Bsqueda bibliogrfica

Una propuesta para el uso de las bases de datos en el rea de ciencias de la salud
Ctedra de Biofsica Facultad de Odontologa Universidad de Buenos Aires

Recorrido de la clase:
introduccin: de los ficheros a las bases de datos uso de las bases de datos: criterios de bsqueda segn objetivos presentacin de herramientas, recetas y atajos

qu formas adopta la informacin?

Escrita

- libros - revistas - handbooks Virtual - BD

Un poco de historia

Primer intento: sistemas de ficheros:

Conjunto de programas donde cada usuario almacena y maneja sus propios datos.

Ej: datos de pacientes ambulatorios y/o internados en un hospital

datos

- datos separados y aislados - datos du/tri/ plicados

datos datos

- programacin complica al usuario - consultas fijadas por la aplicacin Ordenacin Generacin de informes

Intentos posteriores: bases de datos (BD) y sistemas de gestin de bases de datos (SGBD): de datos almacenados Conjunto
entre los que existen relaciones lgicas, que puede ser utilizado por muchos usuarios.
- datos centralizados - independencia entre el dato y la aplicacin - mayor accesibilidad a los datos

SGBD B D

s ot a d

Ejemplo de BD y SGBD:

Ante la necesidad de realizar una bsqueda bibliogrfica, se debe:

definir tema y objetivo de la bsqueda aplicar estrategias que permitan acotar la bsqueda: - seleccionar la base de datos - palabras claves (descriptores) - cota temporal - tipo de publicacin - autor - etc...

Distintos objetivos de bsqued

Diferentes estrategias
Ejemplos: Actualizacin en un tema especfico Bsqueda de un trabajo particular Comienzo de una lnea de investigacin nueva Presentacin de un caso clnico desconocido

Si pretendemos actualizarnos en un tema especfico

Debemos tener en claro cual es el tema en particular (PALABRAS CLAVE) Es recomendable fijar la atencin en trabajos recientes importantes Tambin podemos acercarnos a aquellos trabajos que hayan llamado nuestra atencin (Ejs: POR AUTOR, POR ZONA GEOGRFICA, POR GRUPO ETARIO, ETC)

Si lo que buscamos es un trabajo particular

Si no poseemos datos suficientes ese ser un objetivo de la bsqueda Si contamos con la cita completa, existe la posibilidad de consultar CATLOGOS por Internet - http://www.bl.fcen.uba.ar - http://www.sisbi.uba.ar - http://biblioteca.secyt.gov.ar - http://www.odon.uba.ar/biblioteca/index.htm

Bsqueda

Bibliogrfic a

Hasta podemos dirigirnos al autor

Si queremos bibliografa con el f de comenzar una investigacin

Fijar nuesta atencin en los trabajos que revisen el tema Identificar aquellos autores ms relacionados con nuestro tema

Si nos enfrentamos a un caso clnico en particular

Debemos asegurarnos, lo mejor posible, si est o no descrito Tener en cuenta en que especialidad puede aparecer Debemos plantear estrategias ms especficas

 Estos son solo ejemplos. Debemos:

establecer nuestros objetivos con CRITERIO evaluar todas las alternativas de bsqueda que se nos ocurran

Para esquematizar la bsqueda: DNDE BUSCAR? QU BUSCAR? CMO BUSCAR?

Bibliotecas virtuales en ciencias de la salud

MEDLINE (US National Library of Medicine - NLM) www.pubmed.org LILACS (Literatura Latinoamericana y del Caribe en ciencias de la salud) http://lxp.bvsalud.org/login2.php SciELO (Scientific Electronic Library Online) www.scielo.org

Qu es un descriptor?
Es el trmino o smbolo autorizado y formalizado que se utiliza para representar sin ambigedad los conceptos contenidos en los documentos y en las peticiones de recuperacin de la informacin.
descriptor 2 descriptor 1 descriptor 3 VOCABULARIO ESTRUCTURADO

Qu es un vocabulario estructurado?
Es una coleccin de trminos organizados segn una metologa en la cual es posible especificar las relaciones entre conceptos con el propsito de facilitar el acceso a la informacin.
DECS

Operadores Booleanos
Los operadores Booleanos son necesarios cuando en nuestra bsqueda introducimos ms de un trmino o descriptor. Nos permiten fijar la manera en que el PubMed buscar esos trminos en las citas de las bases de datos El PubMed interpretar los operadores siempre de izquierda a derecha (en el orden que los va encontrando). Si se desea evitar esto deben utilizarse corchetes.

