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GENTICA

Tema No. 2: El genoma humano y su


estudio.
Dr. Wilmer Delgado Luengo
Magster en Gentica Mdica
Doctor en Ciencias Mdicas
Prof. Titular

El genoma humano y su estudio.


DEFINICIONES

Genoma: Conjunto total del material gentico hereditario presente en una clula,
tanto nuclear como extranuclear, codificante o no.
Clase de material gentico:
cido Desoxirribonucleico (ADN): la > de los organismos.
cido Ribonucleico (ARN): algunos virus.
Tipo de material gentico:
Codificante: Genes.
Codifica toda la informacin celular (metabolismo, fisiologa, morfologa,
comportamiento, embriognesis, crecimiento y desarrollo fsico y mental,
reproduccin, entre otras).

No Codificante: intergnico e intragnico.


Ubicacin del material gentico (Eucariotas):
Nuclear
Mitocondrial

El genoma humano y su estudio.

Organismos Eucariotas:
Multicelulares:
animales y plantas.
Unicelulares y
multicelulares simples:
Protozoarios, hongos y
algas.
Membrana celular, pared
celular (plantas),
citoesqueleto.
Compartamentalizacin
celular.

El genoma humano y su estudio.


Ncleo:
Doble membrana nuclear.
Genoma Nuclear
Ciclo celular:
Interfase:
Cromatina.Filamentoso y
disperso.
Divisin Celular:
Cromosoma.

Contiene ~ 90% del ADN.


Organizado en cromosoma,
en tamao y n variable,
segn la especie.
Magnitud del genoma:
En n de cromosomas:
Haploides: n
Diploides: 2n
En longitud:
pb (pares de bases)
nt (nucletidos)

LEPTOTENO
ZIGOTENO
PAQUITENO
DIPLOTENO
DIACINSIS

El genoma humano y su estudio


COMPARACIN DEL GENOMA NUCLEAR Y MITOCONDRIAL
G Nuclear

G Mitocondrial

Tamao

3000 Mb

N de Mol Dif.

24 (X,Y)

1 Molcula

Forma

Lineal

Circular

N total de Mol

Proteinas
asociadas

N de genes

23 cromosomas (haploides)
46 cromosomas (diploides)

16,6 Kb

Miles

Histonas

Ninguna

<30000

37
7

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G Nuclear

G Mitocondrial

ADN repetitivo

Abundante

Escaso

Transcripcin

Individual

Policistrnica

Intrones

Presentes

Ausentes

ADN Codificante

1,5 %

95 %

Recombinacin

Presente

Ausente

Herencia

Mendeliana

Materna

El genoma humano y su estudio


CONSTITUCIN
Azcares:
2-Desoxiribosa
Ribosa
cido Fosfrico:
Monofosfato
Difosfatos
Trifosfatos

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Cdigo Gentico:

Cuatro Nucletidos: A, G, C y T (U).


Codn o Triplete: lectura de la
secuencia de ADN o ARN de tres en
tres nucletidos.
Combinaciones posibles de tres
nucletidos = 64 codones.
64 Codones:
61 codones: codifican para 20
aminocidos biolgicamente
importantes.
3 codones de Terminacin (paro o
sin sentido):
UAA, UAG y UGA.
No codifican para ningn
aminocidos.
Origina la finalizacin de la
sntesis de protenas.
Codn de Inicio:
AUG: Codifica nicamente
para Metionina (Met)
La sntesis, de la mayora de
las protenas, se inicia con
Metionina.

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CDIGO GENTICO:
Degenerado:
Un aminocido puede ser
codificado por mas de un codn
(codones sinnimos).
Disminuye la posibilidad de que
mutaciones puntuales puedan
provocar la incorporacin de un
aminocido distinto, y por ende,
prdida de la funcin proteica.

Universalidad:
Inicialmente se crea que exista
una correspondencia entre
codones y aminocidos,
independiente del organismo
estudiado.
Casi universal: Hay excepciones,
pocas, a la regla.
Los procariotas, eucariotas y
mitocondrias de plantas,
comparten el mismo cdigo
gentico.
Un antepasado comn.

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El genoma humano y su estudio


Niveles de Organizacin (Condensacin, Empaquetamiento) del ADN.

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Niveles de Organizacin (Condensacin, Empaquetamiento) del ADN.

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Niveles de Organizacin (Condensacin, Empaquetamiento) del ADN.

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Heterocromatina:
Aspecto: Se tie intensa/.
Condensacin: mxima
Clasificacin:
Constitutiva:
Permanente/ condensada
en todo el ciclo celular, a
excepcin durante su
replicacin.
Ej: Centromeros y
telomeros.
Facultativa:
Puede pasar a eucromatina
bajo ciertos estmulos. Ej:
Cromos. X.
Al final de la fase G2 toda la
cromatina esta como
heterocromatina.
Transcripcionalmente inaccesible.

