La Matriz de la Vida

Interacciones débiles en un medio acuoso

Mathews, Van Holde & Ahern, 2004

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 Macromoléculas que participan en la
matriz estructural

Son estructuras inmensas que se mantiene unidas por enlaces

COVALENTES fuertes

Los enlaces covalentes, son fuerzas que mantienen átomos

unidos como moléculas. Por ejemplo, los dos enlaces O-H en
las moléculas de agua son enlaces covalentes

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Existen interacciones más débiles que son las responsables
de la arquitectura celular: Interacciones no covalentes,
llamadas enlaces o fuerzas no covalentes, que se producen
entre iones, moléculas o partes de las moléculas. Son de 10 a
100 veces más débiles

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 Energía de enlace
(kJ/mol)

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 Importancia y naturaleza de las
interacciones NC
Son enlaces débiles que permiten romperse y volverse a
formar continuamente en la interacción molecular dinámica
que es la vida
La interacción depende de los rápidos intercambios de
parejas moleculares
Son interacciones de varios tipos, sin embargo todas estas
interacciones son fundamentalmente de naturaleza
electrostática

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 Clases de interacciones NC

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Estructura electrónica de algunos elementos
1s 1s 2s 2p 2p 2p
H C
1s 1s 2s 2p 2p 2p
He N
1s 2s 2p 2p 2p 1s 2s 2p 2p 2p
Li O
1s 2s 2p 2p 2p 1s 2s 2p 2p 2p
Be F
1s 2s 2p 2p 2p 1s 2s 2p 2p 2p
B Ne

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 Enlaces covalentes

1. Compartición de electrones
en orbitales moleculares
2. Estado sólido, líquido y gas
3. Fuertes (>50 kcal/mol)
4. Tantos como orbitales con
electrones desapareados
Electrón del hidrógeno
Electrón del carbono

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 Hibridación de orbitales
1s 2s 2p 2p 2p
C
Sin hibridación

H3C CH3 1s sp3 sp3 sp3 sp3

C
sp3: tetraedro

1s sp2 sp2 sp2 2p

H2C CH2 C
sp2: triángulo

1s sp sp 2p 2p
HC CH C
sp: lineal
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 Enlaces iónicos
Átomo o molécula cargada eléctricamente, debido a que ha
ganado o perdido electrones. Los iones cargados
negativamente, producidos por la ganancia de electrones, se
conocen como aniones y los cargados positivamente,
consecuencia de una pérdida de electrones, se conocen como
cationes

A• + B • A+ + :B-

1. Fuertes (>50 kcal/mol)

2. Propios del estado cristalino
3. Elementos extremos en la Tabla Periódica

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 Enlace iónico

Cristal de NaCl

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 Enlaces de coordinación

Orbital molecular formado por:

- Un orbital vacío
- Un par electrónico
Dador: átomos con pares electrónicos: N, O
Aceptor: orbital vacío (átomos metálicos)
.. ..
.N . .O .
.

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 CH2

Complejo octaédrico H3C CH

de Fe++: Grupo hemo

N
H2C CH CH3

N Fe++ N

CH3 CH2 CH2 COO-

N

H3C CH2
CH2
COO-

N
N
Fe++
N
N
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N
 Complejo tetraédrico
de Fe++/Fe+++: Rubredoxina

O H
C N
CH
CH2
O C H S H C O
CH CH2 S Fe++ S CH2 CH
H N H S H N H
CH2
CH
C N
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O H
 Fuerzas de van der Waals

Son interacciones muy débiles

En el medio biológico tienen importancia en ausencia de agua

Rotas por detergentes

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Compuestos hidrofóbicos

Benceno
Colesterol

04/12/2018 Decano
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Agua
Compuestos polares

L-Arginina

D-Glucosa
04/12/2018 ATP
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 Compuesto
anfipático

(Gangliósido GM1)

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 Micela
Bicapa lipídica

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 Puentes de hidrógeno

Compartición de un protón entre dos pares electrónicos

Dador: Grupo X-H con cierto momento dipolar

Aceptor: Grupo Y: con un par electrónico

Débil (mucho más fuerte que int. de van der Waals)

Rotas por urea 6M, guanidina 8M

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 Algunos enlaces de hidrógeno
N H :O
H
O H :O

N H :N
H

O H :N

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 DNA
conformación B

Estructura
mantenida por
puentes de H
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Par Adenina-Timina

H
N N H O CH3

N N H N
R
N N
O R
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Par Guanina-Citosina

H
N O H N

N N H N
R
N
N H O R
04/12/2018 Dr. Edgar F. Morán Palacio
H 24
Proteínas:
Estructura en a-hélice

Ca
O
N
C
H
Ca Ca
O
N
C
H
Ca

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Proteínas:
Estructura en hoja plegada

Ca
O
N
C
H
Ca Ca
O
N
C
H
Ca
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 Interacciones iónicas o salinas
(No confundir con enlace iónico)

- Entre grupos de carga opuesta en solución

- Débiles (más fuertes que int. de van der Waals)
- Los iones participantes aparecen solvatados
- Rotas por altas concentraciones salinas, extremos de pH

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 Solvatación de iones en solución

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 Nucleosoma:

Asociación
DNA-histonas

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