El operador AND, entre dos palabras, har que el PubMed solo busque aquellas citas en las cuales figuren ambas palabras:
Descriptor A Descriptor B

El operador OR nos permitir obtener todas las citas en las cuales aparezcan uno o ambos trminos:

Descriptor A

Descriptor B

El operador NOT, nos permitir acceder a aquellas citas que contengan al primer descriptor, pero no al segundo. En el diagrama: A NOT B.
Descriptor A Descriptor B

Pub Med
Desarrollado por la National Center for Biotechnology Information (NCBI) en la National Library of Medicine (NLM). Permite acceder a bases de datos bibliogrficas compiladas por la NLM (MEDLINE, preMEDLINE, Genbak y Complete Genoma). Posee sub-bases de datos, que se pueden consultar individualmente.

MEDLINE

Es la bases de datos ms importante de NLM. Abarca los campos de: medicina, enfermera, odontologa, veterinaria, salud pblica y ciencias preclnicas. Contiene ms de 11 millones de referencias bibliogrficas de artculos de revistas a partir de 1996.

Acceso y caractersticas de Pub Med

Se puede acceder directamente con la direccin www.pubmed.net o www.pubmed.com o www.pubmed.org Distintas caractersticas Se puede buscar a partir de autores, trminos, frases, etc. Permite limitar nuestra bsqueda. Posee acceso al MeSH Browser. Se puede buscar y consultar una revista en particular a travs del Journal Browser. Posee un filtro metodolgico (Clinical Queries) que nos permite acceder dirctamente a casos clnicos. Nos permite el truncado de trminos, colocando la raiz de la palabra seguida inmediatamente de un

Para realizar una bsqueda

El PubMed funciona como cualquier otro buscador habitual Si deseamos introducir el nombre de un autor debe escribirse el apellido (los nombres son opcionales). Si deseamos introducir una frase esta debe estar entre comillas. Si la frase no est entre comillas el PubMed introducir automticamente el operador Booleano AND

Limitar una bsqueda

Las herramientas que limitan una bsqueda nos permiten aplicar un filtro, de tal manera que solo se muestren aquellos trabajos verdaderamente pertinentes. Podemos limitar nuestra bsqueda a un campo en particular de la base de datos a un tipo en particular de publicacin(ej: Reviews, casos clnicos, cartas, etc) a una base de datos en particular. a aquellas citas publicadas a partir de cierto ao, o en un perodo determinado a aquellas citas que versen sobre individuos o animales segn gnero y/o grupo etario

Cita bibliogrfica

Es la manera en que el autor nos informa de dnde ha obtenido la informacin para redactar un texto. En ella deben constar: Nombre del autor o de los autores (apellido paterno y primera letra del nombre). ttulo del artculo o tema consultado. ttulo del libro o revista con n del volumen y ao. Nombre del editor. ao de publicacin. lugar y n de pg. (s) consultada (s). Las revistas indican a los autores la forma en

Autores

Ttulo

Lekholm U, van Steenberghie D, Herrimann I, et. al. Osseointegrated implants in the treatment of partially edentulous jaws: A prospective 5-year multicenter study. Int J Oral Maxillofac Implants 1994; 9: 627-635.

Revista

Edicin, ao, volumen y pag.

Sistemas de ordenamiento de citas ms utilizados

1-Nombre y ao (Sistema de Harvard). *Utiliza solo el nombre del autor y el ao de publicacin. 2-Numrico-alfabtico (modificacin del sistema de Harvard). *Se cita mediante la asignacin de un nmero a las referencias de una lista alfabetizada. 3-Orden de mencin. *Se citan las referencias (por nmero) segn el orden en que se mencionan en el texto o artculo. * Evita gastos de imprenta considerables del sistema de nombre y ao. Los lectores acuden rpidamente a la lista

Algunos ejemplos:
1- Algunas revistas incluyen los ttulos de artculos y otras no (Day, 1996) DAY, RA. 1996, Cmo escribir y publicar trabajos cientficos, 2a Edic, The Orys Press, USA. 2- Algunas revistas incluyen los ttulos de artculos y otras no (12) (1 ) 5 AMIEL PEREZ, J. Proyecto de Investigacin y Publicacin, Metodologa de la Investigacin Cientfica. CONCYTEC. Lima-Per, pp. 147-48. (1 ) 2 DAY, RA. Cmo escribir y publicar trabajos cientficos. 1996. 2a Edic, The Orys Press, USA, pag. 283 3- Algunas revistas incluyen los ttulos de artculos y otras no (12) (12). DAY, RA, 1996, Cmo escribir y publicar trabajos cientficos, 2a Edic, The Orys Press, USA, pag. 48-51. (15). AMIEL PEREZ, J. Proyecto de Investigacin y Publicacin, Metodologa de la Investigacin Cientfica. CONCYTEC. Lima-Per, pp. 147-48.