Eucromatina:
Aspecto: Se tie debilmente y
de manera difusa.
Condensacin: menos
condensada.
Transcripcionalmente
accesible: la molcula de ADN
es accesible a protenas
(factores de transcripcin, ADN
polimerasas, ARN polimerasas,
entre otras).
Expresin gnica.

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Clasificacin del genoma Humano segn
su organizacin:
ADN de copia nica: Secuencias nucleotdicas
(exones) presentes una vez o muy pocas veces
en el genoma.
ADN repetitivo: Secuencias nucleotdicas
(intrones) repetidas en nmero variable.
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ADN repetitivo: repeticiones de cientos a
millones de veces en el genoma.
Clasificacin:
ADN disperso:
20 % del genoma
Repeticin regular: cada 4 Kb.
Ejemplos: secuencia Alu (familia Alu), secuencia
Kpn, (familia Kpn),
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ADN satlite:
10 % del genoma
Secuencias repetidas en tandem.
Clasificacin:
ADN --satlite: unidad de repeticin de 171 pb.
Repeticiones en millones de veces en el genoma.
ADN minisatlite o VNTR: Unidad de repeticin
entre 10 y 70 pb, Repeticiones de miles de veces
en el genoma.
ADN microsatlite, o STR: unidad de repeticin 2
- 4 nucletidos. Repeticiones: cientos de veces en
el genoma.

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Homocigoto: ambos alelos de un par de cromosomas homlogos son


idnticos.
Heterocigoto: ambos alelos de un par de cromosomas homlogos son
diferentes.
Heterocigoto simple.
Heterocigoto compuesto.
Hemicigoto: El hombre por tener un (01) solo cromosoma X y un (01) cromosoma Y
es Hemicigoto para casi todos los alelos de los cromosomas X y Y, a excepcin de los
alelos localizados en las regiones pseudoautosmicas.

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Genotipo: la constitucin genmica de un organismo.
Fenotipo: conjunto de rasgos o caracteres
INTERNOS O EXTERNOS (morfolgicos,
anatmicos, fisiolgicos, bioqumicos y moleculares)
resultantes de la expresin del genotipo. El trmino
implica la interaccin entre el genotipo y el medio
ambiente.
Medio Ambiente: conjunto de factores internos y
externos al organismos que influyen sobre su
genotipo con la consiguiente expresin fenotpica.
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OMIM ntry
Statistics:

Prefix

Number of Entries in OMIM (Updated 23 July 2012) :


Autosomal
X Linked
Y Linked
Mitochondrial

Totals

* Gene description

13,241

643

48

35

13,967

+ Gene and
phenotype,
combined

142

149

# Phenotype
description,
molecular basis
known

3,240

262

28

3,534

% Phenotype
description or
locus, molecular
basis unknown

1,627

135

1,767

Other, mainly
phenotypes with
suspected
mendelian basis

1,779

125

1,906

20,029

1,170

59

65

21,323

Totals

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Mutacin:
Alteracin o cambio en la secuencia del ADN:
Genoma Nuclear o Miticondrial
Codificable (gen estructural) o no codificable (regulacin de la
expresin gnica)
Heredable (clulas germinales) o no (clulas somticas).
Principal causa de variabilidad gentica.
Importancia:
Evolucin de las especies.
Identidad gentica de un individuo.

Heredobiolgicas
Identificacin de individuos.
Pruebas forenses.
Migraciones humanas.

Diagnstico de enfermedades:
Propsito.
Dx Prenatal.

Tratamiento de enfermedades:
Cncer.
Clulas madres.

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El genoma humano y su estudio


La reaccin en cadena de
la polimerasa (PCR)
Obtencin millones de
copias de un fragmento
mediante la amplificacin
selectiva in vitro de ADN,
basada en las
propiedades de
desnaturalizacin,
renaturalizacin e
hibridacin del ADN.

Taq
polimerasa

Primers

dntp
s

Desnaturaliz
acin 95C
n ciclos

Alineacin
45C

Extensin
72C

2 nuevas copias

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Tecnologa del ADN
Recombinante:
Enzimas de Restriccin
Clonaje Molecular
Vectores de Clonacin
Plasmidos
Bacterifagos
YACs (Plsmido de gran
tamao)
Cosmidos (Plsmidos +
Fago)

ER
AGTTGTACCTCACTTGGAAAAA
TCAACATGGAGTGAACCTTTTT
AGTTGTA
TCAACAT

CCTCACTTGGAAAAA
GGAGTGAACCTTTTT

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ANEMIA FALCIFORME

A:

CCT
pro

GAG GAG
glu
glu

S:

CCT
pro

GTG
val

GAG
glu

C:

CCT
pro

AAG
lys

GAG
glu
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Diagnstico Molecular Distrofia Muscular
Duchenne/Becker

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Diagnstico Molecular Fibrosis Qustica:
F508
cN

98 pb
95 pb

cH feto cF508

Alelo Normal: 98 pb
Alelo Mutado: 95 pb

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CASO DE PATERNIDAD: D1S80

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GRACIAS

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