, Cambridge, UK. 2. GenBank: (NCBI), NIH campus, USA.

3. DDBJ: DNA Databank of Japan.

Base de datos de protenas * GenBank, EMBL and DDBJ * SWISSPROT, PRF, Protein Data Bank (PDB).

Explorando www.ncbi.nlm.nih.gov
Secuencia incgnita

Blastn Blastp

Podemos encontrar de homologa con alguna otra secuencia ya descripta

Explorando www.ncbi.nlm.nih.gov

Comparacin de secuencias

Blastn Blastp

Anlisis de secuencias
Buscar marcos abiertos de lectura

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/gorf/

Anlisis de secuencias
- Diseo de cebadores (PCR, Secuenciacin, sondas) http://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast/

- Buscar Dominios Conservados

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/wrpsb.cgi - Analizar sitios de restriccin - Estructura 3D