Ttulo

Se expresa tal como figura en la obra: Osseointegrated implants in the treatment of partially edentulous jaws Puede hacerse constar un subttulo.

rev

Revista

Los estilos de revistas son variados. Existe ya una uniformidad con las abreviaturas de los ttulos de las revistas.

Ejemplo: La Journal of the American Chemical Society se abrevia de distintas formas, como: J.Amer.Chem.Soc. J.A.C.S.,

Cmo evaluar la calidad de las publicaciones resultado de una bsqueda bibliogrfica?

grupo de trabajo reconocido lugar de trabajo relevancia de la revista

Supuesto:

Parmetros bibliomtricos de calidad: ndices de citas.

Citacin calidad

reconocimiento de pares

Thomson ISI (Institute for Scientific Information) y sus productos http://www.isinet.com/essays/selectionofmaterialforcoverage

/199701.html

productor de bases de datos evaluacin de la investigacin ms importante de ms impacto que se publica mundialmente.

productos principales en Web of Science desde 1997:

Citation Indexes (ndices de citas) Journal Citation Reports

Bases de Datos del Institute for Scientific Information

Bases de datos de citas:

Science

Citation Index. 3.800 revistas sobre ciencia. versin electrnica 5.900 revistas Sciences Citation Index: 1.725 revistas sobre ciencias sociales y selectivamente de otras 3.300 and Humanities Citation Index: 1.144 revistas del tema y selectivamente de otras 6.800

Social

Arts

bases de datos de citas

estrategias de bsqueda

por autor

por artculo

qu artculos cita? qu artculos lo han citado?

source index: lista de artculos citados, por orden alfabtico de autor citation index: lista de autores citados subject index: lista de artculos por orden de palabra clave de los ttulos corporate index: lista de pases e instituciones de las que

Propsito de los JCR?

...determinar en forma sistemtica y objetiva la importancia relativa de las revistas cientficas dentro de las diferentes disciplinas que componen las ciencias duras y sociales.

principales indicadores cuantitativos:

nmero total de citas factor de impacto (FI) nmero total de artculos

Factor de impacto

Medida de la repercusin o impacto de una revista Ej: FI ao 2005: se dar a conocer a fines de 2006 A: n citas del ao 2005 B: n citas del ao 2005, referidas a trabajos del bienio 2003-2004 C: n trabajos citables publicados en el bienio

B F.I. C =

(informado con 3 decimales)

Variacin del factor de impacto en funcin del tiempo desde la publicacin

Usos correctos del F.I.:

editores de revistas cientficos con trabajos a publicar bibliotecas

Usos incorrectos del F.I.:

aplicacin directa a autores en concursos y promociones acadmicas en comparaciones interdepartamentales

Algunas variables a tener presentes:

variacin temporal variacin por disciplina variacin por tipo de publicacin

Fluctuaciones en el factor de impacto en funcin del tiempo

F.I. JOURNAL TITLE

2.581 2.523 1.854 1.710 1.663 1.522 1.525 1.457 1.425 1.398 1.336 1.229 1.171 1.132 1.124 J DENT RES CRIT REV ORAL BIOL M J CLIN PERIODONTOL CLIN ORAL IMPLAN RES J OROFAC PAIN J PERIODONTAL RES PERIODONTOL 2000 CARIES RES J PERIODONTOL INT J ORAL MAX IMPL ORAL MICROBIOL IMMUN AM J DENT EUR J ORAL SCI INT J PERIODONT REST CURR OPIN PERIODONT

REVISTAS CIENTFICAS CON MAYOR FI 2002

FACTOR DE IMPACTO TOTAL CITAS TOTAL ARTCULOS

ANNU REV IMMUNOL ANNU REV BIOCHEM CA-CANCER J CLIN NEW ENGL J MED NATURE SCIENCE NAT MED NAT IMMUNOL CELL NAT GENET

54.455 36.278 32.886 31.736 30.432 28.956 28.740 27.868 27.254 26.711

13709 16591 3096

143124 326546 296080

26 27 17 378 889 987 137 134 350 222

31696 6297
139765

44050

Variacin del factor de impacto segn disciplina

Factor de impacto ponderado:

FI FIP = -------- X 100 FIM

FIP = factor de impacto ponderado FI = factor de impacto de la revista en cuestin FIM = factor de impacto mximo del campo de conocimiento de que se trate

Variacin del factor de impacto segn tipo de publicacin

Problemas con las citas

Copia de citas: sin lectura previa Citacin sesgada:
Autocitacin

deliberada Cita para editores Omisin Segundo ms prolfico

Problemas con las publicaciones

faltas de tica en la publicacin
fraude: invencin falsificacin y manipulacin de datos plagio publicacin duplicada publicacin fragmentada (salami publication) - publicacin inflada (meat extender publication) otros: autoplagio - sesgos en la publicacin publicidad de resultados de investigacin -